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  • 简介:摘要目的采用生物信息学方法分析中心体蛋白55(CEP55)在肺腺癌中的表达,探究CEP55在肺腺癌中的潜在机制及其临床意义。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌转录组和临床数据,借助R语言和Perl软件进行数据处理,使用Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis检验及logistics回归分析CEP55表达差异性以及与临床病理参数的相关性,Kaplan-Meier和Cox回归分析肺腺癌患者预后影响因素;使用基因富集分析(GSEA)方法分析预测CEP55在肺腺癌中参与的信号通路。组间比较采用Wilcoxon秩和检验,多组比较采用Kruskal-Wallis检验。结果CEP55在肺腺癌组织中的表达量明显高于癌旁组织[6.151(2.671,10.464)比0.628(0.428,0.932),Z=-11.959,P<0.05],CEP55表达量与年龄[<65岁7.220(3.590,11.062)比≥65岁5.320(2.194,9.386),Z=-3.478,P<0.05]、性别[女性5.315(2.218,9.379)比男性7.213(2.903,11.533),Z=-3.049,P<0.05]、肿瘤分期[Ⅰ 4.969(2.163,8.927)比Ⅱ 6.913(3.397,11.513)比Ⅲ 7.444(4.127,13.286)比Ⅳ 8.192(2.624,13.623),χ2=21.624,P<0.05]、T分期[T1 4.166(1.964,7.978)比T2 6.949(3.458,11.354)比T3 5.982(2.734,11.482)比T4 8.542(2.118,12.132),χ2=20.711,P<0.05]及N分期[N0 5.366(2.213,9.711)比N1+N2+N3 7.417(3.949,12.210),Z=-3.911,P<0.05]显著相关,CEP55高表达患者比低表达患者更容易进展到晚期。Kaplan-Meier生存分析表明CEP55表达水平越高,患者预后越差(P<0.05)。CEP55表达量[风险比(HR)=1.252,95%可信区间(CI):1.046~1.499,P<0.05)可作为肺腺癌患者的独立预后因素。GSEA富集分析显示CEP55高表达主要与细胞周期信号通路、卵母细胞减数分裂、p53信号通路、RNA降解和DNA复制途径相关。结论CEP55在肺腺癌组织中显著高表达,且CEP55高表达与肺腺癌患者预后不良相关,可作为肺腺癌患者的独立预后因素,p53信号通路调控CEP55表达在肺腺癌中发挥重要作用。

  • 标签: 中心体蛋白55 肺腺癌 基因表达 信号通路
  • 简介:摘要目的探讨肌细胞增强因子(MEF)-2的基因多态性(SNP)与先天性心脏病(CHD)发生间的联系。方法收集广西医科大学第一附属医院心胸外科2020年4月至2020年9月50例无血缘关系的广西壮族CHD儿童患者的临床资料以及血液标本,同时随机选取50例无血缘关系的健康儿童做对照,提取外周血DNA,实验采用聚合酶链反应(PCR)-DNA检测技术,对50例对照组儿童与50例CHD患儿的基因MEF-2开展全部编码外显子,借助PCR技术进行相应片段的扩增,对扩增所得片段经由直接测序法完成测序,并对结果展开分析。应用SPSS 20.0统计软件分析,采用χ2检验检测等位基因与各基因型于2组研究对象间的频率分布,以P<0.05为差异有统计意义。结果在对MEF-2A基因突变的筛查中,未见明显突变。在1例患儿中的MEF-2A因子第3外显子区域内发现一个SNP位点,位于241位氨基酸(半胱氨酸)密码子的第三位碱基C-T,即c.241C>T,属于同义突变。2组之间未见显著不同表现(基因型频率对比χ2=0.659,P>0.05;等位基因频率对比χ2=0.022,P>0.05),差异无统计学意义。在观察组和对照组之间SNP位点,CHD组的T等位基因携带率(T=84%)明显高于对照组(T=65%),比值比(OR)为0.354。结论MEF-2A基因SNP位点的T等位基因可能是影响广西壮族儿童CHD产生的危险因素。

  • 标签: 先天性心脏病 基因突变