简介:摘要目的评价Luminex NxTAGTM RPP对17种呼吸道病原体的检测性能。方法通过比较Luminex NxTAGTM RPP试剂盒与一代测序检测临床标本的结果,以评价Luminex NxTAGTM RPP试剂盒的检测性能。结果与一代测序相比,Luminex NxTAGTM RPP试剂盒对流感病毒A型(FluA)、2009甲型H1N1流感病毒(H1N1pdm09)、H3N2亚型流感病毒(H3N2)、流感病毒B型(FluB)、副流感病毒2型(PIV 2)、副流感病毒3型(PIV 3)、副流感病毒4型(PIV 4)、肺炎衣原体(CP)和冠状病毒HKU1(CoV HKU1)检测具有高度一致性;对腺病毒(ADV)、冠状病毒229E(CoV 229E)、冠状病毒OC43(CoV OC43)、呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(RV)、博卡病毒(BoV)的检测结果具有中度一致性。然而对于副流感病毒1型(PIV 1)、偏肺病毒(MPV)两种方法检测一致性较差。结论Luminex NxTAGTM RPP试剂盒本身具有检测准确、高通量与操作时间短等特点,对大多数呼吸道病原体的检测表现出良好的性能。
简介:摘要目的使用Luminex NxTAG™ RPP试剂盒检测广州地区呼吸道感染样本,总结近一年广州地区呼吸道感染病原谱,为呼吸道感染临床诊疗和疾病防控工作提供参考依据。方法采集2018年12月到2019年11月广东省妇幼保健院和广东省第二人民医院共484例呼吸道感染样本,采用QIAamp MinElute Virus Spin Kit(50)进行总核酸提取,采用Luminex NxTAG™ RPP试剂盒检测样本中的病原体;采用Excel 2016对数据进行作图,采用SPSS19.0软件进行统计分析。结果在484份标本中,病原体核酸阳性样本有397份,总阳性率为79.96%,感染以甲型流感病毒2009型(influenza A H1N1pdm09 virus, H1N1 2009)、鼻病毒(rhinovirus, RhV)、偏肺病毒(metapneumovirus, MPV)为主。在年龄分布中,儿童组的H1N1 2009、合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)、副流感病毒(parainfluenza Virus, PIV)、MPV、RhV、博卡病毒(bocavirus,BoV)阳性率相对较高;成人组的乙型流感(influenza B virus,FLuB)阳性率相对较高。H1N1 2009、RSV、MPV、BoV在门诊患者中的阳性率较高;FLuB在住院患者阳性率相对较高。在不同症状的患者病原体检测中,咳嗽与咳痰症状患者的样本RSV阳性率较高;而鼻塞症状患者的样本冠状病毒(coronaviruses, CoV)、MPV、RhV阳性率较高。大多数病原体在冬春季检出率偏高。结论H1N1 2009、RhV、MPV为2019年广州呼吸道感染的重要病原体,加强对这些病原体的研究与监测,可作为广州呼吸道感染性疾病的防控重点。
简介:摘要目的了解广州市急性呼吸道感染病原体分布特征,为临床诊疗和预防控制提供病原学依据。方法收集广州市两家定点医院2018—2019年急性呼吸道感染病例的鼻咽拭子标本1 326份,通过一代测序确定病原体,检测范围包括甲型流感病毒(FluA)及其5个亚型、乙型流感病毒(FluB)、鼻病毒/肠病毒(HRV/EV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、副流感病毒(PIV)的4个亚型、人偏肺病毒(HMPV)、博卡病毒(HBoV)、冠状病毒(HCoV)的4个亚型、肺炎支原体(M.P)、肺炎衣原体(C.P),并结合流行病学信息进行统计分析。结果1 326例病例的总阳性率为72.93%,其中单一感染841例,混合感染126例。病毒阳性率排前三位的是FluA(43.97%)、ADV(9.20%)、HRV/EV(7.16%)。病毒在5~13岁组的阳性率最高,为80.00%。HRV/EV(P<0.01)、HBoV(P<0.01)、RSV(P<0.01)、ADV(P<0.01)、HCoV-OC43(P<0.01)易发生在混合感染中,差异有统计学意义。结论急性呼吸道感染与年龄、病原体有关。FluA、ADV、HRV/EV是广州地区急性呼吸道感染的主要病原体。
简介:摘要目的了解广东省发热呼吸道症候群病原谱及其流行特征,为疾病防控和临床诊疗提供参考依据。方法使用实时荧光聚合酶链式反应法,对1 891份鼻咽拭子进行病原体检测,采用卡方检验与Bonferronni两两比较法对不同的检出率进行比较。结果1 891份标本中,病毒核酸阳性样本有810例,总检出率42.78%;感染以副流感病毒(Parainfluenza virus, PIV)、鼻病毒(Rhinovirus, RhV)、冠状病毒(Coronavirus, CoV)为主。在年龄分布中,"<5岁"组与"5~岁"组病原体检出率偏高。不同症状的患者病原体检测,偏肺病毒(Metapneumovirus, MPV)在肺炎患者检出率相对较高;甲型流感病毒(Influenza virus A, FLuA)、PIV、CoV、RhV在非肺炎患者检出率较高;FLuA与腺病毒(Adenovirus, ADV)在高热与超高热组的检出率相对较高;CoV与肺炎支原体(Mycoplasma pneumonia, MP)在中度发热组的检出率相对较高;PIV在咳嗽患者检出率相对较高。多个病毒流行具有较强的季节性,普遍在冬春季检出率较高;在不同年份,不同的病毒检出率有较强规律性。结论PIV、RhV、CoV为广东省近年呼吸道感染的主要病原体。