简介:人参皂苷为人参主要的药理活性组成部分,通过水解二醇系人参皂苷的糖苷配基是制备稀有人参皂的常用方法。酶法转化因其底物高度专一、条件温和、副产物少等潜在优势而被作为结构修饰和生理研究的主要技术手段。本文主要对糖苷酶转化人参皂苷研究进展进行了综述,为其工业化生产高活性皂苷提供理论依据。
简介:目的:随着人参药用和保健价值的不断发掘,人参皂苷引起人们越来越多的关注,但有关人参皂苷与肠道菌群之间相互作用的研究仍为空白领域,本实验旨在探明人参皂苷对小鼠肠道菌群的影响,以期为人参皂苷的推广应用提供理论基础和实验依据。方法:有机溶剂法提取人参皂苷,将正常BALB/c小鼠按2mg/0.1kg人参皂苷进行连续灌胃饲养,分别在灌胃第10d和第13d无菌收集小鼠粪便,提取肠道细菌基因组总DNA,应用PCR-DGGE技术获得肠道菌群分子指纹图谱,进行菌群结构相似性、多样性分析,并将感兴趣的优势条带进行切胶、测序分析,对获得的序列在GeneBank数据库比对。结果:灌胃人参皂苷后小鼠肠道菌群结构发生改变,荧光假单胞菌和丁酸梭菌数量明显增加。结论:人参皂苷使小鼠肠道的菌群结构和数量发生明显改变,天然的人参皂苷口服很难被直接吸收利用,因此推测人参皂苷可能以肠道菌群作为发挥生物学作用的靶点,进而行使提高健康水平等保健功能。
简介:G-proteincoupledreceptors(GPCRs)representoneofthemostimportantclassesofdrugtargetsforpharmaceuticalindustryandplayimportantrolesincellularsignaltransduction.PredictingthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsisvitalforfurtherunderstandingthemechanismofsignaltransductionandthefunctionofthereceptorswithinacell,whichcanprovidenewcluesforpharmaceuticalresearchanddevelopment.Inthisstudy,thefeaturesofaminoacidcompositionsandphysiochemicalpropertiesofthefull-lengthGPCRsequenceshavebeenanalyzedandextracted.Basedonthesefeatures,classifiershavebeendevelopedtopredictthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsusingsupportvectormachines.Thetestingresultsshowthatthismethodcouldobtainbetterpredictionaccuracy.
简介:目的通过对生活在同一家庭患有体癣的患者、家庭成员和所养宠物进行观察和分析,探讨人畜共患癣病的常见致病菌种以及治疗方案。方法收集2005年3月~2009年1月就诊于我院因接触宠物而致病的体癣患者,对其宠物的带菌情况进行调查,确诊后给予外用特比萘芬乳膏或联苯苄唑凝胶,未愈者给予口服伊曲康唑治疗。结果共收集15例患者,真菌培养结果显示8例为石膏样小孢子菌,4例为须癣毛癣菌,3例为犬小孢子菌。患者皮损真菌培养结果和所养宠物皮损真菌培养结果一致。按上述方法对患者及其宠物进行治疗,所有患者和10只(3只被丢弃)宠物全部治愈。结论15例人畜共患体癣中,石膏样小孢子菌感染所致的比例最高,其次是须癣毛癣菌和犬小孢子菌,外用特比萘芬乳膏或联苯苄唑凝胶以及口服伊曲康唑胶囊可以有效治疗此类人畜共患皮肤癣菌病。
简介:Allelefrequenciesfor15shorttandemrepeat(STR)loci(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,vWA,TPOX,D18S51,D5S818,andFGA)wereobtainedfrom7,636unrelatedindivid-ualsofChineseHanpopulationlivinginQinghaiandChongqing,China.Totally206alleleswereobserved,withthecorrespondingallelefrequenciesrangingfrom0.0001–0.4982.Chi-squaretestshowedthatalloftheSTRlociagreedwiththeHardy-Weinbergequilibrium.Wealsocomparedourdatawithpreviouslypub-lishedpopulationdataofotherethnicsorareas.TheresultsarevaluableforhumanidentificationandpaternitytestinginChineseHanpopulation.
简介:目的:探讨人参皂苷对骨肉瘤患者血清血管内皮生长因子(VEGF)、肿瘤特异性生长因子(TSGF)的影响及临床疗效。方法:收集我院收治的骨肉瘤患者60例,根据用药不同分为对照组和实验组,每组30例。对照组采用FOLFOX4方案化疗,实验组在对照组基础上加用人参皂苷治疗。观察并比较两组患者治疗前后的肿瘤体积、血清VEGF及TSGF水平变化以及临床疗效。结果:与治疗前比较,两组患者治疗后的肿瘤体积均显著减小,血清VEGF及TSGF水平均显著下降,差异具有统计学意义(P〈0.05);与对照组相比,实验组患者治疗后肿瘤体积减小更明显,血清VEGF及TSGF水平下降更显著,差异具有统计学意义(P〈0.05);实验组患者治疗总有效率(80.0%)显著高于对照组(46.67%),差异具有统计学意义(P=0.009)。结论:人参皂苷能够显著降低骨肉瘤患者血清VEGF及TSGF水平,减小肿瘤体积,临床疗效显著。
简介:目的:对目前研究较为广泛的miR-15a的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,以期为miR-15a靶基因的实验验证提供数据支持,并为深入研究miR-15a的调控机制及生物学功能奠定基础和提供理论指导。方法:选择TargetScan5.1与PicTar两种计算方法预测miR-15a的靶基因的交集作为分析的基因集合,分别进行GO注释描述、GO富集分析和生物通路富集分析。结果与结论:预测靶基因集合分别富集在转录调控、蛋白质修饰、细胞周期等生物学过程和蛋白激酶活性等分子功能上(P〈0.01);经典miR-15a预测靶基因集合显著富集于KEGG通路数据库中的Wnt信号通路、细胞周期和p53信号通路等5个信号转导通路及前列腺癌、慢性髓细胞性白血病、黑素瘤等7个疾病通路中(P〈0.05)。
简介:东方田鼠(Microtusfortis)分布于我国东北、西北、华中、华南17个省区,在韩国及俄罗斯也见报道.国内对该鼠的5个亚种,即指名亚种(M.f.fortis)(西北)、东北亚种(M.f.pelliecus)、辽宁亚种(M.f.dolichocephalus)、长江亚种(M.f.calamorum)和福建亚种(M.f.fujianensis)(华南),作过一般生物学描述[1],对于东方田鼠研究得较多的是长江亚种,60年代有人对该种动物的生态学特点进行了报道,近期对洞庭湖区东方田鼠的种群动态、繁殖特性、迁移行为也有系列研究[2],特别是该种动物具有对日本血吸虫天然抗感染性,引起了学术界的广泛兴趣,本研究通过对人工繁殖的东方田鼠的细胞遗传学的观察,了解该种动物的染色体数目的范围、染色体核型以及染色体G带特征.
简介:Microarrayhasbecomeapopularbiotechnologyinbiologicalandmedicalresearch.However,systematicandstochasticvariabilitiesinmicroarraydataareexpectedandunavoidable,resultingintheproblemthattherawmeasurementshaveinherent"noise"withinmicroarrayexperiments.Currently,logarithmicratiosareusuallyanalyzedbyvariousclusteringmethodsdirectly,whichmayintroducebiasinterpretationinidentifyinggroupsofgenesorsamples.Inthispaper,astatisticalmethodbasedonmixedmodelapproacheswasproposedformicroarraydataclusteranalysis.TheunderlyingrationaleofthismethodistopartitiontheobservedtotalgeneexpressionlevelintovariousvariationscausedbydifferentfactorsusinganANOVAmodel,andtopredictthedifferentialeffectsofGV(genebyvariety)interactionusingtheadjustedunbiasedprediction(AUP)method.ThepredictedGVinteractioneffectscanthenbeusedastheinputsofclusteranalysis.Weillustratedtheapplicationofourmethodwithageneexpressiondatasetandelucidatedtheutilityofourapproachusinganexternalvalidation.
简介:Annotationsofcompletegenomesequencessubmitteddirectlyfromsequencingprojectsarediverseintermsofannotationstrategiesandupdatefrequencies.Theseinconsistenciesmakecomparativestudiesdifficult.Toallowrapiddataprepara-tionofalargenumberofcompletegenomes,automationandspeedareimpor-tantforgenomere-annotation.Hereweintroduceanopen-sourcerapidgenomere-annotationsoftwaresystem,Restauro-G,specializedforbacterialgenomes.Restauro-Gre-annotatesagenomebysimilaritysearchesutilizingtheBLAST-LikeAlignmentTool,referringtoproteindatabasessuchasUniProtKB,NCBInr,NCBICOGs,Pfam,andPSORTb.Re-annotationbyRestauro-Gachievedover98%accuracyformostbacterialchromosomesincomparisonwiththeoriginalmanuallycuratedannotationofEMBLreleases.Restauro-GwasdevelopedinthegenericbioinformaticsworkbenchG-languageGenomeAnalysisEnvironmentandisdistributedathttp://restauro-g.iab.keio.ac.jp/undertheGNUGeneralPublicLicense.
简介:heterotrimericguanine核苷酸绑定蛋白质(G蛋白质)被表明了各种各样的发信号调停在植物的小径。然而,它在发信号的phytochromeA(phyA)的角色留下逃犯。在这研究,我们发现新调停phyA的显型指明了far-red照耀(FR)preconditioned房间死亡,它仅仅在跟随暴露到白光(WL)的FR-grown幼苗的胚轴发生。房间死亡在G变异的gpa1被减轻,但是与野类型(WT)比较在G变异的agb1加重了,在调停phyA的房间死亡小径的GPA1和AGB1的对抗角色的陈述语气。进一步的调查显示nonphotoconvertibleprotochlorophyllide(Pchlide633)的导致FR的累积,在暴露上产生反应的氧种类(ROS)到WL,为前提FR的房间死亡被要求。而且,ROS主要在叶绿体被检测用荧光灯探查。有趣地,到黑暗成年的幼苗的H2O2的申请导致类似于前提FR的房间死亡的显型。这表明ROS是为房间死亡的一个批评调停人。另外,我们观察到agb1比WT幼苗对H2O2更敏感,显示G蛋白质可以也修改到ROS应力的幼苗的敏感。一起拿这些结果,我们推断G蛋白质可以涉及表明小径调整Arabidopsis胚轴的前提FR的房间死亡的phyA。在phyA位于G蛋白质的参与下面发信号的可能的机制在这研究被讨论。
简介:Thestudyofsmalldrugmoleculesinteractingwithnucleicacidsisanareaofintenseresearchthathasparticularrelevanceinourunderstandingofrelativemechanisminchemotherapeuticapplicationsandtheassociationbetweengenetics(includingsequencevariation)anddrugresponse.Inthiscontribution,wedemonstratehowthesequence-specificbindingofananticancerdrugDacarbazine(DTIC)tosinglebase(A-G)mismatchcouldbesensitivelydetectedbycombiningelectrochemicaldetectionwithbiosensingsurfacebasedongoldnanoparticles.
简介:UnderstandingthecouplingspecificitybetweenGprotein-coupledreceptors(GPCRs)andspecificclassesofGproteinsisimportantforfurtherelucidationofreceptorfunctionswithinacell.IncreasinginformationonGPCRsequencesandtheGproteinfamilywouldfacilitatepredictionofthecouplingpropertiesofGPCRs.Inthisstudy,wedescribeanovelapproachforpredictingthecouplingspecificitybetweenGPCRsandGproteins.ThismethodusesnotonlyGPCRsequencesbutalsothefunctionalknowledgegeneratedbynaturallanguagepro-cessing,andcanachieve92.2%predictionaccuracybyusingtheC4.5algorithm.Furthermore,rulesrelatedtoGPCR-Gproteincouplingaregenerated.Thecom-binationofsequenceanalysisandtextminingimprovesthepredictionaccuracyforGPCR-Gproteincouplingspecificity,andalsoprovidescluesforunderstandingGPCRsignaling.
简介:AcomputationalsystemforthepredictionandclassificationofhumanG-proteincoupledreceptors(GPCRs)hasbeendevelopedbasedonthesupportvectormachine(SVM)methodandproteinsequenceinformation.ThefeaturevectorsusedtodeveloptheSVMpredictionmodelsconsistofstatisticallysignificantfeaturesselectedfromsingleaminoacid,dipeptide,andtripeptidecompositionsofproteinsequences.Furthermore,thelengthdistributiondifferencebetweenGPCRsandnon-GPCRshasalsobeenexploitedtoimprovethepredictionperformance.ThetestingresultswithannotatedhumanproteinsequencesdemonstratethatthissystemcangetgoodperformanceforbothpredictionandclassificationofhumanGPCRs.
简介:目的:利用慢病毒载体建立稳定表达猪载脂蛋白BmRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(pAPOBEC3F,简称pA3F)的PK15细胞系。方法:以实验室前期构建的pBPLV-flag-pA3F质粒为模板,PCR扩增pA3F基因,克隆到pLenti-Puro-3Flag载体构建成pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒,Western印迹鉴定其在HEK293T细胞中的表达;将pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒与包装载体共转染HEK293T细胞,包装成Lenti-pA3F慢病毒并测定病毒滴度;将Lenti-pA3F慢病毒感染PK15细胞,通过嘌呤霉素压力筛选并结合有限稀释法,筛选稳定表达pA3F的细胞单克隆株,最终Western印迹检测细胞单克隆株中pA3F的表达。结果:菌落PCR和序列测定表明pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒构建正确,Western印迹显示该质粒可在HEK293T细胞中表达pA3F蛋白;包装了Lenti-pA3F慢病毒,滴度为1.32×10^8TU/mL,慢病毒感染PK15细胞后可检测到pA3F蛋白的表达;经Western印迹鉴定,筛选得到的单克隆细胞可稳定表达pA3F蛋白。结论:建立了稳定表达pA3F的PK15细胞单克隆株,为进一步深入研究猪内源性反转录病毒在pA3F作用下的免疫逃逸机制奠定了基础。