简介：摘要目的分析浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1，HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征，为疫情流行趋势和防治提供依据。方法纳入2018年8月至2019年12月绍兴市新确证未经抗病毒治疗的423份HIV-1感染/艾滋病病例血液样本，获得375份样本序列，采用反转录聚合酶链反应和巢式聚合酶链反应扩增HIV-1的pol基因，采用MEGA 6.0软件构建系统进化树分析亚型，并采用HyPhy软件和Cytoscape 3.7.2。生成不同基因距离的分子网络，通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点。结果375份样本序列中发现8种亚型，优势亚型为流行重组型(circulating recombinant form, CRF)07_BC 215份(57.33%)，CRF01_AE 103份(27.47%)，其他包括CRF08_BC、CRF85_BC、CRF55_01B、B、C和CRF01_AE/B亚型。在基因距离为1.50%时，共形成24个分子簇，194条序列入网，入网率为51.73%。在分子簇最多的0.75%基因距离时，共形成30个分子簇，129条序列入网，入网率为34.40%，35例以老年人为主的病例聚集成CL1簇。42份样本存在监测性耐药突变(surveillance drug resistance mutation, SDRM)，耐药传播率为11.20%(42/375)，其中非核苷类反转录酶抑制剂耐药突变38例，分别为K103N(32/375，8.53%)、K103S(4/375，1.07%)、Y188L(1/375，0.27%)和G190A(1/375，0.27%)，蛋白酶抑制剂耐药突变4例，分别为M46I(3/375，0.80%)和V82A(1/375，0.27%)。分子簇C2序列携带高比例耐药突变(94.29%，33/35)。结论绍兴市HIV-1亚型丰富多样，CRF07_BC亚型传播迅速；在0.75%基因距离仍聚集的CL1簇老年病例亟待干预，防止该耐药毒株的进一步快速传播。

简介：摘要心血管疾病发病率高，是世界范围内重大的公共卫生问题，长链非编码核糖核酸(lncRNA)在心血管疾病的基因编程和基因调控中扮演着重要角色。lncRNA母系表达基因3(MEG3)是近年来发现的非编码核糖核酸，其在冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)患者中表达异常，在CHD发生发展及疾病的诊断和预测方面具有重要价值，与CHD的严重程度及预后相关，可以作为CHD的临床诊断标志物及治疗靶点。lncRNA MEG3通过调节内皮损伤、心肌凋亡、动脉粥样硬化、炎症反应等病理改变，在CHD中发挥作用，然而MEG3调控CHD的确切分子机制尚处于初步研究阶段，未来需要进一步验证这些基因通路。本文对lncRNA MEG3信号通路调控CHD的研究进展作一综述。

简介：摘要目的利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）及实验验证寻找RA相关的关键基因。方法从GEO数据库下载了RA患者基因芯片数据，构建基因网络，利用WGCNA将基因划分为不同的模块，将与RA临床症状相关的模块中的关键基因进行了基因本体论分析。随后使用GEO不同的数据集用受试者工作特征曲线（ROC）评价关键基因对RA诊断的准确性。此外，还通过实时荧光定量反转录PCR（RT-PCR）及蛋白质印迹法验证关键基因在RA中的表达，分析其与DAS28的关系。采用配对样本t检验和Pearson相关性分析对结果进行分析。结果共筛选出5 413个基因构建了加权基因共表达网络，将基因分为23个模块。其中，黑色模块与RA临床症状密切，包含346个基因。富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路分析显示其要富集于对IL-6的正调控、IL-1β分泌、破骨细胞分化、NOD样受体信号通路、辅助性T细胞（Th）17细胞分化等多个与RA密切相关的通路。其中运动性精子结构域包含蛋白2（MOSPD2）与临床症状具有明显相关性，在血液单核细胞、骨髓单核细胞中高表达（t=2.238，P=0.032；t=3.153，P=0.006），在RA关节滑膜液中与血液中表达呈正相关（r=0.683，P=0.03）。ROC曲线分析表明，MOSPD2能区分RA和对照组（曲线下面积分别为0.855和0.726）。RT-PCR及蛋白质印迹法结果显示，MOSPD2在RA患者中表达上调（t=-3.96，P=0.02）。MOSPD2在血液中的表达水平与RA患者的DAS28呈正相关（r=0.8846，P=0.0462）。结论MOSDP2与RA患者临床症状密切相关，可能是诊断及治疗RA的靶点之一。