简介：【摘要】转录组测序（RNA-seq）是生物医学研究的重要手段之一，对数据进行质量控制，剔除质量异常样本，是保证生物学结果准确的必要前提。然而，现有的质量控制工具都局限于单个样本或单一数据层面，不利于分析人员多角度发现异常样本。本研究基于R语言开发了RawdataQC软件包，可以在原始数据、比对数据和基因表达谱三个层面对多个样本进行质量控制；通过可视化方法，帮助使用者综合多个数据层面发现低质量样本。本研究将助力广大临床医生和研究者开展转录组数据质量控制，为生物学结果准确提供质量保证。

简介：

简介：摘要 目的：探究基因组DNA污染及乳腺癌单样本预测器(single sample predictor, SSP)在RNA-seq中鉴定Basal-like亚型乳腺癌的一致性与稳健性。方法：使用4种SSP联合3种数据校正方法，按比例随机去掉一定比例的非Basal-like亚型样本，并使用正态分布模拟基因组DNA对基因表达量的影响。结果：数据校正方法影响乳腺癌SSP鉴定Basal-like亚型的一致性(κ=0.733-0.964)；乳腺癌SSP可以一致鉴定出Basal-like亚型(κ=0.846-0.958)，对Basal-like亚型鉴定的稳健性高；基因组DNA污染对Basal-like亚型鉴定的一致性影响较小(κ=0.922-1)。结论：Basal-like亚型的鉴定具有高度的一致性与稳健性且受基因组DNA污染影响较小。

简介：【摘 要】目的：分析免疫组化措施实施后，肝癌患者诊断效果，对上述方案的应用价值进行评估。方法：选择我院100例肝癌患者（原发性肝癌、继发性肝癌各50例）作为此次研究样本，入选时间：2020年12月-2021年8月，随后选取同期入院接受健康体检者50例的数据资料与之进行对比，肝癌患者肿瘤组织行GPC-3免疫组化诊断措施，将上述患者设置为原发性肝癌组、继发性肝癌组、对照组。对比上述措施的临床效果。结果：AFU（α-L岩藻糖苷酶）、sF（血清铁蛋白）、AFP（血清甲胎蛋白）、CAl9—9（唾液酸化的乳-N-岩藻戊糖II）的平均检测水平对比结果显示，原发性肝癌组、继发性肝癌组均显著高于对照组，P