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  • 简介:目的使用影像方法构建一个影像标签分类模型,对肺肿瘤良恶性进行分类预测。方法分析四川大学华西医院80例怖肿瘤患者的CT影像数据,分割肿瘤区域,提取肿瘤形状、大小、强化程度、纹理和小波变换共485个影像特征。利用Lasso算法筛选出与肿瘤良恶性鉴别最密切的特征,并使用Logistic回归构建诊断肿瘤良恶性的预测模型。采用受试者工作特征(receiveroperatingcharacteristic.ROC)曲线及其曲线下面积(areaundercurve,AUC)来评估该影像标签在训练集和验证集中的效能。结果选取3个影像特征构建出影像标签,具有很好的预测分类效果。训练集的AUC为0870(95%CI:0760-0978J,灵敏度为0.870,特异度为0.818;验证集的AUC为0.853(95%CI:0.717-0.989),灵敏度为0.882,特异度为0.778。结论随着CT在临床诊断中的广泛使用,真有望成为辅助检测肿瘤良恶性的非侵入手段。

  • 标签: 影像组学 肺肿瘤 良恶性预测 Lasso算法
  • 简介:目的:探讨基于影像的肺结节恶性程度预测。方法:对肺部图像影像数据库(TheLungImageDatabaseConsortium,LIDC)-IDRI(ImageDatabaseResourceInitiative)中604例肺结节患者的CT图像进行分析,其中含肺结节的CT图像共2803幅,医师手工勾画肺结节轮廓。根据肺结节诊断标准,共提取96个灰度、形态和纹理高通量特征,输入基于随机森林的多类分类器进行恶性程度预测。恶性程度分为5级,以数字1~5表示。随机选取1000幅CT图像作为训练样本,剩余的1803幅CT图像作为测试样本,实验重复10次。结果:对于单个肺结节,5类恶性程度的平均预测准确率为77.85%。对于每一类预测,曲线下面积(areaundercurve,AUC)均在0.94以上。对于每例患者,肺结节恶性程度的预测准确率为75.16%。结论:该研究提出的基于影像的方法对肺结节恶性程度的预测性能良好,可为临床诊断提供可靠的辅助信息,以利于早期发现病灶。

  • 标签: 肺结节 CT图像 随机森林 影像组学
  • 简介:近年来,急性中毒事件的发生率呈不断上升趋势,突发群体性中毒事件也时有发生。急性中毒属于急诊工作重要组成部分,但其临床检测及诊断一直存在困难。代谢作为毒性评价手段具有其独特的优势:①检测样品多为外周性生物体液(如血、尿),并且同一动物或人体可连续观察并多次获取毒物作用后发生、发展、恢复甚至治疗干预等过程的样品;②样品处理相对简单,大多在适当处理后可直接进样;③可根据代谢图谱在不同时期或状态的变化发现毒物的代谢轮廓及特征性生物标志物,且这些标志物的出现一般要早于传统的病理学终点;④生物样品中的生物标志物往往表征着特定部位或代谢途径的损伤,因而可以较好的了解毒物作用部位及其作用过程。

  • 标签: 代谢组学 急性中毒
  • 简介:摘要影像基因用影像方法探索影像特征与基因表达模式之间的联系,具有无创、能显示肿瘤整体信息的特点。影像的应用对预测非小细胞肺癌(NSCLC)的基因突变具有一定作用,是近年来研究的热点。影像特征与常规影像特征、临床特征等联系起来,可提供肿瘤的多方位信息,在NSCLC驱动基因表型的预测和精准治疗中将发挥越来越重要的作用。

  • 标签: 癌,非小细胞肺 受体,表皮生长因子 间变性淋巴瘤激酶 KRAS基因 影像组学
  • 简介:摘要:代谢可在整体水平上定量考察饮食、生活习惯、生物活性物质和肠道菌群等引起的身体代谢的细微动态变化,有望为营养需求研究、营养流行病与其相关疾病研究提供新的策略。

  • 标签: 代谢组学 临床营养 应用
  • 简介:摘要蛋白质技术有助于人类深入研究食物蛋白质活性成分、进行营养评价和营养相关疾病的生物标记、揭示营养素代谢与调控机制等,在营养研究中具有广泛的应用前景。笔者综述了蛋白质在营养中取得的应用价值及成就,以及蛋白质技术在营养相关疾病如糖尿病、肥胖、心血管疾病及衰老方面的研究应用。

  • 标签: 蛋白质组学 营养学
  • 简介:摘要社区获得性肺炎(community acquired pneumonia,CAP)是5岁以下儿童死亡的重要原因,病毒和细菌均是常见病因。目前关于儿童CAP病原精准诊断仍是临床中的挑战。临床中病原诊断主要通过采集各类样本(如鼻咽拭子、痰、血液、体液等)进行病原检测,如抗原、抗体、培养、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测等。不同样本及不同检测方法各有优劣,尤其是病毒性肺炎和细菌性肺炎的诊断,对于治疗措施存在很大差异。为了早期识别不同病原,减少抗生素的不合理应用,临床医生及科研工作者仍在不断探索早期准确的病原诊断。代谢是一个快速发展的领域,它旨在识别和量化所有代谢物的浓度变化或模型系统中的代谢。大多数疾病状态与代谢稳态有关,代谢能为发现新的生物标记物提供线索,也用于不同病原体所致感染的研究,非靶向代谢学分析为儿童CAP的病因提供新的诊断思路。

  • 标签: 细菌 生物标志物 社区获得性肺炎 质谱 病毒
  • 简介:目的:探索影像在甲状腺癌中的应用价值。方法:选择于复旦大学附属肿瘤医院手术的77例甲状腺乳头状癌单灶患者的病灶超声图像,进行影像特征研究并判断有否淋巴结转移,并与病理结果进行比较。结果:77例患者中,淋巴结转移27例,超声术前发现4例;淋巴结未转移50例,超声术前发现47例。通过影像方法判断病灶淋巴结有无转移,对照病理结果,准确率为73.1%,灵敏度为71.4%,特异度为74.0%。结论:影像在判断甲状腺乳头状癌淋巴结转移中有明确价值和极大潜力。

  • 标签: 甲状腺癌 影像组学 淋巴结转移
  • 简介:摘要胚胎植入依赖于良好的胚胎质量、子宫内膜容受性,及胚胎-子宫内膜间同步和谐地交流对话。相较于发展较成熟的胚胎培养技术,目前子宫内膜容受性仍缺乏有效的诊断与治疗方法,传统检测方法如胞饮突检测、组织检测、超声等,其准确性和可重复性饱受质疑。随着技术的发展,利用基因表达的整体特征描述、诊疗疾病已成为可能,其在子宫内膜容受性领域也具有较大的研究和临床运用价值。本文就近年来子宫内膜容受性领域转录临床研究作一综述,概括子宫内膜容受性相关编码基因、非编码基因研究的基本情况及临床运用情况,为后续研究子宫内膜容受性、指导临床诊疗提供参考。

  • 标签: 子宫内膜容受性 种植窗 转录组学 信使RNA 非编码RNA
  • 简介:摘要乳腺癌是威胁全球女性生命健康的最常见恶性肿瘤。影像作为目前研究的前沿领域,对乳腺癌的早期精准诊断和疗效评价具有很大的临床价值。关注肿瘤异质性的亚区域特征以及联合其他数据分析,为乳腺影像研究指明了新方向。现有影像模型与临床应用的需求仍存在差距,乳腺影像诊断医师应抓住机遇不断探索,努力实现影像和临床转化的双重突破。

  • 标签: 乳腺肿瘤 影像组学 研究现状
  • 简介:摘要细胞外囊泡(EV)能够携带包括核酸、蛋白和小分子代谢物在内的多种生物活性成分,其在肿瘤诊断与治疗中的价值已得到广泛认可。然而目前对于EV内含物的研究主要集中在RNA和蛋白质上,对于最能直接反映细胞状态的小分子代谢物在EV中的作用尚不明确。近年来EV代谢在肿瘤研究中逐渐受到了关注,尽管由于前处理复杂且代谢物含量较低,EV代谢研究仍存在诸多挑战,但其在调控肿瘤进展及作为肿瘤标志物方面的价值已逐步显现,有望为肿瘤的诊断与治疗提供新的靶点。

  • 标签: 细胞外囊泡 代谢组学 肿瘤
  • 简介:摘要随着基因芯片技术、RNA测序技术等转录技术发展,特应性皮炎(AD)发病中重要的相关影响因素逐渐被揭示,如不同T辅助(Th)细胞的亚型以及其他免疫相关细胞如巨噬细胞、朗格汉斯细胞;在AD的瘙痒及皮肤屏障破坏方面,相关免疫细胞如Th2细胞及角质形成细胞等所释放白细胞介素4、白细胞介素13、聚丝蛋白、兜甲蛋白等活性物质的异常变化起着主要作用。同时,转录技术已被用于分析患者治疗前后转录谱的变化从而对患者的病情和治疗效果进行评估等。本文总结近年来在AD转录方面的研究进展。

  • 标签: 皮炎,特应性 转录组 芯片分析技术 RNA测序技术
  • 简介:摘要影像可从医学图像中高通量地提取影像特征进行定量分析,进而量化肿瘤异质性,无创地评估肿瘤的生物学行为。近年来,影像在核医学领域尤其是PET中的应用发展迅速。该文对基于PET的影像在肿瘤鉴别与预后评估方面的应用及面临挑战与前景进行论述,以提高对PET影像的认识。

  • 标签: 肿瘤 正电子发射断层显像术 影像组学 发展趋势
  • 简介:摘要蛋白质是近年来研究的热点,蛋白质的概念在1994年由Marc Wikins首次提出,但蛋白质可以追溯到18世纪90年代中期甚至更早。在19世纪初,随着各种技术的成熟,经过各国科学家的讨论,提出了蛋白质的概念。蛋白质水平的变化提供了某些疾病的变化信息,因此,可以通过蛋白质技术,测定蛋白质水平的变化,进而研究疾病,描述生物体或器官的功能状态。随着蛋白的发展,越来越多的人将蛋白学运用到医学方面,包括对疾病的预测和诊断。本文主要总结和归纳了蛋白质在肾脏疾病方面的应用。

  • 标签: 肾疾病 蛋白质组学 生物标记
  • 简介:摘要心肌梗死是一种常见的心血管疾病,具有很高的致死率。早已有研究证明心肌梗死等心血管疾病与代谢异常相关。代谢是继基因,转录和蛋白之后发展的一门检测机体内代谢物变化的新兴技术,可用来发现疾病的潜在标志物,揭示疾病的病理机制和发现药物作用靶点等以应用到临床的预防和诊疗中。近年来代谢已被应用在心肌梗死的研究领域,现就代谢在心肌梗死中的应用进行综述,以期为预防和诊治心肌梗死提供更多思路。

  • 标签: 心血管疾病 心肌梗死 代谢组学
  • 简介:摘要新型冠状病毒肺炎疫情正成为全球关注的焦点。作为一种新发现的病毒,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的来源、是否变异、感染途径等问题尚待研究。此文通过对GISAID平台发布中的SARS-CoV-2核苷酸序列进行分析,并就目前关于SARS-CoV-2的病毒起源、核酸序列、遗传关系、传播途径和感染机制等分子生物方面的研究结合笔者对基因序列分析进行了综述。

  • 标签: 冠状病毒属 来源 变异 生物信息学
  • 简介:1概述药物基因(Pharmacogenomics/Pharmacogenetics,PGx)的概念已存在数十年,其主要目的是明确个体间药物反应差异的重要基因变异。测序技术、生物信息技术和计算技术的突破使得PGx研究在近2年来取得了令人瞩目的成就。

  • 标签: 药物基因组学 电子病历 顶层设计 位点变异 表型组 测序技术
  • 简介:摘要支气管哮喘(哮喘)是全球常见的慢性呼吸系统疾病,具有高度的异质性,其主要特征为呼吸症状既往史和可逆性呼气气流限制。目前对于哮喘的分型、诊断和管理都仍在探索中。作为后基因代表性技术,代谢能够广泛分析样本中内源和外源性的低相对分子质量代谢物(<1 500)。因哮喘异质性高,在哮喘的基础研究中有独特优势,代谢能够更敏感地捕捉哮喘患者体内的代谢波动和病理变化。本文综述了2013年以来,重点综述了2016年之后基于代谢在哮喘方面的研究进展,其中包括对哮喘诊断、分型、评估和应用药物。

  • 标签: 代谢 哮喘 质谱法
  • 简介:代谢是近年来新发展起来的一门,已成为生物医学研究领域的新热点。由于其广泛的应用前景,目前已是系统生物的重要组成部分。肝损伤及肾损伤是临床常见的危害人类健康的疾病,但目前的指标缺乏特异性,且灵敏度不高,造成临床上难以对肝肾损伤做出准确而及时的预警和监测。代谢能从代谢的角度整体分析疾病,快速、安全地对疾病的严重程度进行判别,在肝肾损伤的早期诊断等方面的研究已初显优势。本文主要综述了代谢技术在肝肾损伤研究中的应用现状。

  • 标签: 代谢组学 肝损伤 肾损伤 进展
  • 简介:摘要影像是通过多种技术从图像中提取病灶的纹理、形态等定量特征以量化肿瘤异质性的一种技术,已逐步运用于肝内胆管细胞癌的诊断、生物学行为预测及治疗后评估等方面。但肝内胆管细胞癌影像仍存在数据质量参差不齐、提取的特征缺乏一定稳定性和可重复性、推广适用性较差等局限。作者就影像在肝内胆管细胞癌中的应用展开综述。

  • 标签: 肝内胆管细胞癌 影像组学 体层摄影术,X线计算机 磁共振成像