简介:高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。
简介:传统抗菌剂(抗生素和化学合成药)添加剂常能产生耐药性,且易残留于肉、蛋、奶等畜产品中,给人类健康造成危害,因此很多国家已禁止人畜共用的抗生素类及磺胺类药物作为饲料添加剂使用,并都在寻找改进和替代抗生素等添加剂。我国传统的天然中药添加剂因具成本低廉、作用广泛、毒副作用小、无耐药性和低残留等优点而倍受重视。笔者选取资源较广价格较价廉的广东土牛膝、穿心莲、大青叶、锁阳、淫羊藿和胡芦巴等6种药材组方,通过饲养试验筛选出3个具有良好促进肉鸡生长的复方(①穿心莲-大青叶-锁阳-胡芦巴、②广东土牛膝-大青叶-锁阳-淫羊藿和③广东土牛膝-大青叶-胡芦巴-淫羊藿)。其中①号复方在添加量为1.5%时可提高黄羽肉鸡增重8%,降低耗料增重比6%;②号复方在添加量为1.0%时可提高0周~3周黄羽肉鸡增重9%和降耗料增重比6%,提高4周-7周龄黄羽肉鸡增重26%和降耗料增重比19%;③号复方在添加量为1.0%时可提高0周-3周黄羽肉鸡增重3%和降耗料增重比2%,提高4周-7周龄黄羽肉鸡增重22%及降低耗料增重比16%。