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  • 简介:桔小实蝇是重要柑橘害虫,目前已对多种杀虫剂产生不同程度抗性,化学防治方法往往效果不理想,近年来植物转基因抗虫育种技术表现出巨大潜力,这为更好地防治桔小实蝇提供了新思路。本研究为获得桔小实蝇抗性转基因柑橘,桔小实蝇细胞色素P450基因(cytochromeP450monoxygenases,P450)电压门控钠离子通道基因(sodiumchannel,SC)进行核苷酸序列比对,分别克隆得到片段大小为590bp550bpP450基因SC基因正反目标片段,利用植物表达载体pFGC5941,将基因正反向片段与Intron两端连接,成功构建RNA干扰(RNAi)载体"pFGC-P1F1R1/P2F2""pFGC-C1R1/C2R2"。本研究利用XhoⅠ-NcoⅠ、XbaⅠ-BamHⅠ酶切位点对质粒载体进行双酶切分析实验,克隆测序得到大小为590bp550bp两个酶切片段,经核苷酸序列比对分析,验证其与插入片段一致,说明RNAi载体构建成功。通过农杆菌遗传转化体系,将外源重组载体整合到柑橘基因组中,经除草剂筛选、PCR检测分别得到12株转P450基因阳性苗9株转钠离子通道基因阳性苗,这为后期柑橘抗桔小实蝇效果评价提供了实验材料。

  • 标签: 桔小实蝇 P450基因 钠离子通道基因 RNAI载体 遗传转化
  • 简介:第十一届国际植物组织培养生物技术大会(简称IAPTC&B)定于2006年8月13-18日在北京举行。大会主席:许智宏(北京大学校长),大会秘书长:李家洋(中国科学院副院长),组委会主席:薛勇彪(中国科学院遗传发育所所长),大会财经委员会主席:朱祯(中国科学院生物局副局长)。

  • 标签: 植物组织培养 生物技术 北京大学 国际 中国科学院 主席
  • 简介:出于对转基因作物中标记基因安全性考虑,植物转基因育种中标记基因删除将成为未来研究热点之一。位点特异性重组系统之一Cre/loxP系统是目前在植物遗传转化中应用较多,较成熟一个标记基因删除系统。为了利用Cre/loxP系统构建一种可调控标记基因删除系统,本研究首先从拟南芥中克隆了逆境诱导型启动子rd29A,同时从质粒pCre上克隆了Cre基因,构建了含有rd29A:Cre:Tnos表达元件中间载体,将这一表达元件插入到另一植物双元表达载体pKsb中,最终构建了含有loxP-Pnos—nptⅡ-Toes—rd29A—Cre-Tnos-loxP可诱导型删除标记基因nptⅡ植物双元表达载体。

  • 标签: CRE/LOXP系统 RD29A启动子 诱导型标记基因删除系统
  • 简介:为丰富太子参分子标记库、开发太子参SSR标记、寻找有效太子参种源鉴定方法。本研究运用MISA、Primer3等分子生物学分析工具,从太子参转录组中搜索获得11297个SSR位点,其出现频率为8.87%,分布距离为平均每10kb有1.47个SSR位点,其中主要重复类型是单核苷酸重复;11297个SSR位点中不同核苷酸基序类型SSR有259种,主要以单核苷酸重复基序A/T为主,其次是三核苷酸重复基序AAT/ATT。在此基础上设计、筛选得到16821特异性引物,其中针对高多态性SSR序列引物有8706,随机挑选其中20引物来源于贵州、江苏、福建6个太子参样品DNA进行PCR扩增,其扩增成功率达70%~80%。太子参转录组SSR分布密度大、类型丰富、多态性潜能高、通用性好,可为开发太子参功能性标记提供前期基础,在太子参种质资源评价优质种源筛选等方面具有极大开发价值良好应用前景。

  • 标签: 太子参 SSR 转录组 位点信息
  • 简介:为探索白刺花(Sophoraviciifolia)硬实形成相关机制,采用IlluminaHiSeqTM2000高通量测序技术对白刺花种子转录组进行测序,利用Trinity软件将数据组装形成转录本,所有转录本进行Nr(NCBInonredundantproteinsequences)、Nt(NCBInucleotidesequences)、Pfam(proteinfamily)、KOG/COG(euKaryoticorthologgroups/clustersoforthologousgroups)、Swiss-Prot(Amanuallyannotatedandreviewedproteinsequencedatabase)、KEGG(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes)GO(geneontology)分类功能注释、Pathway注释,并种子形成代谢通路中相关基因进行了分析。转录组共获得了333339724条初始序列,总长为335557bp,初始序列组装获得序列片段平均长度与N50值分别为282bp537bp;与KOG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了44840个GO功能注释、46126个KOG功能注释以及89494个PFAM注释:并从KEGG通路中找到有色氨酸代谢、半胱氨酸甲硫氨酸代谢途径编码基因片段分别有6637个。

  • 标签: 白刺花 转录组 硬实 高通量测序
  • 简介:高质量mRNA分离纯化是转录组文库构建和基因表达调控等生物学实验前提。为了调取较完整、纯度较高mRNA,本研究采用磁性分离技术调取mRNA,磁性复合微粒通过其表面的功能团与oligo(dT)_(25)相偶联,形成杂交体-磁珠复合体,外加磁场来实现mRNA快速分离,并经过不同试剂纯化后得到高质量mRNA,用于构建转录组文库。结果表明:mRNA被调取后,使用不同缓冲液纯化时mRNA质量影响较大,经多次试验验证:结合缓冲液为2.5mol/LLiCl,洗脱缓冲液采用0.1mol/LLiCl1%LiDS相结合进行纯化时,检测结果显示文库条带位于400~600bp之间,条带大小符合上机要求。高质量转录组文库构建为高通量测序基因克隆等实验提供帮助。

  • 标签: MRNA 分离与纯化 转录组文库 磁性复合微粒
  • 简介:根据拟南芥MIKC型MADS—box蛋白序列构建HMM(hiddenmarkovmodel)模型,在大豆基因组中确定了57个MIKC型MADS-box同源基因。分子进化树分析表明,57个大豆MIKC型MADS-box基因分为14个亚类,而MIKC^+型基因又分为两个进化支。控制花形态建成ABCDE同源异型基因(如AP1,AG,AP3PI等)重要控制开花时间基因(如SVPSOCl)在大豆基因组中表现出多拷贝特征。MEMESMART分析表明,大豆拟南芥MIKC型MADS—box基因具有保守MADSK-box基序,还有一些亚类具有特异基序。MIKC型MADS—box基因结构较为保守,多数基因具有7~8个外显子。本研究得到MIKC型MADS—box基因为下一步研究大豆花形态建成开花时间调控分子机制提供了重要参考依据。

  • 标签: 大豆 MIKC型MADS—box 保守基序
  • 简介:引物设计是RAMPREMAP标记分析关键,二者都使用锚定微卫星序列引物。目前已开发出多个RAMP锚定微卫星序列引物,与不同RAPD引物进行扩增,得到更多引物组合。REMAP使用反转录转座子外向LTR引物锚定微卫星序列引物。而RAMP分析采用不对称PCR循环,在PCR扩增后15个循环中,退火温度设为2个;REMAP则采用常规PCR循环。扩增产物可在聚丙烯酰胺凝胶、变性聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶上进行电泳分离,检测时可使用同位素、银染或溴化乙锭染色等技术。目前,这两种标记技术已在作物动物种质资源遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、转基因植株基因稳定性分析等方面都有成功应用

  • 标签: RAMP REMAP 分子标记
  • 简介:NAC转录因子在植物逆境应答中具有重要作用。本研究从番茄中克隆了一个NAC基因SlNAC71。该基因编码区长1059bp,编码352个氨基酸,预测分子量约为39.51kD,等电点为8.40。推测氨基酸序列中含有1个高度保守NAM结构域。SlNAC71基因序列具有miR164靶序列识别位点。亚细胞定位预测SlNAC71蛋白定位于细胞核。进化树分析发现,SlNAC71AtNAC分为一个分支。组织特异性表达模式分析表明在检测所有组织中SlNAC71都有表达,在叶中表达量最高,在茎中表达量最低。SlNAC71基因表达受高盐诱导,说明番茄SlNAC71基因可能参与番茄高盐胁迫应答。

  • 标签: 番茄 SlNAC71 克隆 表达分析
  • 简介:龙血树是热带、亚热带地区所特有的珍稀植物,是著名民间药物“血竭”重要原料。该药在我国中药材市场中占有重要地位。目前血竭生产是从多年生龙血树上取其带脂茎杆提炼而成,该法需要大量原材料,不断砍伐已使其资源面临枯竭威胁,现其己被列为国家三级保护濒危植物。如何有效地开发利用龙血树这一宝贵资源,使其得到可持续高效利用是目前研究一个重要方向。本研究以经诱导物诱导处理刚产生血竭未经诱导物处理海南龙血树(DracaenacambodiannPierreexGagnep)组培苗为材料,利用抑制消减杂交(supressionsubtractivehybridization,SSH)技术构建了龙血树血竭生物合成相关基因差减cDNA文库,采用PCR方法筛选差减文库获得431个重组子。随机挑取200个克隆经ReverseNorthernBlot筛选剔除假阳性后,共获得59个差异较明显阳性克隆,测序后得51条差异片段,通过BLASTnBLASTx进行比较分析,结果表明:分离到与信号转导相关cDNA片段5个,转录翻译相关蛋白cDNA片段5个,物质能量代谢酶类cDNA片段12个,另外有23个克隆在GenBank中均未发现显著相关同源序列,推测它们可能是功能未知新基因或是靠近3--末端基因片段,因保守性较低,难以通过同源比较推测其功能。

  • 标签: 海南龙血树 血竭 抑制差减杂交
  • 简介:通过利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究巴西蕉(Musaparadisiaca)叶片在60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、12h、24h不同时间转录组分析。结果表明:盐胁迫12h上调和下调DEGs(differential-expressedgenes)分别为2938个2727个;24h分别有834个893个。GO富集分析,差异基因主要在细胞过程、代谢过程、刺激响应、结合以及催化活性等。KEGG分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、黄酮类生物合成、苯丙素生物合成等。通过GOKEGG显著性富集分析发现,NaCl胁迫12h后差异表达基因数明显多于24h胁迫后差异基因表达数。qRT-PCR验证了DEGs表达趋势与RNA-Sep测序分析结果一致,证明了RNA-Sep结果准确性。本研究通过香蕉叶片转录组分析,为研究香蕉耐盐分子机制提供参考。

  • 标签: 巴西蕉 转录组 盐胁迫
  • 简介:Bar基因是转基因商品化作物中应用最多目标基因,也是水稻遗传转化中应用较多选择标记基因,因此,建立以Bar基因为选择标记通用高效遗传转化体系非常必要。本研究中,以籼型水稻明恢63为受体,Bar基因作选择标记,采用农杆菌介导遗传转化法,将Bar基因转入其中,获得了一批转化子,初步建立了稳定、高效水稻遗传转化体系。随后,以此体系为基础,将装有不同基因两个载体pBar-1C^*pBar-1Ab进行了转化,分别从5400块4800块愈伤组织中获得156个115个抗性愈伤,其抗性愈伤率分别为2.8%2.4%,分化率分别为80.7%87.8%,由此说明,此转化体系相对稳定,且分化率高、抗性愈伤率也较高,可用于同类选择标记遗传转化,加快水稻转基因育种步伐。

  • 标签: 选择标记 BAR基因 农杆菌介导的遗传转化 水稻
  • 简介:模板DNA质量直接影响PCR扩增结果,而不同提取方法及其缓冲液成份与浓度提取DNA质量有重要影响.本文以5个栽培大豆品种叶片为材料,比较分析了SDS与CTAB两种提取方法以及不同浓度CTAB提取缓冲液所提取DNA质量影响,并通过PCR进行检验.实验结果表明:用1%(W/V)、2%(W/V)浓度CTAB提取缓冲液1.25%(W/V)SDS提取缓冲液所提取大豆叶片DNA质量较好,均能满足PCR扩增模板需求,其中以1.25%(W/V)SDS提取得到大豆叶片DNA质量最好,以其为模板扩增效果最佳,而4%浓度CTAB不适宜提取大豆叶片DNA.

  • 标签: PCR 大豆 叶片 DNA 提取方法 缓冲液
  • 简介:为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,两个油酸含量不同高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4%56.2%)成熟期种子进行转录组分析实时荧光定量PCR分析。IlluminaHiseq,M2000测序得到8.09Gbcleanreads,组成52361个unigene,平均长度为659bp。比对公共数据库得到48911f93.41%)个氨基酸序列。鉴定出6414个在高油酸油菜低油酸油菜中差异显著基因,这些基因有1296个在高油酸油菜中上调表达(20.21%),5118个下调表达(79.79%),共有2043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930,Bna0104450Bna0305890在高油酸油菜中上调表达,其余下调表达。Bna0501620,Bna0391450Bna0084310在高油酸油菜中表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上,分别为4.48倍,4.21倍2.26倍。这些新发现差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究。

  • 标签: 高油酸油菜 转录组 定量PCR
  • 简介:甜玉米自交系1132种子经过空间诱变材料进行表型鉴定自交繁殖,在SP2代植株发现穗行数、穗粗、穗轴粗穗粒重等产量性状上出现变异果穗,通过连续自交获得穗行数、粒深、穗粗比对照明显增大稳定变异株系,其根系也明显发达。利用分布在10条染色体198引物16份稳定变异株系进行SSR多态性分析,发现32引物存在多态性,变异座位在玉米基因组10条染色体均有分布,但在第3、第4、第8、第9等4条染色体变异座位明显较多,占总变异座位69.7%。

  • 标签: 甜玉米 空间诱变 SSR分析
  • 简介:国内外关于不同地域亚洲棉遗传多样性是否存在较大差异尚无详细报道。本研究来源于印度、越南和中国(贵州,广西和云南等省)不同地域102份亚洲棉进行了SSR遗传多样性分析。研究结果显示,26SSR引物共检测到103条多态性条带,平均每对引物扩增出约3.96条多态性片段;SSR引物组合平均多态性信息含量、基因多样性指数Shannon信息指数分别为0.59、0.28350.4361;不同地域亚洲棉遗传多样性程度不同;UPGMA聚类分析主成分分析结果基本一致,102份亚洲棉可以聚类到三个组,来源于云南滇亚16号与其他种质遗传距离较远,单独归为一个组。研究结果表明,亚洲棉具有丰富遗传多样性,不同地域亚洲棉遗传多样性不同。

  • 标签: 亚洲棉 SSR 遗传多样性 聚类分析
  • 简介:不论是野生还是离体条件下,珠芽均是植物进行繁殖再生重要器官,已从多方面进行了研究,但缺乏全面系统介绍。本综述从植物珠芽定义、起源与发生部位、发育过程、显微结构、生理生态及实际生产中作用等方面介绍了珠芽研究进展,认为植物珠芽可着生于叶腋、花序或叶片表面,是由薄壁细胞分裂分化而来;珠芽发育一般经历了启动、膨大和成熟三个阶段,与内源激素含量变化有关;珠芽在数量、萌发率生活力等方面有明显优势,是良种繁育种群繁衍高效方式;并探讨了珠芽形成分子机制,未来珠芽研发进行了展望。

  • 标签: 珠芽 发育过程 形成机制 研究应用
  • 简介:大豆花叶病毒SMV抗性遗传研究一直是大豆抗病遗传研究热点之一。本研究以哈91R3—301×黑农41组合构建了遗传群体,其F2分离单株SSR标记基因型基本符合1:2:1比例,说明这个群体没有偏分离。根据F3株系病情指数分布推测SMV3F2成株抗性似乎由多基因控制。根据SSR分子标记基因型F2:3株系SMV3抗病性表型结果连锁分析,推测Satt296是与大豆花叶病毒(SMV)3号株系抗性主基因连锁分子标记,应用Joinmap作图软件将该标记定位在D1b连锁群上,这一结果与部分文献报道研究结果一致。本研究获得与抗性基因连锁分子标记在其他RIL群体中验证得到了初步证实,推测定位在D1b连锁群上抗性座位可能是控制SMV3主基因之一,该标记可望应用于大豆抗SMV3分子标记辅助选择。

  • 标签: 大豆 大豆花叶病毒 SMV3抗性遗传 SSR标记
  • 简介:S1是水稻(OryzasativaL.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要基因座,杂种雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’S1等位基因序列全长7kb,局倍区域有高GC分布。为此本研究通过分多段运用有针对性PCR方法,所用材料IRAT216与IRAT216S1进行了扩增并测序,获得了各自S1全长序列,并进行了比对,发现IRAT216与‘日本晴’序列完全相同,但IRAT216与IRAT216S1之间存在多处变异。同时针对有效变异区S1基因进行了分子进化调查,建立了水稻分子进化树,确定了S1在物种进化中意义。本研究S1基因序列测定,将为水稻分子标记辅助育种中分子标记开发提供序列参照,同时也将为S1基因RNA表达分析与蛋白功能研究、在各物种中分化变异水稻在进化中地位划分提供理论依据,并能为水稻起源研究提供参考。

  • 标签: 栽培稻 杂种不育 分子进化 S1基因
  • 简介:本研究以贵州省黔东南自治州黎平县野生亮叶含笑为研究对象。采用水蒸气蒸馏法亮叶含笑8种不同器官(即一年生叶,一年生茎,两年生茎,花瓣,雄蕊,雌蕊,苞片,假种皮)进行精油提取,并使用GC-MS与峰面积归一化法分离、分析其化学成分与相对含量。结果表明:亮叶含笑8种器官精油中共检测出52种化合物,大多属于倍半萜类,有部分单萜类萜类含氧衍生物,属于酸酯类化合物。亮叶含笑叶一年生中含有14种化合物;一年生茎含有16种化合物;两年生茎含有14种化合物;假种皮含有19种化合物;花含有24种化合物;苞片含有16种化合物。不同器官精油化合物种类存在一定差异。

  • 标签: 亮叶含笑 不同器官 精油成分 气相色谱-质谱联用