结核杆菌DNA荧光定量PCR检测及与涂片抗酸染色的对比研究

(整期优先)网络出版时间:2017-11-21
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结核杆菌DNA荧光定量PCR检测及与涂片抗酸染色的对比研究

黄琼

(岳阳县疾病预防控制中心湖南岳阳414100)

摘要:目的对比并分析荧光定量PCR检测结核杆菌DNA拷贝数与涂片抗酸染色镜检结果。方法选取2016年1月~2016年12月在我中心确诊的结核病患者150痰样本作为结核组,另选取同期来我中心就诊的无结核表现的其他病例患者的40份痰样本作为对照组,两组分别同期进行荧光定量PCR检测和涂片抗酸染色镜检,对检测结果进行比较分析。结果荧光定量PCR法检测结核杆菌阳性率为72.67%,明显高于抗酸涂片法的26.00%,差异具有统计学意义(P<0.05)。150例痰样本中,抗酸涂片结果阴性112例,阳性34例,疑似4例。在112例阴性结果中,有40例荧光定量PCR检测为阴性,72例检测为阳性,其中结合杆菌DNA拷贝数以102~103数量级居多;38例阳性(含疑似)结果中,有1例荧光定量PCR检测为阴性,37例检测为阳性,其中结合杆菌DNA拷贝数以103~104数量级居多,结果显示,DNA拷贝数数量级与涂片阳性程度基本呈正相关性。结论对于结核杆菌的检测,采用荧光定量PCR法较涂片抗酸染色法,敏感度更高,特异性更强,且前者检测结核杆菌DNA拷贝数与后者镜检阳性程度具有较好的相关性,两种方法联合使用可为临床诊疗提供可靠的依据。

关键词:结核杆菌;荧光定量PCR;DNA拷贝数;涂片抗酸染色

[Abstract]objectivetocompareandanalyzetheresultsofthetestresultsofthedetectionoftheDNAcopynumberoftuberculosisbacillusinfluorescenceandPCR.SelectionmethodsfromJanuary2016toDecember2016inourcenterdiagnosedTBpatients150sputumsamplesastuberculosisgroup,theotherselectedatthesametimetothecenterofTBshownoothercasesofsputumsamplesascontrolgroup,40patientswithtwogroupsrespectivelyoverthesameperiodwithfluorescentquantitativePCRdetectionandsmearmicroscopyacid-faststain,acomparativeanalysisoftestresults.Resultsthepositiverateoftheccawas72.67%,obviouslyhigherthanthe2600%oftheanti-acidsmearmethod,andthedifferencewasstatisticallysignificant(P<0.05).In150sputumsamples,antiacidsmearresultswerenegative112,positive34,andsuspected4cases.Ofthe112casesofnegativeresults,40werenegativeand72werepositive,withthebacterialDNAbeingcopiedbetween102and103ordersofmagnitude.38caseswerepositive(suspected)results,therearenegativefor1caseoffluorescencequantitativePCRdetection,testingpositivefor37cases,includingcombinedbacillusDNAcopyof103~104ordersofmagnitude,theresultsshowedthatDNAcopynumberorderofmagnitudeandsmearpositivedegreeofpositivecorrelationbetweenthebasic.Conclusionforthedetectionofmycobacteriumtuberculosis,andusingthefluorescentquantitativePCRmethodwithsmearacidstainingmethod,highersensitivity,specificity,andtheformermicroscopytodetectmycobacteriumtuberculosisDNAcopynumberandthelatterhasgoodcorrelation,positivedegreecombinedtwomethodscanprovidereliablebasisforclinicaldiagnosisandtreatment.

[Keywords]tuberculosisbacillus;FluorescencequantitativePCR;DNAcopynumber;Smearanti-aciddyeing

近年来随着流动人口数量和比例的增加,加上艾滋病的传播率提高,使得临床上结核病的发病率也呈现了逐年上升的趋势,然而结核杆菌的传统检测多采用痰标本直接涂片进行抗酸染色计数,但假阳性率较高,敏感性和特异性较低[1]。随着检测技术的不断进步,PCR技术在结核杆菌的检测上获得了广泛应用和认可[2],为此本研究特利用荧光定量PCR检测结核杆菌DNA拷贝数与涂片抗酸染色镜检的结果进行对比并分析。现具体报告如下。

1资料与方法

1.1一般资料

选取2016年1月~2016年12月在我中心确诊的结核病患者150痰样本作为结核组,其中男89例,女61例,年龄12~58岁,平均(42.2±7.1)岁;另选取同期来我中心就诊的无结核表现的其他病例患者的40份痰样本作为对照组,其中男24例,女16例,均为接受过抗痨治疗。

1.2样本采集

两组患者清早起床痰液1~2口,痰液中注意避免混入唾液,由灭菌样本盒加盖送检。

1.3方法

抗酸染色采用梅里埃诊断产品(上海)有限公司代理销售的染色液,结核杆菌DNA荧光定量PCR检测试剂由中山大学达安基因股份有限公司提供,检测仪器为美国ABI公司生产的7300荧光定量PCR仪。

1.3.1荧光定量PCR检测

向痰液样本中按2~4倍量加入浓度2%的NaOH,持续震荡5min后于室温下静置0.5h,静置期间可振荡3次以使痰液充分液化。取液化的痰液离心处理后弃上清液,加100uLDNA浓缩液,混合均匀后在离心弃上清液,加入20uLDNA浓缩液,给予100℃恒温及离心处理后取3uL进行PCR反应实验,其中反应条件:37℃,180s;93℃,60s;93℃,5s;60℃,40s,40循环次。

1.3.2抗酸染色镜检

将细菌涂片标本经制备涂片、初染、脱色、复染、干燥固定,镜检观察:连续观察300个视野未发现结核分枝杆菌视为抗酸杆菌阴性(-);连续观察300视野发现1~8条杆菌视为疑似结果(±);连续观察100视野内发现3条以上杆菌视为抗酸杆菌阳性(+)。以上严格按照实验规程及试剂说明进行操作。

1.4统计学处理

应用SPSSl9.0版软件对本次研究数据进行统计分析,n或%表示计数资料,采用X2检验,以P<0.05为具有统计学意义。

2结果

2.1两种不同方法检测结核杆菌阳性率的比较

结核组结果显示,荧光定量PCR法检测结核杆菌阳性率为72.67%,明显高于抗酸涂片法的26.00%,差异具有统计学意义(P<0.05)。见表1。

3讨论

结核病的细菌学检查临床公认的结核杆菌检测的“金标准”,是临床发现结核病患者、判断治疗效果、以及疾病控制和评价等的重要依据,也是临床对结核患者进行确诊以及治疗和预后的诊断标准的[3]。但是值得注意的是该操作过程中由于受人为、设备等的干扰因素较为显著,导致误差较大,本研究中对照组就出现了1例阳性,因此其特异性不强;此外该方法对结核杆菌和非结核分枝杆菌的分辨效果不佳,而且对结核分枝杆菌的药物敏感性已无法获知;尤其是“金标准”中要求的细菌培养,在时间上需要4~6周时间,且对培养条件要求较高,失去了早期诊断和疗效判定意义,故临床意义大打折扣,难能满足临床诊疗的需要[4]。

FQ-PCR技术是在常规PCR的基础上利用了荧光探针标记技术,在融合了核酸扩增与光谱技术下,使得探针和待检测基因进行有效的特异性结合;同时该技术实现了操作流程的“全封闭式”,并辅以dUPT一UNG酶防污染体系,有效降低了因产物污染而导致的假阳性[5]。因此本研究结果显示荧光定量PCR法检测结核杆菌阳性率为72.67%,明显高于抗酸涂片法的26.00%;并且表二的结果也显示DNA拷贝数数量级与涂片阳性程度基本呈正相关性,这与林瀛等[6]的研究结果相一致,说明FQ-PCR的定量检测具有较高的准确度[7]。

综上所述,对于结核杆菌的检测,采用荧光定量PCR法较涂片抗酸染色法,敏感度更高,特异性更强,且前者检测结核杆菌DNA拷贝数与后者镜检阳性程度具有较好的相关性,两种方法联合使用可为临床诊疗提供可靠的依据。

参考文献

[1]常新剑,裴秋玲.用三种检测法检测结核分枝杆菌的效果[J].当代医药论丛,2015,13(24):58-59.

[2]王俊妨,靳颖,牛伟霞,等.荧光定量PCR在脑脊液结核分枝杆菌DNA检测中的应用[J].检验医学,2017,32(2):135-137.

[3]周稳兰,陆春芬,朱蔚岗,等.荧光定量PCR检测技术在肺结核诊断中的应用[J].江苏医药,2015(23):2874-2875.

[4]杨振兴,陈威,许敏,等.五种检测方法在结核病诊断中的应用评价[J].中国热带医学,2016,16(10):1024-1026.

[5]王霖,王辉,李才信,等.荧光定量PCR技术在肺结核诊断中的应用研究[J].中国卫生标准管理,2016,7(11):169-171.

[6]林瀛,陈小岩,俞训彬.结核分枝杆菌DNA实时定量PCR技术在临床病理诊断中的应用[J].实用检验医师杂志,2015,7(3):143-147.

[7]陈杏媛,郭琴华.结核杆菌三种实验方法的应用评估[J].实验与检验医学,2016,34(3):373-374.