实时荧光定量PCR在流感病毒核酸检测中的应用

(整期优先)网络出版时间:2021-09-27
/ 2

实时荧光定量 PCR在流感病毒核酸检测中的应用

陈玉梅 伊春市疾病预防控制中心 黑龙江 伊春市 153000

【摘要】目的探讨在实施流感病毒核酸检测中实时荧光定量PCR检验方式运用可行性。方法:选取2018年1月1日~2020年12月31日,我中心收到的300件流感样病例咽拭子作为研究对象;针对流感病毒核酸利用实时荧光定量PCR完成检测,就获得结果进行分析。结果:对于300件流感样病例咽拭子完成检测后,80件获得流感病毒核酸阳性结果;其中56例属于甲型H1N1病毒,15件属于季节性甲3亚型病毒,6件属于季节性甲1型病毒,2件属于乙型病毒,1件属于丙型病毒。结论:实时荧光定量PCR检验方式有效运用,呈现出有效性以及科学性特点,对于流感病毒核酸检测准确性以及快速性可以做出保证,对于流感病毒流行规律可以进行认真分析,对于公共卫生事件突发可以给予充分预防。

【关键词】流感病毒核酸检测;实时荧光定量PCR;诊断结果


伴随甲型H1N1流感疾病爆发与流行,使流感预防重要意义获得社会广泛关注[1]。本研究选取2018年1月1日~2020年12月31日的300件流感样病例咽拭子作为研究对象;旨在探讨在实施流感病毒核酸检测中实时荧光定量PCR检验方式运用可行性,为达到预防公共卫生事件突发目标,现报告如下。

1资料与方法

1.1 一般资料

选取2018年1月1日~2020年12月31日,我中心收到的300件流感样病例咽拭子作为研究对象。

1.2 方法

1.2.1 合理进行样本采集

对于所有咽拭子,通过对患者咽后壁以及双侧咽扁桃体进行擦拭,将部分剪去,并且于无菌病毒采样液中进行放置。保存温度为4℃。于实验室尽快送检。对于疑似甲型H1N1病毒,需要对其实施A类包装。

1.2.2 仪器以及试剂

主要利用实时荧光定量PCR仪(STRATAGENE MX3000P)完成检测。将病毒核酸提取试剂盒作为本次研究试剂盒。在进行检测期间,对于试剂盒说明书需要严格参照。

1.2.3 合理进行对应检测

在漩涡振荡器内部将检测标本置入,合理进行充分振荡,并且实施1min处理。对1预装板进行选取,准备蛋白酶K稀释液(1.4mL)在蛋白酶K干粉中加入。观察溶解完全后,分别在第一列以及第七列各准备20μL于每孔加入。后续分别准备200μL标本于每孔加入。在核酸自动提取仪卡槽中准备预装板安置,合理安装磁套,并且将程序启动。完成运行后,将磁套弃掉,并且合理取出预装板。保存温度为-20℃。在Real-timePCR反应体系中,分别准备1μL EnzymeMix、12.5μL 2x-PCR MasterMix以及205μL Rnase FreedH进行加样。分别于上游以及下游完成引物以及探针。均为0.5μL。完成20μL反应体系配置后,准备流感病毒核酸提取液5μL于反应体系中添加。针对样本实施PCR扩增处理。对Ct值进行检测,观察在35以下,并且呈现出S形曲线后,获得阳性检测结果。如未表现出Ct值现象,则证明获得阴性结果。

1.3 观察指标

统计观察各流感病毒核酸阳性结果类型。

  1. 结果

对于300件流感样病例咽拭子完成检测后,80件获得流感病毒核酸阳性结果;其中56例属于甲型H1N1病毒,15件属于季节性甲3亚型病毒,6件属于季节性甲1型病毒,2件属于乙型病毒,1件属于丙型病毒。(见表1)

表1 各流感病毒核酸阳性结果类型统计 (n=80)

组别

n

比例(%)

甲型H1N1病毒

56

70.00

季节性甲3亚型病毒

15

18.75

季节性甲1型病毒

6

7.50

乙型病毒

2

2.50

丙型病毒

1

1.25

3讨论

流感是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,其临床特点为起病急,全身中毒症状明显,如高热、头痛、全身酸痛、软弱无力等,而呼吸道症状较轻。流行性感冒主要通过接触及飞沫传播,传染性强,轻症患者病程短,常呈自限性,重症患者需进行药物治疗,一般可治愈。流行性感冒主要是由于患者被流感病毒感染而引起,主要以空气、飞沫传播为主,人群普遍易感,好发于婴儿、老年人、有基础疾病者、免疫力低下者。

流感作为急性呼吸系统疾病之一,主要因为流感病毒导致患病。其症状以酸痛、高热、呼吸道症状以及乏力为主

[2]。表现出潜伏期短、流感传染性强、传播迅速特点,主要分为三种类型,分别为甲型、乙型以及丙型。以甲型对人们造成最大程度威胁,对此将流感检测以及防控力度加强,具有重要意义[3]

流感病毒呈现出较强致病能力,并且较易表现出变异现象。因为人们针对特异性菌株在必要免疫力方面较为缺乏,从而往往呈现出流行爆发现象,对此将流感防控力度加强,采取有效方法针对流感病毒核酸实施检测,意义显著[4]。实时荧光定量PCR检测方式有效运用,呈现出显著优势,同普通RT-PCR检测比较,其呈现出更低灵敏度以及更短实验周期特点,并且对于实验室污染可以充分避免。实时荧光定量PCR检测有效应用,其可通过光谱技术敏感性、PCR针对DNA高效扩增以及探针技术特异性展开有效检测,呈现出重复性好、敏感性高优势,并且操作简单、更为直观、容易操作,通过闭管检测,能够将实验室污染发生率显著降低,实用性良好[5]

本次研究发现,对于300件流感样病例咽拭子完成检测后,80件获得流感病毒核酸阳性结果;其中56例属于甲型H1N1病毒,15件属于季节性甲3亚型病毒,6件属于季节性甲1型病毒,2件属于乙型病毒,1件属于丙型病毒,从而表明实时荧光定量PCR检验方式有效运用,对于流感类型可以充分明确,从而采取针对性措施展开对应治疗。

综上所述,实时荧光定量PCR检验方式有效运用,呈现出有效性以及科学性特点,对于流感病毒核酸检测准确性以及快速性可以做出保证,对于流感病毒流行规律可以进行认真分析,对于公共卫生事件突发可以给予充分预防。

【参考文献】

[1]包红梅,田国彬,曾显营,等.H10N8亚型禽流感病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立[J].中国预防兽医学报,2020,42(12):1233-1238.

[2]樊佩佩,赵晓南,伏晓庆,等.2018-2019监测年度云南省流感病毒分子流行病学特征分析[J].现代预防医学,2020,47(21):3846-3850.

[3]何敏,石利民,乔梦凯,等.2014—2016年南京市甲型H3N2流感病毒HA基因的进化分析[J].中华实验和临床病毒学杂志,2020,34(05):490-494.

[4]李艳宇,李姗姗,杜嘉鑫,等.2017—2018年北京市东城区新甲型H1N1流感病毒HA基因特征研究[J].职业与健康,2020,36(20):2834-2838.

[5]杨舒雯.荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果[J].临床研究,2020,28(10):32-33.