新型冠状病毒实验室核酸检测方法及实践

(整期优先)网络出版时间:2022-06-24
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新型冠状病毒实验室核酸检测方法及实践

汪鹏

红安县疾病预防控制中心 湖北 黄冈 438400


【摘要】目的:探讨观察新型冠状病毒实验室核酸检测方法及实践效果。方法:2021年1月到2022年12月,选取医院发热门诊收治的4587例发热患者为研究对象,患者均进行新冠肺炎筛查,提供相应咽拭子,并采用实时荧光定量PCR技术进行检测,获取检测结果并分析。结果:4587例发热患者中,阳性率及阴性率分别是0.46%、99.54%。结论:实时荧光定量PCR技术可在新型冠状病毒实验室核酸检测中发挥显著作用,及时筛查出阳性患者,指导患者早期进行有效治疗,预防疾病进一步发展。

关键词:新型冠状病毒;实验室核酸检测;实时荧光定量PCR技术;发热;阳性;阴性

自新型冠状病毒首次问世至现在,新型冠状病毒依然未得到有效控制,依然处于大肆传播状态。我国统计学数据[1]显示,累计至2022年3月31日,共有458539人确诊新型冠状病毒肺炎,其中治愈175119人,死亡13197人。Worldometer实时统计数据[2]显示,累计至北京时间2022年1月14日6时30分,共有320295172人确诊新型冠状病毒肺炎,其中死亡5537500人。核酸是筛查出新型冠状病毒肺炎患者的有效方法,灵敏度高,假阴性率低,相较于抗体检测等方法,其检测灵敏度以及特异度明显更好。各国在核酸检测时,均通过口咽拭子、鼻咽拭子采集样本,之后进行实验室检测,筛查患病患者。实时荧光定量PCR技术是实验室检测主要应用的方法,本文主要分析该检测技术在新型冠状病毒检测中的应用价值,报道内容如下。

1.资料与方法

1.1临床资料

以门诊发热患者为对象,选取4587例进行此次研究,患者于2021年1月-2022年12月入院。其中男性有2531例,女性有2056例;最小年龄19岁,最大年龄80岁,平均年龄(44.72±13.18)岁。纳入标准:(1)患者均因发热就诊发热门诊;(2)患者均配合医生提供咽拭子。排除标准:(1)患者有核酸阳性检出史;(2)患者存在精神障碍或认知障碍。

1.2方法

1.2.1仪器设备

由湖南圣湘生物科技有限公司提供的核酸提取试剂盒、新型冠状病毒核酸检测试剂盒;检测仪器是罗氏 cobas z480 荧光定量 PCR 仪、安捷伦 MX3000P 荧光定量 PCR 仪。

1.2.2检测流程

患者入院且确定发热后进行采样,由本院发热门诊完成生物安全培训且考核合格、穿戴三级防护衣物的医生进行采样工作,均采集患者的口咽拭子。若患者多次检测结果均为阳性或是高度疑似患者,还需安排临床医师采集患者的鼻咽拭子、肛拭子、痰液拭子、肺泡灌洗液等标本进行检测。样本采集完毕后,将其置入耐冷冻、携带旋盖有垫圈的病毒保存管中,拧紧保存管,在保存管中粘贴相应的条形码。在样本管喷洒浓度是75%的酒精,有效消毒后将其置入密封袋中,每袋只能装一份样本。收集样本后将其竖放在样本运送盒中,将盒子盖紧,置入运输箱中运输,在运输箱标识新冠肺炎检测。经生物安全培训且考核合格专人进行运输工作,将样本送入实验室中。接收人员必须应用75%酒精进行运输箱喷洒,从盒中取出样本,并将其置入生物安全柜,核对样本数量,确定样本是否存在泄漏现象。通过磁珠法进行核酸RNA提取,试剂盒中有磁珠洗涤液、磁珠结合液、裂解液等物品。完成核酸DNA提取后,配合PCR反应液,并在荧光定量PCR仪上采集荧光信号,结合荧光信号变化进行RNA检测,最后按照PCR 检测体系进行结果评估。结果分析过程中需进行阴性、阳性质控品结果观察,阴性质控品显示 FAM通道、ROX 通道中无Ct值存在,或Ct值大于40;阳性质控品显示FAM通道、ROX 通道且内标通道Ct值不超过35。若质控品同时满足上述要求,则代表该批次实验有效,否则则代表该批次实验无效,必须进行重新检测。

1.3统计学方法

统计学软件SPSS22.0。

2.结果

4587例发热患者中,其中确诊阳性的患者有21例,确诊阴性的患者有4566例,阳性率是0.46%,阴性率是99.54%。

3.讨论

新型冠状病毒感染后导致的肺部炎症被称作新冠肺炎,也是现今尚未有效控制的一种呼吸道传染病。新型冠状病毒属于股安装包内高度冠状病毒 β 属新成员,是单链 RNA 病毒,具有包膜,颗粒为椭圆形或是圆形,多为多形性体格点,其基因特征和SARS-CoV、MERS-CoV 存在明显差异[3]。新冠肺炎主要损害人体呼吸系统、免疫系统与生育系统,其严重程度远胜于普通流感病毒,具有较大传染性、传播性以及危害性。想要早期进行有效治疗,首先要提供充足病原学证据,确诊新冠肺炎,然后展开相关治疗。实验室核酸检测是该病首选检测手段,但检测过程中所用检测技术直接影响最终检测结果。实时荧光定量PCR技术是现今比较推崇的新冠肺炎检测技术,在多种病原体检测中应用,具有较高敏感性,较好特异性。但近段时间有媒体报道,很多地区必须进行多次核酸检测,才能确诊阳性病例,对实时荧光定量PCR技术检测结果提出质疑。但从核酸检测整体流程可发现,实时荧光定量PCR技术固然可在实验室检测中发挥显著作用,但实际检测结果的影响环节与影响因素比较多,不同采样部位、样本中的病毒含量、采样管中的保存液成分及体积等,均会对核酸提取效率造成影响。若实验室检测人员技能水平低下,也会对检测结果造成直接影响,最终导致检测结果错误。但从技术角度看,实时荧光定量PCR技术可在核酸检测中发挥显著作用,筛查出阳性患者。

综上可知,在新型冠状病毒实验室检测中应用实时荧光定量PCR技术,价值显著。



参考文献:

[1] 陈培松,何宇婷,黄裕立,等. 不同方式灭活口咽拭子标本对2019新型冠状病毒实时荧光定量PCR检测结果的影响[J]. 中华检验医学杂志,2020,43(4):364-367.

[2] 周帅锋,李世康,陈雨,等. 微滴式数字PCR和实时荧光定量PCR对新型冠状病毒肺炎患者不同时间血便尿中核酸检测结果初步探讨[J]. 实用预防医学,2020,27(11):1316-1320.

[3] 吕莉琨,李力,刘小畅,等. 天津市COVID-19患者治疗后不同类型标本中新型冠状病毒核酸检测结果分析[J]. 中华微生物学和免疫学杂志,2020,40(6):405-409.