揭开宏基因组病原微生物二代测序的神秘面纱

(整期优先)网络出版时间:2024-04-07
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揭开宏基因组病原微生物二代测序的神秘面纱

 范贵荣

四川绵阳四0四医院(绵阳市第一人民医院)621000

作为医生,经常遇到病人提问,如:我反复发烧,什么检查都做了,怎么一直找不到病因?我该怎么办呢?听说现在有一种高档检测叫宏基因组病原微生物二代测序,它能准确找到病因,我什么时候选择做这个检查呢?今天就给大家来介绍一下这个神秘的检测—宏基因组病原微生物二代测序。

一、什么是宏基因组病原微生物二代测序

  不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,能够快速、客观的检测临床样本中的多种病原体。目前可检测的病原体有8000多种,其中包括3000余种细菌、4000余种病毒、200余种真菌和140种寄生虫。

二、宏基因组病原微生物二代测序与传统细菌培养的区别

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  宏基因组病原微生物二代测序不需要培养,标本中的所有病原体都能检测出来,就象一个人拿网打鱼;传统微生物培养需要培养,很多病原体较难培养出,好比一个人拿钓鱼杆钓鱼。

三、什么时候选择宏基因组病原微生物二代测序

  通常情况下,我们应首先选择传统细菌培养,能满足大多数疾病的要求。若遇到下列情况,可选择宏基因组病原微生物二代测序。

病情危重需要尽快明确病原体;

特殊病患者如免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染患者需要尽快明确病原体;

传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳;

疑似新发病原体、临床上提示可能有一定的传染性;

疑似特殊病原体感染;

长期发热和(/或)伴有其他临床症状、病因不明的感染。

四、标本采集及送检注意事项

(一)标本采集

  抗菌药物使用前,症状明显时采集标本。血液采集用紫头抗凝管,其它样本用无菌、干燥、洁净容器。采集过程应严格无菌操作,避免污染。

(二)标本保存

  血液室温(6℃-35℃)竖直储存,其它样本非即刻送检,应立即置于-20℃(短期,保存一周)或-80℃(长期)保存,禁止反复冻融。

(三)标本运送

  血液常温运输,其它样本干冰方式运输。

(四)标本采集量

标本类型

标本体积

外周血

3-5ml

肺泡灌洗液

3ml以上

脑脊液

3ml以上

脓肿

3ml以上

胸腹水

3ml以上

尿液

10ml左右

其他无菌体液

3ml以上

五、基因组病原微生物二代测序报告怎么看

  宏基因组病原微生物二代测序报告的阳性结果包含一大堆病原体。这一大堆病原体到底是不是我们患病的病原体?谁是我们患病的病原体?我们一定要结合症状,请专业医生或专业检测人员进行解读。