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  • 简介:摘要目的分析2015—2019年北京市麻疹病毒(measles virus, MV)分子流行病学特征,为消除麻疹提供实验室依据。方法通过北京市麻疹实验室网络收集2015—2019年麻疹病毒阳性咽拭子标本,提取病毒核酸后采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹病毒N基因C末端450个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定,获得基因序列同WHO麻疹病毒基因型代表株、中国和其他国家D8基因型参考株构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸同源性;对D8和B3基因型麻疹病例进行描述性分析。结果2015—2019年全市麻疹病毒基因型鉴定株546株,其中H1a基因型531株,疫苗株5株,B3基因型1株,D8基因型9株,其中8株为2019年流行株。本土株H1a基因型MV核苷酸和氨基酸同源性为91.5%~100.0%和73.6%~100.0%。2019年8例D8基因型麻疹病例均为成人,其中2例为一起暴发疫情,其余6例为散发病例。结论输入性D8基因型成为2019年北京市MV主要流行基因型;2015—2019年随着麻疹发病下降,本土基因型H1a已经不占优势,而其他不同基因型输入,形成混合流行的趋势,建议在消除麻疹工作中,不仅要努力阻断本土麻疹病毒传播,更要防控非本土基因型病毒输入和持续传播,避免其逐渐演化为优势毒株而建立本土传播的风险。

  • 标签: 麻疹 麻疹病毒 H1a基因型 D8基因型 B3基因型 分子流行病学
  • 简介:摘要目的研究阐明北京地区人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)的流行特征和基因变异规律,为HCoV的感染防控提供分子流行病学依据。方法本研究收集了2016—2017年北京市呼吸道多病原监测采集的HCoV阳性病例样本287份和流行病学数据,分析HCoV检出率、人群、季节特征,采用RT-PCR方法扩增HCoV pol基因部分片段用于HCoV分型和进化分析研究。结果本研究HCoV检出率为1.89%,HCoV阳性样本的呼吸道病毒共感染率为20.56%(59/287)。鉴定出OC43型69株,核苷酸同源性为97.2%~100%,氨基酸同源性为92.2%~100%;229E型39株,核苷酸同源性为99.2%~100%,氨基酸同源性为99.2%~100%;HKU1型10株,NL63型2株。结论OC43型和229E型为2016—2017年北京市HCoV主要型别,呈现出一定的季节差异,同一型别流行株具有很高的核苷酸和氨基酸同源性。

  • 标签: 人冠状病毒 分子流行病 基因型 进化分析