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  • 简介:摘要目的研究2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染病例中人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的感染情况及流行病学特点,并对分离出的人腺病毒做全基因组序列分析。方法采集2018年4月至2019年3月济南市第四人民医院、山东大学齐鲁儿童医院、章丘区人民医院的急性呼吸道感染住院病例患者的鼻/咽拭子样本共计1 969份,采用实时荧光定量PCR的方法检测样本中呼吸道相关病原体,包括人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒的阳性率,并对分离出的7株腺病毒阳性标本进行测序,以确定腺病毒型别,并构建基因进化树进行分析。结果在收集的1 969份标本中,3种呼吸道病毒阳性病例共计242例,阳性检测率为12.30 %(242/1969),鼻病毒阳性率为3.00%(59/1969)、呼吸道合胞病毒阳性率为6.30 %(124/1969)、腺病毒阳性率为3.86%(76/1969)。不同年龄段间鼻病毒检出率差异无统计学意义(Fisher精确检验值8.376,P=0.720),不同年龄段间呼吸道合胞病毒、腺病毒检出率差异均有统计学意义(χ2=19.28、12.16;P=0.001、0.016)。不同性别间腺病毒检出率差异具有统计学意义(χ2=14.33,P<0.001),不同性别间鼻病毒阳性率和呼吸道合胞病毒阳性率均无统计学意义(χ2=0.30、2.90,P=0.862、0.089)。比较不同月份间三种病毒核酸阳性率,发现鼻病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒的检出率分别在10月份、12月份、11月份达到最高(分别为8.61%、26.50%和8.84%)。对测序的7株腺病毒阳性标本构建基因进化树后发现其均为HAdV-2型。结论2018年4月至2019年3月济南市急性呼吸道感染相关的人鼻病毒、呼吸道合胞病毒及人腺病毒在不同组别间有不同的流行病学特点,为急性呼吸道感染的早期预防和临床治疗提供参考依据。

  • 标签: 呼吸道相关病毒 流行特征 全基因组 基因分型
  • 作者: 崔爱利 朱贞 毛乃颖 谢智博 关路媛 胡孔新 朱汝南 吴巨龙 李岩 马英伟 李芳彩 王文洋 郜振国 张燕 许文波
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华预防医学杂志》 2022年第07期
  • 机构:国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室,北京 102206,陕西省疾病预防控制中心病毒病预防控制所,西安710054,中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所,北京 100176,首都儿科研究所病毒研究室 儿童病毒病病原学北京市重点实验室,北京 100020,山东省疾病预防控制中心传染病预防控制所,济南 250014,河北省疾病预防控制中心病毒病防治所,石家庄 050021,长春市儿童医院 精准医学研究中心,长春 130061,湖南省疾病预防控制中心微生物检验科,长沙 410005,安徽理工大学医学院免疫学教研室,淮南 232001,新疆维吾
  • 简介:摘要目的了解我国九省份发热呼吸道症候群(FRS)监测病例中常见病毒感染情况。方法研究资料来源于中国疾病预防控制中心“传染病监测技术平台信息管理系统”中九省份(安徽、北京、广东、河北、湖南、吉林、山东、陕西和新疆)2009年1月至2021年6月间的FRS病例监测数据,最终将具有8种病毒[人流感病毒(HIFV)、人呼吸道合胞病毒(HRSV)、人腺病毒(HAdV)、人副流感病毒(HPIV)、人鼻病毒(HRV)、人偏肺病毒(HMPV)、人冠状病毒(HCoV)以及人博卡病毒(HBoV)]核酸检测结果的8 243例FRS监测病例纳入研究。采用χ²检验/Fisher确切概率法分析不同年龄组、不同地区和不同季节病例的病毒检出率差异。结果8 243例FRS病例年龄M(Q1,Q3)为4(1,18)岁,<5岁以下儿童占56.56%(4 662例);男性占58.1%(4 792例);病例主要来源于门、急诊病例和住院病例,其中门急诊病例数为2 043例,住院病例数为6 200例。FRS病例的病毒检出率从高到低依次为HRSV、HIFV、HPIV、HRV、HAdV、HMPV、HCoV和HBoV。有524例病例同时检出两种及两种以上病毒,占病毒检测阳性病例数的15.66%。不同年龄组中病毒检出率的差异具有统计学意义(均P<0.05),<5岁以下儿童的病毒检出率较高(49.96%)。南方任一病毒阳性检出率高于北方(P<0.001)。FRS病毒阳性病例全年均有检出,HRSV检出率在秋、冬季较高,HIFV检出率在冬季较高,HMPV检出率在冬、春季较高;而HPIV、HRV、HCoV和HBoV的检出率在夏、秋季节较高,而HAdV在不同季节检出率的差异无统计学意义。与2009—2019年相比,2020—2021年的任一病毒阳性检出率有所下降,由原来的41.37%下降至37.86%;HIFV检出率由原来的10.62%急剧下降至1.37%;HPIV检出率由原来的8.24%下降至5.88%。而HRV和HBoV的检出率则由原来的5.43%和1.79%,分别上升至9.67%和3.19%。结论2009—2021年中国九省份FRS病例以HRSV和HIFV感染较为常见,8种常见呼吸道病毒的流行特征存在年龄、地区和季节差异。

  • 标签: 呼吸道感染 发热呼吸道症候群 新型冠状病毒肺炎 监测
  • 简介:摘要目的分析2021—2022年度山东省流感流行分布特征、流行毒株病原学及其血凝素(HA)基因特性。方法收集2021—2022年度山东省流感样病例(ILI)哨点监测数据,进行描述性分析;采用荧光定量PCR核酸检测、病毒分离方法对采集的ILI标本开展检测,分析不同时间流感病毒的分布,按每市选取3株病毒进行基因测序,进行HA基因进化分析。结果2021—2022年度,山东省54所流感监测哨点医院共报告ILI 528 263例,ILI就诊比例为4.07%,0~4岁ILI最多,为45.86%;呈冬春季流行高峰,最高峰为2021年第52周(6.62%)。共对26 754份标本开展了核酸检测,阳性率27.10%,均为B型Victoria系流感病毒,PCR阳性率高峰为2021年第49周(63.78%);共报告ILI聚集性或暴发疫情295起,经实验室确诊269起为流感病毒阳性,以小学发生的疫情为主,2021年12月份报告疫情数最多。基因进化分析显示:HA基因与2020—2023年度推荐的疫苗株遗传距离均较近,介于98.6%~99.5%,且分成2个分支(V1A.3a.1,V1A.3a.2)。结论2021—2022年度,山东省流感流行高峰在12月,毒株型别单一,流感病毒阳性率和暴发疫情报告数均较高,毒株与WHO疫苗推荐株HA基因同源性较好,但整体上流感病毒群体免疫屏障较弱。

  • 标签: 流感 流行特征 流感病毒 核酸检测 基因特征分析