简介:摘要目的通过分析基于靶点网络及临床数据挖掘探究名中医贾跃进治疗冠心病合并抑郁症的用药规律及核心中药处方。方法通过GeneCards、OMIM、TTD数据库分别获取冠心病及抑郁症的靶点,构建2种疾病靶点的PPI网络,并进一步筛选核心靶点;利用Metascape平台对交集靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,分析冠心病合并抑郁症的作用机制;通过TCMSP查询作用于靶点的有效成分及包含这些有效成分的中药,将数据导入Cytoscape 3.9.0构建核心靶点-有效成分-中药网络,进行网络拓朴学分析;采集贾跃进老中医2015年1月1日-2021年1月1日的门诊临床数据,运用古今医案云平台(V2.3.5)进行数据挖掘,得到其常用处方,将结果与靶点网络分析得到的中药进行核心处方拟合,并对核心处方中的药物进行分析。结果冠心病合并抑郁症靶点PPI网络分析获得1 501个交集靶点,可分为4个核心靶点聚类,包括炎症因子类、肿瘤因子类、脂质代谢类因子、纤维化类因子;通过TCMSP获得作用于靶点的有效成分480个,分属181味中药,其中核心成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素、β-胡萝卜素、金合欢素、刺芒柄花素、鞣花酸。GO富集分析共得61条结果,主要有蛋白质磷酸化的正调控、信号受体激动剂活性、膜面等;KEGG通路富集分析共获得20条结果,主要有癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、JAK-STAT通路等。临床数据挖掘纳入验案120例,方剂148首,涉及中药135味,药性以平、温、微寒、寒为主;药味以甘、苦、辛、淡为主、药物主要归肺、脾、肝、心、肾经等;通过药物关联分析、聚类分析和复杂网络分析综合得出常用组方。将常用组方与靶点网络分析得到的中药拟合出核心处方:半夏、甘草、柴胡、香附、丹参、延胡索、党参、黄芪、石菖蒲。结论贾跃进老中医治疗冠心病合并抑郁症的用药规律及符合中西医机制的核心处方,本研究为冠心病合并抑郁症的临床治疗和进一步研究提供指导。
简介:摘要目的研究通过在线光学体表监测预测肺癌靶区位置运动的可行性。方法选取16个肺癌病例立体定向体部放疗(SBRT)计划中不同方式获取的CT图像进行实验模拟,以计划CT及原始靶区位置作为基准参考,以四维CT中10个时相的CT和每次锥形线束CT(CBCT)为浮动对象,在其上勾画浮动靶区位置。采用双目视觉表面成像法获取基准和浮动图像体表点云数据,并通过主成分分析提取点云特征信息进行比较。使用随机森林算法对特征信息差和对应靶区位置差拟合,构建靶区位置在线预测模型。结果左右、头脚、腹背方向,选取的主成分方差解释度分别为99.76%、99.25%、99.58%,模型对靶区位置的预测均方根误差(RMSE)为0.0447、0.0837、0.0616 mm。结论基于体表光学数据在线预测肺部靶区实时位置具有可行性,可为临床放疗中靶区位置在线监测验证和剂量评估提供参考。
简介:摘要目的基于网络药理学及分子对接技术研究当归拈痛汤治疗痛风性关节炎的分子机制。方法利用TCMSP筛选当归拈痛汤的有效成分与相应靶点,检索GeneCards、OMIM、PharmGKB及DrugBank数据库得到痛风性关节炎相关靶点,映射取交集得到当归拈痛汤治疗痛风性关节炎的潜在作用靶点。借助Cytoscape软件绘制当归拈痛汤治疗痛风性关节炎的中药复方调控网络及PPI网络,使用David数据库对当归拈痛汤治疗痛风性关节炎的靶点进行GO及KEGG通路富集分析,采用Autodock软件进行分子对接。结果当归拈痛汤治疗痛风性关节炎的有效成分有198个,关键有效成分为槲皮素、山柰酚;关键靶点有46个,其中NFE2L2、HMOX1、PPARA、PTGS2、IL1β、CXCL8为核心靶点;GO功能富集结果显示,关键基因主要介导炎症反应调节、对氧化应激的反应、脂肪酸代谢过程、类固醇代谢过程、对脂多糖的反应、活性氧类代谢过程等生物过程;KEGG通路富集结果显示,当归拈痛汤重点介导IL-17信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、AGE-RAGE信号通路等发挥治疗痛风性关节炎的作用;分子对接结果显示,当归拈痛汤相关中药的有效成分与痛风性关节炎的作用靶点可高效结合,且结构稳定。结论当归拈痛汤具有多成分-多通路-多靶点的治疗特点,通过对免疫炎症反应和对氧化应激反应的调控作用来治疗痛风性关节炎。
简介:摘要目的探索基于卷积神经网络构建前列腺癌术后放疗临床靶区(CTV)及部分危及器官(OAR)自动勾画模型的方法,以提高临床工作效率和靶区勾画统一性。方法回顾性分析由一位放疗医师勾画的117例前列腺癌术后患者CT资料,基于3D UNet设计多分类自动勾画模型CVT-UNet,采用戴斯相似系数(DSC)、95分位豪斯多夫距离(95%HD)和平均表面距离(ASD)评估模型分割能力,比较另外两位医师对测试集自动勾画靶区评估结果的差异。再随机收集78例由其他医生治疗的患者进行模型外部验证,比较两位医师评价的差异。结果测试集前列腺瘤床区(CTV1)、盆腔淋巴结引流区(CTV2)、膀胱和直肠的平均DSC分别为0.74、0.82、0.94和0.79。临床评分显示:两位医师对CTV2和OAR的勾画达成了更多的共识;而对CTV1的勾画则共识较少,故评分差异较大。结论基于卷积神经网络构建用于术后前列腺癌CTV及相关OAR的自动勾画模型可行,但前列腺瘤床区的自动分割仍需改善。
简介:摘要目的探讨环状RNA(circRNA,Circ)_101237调控肝癌细胞进展的分子机制。方法将新乡医学院第一附属医院2019年7月至2021年7月行手术切除的肝癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析癌旁组织和肝癌组织Circ_101237表达水平。采用sh-Con和sh-Circ_101237慢病毒感染人肝癌细胞系MHCC97H,建立sh-Con组和sh-Circ_101237组细胞系,细胞计数试剂盒(CCK-8)、克隆形成实验、划痕实验和Transwell实验分析Circ_101237对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。双荧光素酶报告实验分析Circ_101237的靶基因。组间数据比较采用t检验。结果癌旁组织中Circ_101237表达水平(1.01±0.18)明显低于肝癌组织Circ_101237表达水平(2.09±0.26),差异有统计学意义(t=30.560,P<0.05)。sh-Con组细胞吸光度值(A)、细胞克隆形成数量、划痕愈合率和侵袭数量[(1.97±0.09),(164.67±14.40)个,(62.50±5.51)%,(130.83±25.18)个]明显高于sh-Circ_101237组细胞A值\细胞克隆形成数量、划痕愈合率和侵袭数量[(1.33±0.18),(111.33±9.07)个;(28.63±6.84)%,(92.33±14.05)个],差异有统计学意义(t=7.782、7.675、9.444、3.270,P<0.05)。Circ_101237与miR-490-3p存在连续互补结合位点。sh-Con组细胞miR-490-3p表达水平(0.99±0.14)明显低于sh-Circ_101237组细胞miR-490-3p表达水平(2.17±0.24),差异有统计学意义(t=10.280,P<0.05)。miR-NC+sh-Circ_101237组细胞A值(1.01±0.13)明显低于miR-490-3p抑制剂+sh-Circ_101237组细胞A值(1.60±0.09),差异有统计学意义(t=9.143,P<0.05)。miR-NC+sh-Circ_101237组细胞划痕愈合率[(27.41±5.15)%]明显低于miR-490-3p抑制剂+sh-Circ_101237组划痕愈合率[(49.19±7.81)%],差异有统计学意义(t=5.703,P<0.05)。miR-NC+sh-Circ_101237组细胞侵袭数量[(90.83±9.87)个]明显低于miR-490-3p抑制剂+sh-Circ_101237组细胞侵袭数量[(122.33±11.09)个],差异有统计学意义(t=5.197,P<0.05)。结论Circ_101237在肝癌组织中呈高表达,通过miR-490-3p调节着肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭等恶性细胞生物学行为。
简介:摘要目的了解深圳地区2019—2021年诺如病毒暴发分子流行特征。方法收集2019年1月至2021年12月诺如病毒暴发信息及标本,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应样本进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;对其中3株GII.2[P16]进行基因组扩增和序列分析。结果2019年1月至2021年12月,共报告诺如病毒暴发246起,主要发生在幼儿园(132,53.66%)和小学(52,21.14%)。每起暴发发病数范围为3~130,中位数为8。每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰。211起暴发分型成功,GI和GII分别检出7种和11种基因型,78起(36.97%)诺如病毒暴发由GII.2[P16]引起。对GII.2[P16]基因组分析表明,深圳2020年暴发株仍属于GII.2[P16](2016-2017)亚群,在非结构蛋白P22(L777S)和3C蛋白酶(A1047V和P1074T)上出现氨基酸变异。结论GII.2[P16]是2019年1月至2021年12月引起深圳市诺如病毒暴发的流行株,主要发生在学校和幼儿园,持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和新毒株的出现。
简介:摘要目的探讨长链非编码RNA膀胱癌相关转录本1(lncRNA BLACAT1)通过靶基因调控膀胱癌细胞发生发展的机制。方法采用qRT-PCR法检测正常膀胱细胞SV-HUC-1及膀胱癌细胞SW780中BLACAT1的表达水平;转染siRNA-NC、siRNA-BLACAT1至SW780细胞,设为siRNA-NC、siRNA-BLACAT1组,保留细胞不转染任何质粒设为空白对照组(NC组)。采用CCK-8法检测SW780细胞的增殖情况,采用流式细胞术检测SW780细胞的凋亡情况,采用双荧光素酶报告基因和qRT-PCR验证lncRNA BLACAT1的靶向基因,采用免疫印迹法检测BAMBI蛋白的表达量。结果LncRNA BLACAT1在膀胱癌细胞SW780中的表达水平显著高于正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1,差异有统计学意义(P<0.05);siRNA-BLACAT1组中lncRNA BLACAT1 mRNA水平均低于siRNA-NC组、NC组(均P<0.05),而siRNA-NC组中lncRNA BLACAT1 mRNA水平低于NC组(P<0.05);三组SW780细胞的24 h的吸光度(OD)值比较,差异均无统计学意义(均P>0.05),而三组SW780细胞在48、72 h的OD值比较,差异均有统计学意义(均P<0.05),且siRNA-BLACAT1组在48、72 h时的OD值均低于siRNA-NC组、NC组(均P<0.05),而siRNA-NC组在48、72 h时的OD值均低于NC组(均P<0.05);siRNA-BLACAT1组中的细胞凋亡率均高于siRNA-NC组、NC组(均P<0.05);siRNA-NC组的细胞凋亡率高于NC组(P<0.05);lncRNA BLACAT1与BAMBI存在靶向结合位点,双荧光素酶报告基因实验结果显示,与BLACAT1+NC组相比,BLACAT1+BAMBI组的荧光活性明显增加(P<0.05),siRNA-BLACAT1组的BAMBI蛋白水平、BAMBI mRNA的相对表达量低于siRNA-NC组、NC组(均P<0.05),而siRNA-NC组的BAMBI蛋白水平、BAMBI mRNA的相对表达量低于NC组(P<0.05)。结论lncRNA BLACAT1可调控膀胱癌细胞增殖及促进细胞凋亡,其机制与靶向BAMBI有关。
简介:摘要急性髓系白血病(AML)是成年人中最常见的急性白血病,具有明显的异质性。在血液肿瘤中,AML的靶向治疗起步较晚。虽然传统化疗仍是AML治疗不可缺少的部分,但从2017年开始越来越多的小分子靶向药物得到应用。文章对第64届美国血液学会年会上部分小分子靶向药物治疗AML的进展进行介绍。
简介:摘要原发性心脏血管肉瘤(primary cardiac angiosarcoma,PCAS)十分罕见,恶性程度高,患者常表现为非特异性症状,早期诊断困难,预后差。目前对于PCAS治疗主要以手术切除为主并辅以放化疗,但远期生存情况尚不理想。了解心脏血管肉瘤的分子病理研究进展,寻找靶向治疗的可能有效靶点,是目前延长PCAS患者生存期的希望。