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43 个结果
  • 简介:甘蔗是重要糖料作物,也是重要能源作物。由于复杂遗传背景、较低可育性缺乏优异种质资源等因素给甘蔗品种改良带来了很大困难,通过转基因技术为甘蔗品种改良提供了有效途径。而转基因植物遗传稳定性是植物转基因育种过程中一项重要研究课题。本研究通过一次多基因遗传转化,同时将四个目的基因导入甘蔗品种新台糖22号中。通过PCR检测,对转基因甘蔗T_0、T_1T_2代遗传稳定性进行分析;通过外源蛋白快速试纸条检测,对转基因植株四个外源基因中基因(bar抗除草剂基因cry1Ab抗虫基因)蛋白表达进行检测。证明一次四基因遗传转化甘蔗转基因株系,在T_0代出现了部分基因丢失现象,且T_0代甘蔗主茎分蘖可能为不同转基因事件。但如果是四个基因均能完整整合到基因组中株系,则四个基因可以在T_0、T_1T_2代中得到稳定遗传,也可以稳定检测得到外源基因蛋白表达。

  • 标签: 甘蔗转基因 遗传稳定性 基因遗失 试纸条检测
  • 简介:根据刺五加鲨烯合酶基因2(squalenesynthase,SS2)鲨烯环氧酶基因1(squaleneepoxidase,SE1)DNA序列,通过Southern杂交qRT-PCR法确定SS2SE1拷贝数。以actin为内参照基因,利用qRT-PCR法分光光度法确定不同SS2SE1拷贝数下基因表达量皂苷含量。结果表明,刺五加SS2存在12拷贝,SE1存在1、23拷贝类型及其相互组合6种拷贝数组合基因型。刺五加SS2SE1表达量与皂苷含量均随拷贝数增加而显著提高(p〈0.05),两者间存在极显著正相关关系(P〈0.01)。SS2SE1每增加1个拷贝可使皂苷含量分别提高0.570.42倍。研究结果为进一步揭示刺五加皂苷含量差异形成分子机理奠定了基础。

  • 标签: 刺五加 鲨烯合酶 鲨烯环氧酶 拷贝数 皂苷
  • 简介:以番茄为试材,研究了热处理对番茄硬度、Vc含量、可滴定酸含量、可溶性固形物含量贮藏期影响。结果表明:55℃处理番茄硬度最大,其次是38℃52℃。说明热处理会减少番茄果实水分,增加果皮韧性;热处理32℃52℃对贮藏期番茄可溶性固形物保存效果较好;高温短时间热处理对贮藏期番茄Vc保存效果较好;55℃热处理可滴定酸含量较高。52℃番茄热处理对延长番茄贮藏时间效果明显。

  • 标签: 热处理 番茄 品质 耐贮性
  • 简介:大麦糖化力蛋白质含量是影响大麦品质重要指标,对此类性状进行QTL定位具有重要经济意义。本研究分别采用传统单QTL扫描方法3种贝叶斯LASSO方法实现此类性状QTL精细解析。在对大麦蛋白质含量QTL检测上,单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法检测到了7个QTL,其中2个与单QTL扫描方法检测QTL吻合。在大麦糖化力QTL检测上,传统单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法除了检测到这3个QTL外,还检测发现了额外2个连锁QTL;表明贝叶斯方法在北美大麦蛋白质含量糖化力QTL检测中可以更加有效地分离处于连锁位置或接近状态QTL进而提高QTL检测效力。

  • 标签: 贝叶斯LASSO QTL 多QTL定位
  • 简介:通过增加外源CaCl2钙离子螯合剂EGTA处理后,研究香蕉幼苗在60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、4h、8h、12h、24h48h不同时间下,测定其叶片CaMCa^2+-ATPase基因相对表达量。结果表明,在NaCl胁迫过程中,香蕉幼苗在正常生长条件下,其根叶片CaM基因Ca^2+-ATPase基因均有表达。巴西蕉幼苗根在盐胁迫过程中CaM基因没有发生显著变化,但是粉蕉根却发生了显著变化,这可能与粉蕉耐盐性高于巴西有关。随着盐胁迫时间延长,巴西蕉粉蕉幼苗根Ca^2+-ATPase基因相对表达量均呈现先上升后下降趋势。

  • 标签: 香蕉幼苗 盐胁迫 CaM基因 Ca2+-ATPase基因 荧光定量
  • 简介:NBS类抗病基因是植物中最大一类抗病基因。亚麻荠是一种新型能源及特用油料作物,抗病、虫、杂草及逆境能力极强。然而,有关其抗性分子机理鲜有报道。本研究采用NB-ARC标准结构域HMM模型,对亚麻荠本地蛋白质数据库进行检索分析,在全基因组水平上鉴定NBS类抗病基因。结果表明亚麻荠基因组共有472个NBS类抗病基因,分布于17条染色体上,56%基因成簇分布。所有串联重复基因也都以基因簇形式出现,这表明串联重复有利于基因簇形成。系统发生树分析显示TIR-NBS-LRR(TNL)CC-NBS-LRR(CNL)两类亚家族抗病基因可能在进化过程中遵循不同进化路径,导致其在应对病原菌侵染时发挥不同功能。本研究发现将为鉴定新植物抗病基因和解析亚麻荠高抗病机制提供科学参考。

  • 标签: 亚麻荠 抗病基因 NBS家族 基因簇 生物信息学
  • 简介:辣椒资源遗传多样性丰富,育种潜力大,本研究从分子水平研究不同种间辣椒种质资源遗传多样性差异,为辣椒种质资源收集、研究及合理利用提供参考。并首次利用基于辣椒全基因组编码区序列设计152对SSR辣椒基因组引物,用不同地理来源且性状差异显著11个种(亚种)24份辣椒种质资源对152对SSR引物进行筛选,从而获得条带清晰、稳定性好41对SSR多态性引物,并利用NTSYS-pc2.10ePOPGENE32软件分析24份辣椒种质资源遗传多样性数据。结果表明:41对SSR引物扩增出211个多态性条带,平均每对引物扩增出5.15个位点,说明SSR引物在辣椒遗传分析中有较高实用性。有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、香农指数(Shannon-Weaver)(I)、多态信息含量(PIC)均值结果分别为4.0861、0.4198、0.7247、1.4232、0.6654,表明辣椒遗传信息非常丰富。UPGMA方法聚类分析及主成分分析将24份辣椒聚为7类,结果基本与辣椒种类来源相符。

  • 标签: 辣椒 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析
  • 简介:本研究以新颖极端粗茎水稻材料R404及细茎品种日本晴为亲本杂交构建F2分离群体(152个单株)为作图群体,对控制水稻茎秆粗、茎壁厚以及穗颈粗3个茎粗度相关性状QTL进行定位分析。通过QTLIciMapping分子标记作图软件分析,在水稻3、8、11以及12号染色体上分别检测到7个QTLs,其中茎粗穗颈粗2个QTLqSDM8.1qRDM8.1可能为同一基因位点调控,茎粗茎壁厚2个QTLqSDM3.1及qSWT3.1也定位在相近位置,这2个染色体位置可能存在控制茎粗一因多效基因。qSWT3.1(15.39%)、qRDM3.1(44.66%)qSDM8.1(19.16%)在其所控制相应性状(茎粗,茎壁厚穗颈部粗)中贡献率是最大,是主效QTL。除了定位于3号染色体QTLs外,其他与粗茎性状相关QTLs均为新发现QTLs。本研究结果为粗茎QTL进一步精细定位奠定了基础,也为粗茎QTL应用于水稻抗倒伏品种培育及种质创新提供重要基因来源,对保障国家粮食安全具有重要意义。

  • 标签: 水稻 茎粗 穗颈粗 茎壁厚 QTL定位
  • 简介:茶树是重要叶用经济作物,但是茶树每年都要开花结实,消耗大量养分,导致茶树鲜叶产量减少品质降低。雌蕊缺失茶树资源是天然不结实茶树品种。采用IlluminaHiSeqTM2500高通量测序技术,对雌蕊缺失茶树花花芽、花蕾、花进行转录组分析。经组装获得237484条Transcripts,取最长Transcripts作为Unigene,有182123条,将获得Unigene与Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG、GO等七种数据库进行注释,有22049条Unigene被注释上26种KOG分类,注释到KEGGUnigene条数为21315,涉及pathway有130条。此外,发掘出与花器官形态建成ABCDE模型功能基因31个,这些注释信息完成为茶树花器官发育基因及性别决定相关基因发掘提供了重要依据。

  • 标签: 茶树 雌蕊缺失 转录组 RNA-SEQ 基因注释
  • 简介:本研究对219份茄子种植资源进行耐涝性鉴定,获得了219份材料耐涝表型数据。用196个SSR标记对219份茄子种质资源基因组进行扫描,分析219份茄子材料群体结构及亲缘关系,并采用TASSEL软件一般线性模型(GLM)方法对标记与性状进行关联分析。最终得到了219份茄子材料群体结构、亲缘关系以及与茄子耐涝性紧密关联27个分子标记,为茄子耐涝分子标记辅助育种提供一定参考。

  • 标签: 茄子 耐涝性状 SSR分子标记 关联分析
  • 简介:针对果实成熟时表现不同颜色甜樱桃品种(黄色品种‘佐藤锦’,红色品种‘拉宾斯’),采用高效液相法测定分析其果实生长中花色苷主要成分及含量,采用RT-PCR克隆‘佐藤锦’一个MYB基因,同时利用荧光定量PCR分析PacMYBA基因在两个品种甜樱桃果实生长过程中表达情况。结果表明,‘拉宾斯’果实转色后花色苷积累上升趋势明显,成熟后花色苷含量高且组分由单一一种逐渐丰富为3种;‘佐藤锦’果实转色后花色苷含量有所增加但增加幅度不大,且花色苷组分单一;二者在转色后PacMYBA相对表达上升趋势明显,成熟时‘拉宾斯’PacMYBA相对表达远高于‘佐藤锦’。本研究对解释甜樱桃果实生长过程中色泽变化及推测PacMYBA对甜樱桃果实花色苷起正调控作用提供理论基础。

  • 标签: 甜樱桃 MYB 花色苷积累 基因表达
  • 简介:为探索白刺花(Sophoraviciifolia)硬实形成相关机制,采用IlluminaHiSeqTM2000高通量测序技术对白刺花种子转录组进行测序,利用Trinity软件将数据组装形成转录本,对所有转录本进行Nr(NCBInonredundantproteinsequences)、Nt(NCBInucleotidesequences)、Pfam(proteinfamily)、KOG/COG(euKaryoticorthologgroups/clustersoforthologousgroups)、Swiss-Prot(Amanuallyannotatedandreviewedproteinsequencedatabase)、KEGG(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes)GO(geneontology)分类功能注释、Pathway注释,并对种子形成代谢通路中相关基因进行了分析。转录组共获得了333339724条初始序列,总长为335557bp,初始序列组装获得序列片段平均长度与N50值分别为282bp537bp;与KOG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了44840个GO功能注释、46126个KOG功能注释以及89494个PFAM注释:并从KEGG通路中找到有色氨酸代谢、半胱氨酸甲硫氨酸代谢途径编码基因片段分别有6637个。

  • 标签: 白刺花 转录组 硬实 高通量测序
  • 简介:据报道,酵母中HOPS复合体参与囊泡融合及运输。本研究分别以酿酒酵母HOPS复合体各亚基氨基酸序列,通过BLASTp在稻瘟病菌数据库中搜索得到了6个酿酒酵母HOPS复合体各亚基同源蛋白,我们通过生物信息学方法对稻瘟病菌6个HOPS复合体亚基同源蛋白理化特性、蛋白质结构域进化关系进行了分析。基于稻瘟病菌98-06菌丝阶段孢子侵染水稻CO39不同阶段转录组测序数据,分别选取稻瘟病菌内吞外泌途径相关基因,制作了表达模式图。此外,MoYpt7蛋白在其假定下游效应因子ΔMoVps41突变体中定位研究表明MoVps41可能影响了液泡融合。

  • 标签: 稻瘟病菌 内吞 外泌 MoYpt7 MoVps41
  • 简介:本研究探讨滴灌施肥条件下灌水量施肥量对温室番茄品质影响,优化陕北地区温室番茄水肥供应技术,为该地区优质番茄生产提供技术支持。通过田间试验,采用完全随机组合方法,试验由3个灌水水平(100%ET,80%ET60%ET)3个施肥水平(N-P2O5-K2O分别为240-120-150kg/hm2,180-90-112.5kg/hm2120-60-75kg/hm2)进行完全随机组合,采用主成分分析法对番茄果实6项品质指标(可溶性糖,维生素C,硝酸盐,糖酸比,有机酸番茄红素)进行综合评价,提出相对较优水肥供应量。分析表明,灌水单因素对可溶性糖含量、维生素C番茄红素影响极显著(p〈0.01),对硝酸盐有机酸影响显著(p〈0.05);在相同施肥水平下,随着灌水量增加,番茄可溶性糖含量、维生素C、番茄红素、硝酸盐有机酸含量随着灌水量增加而降低;施肥单因素对维生素C、硝酸盐番茄红素影响极显著(p〈0.01),随着施肥量增加,维生素C、硝酸盐番茄红素随之增加;水肥供应仅对番茄维生素C、硝酸盐含量番茄红素含量有显著交互作用(p〈0.05)。主成分分析法表明,灌水量为60%ET氮磷钾施用量为240-120-150kg/hm2时得分最高,综合品质相对较优,推荐该处理为陕北地区温室番茄水肥供应技术优选方案,能够为该地区优质番茄生产提供技术支持。

  • 标签: 番茄(Solanum lycopersicum L.) 维生素C 番茄红素 主成份分析法
  • 简介:简单重复序列(SSR)广泛存在于基因组中,是亲缘关系分析、DNA指纹图谱构建和遗传多样性研究领域中非常重要遗传标记之一。红豆树群体已处于濒危状态,且属无参基因组,其近缘种开发SSR引物亦很少,为满足红豆树遗传多样性研究及制定合理保护策略,本研究基于SLAF-seq(specific-locusamplifiedfragmentsequencing)技术对天然群体中典型红豆树进行简化测序,利用MISA软件对测序获得所有SLAF片段进行SSR位点搜索,并对SSR位点特征进行统计分析,最后利用PrimerPremier5.0软件进行引物批量设计。与日本晴水稻测序数据相比,红豆树参考基因组双端比对效率为90.14%,酶切效率为92.37%,说明SLAF建库正常;测序Q30为92.32%,GC含量为37.17%,说明达到测序要求。本研究共获得6426462reads592221个SLAF标签,其中16653个多态性SLAF标签,含有17868个SSR位点,平均每6.98kb就分布有1个SSR位点。不同核苷酸重复类型基元类型数量及SSR位点数量间差异较大,除单核苷酸外,二、三核苷酸重复类型数量较多,分别占总SSR位点17.15%15.02%,其中AT/TAGAA/TTC基元重复数量最多,分别为1090个(43.1%)349个(15.2%)。通过批量引物设计共得到2817对引物,以二、三核苷酸类型较多,两者所占比例高达94.8%。结果表明:SLAF-seq技术可以很好应用于红豆树(无参基因组)SSR位点开发,基于简化基因组测序数据发掘SSR位点能够为SSR分子标记开发提供信息,并有助于后续群体遗传多样性交配系统分析等。

  • 标签: 红豆树 SLAF-seq SSR 分布 位点分析
  • 简介:为了从蛋白质分子生物学方面研究白菜型冬油菜不同抗寒品种低温逆境及恢复条件下相关蛋白响应机制,揭示大田生产中冬油菜抵御突发骤变低温伤害抗寒机理,以超强抗寒冬油菜品种陇油7号弱抗寒品种天油2号为材料,在培养箱培养至幼苗五叶期时,模拟北方寒旱区冬油菜返青期倒春寒环境,运用双向电泳结合质谱技术,分析其幼苗在低温(4℃)-恢复(20℃)-低温(4℃)-恢复(20℃)过程中存在蛋白及其差异表达量。研究表明低温胁迫与恢复过程中,有2个蛋白点发生了显著差异丰度变化,它们分别是半胱氨酸型氧化还蛋白过氧化物酶(定义为1号蛋白)一种未知蛋白(2号蛋白)。且不同抗寒性品种存在2种不同蛋白差异表达机制,1号蛋白在抗寒性较弱天油2号低温胁迫恢复过程中表现出上调-下调-上调变化趋势,抗寒性较强陇油7号中此蛋白在第一次低温胁迫后消失,而出现了另外一种未知蛋白(蛋白2),且在低温胁迫恢复过程中也表现出上调-下调-上调变化趋势,并且表达量高于天油2号中蛋白1,因此,这种未知蛋白2可能是陇油7号抗寒性强于天油2号原因之一。

  • 标签: 白菜型冬油菜 低温胁迫 双向电泳 蛋白质
  • 简介:通过利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究巴西蕉(Musaparadisiaca)叶片在60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、12h、24h不同时间点转录组分析。结果表明:盐胁迫12h上调和下调DEGs(differential-expressedgenes)分别为2938个2727个;24h分别有834个893个。GO富集分析,差异基因主要在细胞过程、代谢过程、刺激响应、结合以及催化活性等。KEGG分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、黄酮类生物合成、苯丙素生物合成等。通过GOKEGG显著性富集分析发现,NaCl胁迫12h后差异表达基因数明显多于24h胁迫后差异基因表达数。qRT-PCR验证了DEGs表达趋势与RNA-Sep测序分析结果一致,证明了RNA-Sep结果准确性。本研究通过香蕉叶片转录组分析,为研究香蕉耐盐分子机制提供参考。

  • 标签: 巴西蕉 转录组 盐胁迫
  • 简介:本研究以贵州省黔东南自治州黎平县野生亮叶含笑为研究对象。采用水蒸气蒸馏法对亮叶含笑8种不同器官(即一年生叶,一年生茎,两年生茎,花瓣,雄蕊,雌蕊,苞片,假种皮)进行精油提取,并使用GC-MS与峰面积归一化法分离、分析其化学成分与相对含量。结果表明:亮叶含笑8种器官精油中共检测出52种化合物,大多属于倍半萜类,有部分单萜类萜类含氧衍生物,属于酸酯类化合物。亮叶含笑叶一年生中含有14种化合物;一年生茎含有16种化合物;两年生茎含有14种化合物;假种皮含有19种化合物;花含有24种化合物;苞片含有16种化合物。不同器官精油化合物种类存在一定差异。

  • 标签: 亮叶含笑 不同器官 精油成分 气相色谱-质谱联用
  • 简介:黄瓜枯萎病是一种世界性土传病害,常常给黄瓜生产造成非常严重甚至毁灭性损失。从感病品系‘早二N’上分离纯化得到黄瓜枯萎病病原菌为尖孢镰刀菌黄瓜专化型(Fusariumoxysporumf.sp.cucumerinum),利用真菌核糖体基因及其间隔区DNA相似性鉴定了病原菌属性,发现其内转录间隔区(internaltranscribedspacer,ITS)序列与尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)相似性为99%。回接试验进一步确证了分离得到枯萎病菌为尖孢镰刀菌黄瓜专化型(Fusariumoxysporumf.sp.cucumerinum)。以灌根方式对70个黄瓜自交系(含两个对照品系)接种此病原菌,通过调查接种后病情指数分析不同黄瓜品系对枯萎病抗感差异。结果表明:共有26个品系隶属抗病等级、42个品系隶属感病等级。其中'日节成'对枯萎病抗性最强,‘Superina’抗性最弱。这一结果为今后选择抗感亲本研究黄瓜枯萎病抗性遗传机制及分离鉴定抗性基因提供了重要材料选择参考。

  • 标签: 黄瓜 枯萎病 尖孢镰刀菌 品种抗性
  • 简介:为了创造杨树甲基化变异新种质,本研究以国外引进优良欧洲黑杨种质资源N46(P.nigra'N46')无菌苗叶片为材料,通过在分化培养基中添加5-azaC(800μmol/L)诱变方法,在再生植株群体中获得了一个圆叶突变株系M800-18。该株系叶片数量明显增多、叶片长宽比显著增大,叶绿素a、叶绿素b含量降低、光合能力下降,同时该株系保护酶活性显著增强,但其生长速度与对照基本相当。甲基化敏感扩增多态性分析(MSAP)结果表明,变异株系叶片基因组DNA甲基化水平均比对照显著升高。皮尔逊相关性分析结果表明,该株系DNA甲基化水平与叶片数量呈显著正相关,全甲基化、总甲基化水平与光合参数各项指标均呈显著负相关,说明圆叶突变株系表型变化很可能是由于甲基化升高引起。研究结果为研究杨树叶片形状变异表观遗传基础研究及生产应用奠定了基础。

  • 标签: 欧洲黑杨N46 DNA甲基化 5-azaC 突变体 生理特性