简介:WedevelopedanRfunctionnamed'microarrayoutlierfilter'(MOF)toassistintheidentificationoffailedarrays.Insortingagroupofsimilararraysbythelike-lihoodoffailure,twostatisticalindiceswereemployed:thecorrelationcoefficientandthepercentageofoutlierspots.MOFcanbeusedtomonitorthequalityofmi-croarraydataforbothtroubleshooting,andtoeliminatebaddatasetsfromdown-streamanalysis.Thefunctionisfreelyavaliableathttp://www.wriwindber.org/applications/mof/.
简介:MYB蛋白质在真核细胞的有机体起重要作用。在植物,R1R2R3类型MYB蛋白质在房间周期控制工作。然而,R2R3类型MYB蛋白质是否也涉及房间部门过程,仍然保持未知。这里,我们报导那R2R3类型抄写因素基因,AtMYB59,涉及房间周期前进和根生长的规定。AtMYB59蛋白质在洋葱的原子核是局部性的表皮的房间并且transactivation活动。在酵母房间的AtMYB59的表示压制房间增长,和transformants与更长的房间有更多的原子核和更高的aneuploidDNA内容。在AtMYB59的保存领域的变化在酵母细胞生长上废除它的效果。在同步Arabidopsis房间暂停,AtMYB59基因明确地在房间周期前进期间在S阶段被表示。表示和promoter-GUS分析表明AtMYB59基因富有地在根被表示。转基因的植物overexpressingAtMYB59更短的根与野类型的植物(Arabidopsis就职Col-0)相比,并且在在根尖端的有丝分裂的房间的一半附近在中期。相反地,空变异的myb59-1比关口在中期让更长的根和更少有丝分裂的房间,建议那AtMYB59可以由扩大有丝分裂的房间的中期禁止根生长。AtMYB59调整许多下游的基因,包括CYCB1;1基因,可能通过到MYB应答的元素的绑定。这些结果在细胞周期规定和植物根生长为AtMYB59支持一个角色。
简介:Amajorproblemwhichispoorlyunderstoodinthemanagementofbladdercancerislowsensitivitytochemotherapyandhighrecurrenceaftertransurethralresection.Insulin-likegrowthfactor1receptor(IGF-1R)signalingplaysaveryimportantroleinprogression,invasionandmetastasisofbladdercancercells.Inthisstudy,weinvestigatedwhetherIGF-1Rwasinvolvedinthegrowthstimulatingactivityanddrugresistanceofbladdercancercells.Theresultsshowed:ThemRNAsofIGF-1,IGF-2andIGF-1Rwerestronglyexpressedinserum-freeculturedT24cellline,whereasnormalurothelialcellsdidnotexpressthesefactors/receptorsoronlyintracelevels;T24cellrespondedfarbettertogrowthstimulationbyIGF-1thandidnormalurothelialcells;blockageofIGF1Rbyantisenseoligodeoxynucleotide(ODN)significantlyinhibitedthegrowthofT24cellandenhancedsensitivityandapoptosisofT24cellstomitomycin(MMC).TheseresultssuggestedthatblockageofIGF-IRsignalingmightpotentiallycontributetothetreatmentofbladdercancercellswhichareinsensitivetochemotherapy.
简介:目的:通过检测藏獒黑素皮质激素受体1(MClR)基因的单链构象多态性(SSCP)在不同毛色群体中的分布,探讨MClR基因多态性与毛色表型的相关性。方法:采用DNA测序技术,选择不同毛色藏獒的DNA为样本,根据GenBank发布的荷斯坦牛MClR基因序列设计一对引物,采用PCR-SSCP技术分析MClR基因在藏獒中的SSCP。结果:MClR基因在藏獒中具有PCR-SSCP多态性,分别检测到3种基因型(AA、AB和BB);对MClR基因多态性片段DNA克隆测序后发现,MClR基因在编码区第313位存在单碱基突变(G-,A),该突变导致第105位氨基酸发生由丙氨酸向苏氨酸的改变(T105A)。结论:肘CJR基因的多态性与毛色性状不存在显著的相关性。
简介:甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Lam.)作为世界上一种重要的粮食、饲料、工业原料及新型能源作物,从有性生殖F1选择优良实生系进行选择育种一直是甘薯育种的重要方式。为了优化甘薯杂交育种方法,合理选配杂交组合,提高育种效率,本试验利用SSR标记研究了甘薯杂交群体基于SSR标记及13个农艺性状的遗传多样性,得到了群体内的聚类图,并且筛选出了甘薯的高产株系。群体SSR标记的聚类分析结果显示,群体材料与各亲本遗传距离比较远,被聚为3类,而亲本单独聚在另外一类。13个农艺性状的聚类将亲本与部分群体材料聚在了一起,且将群体材料和亲本材料作为一个整体时,其遗传距离的变异高达30%以上,远远高于SSR标记所获得的遗传变异系数。
简介:目的:利用慢病毒载体建立稳定表达猪载脂蛋白BmRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(pAPOBEC3F,简称pA3F)的PK15细胞系。方法:以实验室前期构建的pBPLV-flag-pA3F质粒为模板,PCR扩增pA3F基因,克隆到pLenti-Puro-3Flag载体构建成pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒,Western印迹鉴定其在HEK293T细胞中的表达;将pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒与包装载体共转染HEK293T细胞,包装成Lenti-pA3F慢病毒并测定病毒滴度;将Lenti-pA3F慢病毒感染PK15细胞,通过嘌呤霉素压力筛选并结合有限稀释法,筛选稳定表达pA3F的细胞单克隆株,最终Western印迹检测细胞单克隆株中pA3F的表达。结果:菌落PCR和序列测定表明pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒构建正确,Western印迹显示该质粒可在HEK293T细胞中表达pA3F蛋白;包装了Lenti-pA3F慢病毒,滴度为1.32×10^8TU/mL,慢病毒感染PK15细胞后可检测到pA3F蛋白的表达;经Western印迹鉴定,筛选得到的单克隆细胞可稳定表达pA3F蛋白。结论:建立了稳定表达pA3F的PK15细胞单克隆株,为进一步深入研究猪内源性反转录病毒在pA3F作用下的免疫逃逸机制奠定了基础。
简介:目的:探讨氟代脱氧葡萄糖((18)F-FDG)正电子发射断层显像/X线计算机体层成像仪(PET/CT)检查在局灶早期宫颈癌中的临床应用价值。方法:53例病理确诊为早期宫颈癌的患者行全身~(18)F-FDGPET/CT检查,并在检查结束10日内行广泛性全子宫切除术+双附件切除术+盆腔淋巴结清扫术,计算(18)F-FDGPET/CT诊断宫颈原发部位肿瘤及盆腔淋巴结转移的敏感度,特异度与准确度。结果:(18)F-FDGPET/CT检查诊断的宫颈原发部位肿瘤的敏感度为79.25%,特异度为86.79%,准确度为84.9%;以病人为单位诊断盆腔淋巴结转移的准确度为85.71%,特异度为97.87%;以淋巴结为单位诊断盆腔淋巴结转移的准确度为84.61%,特异度为99.00%。结论:PET/CT显像对宫颈癌诊断,分期诊断及盆腔淋巴结转移的检出具有重要临床意义。
简介:选择适合于HAb18F(ab′)2片段抗体的冻干保护剂及其冻干工艺,是确保该生物制品的质量关键之一,对不同种类和不同浓度的保护剂进行了研究,结果表明10%蔗糖对HAb18F(ab′)2片段抗体冻干样品的剂型、外观、残水量(<3%)、复溶时间(<10s)、纯度(>95%)及稳定性没有影响.研究优化与保护剂相结合的适用于HAb18F(ab′)2片段抗体的最佳冻干工艺,为抗体片段扩大生产提供依据.
简介:TheR(replicase)proteinistheuniquelydefinednon-structuralprotein(NSP)responsibleforRNAreplication,mutationrateorfidelity,regulationoftranscrip-tionincoronavirusesandmanyotherssRNAviruses.Basedonourcompletegenomesequencesoffourisolates(BJ01-BJ04)ofSARS-CoVfromBeijing,China,weanalyzedthestructureandpredictedfunctionsoftheRproteinincomparisonwith13otherisolatesofSARS-CoVand6othercoronaviruses.TheentireORF(open-readingframe)encodesfortwomajorenzymeactivities,RNA-dependentRNApolymerase(RdRp)andproteinaseactivities.TheRpolyproteinunder-goesacomplexproteolyticprocesstoproduce15function-relatedpeptides.Ahydrophobicdomain(HOD)andahydrophilicdomain(HID)arenewlyidentifiedwithinNSP1.ThesubstitutionrateoftheRproteinisclosetotheaverageoftheSARS-CoVgenome.ThefunctionaldomainsinallNSPsoftheRproteingivedifferentphylogeneticresultsthatsuggesttheirdifferentmutationrateunderselectivepressure.ElevenhighlyconservedregionsinRdRpandtwelvecleavagesitesby3CLP(chymotrypsin-likeprotein)havebeenidentifiedaspotentialdrugtargets.Findingssuggestthatitispossibletoobtaininformationaboutthephy-logenyofSARS-CoV,aswellaspotentialtoolsfordrugdesign,genotypinganddiagnosticsofSARS.
简介:选用籼粳交组合(晚轮422×沈农265)F2为试材,分别在四川、上海、辽宁同年种植,研究在不同生态条件下穗部性状和程氏指数的变化趋势以及二者的关系。结果表明:在四川和上海穗较长、2次枝梗数较多、结实率较低并且与着粒密度呈极显著负相关,而在辽宁穗较短、1次枝梗数较多、结实率较高并且与着粒密度关系不显著。从北到南,程氏指数、叶毛、1-2穗节长、抽穗时壳色和子粒长宽比均呈偏粳分布,并且偏粳程度呈增加趋势。程氏指数与穗颈弯曲度相关性在各地区均未达显著水平;在四川与着粒密度呈显著负相关,与结实率和千粒重呈显著正相关;在上海与结实率呈显著正相关;在辽宁与着粒密度、1次枝梗数、2次枝梗数、粒数呈极显著负相关,与穗长呈显著正相关。因此,水稻超高产育种必须根据生态条件的差异合理地将协调穗部结构与亚种间杂交优缺点互补相结合。
简介:更小的谷物borer,Rhyzopertha西班牙托钵僧一是一个学生在热带的存储谷物的害虫。在2.5,3.5,5.0,7.0和10.0mL/kg的植物油(加蜜列,香甜的杏仁和椰子)对Rhyzopertha西班牙托钵僧被测试一(F.)在小麦谷物。所有生物鉴定在30℃和65%±被进行2%RH。有在高剂量(10.0mL/kg)的植物油的处理在暴露的24h以内完成了超过95%控制到刚对待的谷物。在他们的效果的三油之间有小差别。在谷物的油的坚持在处理以后是测试atshort术语存储间隔(48,72和96h)和中间术语的间隔(10,20和30天)。所有产品的活动与存储时期减少了。种子生存能力被油处理的高剂量率(10.0mL/kg)减少。对在在开发国家的传统的粮谷贮藏的虫害的增补或其他的谷物杀虫撒布剂被讨论的植物油的潜在的使用。
简介:从古巴的蝎子Rhopalurusjunceus表示昆虫选择的神经毒素(RjAa17f)的recombinantHelicoverpaarmigeranucleopolyhedrovirus(HearNPV)被用红相应再结合系统代替UDP-glucosyltransferase基因(egt)构造。另一egt删除了控制HearNPV被把egfp基因插入到egt地点以一个类似的方法构造。一步舞病毒的生长曲线和病毒的DNA复制曲线分析证实再结合没在宿主细胞影响病毒的生长和DNA复制。在在RjAa17f-HearNPV,Egfp-HearNPV和HZ8-HearNPV之间的吸藏身体形态发生没有可辨别的差别,它被传播电子显微镜学分析证实。然而,RjAa17f-HearNPV的杀虫的活动对第三中间形态H被提高。armigera幼虫根据毒力比较上的生物鉴定。在中部的致命的剂量有戏剧的减小(56.9%)(LD50)并且另外在中部的幸存时间的减小(13.4%)(为与HZ8-HearNPV相比的recombinantRjAa17f-HearNPV的圣50),但是当Egfp-HearNPV与HZ8-HearNPV相比时,仅仅在LD50的27.5%减小和在圣50的10.1%减小珍视。每日的食谱消费分析证明RjAa17f-HearNPV能禁止减HearNPV与egt相比喂的感染的幼虫。这些结果证明这新奇recombinantRjAa17f-HearNPV能对它的主人昆虫改进杀虫的效果,RjAa17f能是另外的recombinantbaculovirus构造的一个可观的候选人。
简介:【背景】多样性比较是评价转基因作物对生物群落影响的标准参数之一。以往用于描述多样性的指数很多,但这些指数各有优缺点,生物学解释不全面。运用现代生物多样性表示方法,能够描述更复杂情况下的多样性关系。本文主要介绍了Rényi多样性指数曲线在生物安全研究中的应用。【方法】Rényi多样性指数曲线与以往常用的一维多样性指数不同,当其等级参数为某些特定值时代表了几个著名的多样性指数,该方法可较为确切地评价复杂的生物群落的多样性。本文在介绍其计算公式后,通过比较河北省2种转Bt基因棉田(孟山都33B和中棉30,均未施农药)以及常规管理(施用农药)和综合治理(IPM,施用农药和释放赤眼蜂相结合)条件下非转基因棉田的蜘蛛群落,证明了该方法的适用性。【结果】Rényi多样性指数曲线分析表明了所有可能的互作类型:1个明确的多样性排序以及2类棉田蜘蛛群落间不同的潜在关系。Rényi指数分析表明,在供试棉田中,中棉30棉田的蜘蛛多样性指数最高,其他3种棉田蜘蛛的多样性高低则难以一概而论。蜘蛛稀有种的多样性以孟山都33B棉田最高,IPM和常规棉田次之;蜘蛛常见种的多样性以IPM棉田最高,常规棉田和孟山都33B棉田次之。【结论与意义】Rényi多样性指数可用于生物群落多样性的综合评价,并可用于评价不同管理措施对生物多样性的影响。该方法弥补了仅用单一数量参数评价多样性的传统方法的缺陷,将不同参数整合成一个具有内在关联的概念框架。
简介:随着环境污染加剧和人们对自身健康关注度的提高,功能性食品在全球范围内蓬勃发展。彩色稻米作为稻米家族中的一员,由于富含微量元素、花色苷、生物碱等功能性成分,已成为当前功能性食品研究开发的热点之一。本研究利用粳稻品种龙锦1号/香软米1578杂交组合214个F_5家系,对水稻糙米总花色苷含量、粒色等级和千粒重的变异及其相关性进行了分析。糙米粒色等级变异范围为1~9,平均值为4.98,变异系数为57.87%;糙米总花色苷含量变异范围为0~5459.34mg/kg,平均值为834.47mg/kg,变异系数为191.96%;糙米千粒重变异范围为11.96~26.24g,平均值为17.75g,变异系数为12.89%。糙米总花色苷含量、粒色等级和千粒重在F5家系中不符合正态分布,表现为右偏态,其中糙米总花色苷含量的偏斜程度最大。糙米总花色苷含量和千粒重的峰度系数为正值,表明为尖顶峰;而糙米粒色等级的峰度系数为负值,表明为平顶峰。糙米总花色苷含量与粒色等级呈极显著正相关,相关系数为0.69;糙米总花色苷含量、粒色等级均与千粒重呈极显著负相关,相关系数分别为-0.20和-0.34。与高亲龙锦1号相比,27个家系的糙米总花色苷含量极显著提高,占214个F_5家系的12.62%,为高花色苷水稻种质创新奠定了基础。