简介:[摘要]目的:基于文献挖掘中医药治疗抽动障碍的脾胃经药物,并运用网络药理学的方法高频脾胃经药物的作用机制进行探究。方法:收集2012年-2022年中国知网数据库、万方数据库、维普中文科技期刊数据库、中国生物医学文献服务系统中中医药治疗抽动障碍的相关文献,整理文献中的中药处方,运用中医传承辅助平台(V3.0)软件对处方进行数据分析,找到治疗抽动障碍的高频脾胃经药物。运用网络药理学的方法浅探其治疗抽动障碍的作用机制。结果:研究共筛选并录入中药处方285首,涉及中药264味。其中高频脾胃经药物为白芍、甘草、僵蚕、茯苓。共筛选出治疗抽动障碍的潜在靶点217个,交集基因的蛋白互作网络包含217个有效节点,3556条边,平均节点度32.8,经过KEGG信号通路富集分析选取前20条信号通路。结论:运用中医传承辅助平台探寻中医药治疗抽动障碍高频脾胃经药物白芍、甘草、僵蚕、茯苓,可通过多种有效成分经由多个靶点、多种信号通路对抽动障碍起到治疗作用。
简介:【摘要】目的:利用网络药理学方法筛选葛根抗阿尔茨海默病(AD)的成分及靶点,初步探讨葛根多成分、多靶点抗AD的物质基础及机制。方法:采用TCMSP数据库(OB≥30、DL≥0.18)筛选葛根活性成分,TCMSP和SwissTargetPrediction数据库预测并分析葛根的关键靶点,DisGenet、GeneCards和PharmGKB数据库获取AD相关靶点,Uniprot数据库查询靶点对应的基因,String数据库联合Cystoscope(3.9.0)软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,AutoDockTools和Pymbol软件进行分子对接,验证关键成分与靶点的结合性。结果:从葛根中筛选出4个成分,303个靶点,其中与AD相关靶点257个,显著影响MAPK级联、类固醇代谢、外来刺激等2388条生物过程,涉及钙、MAPK、PI3K-Akt、cAMP等多个信号通路,经分子对接验证PPI网络中葛根抗AD的关键化合物与靶点之间有较好的结合性。结论:利用网络药理学方法初步确定了葛根抗AD的药效成分、作用靶点及其可能调控的信号通路,为进一步研究葛根抗AD的物质基础与机制提供了科学依据。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨四逆散抗抑郁的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出165个靶点为四逆散与抑郁症的共同基因靶点。结论:四逆散在抗抑郁中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要:目的 采用网络药理学的方法研究黄芩抗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)中选择黄芩的主要活性成分,通过PubChem 分析其活性成分的结构信息。通过SwissTargetPrediction数据库检索活性成分作用靶点,并通过GeneCards和Open Targets数据库选择结直肠癌疾病相关靶点,并与活性成分靶点取交集作为黄芩治疗结直肠癌的潜在作用靶点,导入 Cytoscape构建黄芩活性成分-结直肠癌疾病靶点网络图。利用STRING构建靶蛋白互作网络。根据拓扑分析筛选黄芩治疗结直肠癌的关键药效成分与核心靶点。应用 DAVID(Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)数据库对核心治疗靶点进行GO生物学功能及KEGG通路富集分析。结果 黄芩108个活性成分通过调控67个结直肠癌相关的疾病靶点,产生了199对化合物-靶点关系,其中汉黄芩素、黄芩素发挥了中药作用,在诱导结直肠癌细胞周期阻滞、促进细胞凋亡、减少肿瘤新生血管形成发挥作用,干预IL-17、AGE/RAGE、PI3K/Akt、p38γMAPK等信号通路可对结直肠癌有治疗作用。结论 黄芩中的汉黄芩素、黄芩素类等多成分,通过多种靶点、多条通路协同发挥抗结直肠癌的作用,PTGS2 PTGS1 AR SCN5A PRSS1 NOS2 OPP4 PIK3CG ADRB2 KCNH2等可能是其核心靶点,IL-17、AGE/RAGE、PI3K/Akt、p38γMAPK等可能是其主要作用通路。
简介:摘要:目的 研究保元汤治疗虚劳病的物质基础及作用机制。方法 基于TcmSP数据库建立保元汤化学成分库并按照利宾斯基五法则(ADME)筛选保元汤的有效成分;通过SwissTargetPrediction、TTD、CTD数据库预测有效成分与虚劳病相关的靶点,并导入Metascape数据库以阐明保元汤的作用机制;根据贡献指数分析确定保元汤治疗虚劳病的物质基础。结果 保元汤45个具有良好药代动力学特征和生物活性的有效成分与虚劳病67个靶点协同发挥治疗作用;根据贡献指数分析,Panaxadiol、Tyranton、Kaempferol、quercetin、Calycosin、D-Camphor、formononetin 7个有效成分为保元汤治疗虚劳病的物质基础;对构建的网络分析发现,ABCG2、MTOR、NOS2、CYP2C19和VDR 等靶点主要参与化学致癌作用信号通路、细胞色素P450对外源性化学物质代谢信号通路、HIF-1信号通路和花生四烯酸代谢信号通路。结论 Panaxadiol、Tyranton、Kaempferol、quercetin、Calycosin、D-Camphor、formononetin 7个有效成分作为保元汤的物质基础通过调节ABCG2、MTOR、NOS2、CYP2C19和VDR等靶点以及化学致癌作用、类固醇激素生物合成、HIF-1和花生四烯酸代谢信号通路发挥治疗虚劳病的作用。
简介:[摘要] 目的:运用网络药理学方法探究消瘰丸“异病同治”甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴数据库(HERB)、中医药百科全书数据库(ETCM)及已发表文献,搜索并筛选消瘰丸组方药物的活性成分,利用TCMSP、SwissTargetPrediction平台获取活性成分的潜在靶点;通过GenCards、DrugBank、DisGeNET 数据库检索甲状腺结节、乳腺结节、子宫肌瘤相关疾病靶点;利用Cytoscape3.9.0构建与分析 “活性成分-靶点”网络;利用韦恩图获取活性成分-疾病共有靶点;借助String11.5平台构建药物疾病共有靶点的蛋白互相作用(PPI)网络; 利用 Metascape 平台对关键靶点进行GO和 KEGG通路富集分析。结果:共获得消瘰丸活性成分14个,相关靶点 139个,与3种疾病共有靶点25个;消瘰丸治疗甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤发挥“异病同治”作用的主要活性成分包括β-谷固醇、茵芋苷、谷氨酸等;药物作用的关键靶点可能为GAPDH、CASP3、BCL2、TNF、PTGS2、CCND1、MMP9、ESR1等;涉及的信号通路包括癌症通路、IL-17信号通路、雌激素信号通路等。结论:本研究基于网络药理学方法从“药物-成分-靶点-通路-疾病”多角度探讨了消瘰丸“异病同治”甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤的作用机制,主要涉及炎症反应、免疫调节、雌激素水平变化、细胞增殖、组织增生、血管异位生成等多个过程,从而为后续研究提供数据支持和理论依据。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨四君子汤防治新型冠状病毒肺炎的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出115个靶点为四君子汤与新型冠状病毒肺炎症的共同基因靶点。结论:四君子汤在防治新型冠状病毒肺炎中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:【摘要】目的 研究运用氨氯地平阿托伐他汀钙片治疗高血压并高血脂的效果。 方法 收集我院2020年4月~2021年2年收治的24例高血压并高血脂患者资料,以随机法为原则分为两组,每组12例,给予参照组阿托伐他汀钙片进行治疗,给予研究组氨氯地平阿托伐他汀钙片进行治疗,对比两组患者治疗效果。 结果
简介:摘要:目的 根据祖国医学基础思想及网络药理学理性分析和探讨“大柴胡汤”治疗梗阻性胆汁淤积性肝损伤的作用机制。方法 通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)数据库获取大柴胡汤主要化学成分及其靶点,根据ADME过程筛选药物的活性成分,利用Uniprot数据库将所获药物靶点标准化,通过Cytoscape3.8.0构建药物-活性成分-靶点网络图;通过Genecards、Disgenet、OMIM、Drugbank数据库分别获取梗阻性胆汁淤积性肝损伤靶点构成疾病靶点;利用Venny2.1获取大柴胡汤与梗阻性胆汁淤积性肝损伤交集靶点;利用Cytoscape3.8.0中内置插件Biogenet构建PPI网络并获取核心靶点;运用Metascape对核心靶点进行富集分析。结果 大柴胡汤治疗梗阻性胆汁淤积性肝损伤核心活性成分为槲皮苷、山柰酚、β-谷甾醇等,核心靶点为ESR1、FN1及MYC等。大柴胡汤治疗梗阻性胆汁淤积性肝损伤主要参与PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎、丙型肝炎、MAPK信号通路、IL-17信号通路等。结论 大柴胡汤治疗梗阻性胆汁淤积性肝损伤是多成分、多靶点、多通路共同作用的结果,为大柴胡汤的临床应用以及梗阻性胆汁淤积性肝损伤的临床研究提供了一定的理论依据。
简介:摘要:目的:基于网络药理学预测肾气丸治疗慢性肾脏病矿物质和骨异常(Chronic kidney disease -mineral and bone disorder ,CKD-MBD)的分子机制。方法:利用TCMSP数据库筛选肾气丸中熟地黄、山药、山茱萸、泽泻、牡丹皮、茯苓、桂枝、附子的活性成分和靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络;利用CTD、GeneCards、DrugBank数据库筛选CKD-MBD的潜在疾病靶点;基于Venny2.1.0在线软件取药物和疾病的交集靶点,应用STRING11.0对上述交集靶点进行蛋白互作分析(protein-protein interaction,PPI),结果输入到Cytoscape3.7.2软件,运用其插件Network Analyze和cytoHubba筛选出核心靶点;通过Metascape在线数据库对上述交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:筛选肾气丸的药物活性成分51个,对应药物靶点370个,筛选CKD-MBD靶点4294个,获得交集靶点1851个,信号通路198个,肾气丸治疗CKD-MBD的主要活性成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、花旗松素,核心靶点可能为MAPK1、AKT1、AP-1、TP53、TNF、RELA、IL-6、MAPK8、CXCL8、EGFR,关键信号通路可能为MAPK、PI3K-AKt、cAMP、cGMP-PKG。结论:基于网络药理学初步探究肾气丸治疗CKD-MBD多成分、多靶点、多通路的作用机制,为临床治疗CKD-MBD、延缓CKD进展提供了依据和思路。
简介:摘要:目的:基于网络药理学预测肾气丸治疗慢性肾脏病矿物质和骨异常(Chronic kidney disease -mineral and bone disorder ,CKD-MBD)的分子机制。方法:利用TCMSP数据库筛选肾气丸中熟地黄、山药、山茱萸、泽泻、牡丹皮、茯苓、桂枝、附子的活性成分和靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络;利用CTD、GeneCards、DrugBank数据库筛选CKD-MBD的潜在疾病靶点;基于Venny2.1.0在线软件取药物和疾病的交集靶点,应用STRING11.0对上述交集靶点进行蛋白互作分析(protein-protein interaction,PPI),结果输入到Cytoscape3.7.2软件,运用其插件Network Analyze和cytoHubba筛选出核心靶点;通过Metascape在线数据库对上述交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:筛选肾气丸的药物活性成分51个,对应药物靶点370个,筛选CKD-MBD靶点4294个,获得交集靶点185[1]个,信号通路198个,肾气丸治疗CKD-MBD的主要活性成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、花旗松素,核心靶点可能为MAPK1、AKT1、AP-1、TP53、TNF、RELA、IL-6、MAPK8、CXCL8、EGFR,关键信号通路可能为MAPK、PI3K-AKt、cAMP、cGMP-PKG。结论:基于网络药理学初步探究肾气丸治疗CKD-MBD多成分、多靶点、多通路的作用机制,为临床治疗CKD-MBD、延缓CKD进展提供了依据和思路。
简介:摘要:目的:基于网络药理学预测肾气丸治疗慢性肾脏病矿物质和骨异常(Chronic kidney disease -mineral and bone disorder ,CKD-MBD)的分子机制。方法:利用TCMSP数据库筛选肾气丸中熟地黄、山药、山茱萸、泽泻、牡丹皮、茯苓、桂枝、附子的活性成分和靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络;利用CTD、GeneCards、DrugBank数据库筛选CKD-MBD的潜在疾病靶点;基于Venny2.1.0在线软件取药物和疾病的交集靶点,应用STRING11.0对上述交集靶点进行蛋白互作分析(protein-protein interaction,PPI),结果输入到Cytoscape3.7.2软件,运用其插件Network Analyze和cytoHubba筛选出核心靶点;通过Metascape在线数据库对上述交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:筛选肾气丸的药物活性成分51个,对应药物靶点370个,筛选CKD-MBD靶点4294个,获得交集靶点185[1]个,信号通路198个,肾气丸治疗CKD-MBD的主要活性成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、花旗松素,核心靶点可能为MAPK1、AKT1、AP-1、TP53、TNF、RELA、IL-6、MAPK8、CXCL8、EGFR,关键信号通路可能为MAPK、PI3K-AKt、cAMP、cGMP-PKG。结论:基于网络药理学初步探究肾气丸治疗CKD-MBD多成分、多靶点、多通路的作用机制,为临床治疗CKD-MBD、延缓CKD进展提供了依据和思路。
简介:摘要 目的:运用网络药理学方法探讨熟地黄-骨碎补-肉苁蓉药对治疗膝关节骨性关节炎(KOA) 潜在药理学作用机制。方法:利用 TCMSP 数据库搜集熟地黄-骨碎补-肉苁蓉所含药物活性成分;利用 String 数据库、 Uniprot 数据库搜集成分靶点;利用 GeneCards 、 DisGenet 、 String 数据库、 Drugbank 数据库搜集 KOA 靶点;运用 STRING 进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,利用 Cytoscape 3.9.1 软件获取关键靶点网络图,绘制中药复方-活性成分-靶点网络图;利用 Metascape 进行 GO、KEGG 富集分析;在 PDB 和 TCMSP 数据库获取靶点和成分结构,利用 Autodock Vina 软件进行分子对接。结果:共获得熟地黄-骨碎补-肉苁蓉药对活性成分26个,药物靶点基因231个,疾病靶点基因246个,交集靶标基因共43个,GO 富集分析得到:956 个生物过程、19 个细胞组成和 76 个分子功能,KEGG 分析获得 119 条通路。①主要活性成分为:槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山奈酚、木犀草等;②关键靶点为:IL6、TNF、IL1B、PTGS2、HIF1A 等;③主要通路包括:TNF信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用; IL-17 信号通路、c型凝集素受体信号通路、Th17细胞分化等信号通路。分子对接结果显示,熟地黄-骨碎补-肉苁蓉治疗 KOA 的主要成分和关键靶点结合性能稳定。结论:熟地黄-骨碎补-肉苁蓉通过多成分、多靶点、多通路治疗 KOA,为熟地黄-骨碎补-肉苁蓉对KOA的实验研究及临床治疗将提供更多可能性,完善KOA发病机制及明确中医治疗KOA的优势,造福KOA患者的预后,提高生存质量。