简介：一个直角的图案被用来作为模板优化SSR-PCR扩大系统usingPanax人参genomicDNA。五个因素(DNA模板，TaqDNApolymerase，Mg~(2+)，教材，和dNTP)和退火的温度的四个层次在thissystem独立被测试了。结果证明反应效率被这些因素影响。放大aginsengSSR地点的基于的在结果，一个马厩，生产、可再现的PCR系统和骑车的节目被获得：包含1.0UTaqDNA聚合酶的20μL系统，2.0mmol·L~(-1)Mg~(2+),0.2mmol·L~(-1)dNTPs，0.3μmol·L~(-1)SSR教材，60ng·μL~(-1)DNA模板，用94的一个程序表现了为5的℃min，为30s的94℃，为30s在56.3℃退火，为1min的72℃，37个周期，为7min在72℃完成，并且在4℃存储。

简介：为有效利用SSR-PCR技术分析国家一级重点保护植物银缕梅的遗传多样性,采用正交试验设计L16（43）,即3因素4水平,对影响SSR-PCR扩增结果的因素（引物,模板DNA浓度和循环数）进行优化筛选,并在此基础上对聚丙烯酰胺凝胶上样量进行优化,建立了适合银缕梅的最佳SSR-PCR反应体系：10μL2×PCRMix、40ng模板DNA、10μmol/L引物,其余用ddH_2O补齐至20μL。PCR扩增程序为：95℃预变性15min,95℃变性30s,57.5℃退火1.5min,72℃延伸1min,30个循环,循环结束后,60℃延伸30min,扩增产物4℃保存。聚丙烯酰胺凝胶电泳上样量以1.5~2.0μL为最佳。利用优化后体系进行引物筛选,从18对引物中筛选出11对具有多态性引物,说明该反应体系具有良好的稳定性。该体系的建立可以为今后利用SSR标记对银缕梅遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供基础。

简介：AllfactorsaffectingthePCRsysteminPinusmassonianaLambwereinvestigatedonebyone.TheresultsshowthattheoptimumPCRsystemofEST-SSRwere:2μL10×Buffer(Mg2+Free),30ngtemplateDNA,0.1875mmol/LdNTPs,3.75mmol/LMg2+,8pmolprimerpair,1.0UTaqDNApoly-meraseintotal20μLreactionsystem.Finally,atotalof11isolatesofP.massonianawasusedfortestingthestabilityofthePCRamplification.TheresultsprovethattheoptimumPCRsystemwasstable,reliable,highlyrepetitive.

简介：Inthisstudy,28,691genomesequencesand16,566expressedsequencetags(ESTs)ofEucalyptuswerederivedfromtheGenBankdatabase.Atotalof2292SSRlociweresoughtoutfrom1785effectivesequences.ThroughanalysesofSSRlociinformation,theSSRmotiflengthwasnegativelycorrelatedwiththeabundanceoftheSSRs.IntheESTsequencesofEucalyptus,tripletrepeatmotifswerethemostabundant,anddinucleotiderepeatsmotifshadthehighestfrequencies.Subsequently,395pairsofprimersweredesignedbasedontheSSRloci.UsingoptimizedSSR-PCRconditions,340pairsofprimersweresuccessfullyscreened,withasuccessrateof86.1%.Byconstructionofamaximumlikelihoodphylogenetictreeofsixeucalyptspecies,representedbyfivespeciesofthegenusEucalyptusandoneofthegenusCorymbia,thegeneticrelationshipsofEucalyptusurophyllaandE.camaldulensissuggestedbythistreewasfoundtodifferfromthatsuggestedbytraditionalmorphologicaltaxonomy.TheresultsprovideinsightsforevaluatinggeneticdiversityofEucalyptusandanalysisofEucalyptusphylogeneticsusingSSRmarkers.

简介：在人教版高中《生物·选修3·现代生物科技专题》关于PCR的教学中，有几个问题会经常困扰教师和学生。下面就列举这些问题并作以解答。

简介：对4000条辣椒EST序列进行筛选，获得了119条含有SSR的EST，共设计出35对EST—SSR引物，占所有EST序列的0．87％。在所有的SSR—ESTs中，二核苷酸重复含量最高，其次是三核苷酸重复。GA和AGA分别是二，三核苷酸重复中含量最高的重复基元。以不育系（cytoplasmicmalesterility，CMS），保持系基因组DNA为模板，对EST—SSR引物进行筛选，首次获得Pe21、Pe26和Pe27等3对特异引物，并扩增出特异片段分别为CMSPe2160、CMSPe260、CMSPe27300.EST—SSR标记作为功能基因的一部分，可以直接揭示或反映相关基因功能，特异标记基因的一部分序列，它的应用将对进一步研究辣椒胞质雄性不育分子机理带来一定的促进作用。

简介：普通洋葱（AlliumcepaL.）是一种开放授粉的重要蔬菜作物,在洋葱品种的纯度鉴定中因其亲本保有一定程度的异质性,所以杂交种的纯度百分率难以确定。为了有效地控制杂交种的纯度质量,本研究从收集于各文献的89对引物中筛选出了12对具有多态性的引物,利用筛选出的12对SSR引物对39份洋葱种质进行分析,检测到47条多态性带,平均有效等位基因数为7.25。可变类平均法（Flexiblegrouplinkage）聚类分析表明,SSR标记可将39份洋葱划分为三大类,聚类分析结果与洋葱的自然属性是相符合的。同时发现这些标记在常规品种、亲本自交系内,甚至在杂种一代中都显示出很高的遗传异质性。为了促进和提升繁育品种质量鉴定的准确性,本研究所提出的SSR分子标记辅助育种方案,可通过选定的SSR位点纯和的原种田,制出杂交种。该方案能在选育的几个SSR位点检测出准确的杂交率,还可以有效地监测洋葱F1代杂交种的纯度质量,并且这个方案可以用于任何表现出严重的近交衰退的异花授粉作物的SSR标记分子纯度鉴定,为促进和提升繁育品种质量鉴定的准确性提供帮助。

简介：

简介：本课题组利用圭630/台湾粳的DH群体,建立了一个水稻RFLP连锁图.该图谱含175个标记,总长1224.6cM,相邻标记间平均距离为7.0cM.但该图标记分布不够均匀,存在较多空白区,且在第4和第8染色体上分别存在一个断点.本研究试图在原有RFLP图谱的基础上,添加一些SSR标记,以使该图谱标记更加密集和均匀,并消除两个断点.共筛选了361对RM引物,获得了183对多态标记,在12条染色体上共整合了57个RM标记,染色体连锁图总长度为1811.2cM,比原图谱增长了47.9%,相邻标记间平均距离为7.8cM,与原图谱相近.不过,两条染色体上的两个断点仍无法消除,暗示这两个断点区域多态性较低或重组率较高.

简介：本文通过两种方法提取红刺玫的基因组DNA，结果表明最适合的方法为磁珠法提取。以红刺玫基因组DNA为模板，优化SSR反应体系并确定反应条件，从22对SSR引物中筛选出扩增性强和稳定性好的有用引物12对；以有用引物进一步对红刺玫月季植物进行SSR，5对引物具有多态性，百分率为67～100％。该研究结果为红刺玫和月季亲缘关系分析、杂交亲本选择、以及杂交品系的鉴定奠定基础。

简介：

简介：用21个分布在谷子9条染色体上的SSR标记,对120份来自于核心种质的谷子材料进行遗传多样性研究。21个标记共检查出305个等位变异,各标记检测出的等位变异数在3～26个之间,平均每个位点检测出的等位变异数为14.5个;21个位点的平均多态信息量（PIC）为0.809。基于21个SSR标记的分子鉴定,计算了120份材料间的遗传相似系数,其变化范围为0.8393～0.9672,平均值为0.8906。根据计算的遗传距离,对120份谷子材料进行UPGMA聚类,在遗传相似系数0.8865处这些材料被划分为4个类群,分类结果与这些谷子来源地生态类型总体上表现一致,分别为西北内陆类群、黄土高原内蒙古高原类群、华北平原类群以及华北平原近年育成种类群。

简介：对甜玉米自交系1132种子经过空间诱变的材料进行表型鉴定和自交繁殖,在SP2代植株发现穗行数、穗粗、穗轴粗和穗粒重等产量性状上出现变异的果穗,通过连续自交获得穗行数、粒深、穗粗比对照明显增大的稳定变异株系,其根系也明显发达。利用分布在10条染色体的198对引物对16份稳定变异株系的进行SSR多态性分析,发现32对引物存在多态性,变异座位在玉米基因组10条染色体均有分布,但在第3、第4、第8、第9等4条染色体的变异座位明显较多,占总变异座位的69.7%。

简介：国内外关于不同地域亚洲棉遗传多样性是否存在较大差异尚无详细报道。本研究对来源于印度、越南和中国（贵州,广西和云南等省）不同地域的102份亚洲棉进行了SSR遗传多样性分析。研究结果显示，26对SSR引物共检测到103条多态性条带，平均每对引物扩增出约3.96条多态性片段；SSR引物组合平均多态性信息含量、基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.59、0.2835和0.4361；不同地域的亚洲棉遗传多样性程度不同；UPGMA聚类分析和主成分分析结果基本一致，102份亚洲棉可以聚类到三个组，来源于云南的滇亚16号与其他种质遗传距离较远，单独归为一个组。研究结果表明，亚洲棉具有丰富的遗传多样性，不同地域的亚洲棉遗传多样性不同。

简介：红菜苔是我国独有的蔬菜资源,深受消费者喜爱。利用63对SSR引物检测来自全国的45份红菜苔种质资源的遗传多样性,63对引物扩增出124条带,平均每条引物扩增出近2条带,扩增产物片段大小都在150～300bp之间,相似系数在0.56～0.89之间。结果表明,红菜苔具有丰富的遗传多样性,本研究为菜苔资源的利用和育种提供了分子生物学依据。

简介：从农业(USDA)米饭收集的美国部门的36个米饭条目的基因差异用103ILP(intron长度多型性)和54SSR(简单顺序重复)被估计标记。236和332等位基因的一个总数被ILP和SSR标记分别地检测。平均，SSR标记比ILP标记生产了更高的多型性信息内容价值和等位基因的数字。而Nei的基因距离测量了，使用SSR标记比用ILP标记测量了的高得多。壁炉架的测试显示有统计上重要的关联(r=0.827，P<0.001)在二个标记系统之间。基于ILP和SSR标记聚类的UPGMA导致了一致dendrograms。cophenetic关联系数(r=0.918，0.878和0.924，P<0.001为ILP，SSR和联合标记，分别地)证明高度精确的dendrogram在这些条目之中代表了基因距离。36个条目被划分成四个组。四非洲的Oryzaglaberrima就职在不同的组(I)以内被聚类，并且留下的条目被分开成三个组(II，III和IV)。所有条目能也被聚类进二个主要的组：一个人由III和IV组成，看作了indica组，并且其他人由构成我(O。glaberrima)并且II(像装饰用的梨树)。当indica组分享了混合祖先时，基于模型的簇分析表明像装饰用的梨树的组维持了很纯的祖先，特别为组III，它有七混合与组IV从19.5%～30.0%祖先分享(基于SSR标记)。ILP和SSR标记能为基因学习是很有用的并且在米饭繁殖，这被建议。

简介：利用SSR标记对22份果桑种质进行了基因组多态性分析,从20对引物中筛选出6对用于这些果桑种质的SSR扩增。结果是共扩增出60条DNA条带,其中A10引物多态性最好,有40条多态性带。单条引物扩增的条带数量范围为1~40条,平均10条。扩增产物长度分布在500~2000bp之前,大多集中在500~1500bp。利用VISIONWORKS软件进行Jaccard相似性系数分析,并通过非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,建立亲缘关系图。22份果桑种质资源的遗传相似系数为0.25~0.68,其中种质8-奶油蜜和23-桂椹92L38遗传相似系数最大,为0.68;1-珍珠白和12-桂花蜜遗传相似系数最小,为0.25。在NG法测定下,在遗传相似系数为0.58处,22份果桑种质亲缘关系分为两个大类群。

简介：ToinvestigategeneticdiversitiesamongtheAAgenomeOryzaspeciesintheSoutheastandSouthAsia,atotalof428accessionsoftheAAgenomeOryzaspeciesweregenotypedusing36simplesequencerepeats(SSR)markersdistributedthroughoutthericegenome.Allofthe36SSRmarkersgeneratedpolymorphicbands,revealing100%polymorphism.Thenumberofallelesperlocusrangedfrom3to17withthemeanof8.6.TheNei’sgeneticdiversityindex(He)rangedfrom0.337atRM455to0.865atRM169withanaveragevalueof0.650.ThegeneticdiversityoftheAAgenomeOryzaspeciesintheSoutheastAsiawasobviouslyhigherthanthatintheSouthAsia.AmongthedetectedOryzaspeciesintheSouthandSoutheastAsia,O.rufipogonshowedthehighestgeneticdiversity.Meanwhile,ahighergeneticdifferentiation(Fst)wasfoundamongthedetectedOryzaspeciesintheSoutheastAsiathanintheSouthAsia.TheFstvaluebetweenO.nivaraandO.sativawasthehighest.Theresultsfromthenumberofspecificalleles,specificloci,andallelefrequencyconfirmedthegreatergeneticvariationamongthedetectedspecies.Inaddition,thespecificalleleinRM161displayedhigherfrequency(0.193),suggestingitsimportantfunctioninidentifyingOryzaspeciesofAAgenome.

简介：目的探讨生殖支原体在非淋菌性尿道炎(NGU)／粘液脓性宫颈炎(MPC)中的发病情况。方法应用聚合酶链反应对236例STD门诊的非淋菌性尿道炎(NGU)／粘液脓性宫颈炎(MPC)患者泌尿生殖道标本进行了生殖支原体的检测。结果生殖支原体的阳性检出率为17．8％。结论生殖支原体在性病高危人群中有一定发病率，可引起非淋菌性尿道炎(NGU)／粘液脓性寓颈炎(MPC)。

简介：