简介：目的：利用磁珠富集法分离北柴胡微卫星序列，以开发北柴胡微卫星引物，获得有多态性的简单序列重复（SSR）标记。方法：用生物素标记的混合探针（AC）15、（AG）15、（MAB）12：和两端连接已知序列人工接头的北柴胡基因组DNA酶切片段混和后与磁珠杂交，构建微卫星序列富集的小片段插入文库；利用接头引物分别与生物素探针引物Biotin-（Ac）15、Biotin-（AG）15、Biontin-（MAB）。2形成3个组合，用PCR方法对文库进行初步筛选；对可能的阳性克隆子进行测序复筛，选取微卫星侧翼序列足够长的序列设计引物，用荧光标记的基因分型技术以栽培柴胡种质为材料分析其多态性。结果：开发了5对多态性SSR标记，它们在5份柴胡栽培种质中共扩增出30．70个多态性等位基因，平均每条引物可以扩增出6．14个多态性等位基因；观察等位基因数最多13个，最少3个；有效等位基因数最多11．4个，最少1．6个。同时分析了4对EST-SSR引物，比较了2种SSR标记扩增结果。结论：磁珠富集法是开发柴胡多态性SSR标记的有效方法。
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