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  • 简介:摘要目的分析血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)抑制性突变相关炎症机制及其潜在干预药物,为治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)提供参考。方法从肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库筛选具有ACE2突变的肺腺癌数据,采用R程序语言edgeR包与clusterProfiler包对数据进行差异分析、基因本体学(gene ontology,GO)功能富集分析与京都基因和基因数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。使用String在线分析网站对差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析,筛选出核心基因。应用表观精准治疗预测平台(Epigenomic Precision Medicine Prediction Platform,EpiMed)对关键基因进行多组学关联分析和药物预测。结果共得到差异基因1 005个,其中表达上调91个,下调914个。GO富集71条,其中生物学进程45条,细胞组分16条,分子功能10条。KEGG通路共富集13条,主要富集在炎症通路、病毒感染性疾病、转录调控、药物代谢和蛋白质消化吸收相关通路。PPI网络分析共得到252个蛋白质,H2A簇状组蛋白16、H3簇状组蛋白2、H3簇状组蛋白7、H3簇状组蛋白11、H3簇状组蛋白3、H2B簇状组蛋白3、H2B簇状组蛋白6、H4簇状组蛋白2、H1-4接头组蛋白、H2A簇状组蛋白4为筛选出的10个核心基因。α干扰素、白藜芦醇、塞来昔布、鱼腥草、连翘、地塞米松、白头翁、肿瘤坏死因子α抑制剂、甘草和泛昔洛韦可能是治疗ACE2突变相关炎症的药物。结论ACE2抑制性突变相关炎症与COVID-19发病机制类似,通过激活促进丝裂原活化蛋白激酶、Janus激酶/信号转导及转录激活因子和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白等炎症通路导致疾病发生,白藜芦醇、干扰素、塞来昔布等药物可能对COVID-19具有潜在治疗作用。

  • 标签: 血管紧张素转换酶2 炎症 2019新型冠状病毒 生物信息学 药物预测
  • 简介:摘要目的探讨晚期食管鳞癌患者放化疗的疗效,分析其预后影响因素。方法收集2002—2016年10所医疗中心608例Ⅳ期食管鳞癌患者的病历资料和随访资料,分析患者预后的影响因素。结果ⅣA期食管鳞癌患者的1、3、5年生存率分别为66.7%、29.5%和24.3%,ⅣB期患者分别为58.8%、29.0%和23.5%,两之间差异无统计学意义(P=0.255)。单因素分析结果显示,病变长度、治疗方案、计划肿瘤体积(PGTV)剂量、是否序贯化疗、贫血程度、放射性食管炎程度、放射性肺炎程度与Ⅳ期食管鳞癌放化疗患者的预后有关(均P<0.05)。多因素分析显示,PGTV剂量(OR=0.693, P=0.004)、放射性食管炎程度(OR=0.867,P=0.038)、放射性肺炎程度(OR=1.181,P=0.004)是Ⅳ期食管鳞癌患者放化疗预后的独立影响因素。结论对Ⅳ期食管鳞癌推荐放化疗后序贯化疗的综合治疗方案,能够延长患者的总生存时间,改善患者的预后。PGTV剂量≥60 Gy疗效较好。

  • 标签: 食管鳞癌 放疗 化疗 预后
  • 简介:摘要目的探讨基于代谢学技术分析六价铬[Cr(Ⅵ )]亚慢性染毒的毒作用及其机制。方法6周龄健康雌性SD大鼠29只,采用随机数字表法随机分为3,对照10只、Cr(Ⅵ)低剂量9只、Cr(Ⅵ)高剂量10只。对照大鼠饮纯净水,Cr(Ⅵ)低和Cr(Ⅵ)高剂量大鼠分别饮用10、50 mg/LCr(Ⅵ)水溶液(分别为28、140 mg/L重铬酸钾),连续染毒90 d。利用超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)联用技术检测各组大鼠的血清代谢物。采用主成分分析、偏最小二乘判别分析和正交偏最小二乘判别分析不同Cr(Ⅵ)染毒浓度大鼠血清代谢轮廓特征。Metabo Analyst 4.0软件对数据集进行代谢通路分析。结果UPLC-Q-TOF-MS/MS仪器检测性能稳定,实验检测数据可靠。对照、Cr(Ⅵ)低和Cr(Ⅵ)高剂量大鼠代谢轮廓差异明显,Cr(Ⅵ)接触致大鼠血清代谢轮廓特征发生明显改变。筛选出Cr(Ⅵ)低剂量与对照间存在18个差异代谢物,Cr(Ⅵ)高剂量和对照间存在23个差异代谢物,其中不同Cr(Ⅵ)剂量与对照有13个代谢物同时存在差异,分别是3-羟基- 11Z-十八烷基肉碱、鹅肌肽、焦磷酸法尼酯、油酰乙醇胺、亚麻油肉碱、硫胆酸3-O-葡萄糖酰胺、溶血磷脂酰胆碱[20∶2(11Z,14Z)]、溶血磷脂酰胆碱[20∶3(5Z, 8Z,11Z)]、溶血磷脂酰胆碱[22∶2(13Z,16Z)]、磷脂酰甘油[16∶0/22∶5(7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)]、磷脂酰肌醇[18∶1(11Z)/20:4(5Z,8Z,11Z, 14Z)]、磷脂酰肌醇[20∶ 3(5Z,8Z, 11Z)/18∶0],5羟色胺。甘油磷脂代谢、色氨酸代谢、戊糖与葡糖醛酸间转化、萜类骨架生物合成代谢通路与Cr(Ⅵ)亚慢性染毒相关。结论Cr(Ⅵ)亚慢性暴露可能会导致大鼠血清代谢指纹特征改变,血清差异代谢物主要与氨基酸、脂质代谢相关。

  • 标签: 液相色谱-质谱法 六价铬 代谢组学 代谢
  • 简介:摘要为寻找糖尿病足诊疗规律,本文对比研究了国内外糖尿病足指南。本文从指南制定使用的方法学、内容划分、高危足预防、糖尿病足溃疡减压、糖尿病足溃疡周围血管病变、糖尿病足感染、糖尿病足溃疡愈合、糖尿病足溃疡分类这几个部分,比较了国际糖尿病足工作2019年糖尿病足指南和中华医学会糖尿病学分会2019年糖尿病足指南。糖尿病足预防非常重要,溃疡减压以不可拆卸支具为主;存在外周动脉疾病时,要掌握手术适应证并采取合理治疗方法;有感染时,要根据严重程度不同选择不同的抗感染方法(含手术清创)。促进创面愈合的方法很多,但证据等级多不高;溃疡分类多,但无一能涵盖诊治全部需求。我国医护人员应当将国内外指南与当地医疗条件相结合、规范化地诊治糖尿病足。

  • 标签: 糖尿病足 指南 国际糖尿病足工作组 中华医学会糖尿病学分会
  • 简介:摘要目的探究甲基转移酶样蛋白3(methyltransferase like 3,METTL3)和去甲基化酶肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)在H7N9病毒感染中发挥的作用及可能的分子机制。方法利用Western blot(WB)检测H7N9病毒感染A549细胞后METTL3和FTO的表达。敲低和过表达METTL3和FTO,H7N9病毒感染后用WB和TCID50检测其对病毒复制的影响。利用转录测序方法对METTL3或FTO敲低及野生型对照细胞进行了转录水平基因差异表达分析,对发挥作用的潜在靶标进行初步分析。结果H7N9病毒感染A549细胞24 h后METTL3的表达上调,FTO无明显变化。敲低METTL3和FTO后,病毒核蛋白(nucleoprotein, NP)表达水平和病毒滴度显著下降,过表达METTL3和FTO后,病毒滴度显著增加。转录测序结果显示在METTL3或FTO敲低与对照之间分别发现314和555个差异表达基因,GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果表明这些基因与宿主免疫应答相关。结论METTL3和FTO可能通过调节宿主-病毒相互作用在H7N9病毒感染中起关键作用。

  • 标签: METTL3 FTO H7N9 转录组分析
  • 简介:【摘要 】目的 探讨MTA1和E-cadherin蛋白的表达与贲门癌的浸润、转移和分化程度之间的关系,以及它们三者之间的相关性。方法 采用免疫组织化学方法对60例贲门癌组织和18例癌旁组织中MTA1和E-cadherin蛋白的表达情况进行检测。结果 MTA1的表达与贲门癌的浸润深度无显著相关性,与贲门癌的淋巴结转移呈正相关,与分化程度呈负相关(P值分别是0.045和0.039),E-cadherin的表达与贲门癌的浸润深度、转移呈负相关(P值分别是0.039、0.020),与分化程度无关。Spearman等级相关分析显示, MTA1与E-cadherin的表达呈负相关(rs = -0.293,P

  • 标签: 贲门癌 MTA1 E-cadherin 浸润 转移 分化 相关性 免疫组织化学
  • 简介:摘要目的用全基因测序技术分析深圳市人民医院2008—2016年碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(CR-ECO)的耐药基因构成情况及相关分子流行病学特征。方法收集深圳市人民医院2008年1月1日至2016年12月31日的CR-ECO菌株,采用改良碳青霉烯类失活法和EDTA碳青霉烯类失活法进行表型确证,并采用llumina HiSeq进行二代测序,分析其耐药基因及相关分子生物学特征。结果共收集CR-ECO非重复菌株16株,经过全基因测序发现携带IMP-4基因5株,IMP-26基因1株,NDM-1基因1株,NDM-5基因4株,NDM-13基因2株。16株菌株中检测出AmpC酶和(或)超广谱β内酰胺酶(ESBL)基因及各类外排泵基因,11株CR-ECO出现OmpC膜孔蛋白基因缺失;多位点序列分型、血清学分型呈多样化。结论深圳市人民医院2008—2016年CR-ECO的耐药机制主要以产IMP型或NDM型碳青霉烯酶同时合并AmpC酶和(或)ESBL为主。利用全基因测序可快速了解菌株在基因水平上的分子生物学信息。

  • 标签: 卡巴配能类 大肠杆菌 β-内酰胺酶类 耐碳青霉烯类肠杆菌科 全基因组测序 分子流行病学
  • 简介:摘要目的探讨表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对前列腺癌细胞PC-3侵袭的影响以及组织蛋白酶B(Cathepsin B)在其中可能的作用机制。方法使用不同浓度EGCG培养组织来源为人前列腺癌分离自骨转移灶的PC-3细胞(购自中国科学院上海细胞库),形态学检查分析PC-3细胞在侵袭、迁移上的改变;实验分为对照与EGCG干预(12.5、25.0、50.0、100.0 mg/L),蛋白质印迹法(Western blot),检测不同浓度EGCG对PC-3细胞Cathepsin B合成和分泌的影响;酶联免疫吸附(ELISA)实验,检测不同浓度的EGCG对PC-3细胞CathepsinB分泌的影响。研究历时2年。间数据分析采用One-way ANOVA分析,间两两比较采用Tukey方法。结果抑制侵袭实验中,除12.5 mg/L EGCG干预(341.67±25.17,t=2.230,P>0.05)侵袭细胞数相比对照(376.33±9.50)差异无统计学意义外,25.0 mg/L EGCG干预(241.00±3.60,t=23.070,P<0.05)、50.0 mg/L EGCG干预(170.67±13.31,t=21.780,P<0.05)和100.0 mg/L EGCG干预(72.66±6.80,t=45.020,P<0.05)相比于对照明显减少,差异均有统计学意义(F=241.050,P<0.01);抑制PC-3迁移实验中,12.5 mg/L EGCG干预侵袭细胞数(0.550±0.030,t=5.730,P<0.05)、25.0 mg/L EGCG干预(0.430±0.018,t=20.740,P<0.05)、50.0 mg/L EGCG干预(0.320±0.025,t=22.620,P<0.05)和100.0 mg/L EGCG干预(0.260±0.017,t=38.830,P<0.05)相比对照(0.650±0.004)明显减少,差异均有统计学意义(F=179.60,P<0.01);Western blot结果显示,除12.5 mg/L EGCG干预(3.870±0.151,t=0.710,P>0.05)CathepsinB蛋白的合成和分泌相比对照(3.99±0.25)差异无统计学意义外,25.0 mg/L EGCG干预(3.29±0.12,t=4.370,P<0.05)、50.0 mg/L EGCG干预(2.88±0.10,t=7.140,P<0.05)和100.0 mg/L EGCG干预(2.060±0.085,t=12.660,P<0.05)相比于对照明显减少,差异均有统计学意义(F=79.080,P<0.01)。ELISA实验显示,除12.5 mg/L EGCG干预上清的Cathepsin B前酶光密度值比值(3.00±0.17,t=2.040,P>0.05)和总组织蛋白酶B含量(50.23±1.75,t=2.650,P>0.05)相比对照(3.230±0.097)和(59.65±5.91)差异无统计学意义外,25.0 mg/L EGCG干预(2.320±0.095,t=11.610,P<0.05)和(39.42±4.07,t=4.880,P<0.05)、50.0 mg/L EGCG干预(1.410±0.061,t=27.510,P<0.05)和(25.34±2.80,t=9.090,P<0.05)、100.0 mg/L EGCG干预(0.86±0.10,t=29.470,P<0.05)和(13.80±1.57,t=12.990,P<0.05)相比于对照明显减少,差异均有统计学意义(F=255.980,P<0.01和F=78.950,P<0.01)。结论EGCG抑制前列腺癌细胞PC-3侵袭,其作用机制可能与其抑制Cathepsin B蛋白的合成与分泌相关。

  • 标签: 表没食子儿茶素没食子酸酯 前列腺癌 侵袭 组织蛋白酶B
  • 简介:摘要目的比较国际预后指数(IPI)、修订国际预后指数(R-IPI)、改良国际预后指数(NCCN-IPI)及西班牙淋巴瘤/自体骨髓移植国际预后指数(GELTAMO-IPI)等预后分层模型对弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的预后评估价值。方法回顾性收集2011年9月至2016年3月山西省肿瘤医院收治的238例初治DLBCL患者的临床资料,按IPI、R-IPI、NCCN-IPI及GELTAMO-IPI对患者进行危险分层和预后评估。采用Kaplan-Meier法进行生存分析,采用Cox回归分析比较各危险患者发生进展和死亡的风险,采用Harrell′s C-incex法比较各危险分层模型的预测精确度。结果IPI低危、中低危、中高危和高危患者的3年无进展生存率分别为90.9%、67.5%、54.0%和52.4%,3年总生存率分别为93.9%、72.5%、58.0%和53.7%。预后很好、预后好和预后差患者的3年无进展生存率分别为90.9%、79.8%和53.0%,3年总生存率分别为95.5%、83.3%和55.3%。NCCN-IPI低危、中低危、中高危和高危患者的3年无进展生存率分别为91.7%、76.5%、66.7%和41.1%,3年总生存率分别为95.8%、79.4%、70.0%和42.9%。GELTAMO-IPI低危、中低危、中高危和高危患者的3年无进展生存率分别为91.3%、76.3%、67.4%和32.7%,3年总生存率分别为95.7%、80.7%、67.4%和34.5%。Cox回归分析显示,IPI中低危与低危间患者的进展风险和死亡风险差异明显(HR分别为4.144和5.085),R-IPI预后差与预后好患者的进展风险和死亡风险差异明显(HR分别为2.752和3.171),但明显弱于IPI。NCCN-IPI和GELTAMO-IPI危险分层中,均显示高危与中高危患者的进展风险和死亡风险差异明显,但GELTAMO-IPI对于高危患者的甄别能力优于NCCN-IPI(NCCN-IPI危险分层的HR分别为2.290和2.309,GELTAMO-IPI危险分层的HR分别为3.084和2.966)。Harrell′s C-incex法分析显示,IPI、R-IPI、NCCN-IPI和GELTAM0-IPI预测DLBCL患者3年无进展生存的C-index分别为0.672、0.641、0.664和0.700(均P<0.001),预测3年总生存的C-index分别为0.687、0.653、0.671和0.721(均P<0.001),其中GETAMO-IPI的C-index最高,优于其他预测模型。结论GELTAMO-IPI和NCCN-IPI对高危DLBCL患者的甄别能力优于IPI和R-IPI,且GELTAMO-IPI尤佳。GELTAMO-IPI的预测精确度明显优于其他预后分层模型。

  • 标签: 弥漫性大B细胞淋巴瘤 国际预后指数 预后
  • 简介:摘要目的探讨T1~2N0M0期食管癌根治性放疗的预后及其影响因素。方法回顾性分析泛京津冀食管癌协作10家医疗中心的196例行根治性放疗的T1~2N0M0期食管癌患者的临床资料,其中单纯放疗118例,放疗辅助化疗78例;三维适形放疗(3DCRT)96例,调强放疗(IMRT)100例。计划靶区(PTV)和大体肿瘤区(GTV)中位照射剂量均为60 Gy。中位随访59.2个月。预后影响因素的单因素分析采用Log rank检验,多因素分析采用Cox模型回归分析。结果全组患者双肺20 Gy剂量照射的体积占总体积的百分比(V20)为(18.65±7.20)%,平均剂量为(10.81±42.05)Gy。心脏V30为(14.21±12.28)%,脊髓最高剂量为(39.65±8.13)Gy。放射性肺炎发生率为14.80%(29/196),放射性食管炎发生率为65.82%(129/196),均以1~2级为主,无4级以上急性不良反应。全组患者中位总生存时间和无进展生存时间分别为70.1和62.3个月,1、3、5年总生存率分别为86.1%、65.2%和55.8%,1、3、5年无进展生存率分别为75.1%、57.4%和53.2%。多因素Cox模型回归分析显示,患者年龄(HR=1.023,P=0.038)、GTV最大横径(HR=1.243,P=0.028)是食管癌患者总生存的独立影响因素,GTV体积(HR=1.718,P=0.025)是食管癌患者无进展生存的独立影响因素。结论T1~2N0M0期食管癌患者行根治性放疗疗效较好,患者年龄、GTV最大横径和GTV体积影响放疗预后。

  • 标签: 食管肿瘤 放射疗法 三维适形放疗 调强放疗 预后