简介：目的了解结核分枝杆菌临床分离株相关基因型的分布情况，并分析北京家族菌株与耐药的相关性。方法收集浙江省结核分枝杆菌临床分离株，常规罗氏培养基培养，应用Spoligotyping进行基因分型研究，聚类分析采用BioNumerics软件，统计学分析采用卡方检验。结果70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株可分为2个基因群，即北京家族（Beijingfamily）和非北京家族（Non-Beijingfamily），分别占70％（49／70）和30％（21／70），18种基因型，其中12株为独特类型，剩余58株分为6簇。北京家族菌株中，89．8％（44／49）为典型北京家族（typicalBeijingfamily），非北京家族菌株表现为高度的基因多态性，可分为13个基因型，9株为独特的基因型。北京家族菌株中表现为全敏感者71．4％（35／49），表现为耐药者为28．6％（14／49）；而非北京家族菌株中表现为全敏感者为66．7％，表现为耐药者为33．3％，经卡方检验，两者问的差异无统计学意义（X^2=0．158，P〉0．05）。结论北京家族菌株为浙江的流行优势菌株。北京基因犁与耐药无明显相关性。

简介：摘要目的对2018年青海省一例流感样病例中分离得到的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)分离株QH/CVB5/2018进行全基因组测序及遗传特性分析。方法采用二代高通量测序对QH/CVB5/2 018分离株进行全基因组序列测定，利用SPAdes、DNAStar 7.1、MEGA 6.0、Simplot 3.5.1以及RDP4软件对病毒进行全基因组序列拼接以及遗传进化、基因重组和氨基酸突变分析。结果QH/CVB5/2018全基因组核苷酸序列长度为7 369 bp，编码含2 185个氨基酸残基的多聚蛋白。基于基因组的序列同源性和系统进化分析，显示QH/CVB5/2018与417/JS/CHN/2013同源性最高，核苷酸序列一致性为96.9%(氨基酸序列同源性为99.5%)；基于VP1序列的系统进化分析显示QH/CVB5/2018处于CVB5-C基因型；重组分析显示QH/CVB5/2018可能为CHN_SH/CVB5/2008和CHN_YN-CVB3/2009的重组株，重组发生在6 114～7 199 bp；氨基酸突变位点分析显示，相比于其他CVB5毒株，139S、864S、1086R、1693C、1814D和1819N为QH/CVB5/2018特异突变位点。结论QH/CVB5/2018分离株属于柯萨奇病毒B组5型的C组基因型，可能为重组株。

简介：摘要新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2，SARS-CoV-2）易发生变异。刺突（spike，S）蛋白是SARS-CoV-2与宿主细胞结合的重要结构，S蛋白的基因突变可能会改变病毒传染性、致病性、抗体应答等临床特征。世界卫生组织根据病毒的传染性、致病性和免疫逃逸能力，提出存疑变异株（variant of interest，VOI）和关切变异株（variant of concern，VOC）的分类。本文将对D614G变异株及流行的Alpha（B.1.1.7）、Beta（B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）和Epsilon（B.1.427/ B.1.429）变异株的最新研究进展进行概述。

简介：目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎（流脑）病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌（Neisseriameningitidis，Nm）进行多位点序列分型（multi—locussequencetyping，MLST）研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MI。ST分析对7个管家基因进行扩增并测序，确定菌株的序列型，对其相关性进行分析。结果两例病例分离株7个管家基因位点序列均不相同，第一例病例分离株的序列型为ST-7型，属高致病性ST-5complex／subgroupIII克隆系；第二例病例分离株的序列型为新发现的ST一9804型。结论广州两例B群流脑病例虽然发生时间相近，但分属不同的序列型，无同源性。MLST分型技术对研究不同流脑病例间的流行病学关系有重要意义。

简介：摘要目的了解非布鲁菌病疫区江苏省连云港市布鲁菌分离株的基因分型特征。方法对2018年连云港市第一人民医院临床微生物室血培养分离的13株疑似布鲁菌菌株进行初步鉴定；同时，采用实时荧光定量PCR（Real-time PCR）检测布鲁菌特异性基因bcsp31和插入序列IS-711，对鉴定结果进行复核和分型。运用多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因分型，测序结果用Mega 4.0软件进行编辑。结果13株分离株经初步鉴定均为布鲁菌属。经Real-time PCR检测，13株分离株均为羊种布鲁菌。MLVA结果显示，13株羊种布鲁菌分为12个基因型，且聚类在"中地中海簇"中。13株羊种布鲁菌中有3株生物1型、2株生物2型和8株生物3型。结论连云港市分离的布鲁菌菌株均为羊种布鲁菌，MLVA聚类在"中地中海簇"中。

简介：摘要目的了解浙江省猪链球菌2型(Streptococcus suis type 2，SS2)的分子分型特征。方法对浙江省2005年1月至2021年7月29株散发SS2人源分离株进行基因分型检测，采用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)、多位点序列分型(multilocus sequence typing，MLST)，以及最小核心基因组(minimum core genome，MCG)群方法，分别进行分型检测。结果29株菌株经PFGE得到10种PFGE图谱带型，3个主要分支簇群，其中21株(72.41%)被分成2个主要分支群，8株(27.59%)呈遗传多样性，相似性为49.7%~94.7%。29株菌株经MLST得到3种序列型，其中ST7型25株(86.21%)，ST1型3株(10.34%)，ST25型1株(3.45%)。29株菌株得到3个MCG基因型，其中E型12株(41.38%)，Group1型16株(55.17%)，Group4型1株(3.45%)。结论浙江省SS2主要流行两大克隆群高致病株，少数菌株传播过程中可能存在遗传变异，进化分析呈遗传多样性。

简介：目的研究136株金黄色葡萄球菌肠毒素噬菌体分型，探讨马鞍山市金黄色葡萄球菌分离株的肠毒素产生情况以及该菌在此地区的流行特点。方法运用miniVIDAS全自动荧光免疫分析仪检测肠毒素，采用常规方法进行噬菌体分型。结果136株金黄色葡萄球菌肠毒素检测中有106株为阳性，总阳性率77．9％；23种噬菌体分型有111株被分成12个型别，有90％是Ⅲ群，有25株用本次噬菌体系统无法分型，分辨率达81．6％。结论该地区产肠毒素的金黄色葡萄球菌占有很高的比率，以Ⅲ群噬菌体为主要流行株。

简介：目的了解宁波地区致泻性病原菌组成和主要流行株的基因分型,探讨菌株的同源性,为追踪传染源提供依据。方法病原菌检测采用直接与增菌分离相结合的方法;细菌鉴定采用生化筛检和API等法;细菌分型采用诊断血清和PFGE分型。结果本组9256份样本检出8类16种3473株致泻性病原菌,检出率为37.52%,以副溶血性弧菌最高,与其他病原菌比差异有统计学意义（P〈0.05）;血清分型发现副溶血性弧菌的O3群、沙门菌的甲型副伤寒、志贺菌的褔氏志贺菌、致病性大肠埃希菌O119为各病原菌的优势菌;PFGE分型副溶血性弧菌分出19个,伤寒沙门菌分出3个,甲型副伤寒沙门菌分出12个。结论副溶血性弧菌是引起宁波地区感染性腹泻最主要的流行株,PFGE分型能显示菌株间的亲缘关系,PFGE分子分型可分析菌株的来源,为流行病学追踪传染源提供依据。

简介：摘要目的了解内蒙古自治区（简称内蒙古）15株鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）差异区段（DFR）分型情况。方法对2019年内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地鄂托克旗、达茂旗和松辽平原达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地正镶白旗分离的15株鼠疫菌，采用PCR技术扩增，并进行DFR分型。结果来自鄂托克旗的2株鼠疫菌共同缺失DFR位点1、6、7、13、15、16、17、18、23，来自达茂旗和正镶白旗的13株鼠疫菌共同缺失DFR位点1、6、7、12、13、15、16、17、18、23。通过与DFR位点分布和基因型结果比对，分别归类为基因型G17和G20。结论内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地和松辽平原达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌DFR分型与历史菌株基因型相同。

简介：摘要目的明确新生儿金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus，SA)临床分离株的分子分型及毒力基因的携带特点。方法2013年1月—2019年10月从北京儿童医院共收集到189株新生儿SA临床分离株，对所有菌株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing , MLST)、葡萄球菌染色体盒(staphylococcal cassette chromosome mec, SCCmec)分型、金黄色葡萄球菌蛋白A(Staphylococcus protein A, Spa)分型，并进行了杀白细胞毒素(Panton-valentine leucocidin, PVL)基因及21种超抗原毒力基因的检测。结果189株SA临床分离株中，125株分离自呼吸道分泌物标本，55株分离自皮肤软组织感染的脓液，8株分离自血液，1株分离自胸腔积液。189株SA中有98株甲氧西林敏感SA(methicillin-susceptible SA，MSSA)及91株甲氧西林耐药SA(methicillin-resistant SA，MRSA)。MSSA克隆型较分散，共发现了42种克隆型，ST188-t189是主要的克隆型，占11%；MRSA共有26种克隆型，ST59-SCCmecⅣa -t437为主要的克隆型，占53%。MRSA中PVL的阳性率(32%)明显高于MSSA(10%)(P<0.01)，有166株菌株(88%)至少携带一种超抗原毒素基因，其中携带率最高的为肠毒素基因seq和seb，分别为47%和43%，seb-sek-seq是最常见的超抗原基因谱型。MRSA、MSSA菌株超抗原基因携带率分别为85%(77/91)和90%(88/98)，两者间无明显差异。结论新生儿MRSA与MSSA的主要克隆型不同，MRSA的主要克隆型为ST59-SCCmecⅣa -t437，MSSA的主要克隆型为ST188-t189, MSSA的克隆型更为分散。MRSA中的PVL阳性率(32%)明显高于MSSA的PVL阳性率(10%)，两者超抗原毒力基因携带率分别为85%和90%，无明显差异。

简介：摘要目的分析四川南充和新疆和田甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)分离株全基因组序列特征。方法收集2006年四川南充同1起暴发的3份和2016年新疆和田6份急性期甲肝患者血清标本，通过核酸提取、逆转录、分段巢式PCR、测序和序列拼接获得9条HAV全基因组序列。利用生物信息学软件进行系统进化、抗原中和位点、重组和选择压力分析。结果VP1-2A连接区基因分型表明9条HAV序列都属于IA亚型，分为4个不同的分支，其中3条南充序列和3条和田序列属于同一分支；全基因组序列表明，3条南充序列核苷酸和氨基酸同源性分别为99.99%～100%和100%，与3条和田序列全基因组核苷酸和氨基酸差异分别为0.50%～0.57%和0.08%～0.17%。9条HAV全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为98.29%～100%和99.62%～100%，与我国hd9和蒙古MNA12-001关系最近(核苷酸和氨基酸同源性分别为：与hd9 98.60%～99.50%和99.75%～99.92%；与MNA12-001 98.45%～99.32%和99.71%～99.87%)。9条HAV序列在已发表的抗原中和位点处未发生改变，未发现重组，选择压力分析表明处于负向选择。结论我国存在多株HAV流行株；9条HAV氨基酸序列在主要抗原中和位点处很保守。

简介：

简介：摘要本文利用长株潭地区1951-2014年逐日降水和日平均气温等资料，着重分析了基于降水距平百分率干旱指数的长株潭地区干旱特征，以期能够为当地农作物种植及结构调整提供一定的参考依据。

简介：目的研究2株产气肠杆菌临床株Ea293和Ea2880对厄他培南耐药的机制。方法采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度（MIC），应用K—B法检测菌株对美罗培南、亚胺培南及厄他培南的耐药性，改良Hodge试验检测碳青霉烯酶；聚合酶链反应（PCR）扩增碳青霉烯酶基因（KPC，IMP-1、2组，VIM）和广谱及超广谱p内酰胺酶基因（TEM，SHV，CTX-M-1、2、9组ESBLs），并进行序列分析；十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）进行细菌外膜蛋白分析，并对外膜蛋白基因OmpE36进行PCR扩增及序列分析。结果药物敏感试验显示，产气肠杆菌Ea293和Ea2880均对厄他培南耐药。PCR扩增4种碳青霉烯酶基因和5种广谱及超广谱β-内酰胺酶基因，仅Ea2880的SHV和CTX-M9组ESBLs基因阳性，SHV基因的PCR产物测序为SHV-11型广谱酶。细菌外膜蛋白SDS-PAGE结果显示，与碳青霉烯类抗生素敏感的产气肠仟菌Ea1885相比，Ea293和Ea2880均缺失42kD左右的条带，即OmpE36。PCR扩增外膜蛋白基因OmpE36，Ea2880可见预期片段，DNA序列分析显示其与GenBank公布的产气肠杆菌标准株ATCC13048的相似性为87％，氨基酸序列的相似性亦为87％；而Ea293未扩增出预期片段。结论产气肠杆菌临床株Ea293与Ea2880对厄他培南耐药的主要原因可能是外膜蛋白基因OmpE36缺失，同时Ea2880可能还有CTX-M-9组ESBLs参与。

简介：“喂,护士,帮我一下”。刚走出办公室,我即被这一熟悉而带喘息的声音叫住了。顺着声音传来的方向一看,原来是二十八床病人站在楼梯口之间,正扶着栏杆,大口地喘着气。唉,准又是下楼去转悠,老毛病又犯了,爬不上楼梯了。我急走下去,搀着他的手,关心又似责备地说:“大爷,医生不是叫你多休息吗?你怎么老住外跑。”他只是笑,没有回答,却问起我

简介：目的：对本院150株大肠埃希菌临床分离株的分布及耐药性进行分析，指导临床合理使用抗生素。方法：按卫生部《临床检验操作规程》进行菌株分离，采用德灵公司Microscan常规革兰氏阴性复合板进行菌株鉴定及药敏试验，对近2年来我院大肠埃希菌的耐药性进行回顾调查分析。结果：临床标本中共分离得到大肠埃希菌150株，其中痰标本的检出率最高占54．5%，科室分布ICU最高占20．0％，其中：氨苄西林／舒巴坦钠、氨苄西林、头孢唑啉、哌拉西林、复方新诺明耐药率〉80％，亚胺培南为1．5％，耐药率最低。

简介：摘要目的了解我院的产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌的基因分型，进一步完善该细菌的检测手段，为临床预防和控制感染提供依据。方法用K-B法检测肺炎克雷伯菌对17种常用抗生素的耐药情况；用DHPLC技术分析ESBLs各基因型的流行状况。结果肺炎克雷伯菌对亚胺培南、美罗培南和厄他培南的耐药率分别为4.5％、3.1％、8.6％，对哌拉西林／三唑巴坦、头孢哌酮／舒巴坦、阿米卡星的耐药率均低于14％，对其他抗生素耐药严重；产ESBLs肺炎克雷伯菌检出35株，检出率35％。ESBLs基因分型结果显示，多株同时携带2种或2种以上基因型，且多为CTX-M型与TEM型或SHV型基因共同存在。结论肺炎克雷伯菌临床分离株数较多，对各类抗菌药物呈现不同程度的耐药，耐药性严重，有些具有多重耐药的特点，医院应对其加强耐药性监测和控制工作；治疗肺炎克雷伯菌感染可选择碳青霉烯类、哌拉西林／三唑巴坦、头孢哌酮／舒巴坦、阿米卡星，但已出现这些抗菌药物的耐药株，应引起重视。

简介：本文对安徽省426名健康人群血清检测结果分析表明：风疹HI抗体平均阳性率为59.15%；育龄期妇女易感率为10.77%。对361名健康人群BRDⅡ株风疹减毒活疫苗免疫应答研究结果分析表明：各年龄组对风疹疫苗均有较好的免疫应答反应；免前阳性人群接种风疹疫苗仍可获得良好的免疫应答反应，显示我国选育的BRDⅡ株风疹减毒活疫苗具有良好的免疫原性。推荐我省风疹免疫策略：1）在全省建立风疹的监测；将风疹疫苗的接种纳入EPI管理规程。2）实行1岁儿童完成初种及对婚前育龄期妇女给予一针风疹疫苗的接种的方案。3）在条件许可的情况下，对全省农村地区14岁以下的儿童进行一针普种。

简介：摘要从657例泻便标本分离出弧菌属细菌73株，分离率为11.1％，以致伤弧菌(24株32.8%)、副溶血弧菌(19株26%)和河弧菌(9株9.6%)为主。0-1群霍乱弧菌9株(5.5%)经血清学鉴定均为小川型，患者呈散在发病。

简介：上海市徐汇区疾病预防控制中心在2004年11月10日检出1株痢疾志贺菌Ⅶ型,该菌株在本市未见报道,现就检测过程和结果作一报道.