简介：摘要目的了解非布鲁菌病疫区江苏省连云港市布鲁菌分离株的基因分型特征。方法对2018年连云港市第一人民医院临床微生物室血培养分离的13株疑似布鲁菌菌株进行初步鉴定；同时，采用实时荧光定量PCR（Real-time PCR）检测布鲁菌特异性基因bcsp31和插入序列IS-711，对鉴定结果进行复核和分型。运用多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因分型，测序结果用Mega 4.0软件进行编辑。结果13株分离株经初步鉴定均为布鲁菌属。经Real-time PCR检测，13株分离株均为羊种布鲁菌。MLVA结果显示，13株羊种布鲁菌分为12个基因型，且聚类在"中地中海簇"中。13株羊种布鲁菌中有3株生物1型、2株生物2型和8株生物3型。结论连云港市分离的布鲁菌菌株均为羊种布鲁菌，MLVA聚类在"中地中海簇"中。

简介：摘要目的了解内蒙古自治区（简称内蒙古）15株鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）差异区段（DFR）分型情况。方法对2019年内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地鄂托克旗、达茂旗和松辽平原达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地正镶白旗分离的15株鼠疫菌，采用PCR技术扩增，并进行DFR分型。结果来自鄂托克旗的2株鼠疫菌共同缺失DFR位点1、6、7、13、15、16、17、18、23，来自达茂旗和正镶白旗的13株鼠疫菌共同缺失DFR位点1、6、7、12、13、15、16、17、18、23。通过与DFR位点分布和基因型结果比对，分别归类为基因型G17和G20。结论内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地和松辽平原达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌DFR分型与历史菌株基因型相同。

简介：摘要目的明确新生儿金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus，SA)临床分离株的分子分型及毒力基因的携带特点。方法2013年1月—2019年10月从北京儿童医院共收集到189株新生儿SA临床分离株，对所有菌株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing , MLST)、葡萄球菌染色体盒(staphylococcal cassette chromosome mec, SCCmec)分型、金黄色葡萄球菌蛋白A(Staphylococcus protein A, Spa)分型，并进行了杀白细胞毒素(Panton-valentine leucocidin, PVL)基因及21种超抗原毒力基因的检测。结果189株SA临床分离株中，125株分离自呼吸道分泌物标本，55株分离自皮肤软组织感染的脓液，8株分离自血液，1株分离自胸腔积液。189株SA中有98株甲氧西林敏感SA(methicillin-susceptible SA，MSSA)及91株甲氧西林耐药SA(methicillin-resistant SA，MRSA)。MSSA克隆型较分散，共发现了42种克隆型，ST188-t189是主要的克隆型，占11%；MRSA共有26种克隆型，ST59-SCCmecⅣa -t437为主要的克隆型，占53%。MRSA中PVL的阳性率(32%)明显高于MSSA(10%)(P<0.01)，有166株菌株(88%)至少携带一种超抗原毒素基因，其中携带率最高的为肠毒素基因seq和seb，分别为47%和43%，seb-sek-seq是最常见的超抗原基因谱型。MRSA、MSSA菌株超抗原基因携带率分别为85%(77/91)和90%(88/98)，两者间无明显差异。结论新生儿MRSA与MSSA的主要克隆型不同，MRSA的主要克隆型为ST59-SCCmecⅣa -t437，MSSA的主要克隆型为ST188-t189, MSSA的克隆型更为分散。MRSA中的PVL阳性率(32%)明显高于MSSA的PVL阳性率(10%)，两者超抗原毒力基因携带率分别为85%和90%，无明显差异。

简介：摘要目的分析四川南充和新疆和田甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)分离株全基因组序列特征。方法收集2006年四川南充同1起暴发的3份和2016年新疆和田6份急性期甲肝患者血清标本，通过核酸提取、逆转录、分段巢式PCR、测序和序列拼接获得9条HAV全基因组序列。利用生物信息学软件进行系统进化、抗原中和位点、重组和选择压力分析。结果VP1-2A连接区基因分型表明9条HAV序列都属于IA亚型，分为4个不同的分支，其中3条南充序列和3条和田序列属于同一分支；全基因组序列表明，3条南充序列核苷酸和氨基酸同源性分别为99.99%～100%和100%，与3条和田序列全基因组核苷酸和氨基酸差异分别为0.50%～0.57%和0.08%～0.17%。9条HAV全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为98.29%～100%和99.62%～100%，与我国hd9和蒙古MNA12-001关系最近(核苷酸和氨基酸同源性分别为：与hd9 98.60%～99.50%和99.75%～99.92%；与MNA12-001 98.45%～99.32%和99.71%～99.87%)。9条HAV序列在已发表的抗原中和位点处未发生改变，未发现重组，选择压力分析表明处于负向选择。结论我国存在多株HAV流行株；9条HAV氨基酸序列在主要抗原中和位点处很保守。

简介：摘要目的比较百日咳鲍特菌耐药株与敏感株的基因型别，分析百日咳菌株耐药性演变与分子型别特征的关联性。方法于2016—2018年在监测医院和社区采集<1岁临床疑似百日咳患儿的鼻咽拭子，采用E-test法检测分离的百日咳鲍特菌对红霉素的耐药性，扩增23S rRNA基因并测序检测其2047位点耐药突变；采用多位点抗原序列分型(MAST)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对菌株进行分型。结果600份鼻咽拭子标本共分离到34株百日咳鲍特菌，其中28株对红霉素耐药，6株敏感。所有红霉素耐药株均检测到23S rRNA基因A2047G位点突变，细菌基因型均为prn1/ptxP1/ptxA1/fim3-1/fim2-1，且MLVA型别识别为MT195、MT55和MT104。6株敏感株均未检测到A2047G位点突变，细菌基因型为prn9(或prn2)/ptxP3/ptxA1/fim3-1/fim2-1，且MLVA型别全部为MT27型。结论百日咳鲍特菌红霉素耐药株与敏感株的分子分型特征不同，红霉素耐药性的获得可能伴随特定分子型别的变化。

简介：摘要目的了解1株人流感H3N2毒株的全基因组序列特征、遗传进化及生物学特性。方法对浙江省丽水市分离的1株H3N2流感毒株进行全基因组测序，从美国国立生物信息中心(NCBI)和全球倡议分享流感数据库(GISAD)获取其他流感毒株基因组全序列，通过BioEdit7.0.9将该毒株8节段基因与其他序列比对，MEGA7.0软件邻接法构建进化树，并全面分析该毒株的进化、致病力和抗原性等特征。结果测序得到该毒株为人流感分离株A/Homo sapien/China/LS340/2019（H3N2）株（LS340），LS340为典型的季节性人流感病毒，血凝素基因属于3C.2a1进化分支，具备人际传播能力，部分位点呈现高传播性和高致病性特征，对金刚烷胺耐药。与当季推荐疫苗株相比，抗原区出现涉及A、B两个表位3个位点突变。结论LS340未出现重组、缺失等较大变异，但与当季推荐疫苗株相比已经发生抗原漂变，应及时更新疫苗，同时加强此类病毒变异监测，防止流感大流行发生。

简介：

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简介：摘要目的了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus，RV)基因型及基因特征。方法2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本，经核酸检测和病毒分离后，扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列，即E1基因的739个核苷酸片段，然后与世界卫生组织(World Health Organization, WHO)推荐的13个基因型的32株参考株序列进行比对以确定基因型别，同时与我国其他省份流行RV株序列进行基因亲缘性关系分析。结果本研究分离获得4株RV病毒株，经基因亲缘性关系分析显示，这些病毒株分属于1E-Cluster A基因亚型和2B-Cluster C基因亚型，与我国同期其他省份RV流行趋势基本一致。青海省4株病毒株在氨基酸水平高度保守，但也存在地区特异性的突变位点。结论本研究为青海省风疹防控策略的制定提供了一定的实验室数据。

简介：摘要目的建立红色荧光标记金黄色葡萄球菌(金葡菌)假体感染(PJI)临床株，探究工具菌的生物学特性及和初步应用可行性。方法通过分子克隆手段构建mCherry红色荧光表达质粒，通过电转化和噬菌体转导构建红色荧光标记金葡菌PJI临床株。通过生长曲线检测，体外成膜和生物量分析和荧光强度测量鉴定工具菌生物学特性。采用RAW264.7细胞株、工具菌建立共培养模型。采用该模型示踪不同锌离子浓度处理的巨噬细胞对于荧光PJI金葡菌吞噬能力。使用独立样本t检验、重复测量方差分析对定量数据进行统计。结果使用Gibson系统成功构建了荧光表达质粒pRMC2-pts-mCherry，并且使用噬菌体Phage11将该质粒成功导入金葡菌假体感染临床株ST1792。较之于野生株ST1792，荧光金葡菌ST1792-pRMC2-pts-mCherry两者的生长曲线没有统计学差异(F＝0.012，P>0.05)。在0.5%葡萄糖胰蛋白胨大豆肉汤培养基(TSBG)内，两者的生物膜光密度(OD)值分别为(3.700±0.003)和(3.715±0.042)(t＝0.6056，P>0.05)；10%滑液中生物膜OD值为(3.682±0.084)和(3.648±0.095)(t＝0.474，P >0.05)。使用动物活体成像系统(IVIS)检测荧光强度，24 h荧光强度为(1.95± 0.04)、48 h荧光为(1.94±0.13)、72 h荧光强度为(1.95±0.04)，荧光强度72 h稳定(F＝2.944，P>0.05)。通过荧光显微镜观察以及菌落形成单位(CFU)计数评价发现，使用锌离子浓度30～60 μmol/L不含抗生素的培养基处理RAW264.7 24 h，可以促进其吞噬金葡菌，其中30 μmol/L吞噬率为(44±4)%(t ＝4.75，P<0.01)、45 μmol/L吞噬率为(45±6)%(t＝4.086，P<0.05)、60 μmol/L离子处理的巨噬细胞，其吞噬率为(38±4)%(t ＝4.786，P <0.01)。结论本研究成功构建红色荧光临床PJI金葡菌，并验证其用于PJI相关体外吞噬研究的可行性。

简介：摘要： 【目的】 回顾性研究我院临床分离鲍曼不动杆菌的耐药情况，为临床抗感染治疗提供理论依据。【方法】 收集 2016年至 2018年我院临床分离的鲍曼不动杆菌 756株， 菌株通过VITEK® 60型全自动微生物分析仪进行初步鉴定 和药敏试验。【结果】 756株鲍曼不动杆菌主要分离自痰液（ 89.1%），病区分布以 ICU为主，占 52%。 756株鲍曼不动杆菌对头孢菌素类、碳青霉烯类、氟喹诺酮类和氨基糖苷类抗菌药物具有较高的耐药性，且对碳青霉烯类的不敏感率有逐年增长的趋势 。【结论】 本院3年间鲍曼不动杆菌的临床标本来源及病区分布没有明显变化，主要引起呼吸道感染，对多种抗菌药物耐药情况严重。

简介：[摘 要] 目的 探究我院分离培养的114株耐药碳青酶烯肺炎克雷伯菌（ CRKP）的药物敏感性，耐药基因分型，并进行同源性分析 ， 为临床疾病的防治提供重要的理论依据，并指导临床抗菌药物的合理使用。方法 选取我院2016年 1月至 2018年 12月期间收治的临床住院患者 送检标本 分离培养的114株 非重复性 耐药CRKP。采用 VITECK2全自动细菌鉴定药敏仪对上述耐药菌重新进行菌种鉴定并验证其对碳青酶烯 以及其他临床抗菌药物单药或联合用药 的药敏分析 。改良碳青霉烯灭活试验（ mCIM）检测碳青霉烯酶，乙二胺四乙酸（ EDTA）协同法检测金属酶， PCR 扩增和基因测序技术检测其耐药基因。 通过 脉冲场凝胶电泳 (pulsed field gel electrophoresis， PFGE)分析 114 株菌株 的 同源性。 结果 采用 VITECK2全自动细菌鉴定药敏仪鉴定结果表明上述耐药菌对青霉素类、头孢菌素类和碳青霉烯类药物的耐药率均位于 95%-100%；对氨基糖苷类、喹诺酮类、四环素类和氯霉素类药物的耐药率分别为 70%-75%、 82%-87%、 90-95%和 80-84%，差异有统计学意义（ P <0.05）。此外，该耐药菌对 β-内酰胺类（青霉素类或头孢菌素类或碳青霉烯类）联合氨基糖苷类、喹诺酮类联合氨基糖苷类、氨基糖苷类联合四环素类或氯霉素类的耐药率均位于 57%-66%、 61%-77%、 79%-84%和 68-76%，差异有统计学意义（ P <0.05）。 114株 CRKP经 m CIM检测结果均显示阳性，阳性率为 100%； EDTA协同试验结果显示 8株为阳性，阳性率为 7.02%。经耐药基因检测及测序结果比对显示， IMP、 KPC和 NDM的基因型别为 IMP-4、 KPC-2和 NDM-1。临床耐药发生率逐年上升，差异有统计学意（ P < 0.05）。拉丝试验结果显示高毒力 CRKP1检出率为 16.67%；同时 rep-PCR结果显示 114株 CRKP分为 A-F 6类型，以 A型为主（ 80.71%）。通过 Bio Numerics 软件分析 PFGE条带的聚类情况，本研究 114株 CRKP分为 A-F 6类型， A型为主（ 80.71%， 92/114）， B-F型分别为 4.39%(5/114)、 3.51%(4/114)、 3.51%(4/114)、 4.39%(5/114)和 3.51%(4/114)，与 A型相比差异与统计学意义（ χ2=15.736， P = 0.001）。 结论 CR-KP是导致临床患者肺部感染的主要致病菌，且极易发生多重耐药现象，并随着患者住院时间的延长感染率逐渐上升，提示加强临床用药过程对交叉感染的防护措施，并及时监测致病菌的变化及耐药趋势对临床抗广谱耐药菌的治疗至关重要。

简介：

简介：摘要目的了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后，PCR对其进行eae基因检测，阳性增菌液接种麦康凯琼脂，挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR（clpX、lysP和mdh基因）、16S rRNA基因序列分析及多位点序列分型（Multiocus sequence typing，MLST）鉴定。结果本研究共采集了250份样品，经eae基因检测、生化鉴定、三重PCR检测、16S rRNA及MLST聚类分析，确定2株不发酵乳糖、木糖，无动力，eae、clpX、lysP和mdh基因阳性的菌株为艾伯特埃希菌。进一步对该2株艾伯特埃希菌毒力基因分析发现，该菌株携带Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ组亚型 cdtB基因，但均不携带stx基因。结论本研究表明山西省鸡类中存在艾伯特埃希菌带菌的情况。

简介：摘要目的了解耐多药结核分枝杆菌的药敏谱，为耐多药结核病（MDR-TB）的临床药物选择和防控提供科学依据。方法选取既往收集的MDR-TB 167株，采用lysX基因测序方法进行基因分型，并采用微孔板药敏法及BACTECTM MGIT 960TM液体培养法对其进行13种抗结核药物的敏感性检测，分析不同基因型MDR-TB菌株与耐药表型的相关性及药物交叉耐药情况。采用χ2检验比较计数资料组间差异。结果167株MDR-TB菌株对除异烟肼、利福平外11种抗结核药物总耐药率为95.81%，准广泛耐药结核病（pre-XDR）比例为31.14%（52/167），广泛耐药结核病比例为6.59%（11/167）。北京基因型中链霉素耐药率高于非北京基因型，差异有统计学意义（χ2=30.682，P<0.05），非北京基因型中pre-XDR比例高于北京基因型，差异有统计学意义（χ2=5.332，P<0.05）；氧氟沙星耐药率和吡嗪酰胺耐药率在现代北京基因型与古典北京基因型中差异有统计学意义（χ2=4.105和χ2=3.912，P<0.05）。利福平与利福布汀存在交叉耐药，交叉耐药率为86.23%，且不同程度利福平耐药组间利福布汀耐药率差异有统计学意义（χ2=45.912，P<0.05）。氧氟沙星耐药与莫西沙星耐药有相关性、阿米卡星耐药与卡那霉素耐药有相关性，r分别为0.87和0.91。结论MDR-TB菌株对11种抗结核药物呈高度耐药，且同类型药物之间交叉耐药较为严重；北京基因型菌株是MDR-TB的主要流行菌株，与链霉素耐药高度相关。

简介：

简介：【摘要】目的：急诊预检分诊标准在急诊分诊工作中应用效果研究。方法：选取 2019年 6月～ 12月我院急诊科的 200例患者，随机分为观察组（ 100例）和对照组（ 100例）。对照组应用常规分诊，观察组应用急诊预检分诊标准，对比两组患者的分诊效果和对就诊服务的满意度评分。结果：观察组的分诊效果均优于对照组（ P＜ 0.05）；观察组的就诊服务满意度评分均高于对照组（ P＜ 0.05）；观察组的不良事件发生率小于对照组（ P＜ 0.05） 。结论：在患者分诊中应用急诊预检分诊标准的效果更好，能有效提高患者的分诊效率和质量，缓解护患关系，提高患者对就诊服务的满意度，有利于医院树立良好口碑，值得推广应用。

简介：

简介：摘要目的分析江苏省25株新型冠状病毒(2019-nCoV)全基因组序列，研究其进化特征。方法使用高通量测序技术对确诊病例咽拭子样本进行测序，使用CLC Genomics Workbench 12.0分析单核苷酸多态性(SNP)，MEGA5.1分析病毒进化特征。结果25株病毒共检测到52处碱基突变，进化分析显示25株病毒分成2个进化分支，分支1含有8 782和28 144位置CT连锁SNPs，而分支2此2位置突变为TC，即8 782 (ORF1ab: C8517T,同义突变)和28 144(ORF8: T251C, L84S)。分支2中5株病毒还含有24 034(S：C2 472T，同义突变)、26 729(M：T207C，同义突变)和28 077(ORF8：G184C，V62 L)连锁SNPs，聚成亚组A，不同分支/亚组在人群分布及与疾病关系无显著差异。结论2019-nCoV出现了SNPs，其对病毒传播力、致病性等影响有待进一步研究。

简介：摘要目的分析本院805株铜绿假单胞菌的临床分布及耐药性特点，为临床合理使用抗生素及有效的院感控制提供依据。方法通过回顾性分析方法，采用WHONET5.6软件，对本院2018年6月至2019年12月检出的铜绿假单胞菌的标本来源、科室分布和耐药性等特征进行分析。结果2018年6月至2019年12月共检出铜绿假单胞菌805株，这些菌株大部分分布在烧伤整形外科24.60%（198/805），泌尿外科16.02%（129/805），创伤骨科10.31%（83/805）和重症医学科6.46%（52/805）；标本分布：伤口分泌物379株，尿液192株，痰液97株，血液82株，脓液18株，其他标本37株；药敏结果显示，铜绿假单胞菌对多粘菌素B和阿米卡星的敏感性较高，敏感率分别为98.01%（789/805）和96.64%（778/805），而对氨曲南和替卡西林/棒酸的敏感性较低，敏感率分别为76.89%（619/805）和54.29%（437/805），对其他常见抗生素（天然耐药除外）的敏感率则在80.00%以上。结论本院铜绿假单胞菌的临床分布不均匀，部分药物的耐药性也比较高，医院相关部门要做好病原菌监测工作和合理使用抗生素。