简介:摘 要:目的 用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法 从中药系统药理学分析平台( TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用 OMIM、 TTD 和 PharmGkb 数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用 Excel 筛选分子和靶标, Cytoscape 软件建立柴胡疏肝散的中药成分 -靶点网络图,通过生物学信息注释数据库( DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析。结果 从数据库筛选出柴胡疏肝散 122 个中药成分与卒中后抑郁的 42 个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体( ESR1)、前列素内环氧化物合成酶 2( PTGS2)、糖原合成酶激酶 3β( GSK3β)、 SLC6A4 和白三烯 A4 水解酶( LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、 5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。结论 通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。
简介:摘要目的评价及比较双相障碍维持期药物治疗策略的临床疗效。方法对PubMed、EMBASE、PsycINFO、中国期刊全文数据库、万方数据平台和中国生物医学文献数据库2019年11月21日前发表的有关双相障碍维持期单药或联合药物治疗的随机对照研究进行检索,治疗时间至少12周,选取复发患者占总治疗人数的比例作为临床疗效的结局指标。采用频率学框架(frequentists)的网络Meta分析(network meta-analyses,NMA)随机效应模型评估20种双相障碍维持期药物治疗(锂盐、丙咪嗪、锂盐+丙咪嗪、卡马西平、锂盐+卡马西平、丙戊酸盐、拉莫三嗪、氟西汀、奥氮平、阿立哌唑、奥卡西平、喹硫平、锂盐+丙戊酸盐、利培酮长效针剂、拉莫三嗪+丙戊酸盐、阿立哌唑+拉莫三嗪、帕利哌酮、齐拉西酮、鲁拉西酮、喹硫平缓释剂)的临床疗效。由2位研究者按照纳入与排除标准共同进行文献筛选、资料提取和质量评价后,采用Stata 14.0软件进行数据分析。结果最终纳入40篇文献,共计10 431例患者,包含20种双相障碍维持期的药物干预方式。临床疗效方面,排序前五位依次为:鲁拉西酮、喹硫平、奥氮平、锂盐+卡马西平和阿立哌唑+丙戊酸盐。锂盐(RR:0.78, 95%CI:0.62~0.97)、奥氮平(RR:0.51, 95%CI:0.35~0.75)、喹硫平(RR:0.50, 95%CI:0.33~0.74)、鲁拉西酮(RR:0.40, 95%CI:0.19~0.83)显著优于安慰剂。结论锂盐、奥氮平、喹硫平和鲁拉西酮单药治疗策略比安慰剂有效,其他单药和联合治疗策略尚有待证实。
简介:摘 要:目的 用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法 从中药系统药理学分析平台( TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用 OMIM、 TTD 和 PharmGkb 数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用 Excel 筛选分子和靶标, Cytoscape 软件建立柴胡疏肝散的中药成分 -靶点网络图,通过生物学信息注释数据库( DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析。结果 从数据库筛选出柴胡疏肝散 122 个中药成分与卒中后抑郁的 42 个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体( ESR1)、前列素内环氧化物合成酶 2( PTGS2)、糖原合成酶激酶 3β( GSK3β)、 SLC6A4 和白三烯 A4 水解酶( LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、 5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。结论 通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。
简介:摘要糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)是糖尿病的一种常见的微血管并发症,此类患者存在复杂的代谢紊乱,患者进入终末期后的治疗非常棘手,而且其预后比非糖尿病肾病患者差。因此,我们迫切需要清楚地了解DKD的发病机制。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类能在不同水平调控蛋白质编码基因的表达但不编码蛋白质的RNA。研究发现多种lncRNA在DKD发生发展的不同过程发挥重要作用。相比于可预测的蛋白质编码基因突变带来的影响,lncRNA突变带来的影响非常难以预测。目前lncRNA在不同疾病中的研究已经呈井喷之势。大量文献对lncRNA在DKD中发挥的作用进行了论证,DKD中差异表达的lncRNA可以通过多种信号通路如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT等诱导包括细胞质基质沉积、纤维化、炎性反应、足细胞及肾小管损伤等在内的各种表型的改变。lncRNA调控DKD表型的分子机制及涉及的信号通路错综复杂,本文旨在总结DKD中lncRNA的研究进展,并在最新证据下根据调控的不同表型将lncRNA以及信号传导通路进行整合,便于宏观视角下把握lncRNA在DKD中发挥的作用,为之后的lncRNA研究提供见解。
简介:摘要菌斑微生物之间存在复杂的相互作用,在环境因素的影响下可使群落产生重构,促进牙周炎的发生与发展。关键微生物在调节微生物群落动态变化中十分重要。在牙周微生态中,共存网络构建和分析的方法有助于筛选牙周炎相关的关键微生物以便进一步进行实验研究。这些微生物如牙龈卟啉单胞菌等可以作为微生物成员的重要联络者协同调节群落毒力等特征,或作为响应环境因素的重要调控因子如介导免疫失衡推动群落结构和功能重塑。本文将从微生物共存网络构建、应用网络拓扑分析技术进行关键微生物筛选与预测,以及与牙周炎发生发展相关的关键微生物等方面进行综述,为进一步确定关键微生物以及研究此类微生物在群落动态变化中的作用提供参考。
简介:摘要目的探讨人工神经网络在腹腔镜操作培训中的应用价值。方法采用前瞻性队列研究方法。选取2019年9—11月陆军军医大学第一附属医院158名腹腔镜零基础学员(2019级、2018级、2017级外科硕士研究生52名,外科规培生58名,实习生12名,进修生36名)进行腹腔镜操作培训。采用随机数字表法将学员分为两组。进行人工神经网络腹腔镜模拟器培训的学员设为人工神经网络组;进行箱式腹腔镜模拟器培训的学员设为普通腹腔镜模拟器组。两组学员利用各组的模拟器,接受10 h(为期5 d的连续训练,每天训练时长为2 h)培训,培训内容为腹腔镜手术基本技能。观察指标:(1)两组学员培训前后腹腔镜模拟器操作成绩比较。(2)两组学员培训后腹腔镜模拟器操作成绩提高程度比较。正态分布的计量资料以±s表示,组内比较采用配对t检验,组间比较采用独立样本t检验。偏态分布的计量资料以M(范围)表示。结果筛选出符合条件的学员158名,男140例、女18例;中位年龄为27岁,年龄范围为20~34岁。158名学员中,人工神经网络组79名;普通腹腔镜模拟器组79名。(1)两组学员培训前后腹腔镜模拟器操作成绩比较:人工神经网络组学员培训前钉子转移、图案切割、结扎、体内缝合打结、体外缝合打结分别为(51.2±4.9)分、(45.6±3.7)分、(43.0±3.6)分、(42.1±3.1)分、(39.6±3.1)分,学员培训后上述指标分别为(78.6±3.0)分、(76.4±3.9)分、(79.9±2.5)分、(78.3±3.5)分、(84.1±3.8)分,学员培训前后上述指标比较,差异均有统计学意义(t=-42.490,-56.256,-80.373,-70.802,-79.742,P<0.05)。普通腹腔镜模拟器组学员培训前上述指标分别为(50.1±2.9)分、(45.4±3.9)分、(42.7±3.0)分、(42.3±3.4)分、(39.2±4.7)分,学员培训后上述指标分别为(70.4±5.0)分、(69.8±4.0)分、(72.3±3.3)分、(72.3±3.5)分、(72.8±3.2)分,学员培训前后上述指标比较,差异均有统计学意义(t=-28.942,-42.436,-58.357,-52.322,-53.098,P<0.05)。(2)两组学员培训后腹腔镜模拟器成绩提高程度比较:人工神经网络组学员培训后钉子转移、图案切割、结扎、体内缝合打结、体外缝合打结操作成绩提高程度分别为(27.4±5.7)分、(30.8±5.0)分、(36.9±4.1)分、(36.2±4.5)分、(39.5±5.4)分,普通腹腔镜模拟器组学员培训后上述指标分别为(20.3±6.2)分、(24.4±5.1)分、(29.6±4.5)分、(29.9±5.1)分、(33.5±5.6)分,两组学员上述指标比较,差异均有统计学意义(t=7.597,7.946,10.638,8.200,6.969,P<0.05)。结论腹腔镜操作培训中引入人工神经网络可以提高培训效果。
简介:摘要目的学习和本地化搭建生物样本库信息管理系统,为临床医学研究建立生物样本资源信息管理平台提供应用解决方案。方法通过对OpenSpecimen平台本地化搭建及推广,结合平台本身特色和调研外部使用情况,对该资源信息管理平台网络化建设进行探讨。结果建立了一套标准、稳定及系统的资源信息管理平台,可保障医学研究项目的开展。结论OpenSpecimen是一个开源的、免费的、并由专业开发团队维护的资源信息管理系统。系统以流水线过程为特色,汇集了基于标准的高质量数据,并使用了国际建立的标准,例如医学系统命名法-临床术语、国际疾病分类标准及观测指标标识符逻辑命名与编码系统,并允许用户自定义标准化编码系统等,提高了样本资源信息数据的标准化建设,简化了样本资源管理流程,为实现多个医学样本库间信息交换建立了通用的接口。
简介:摘要目的用精准自动勾画女性肠道器官的Dense V-Network模型对宫颈癌患者进行训练并评估。方法将Dense Net与V-Net2个网络模型进行融合,形成一种用于三维CT图像自动分割的Dense V-Network算法。160例宫颈癌患者CT数据被随机分为训练集130例用于调整模型参数,测试集30例用于评估自动分割效果。采用戴斯相似性系数(DSC)等8个参数定量评估分割效果。结果小肠DSC、杰卡德距离、体积差异性系数、敏感性指数、包容性指数、豪斯多夫距离、轮廓平均差异、质心偏差分别为0.86±0.03、0.25±0.04、0.10±0.07、0.88±0.05、0.85±0.05、(2.98±0.61) cm、(2.40±0.45) mm、(4.13±1.74) mm,结果优于单一算法(均P<0.05)。结论Dense V-Network算法可较为准确地分割肠道器官,医生修改审查简单易行,可用于临床。
简介:[摘要] 目的:运用网络药理学探讨何首乌药物性肝损伤机制。方法:检索TCMSP等获取化合物结构信息,用药效基团匹配法获得潜在药物靶点,进行GO、KEGG、REACTOME富集,蛋白PPI网络聚类和生物过程分析,运用构建化合物-靶点-生物过程-药理作用的网络并进行拓扑学分析。结果:获得化合物24个;靶点32个;GO富集BP 29条、MF 29条和CC 26条,KEGG 9条,REACTOME 86条;蛋白PPI网络聚类分5组和两相生物转化;HBSY网络节点70个、集中度0.358。结论:何首乌蒽醌、二苯乙烯、黄酮可能作用于生物转化一、二相反应相关靶点,导致药物性肝损伤。
简介:摘要目的提出一种新型脉冲神经元模型及其网络,描述其建模方法,并用计算机模拟验证其性能。方法在充分考虑生物学适应性(激活电位阈值和不应期开关),及其对尖峰放电脉冲产生及其传导的动态调节机制基础上,在新型脉冲神经元模型中引入了突出后电位多通道滤波器,实现了输出电流及神经元突触强度的动态调节。提出基于自适应最小均方(LMS)的误差反向传播(BP)学习算法,并将其应用于尖峰放电神经网络的调节。结果在自发噪声下,新型脉冲神经元模型的尖峰放电间期信号直方图满足泊松分布。通过2个新型脉冲神经元的简单连接,可以形成多种复杂的尖峰放电模式。新型脉冲神经元模型具有自发本征噪声的特征,能够形成复杂的周期尖峰放电模式。对于输入噪声控制,该模型的不应期与门限电位适应性参数的稳定性较好。刺激电流-尖峰放电脉冲频率间的线性关系较好。结论所提出的新型脉冲神经元模型在自发噪声条件下能产生多种模式的振荡和相干振荡,这与生物神经元极其相似,能实现复杂的噪声信号处理。所采用的具有不同频带的多通道突触后电位滤波器,能使一些突触后电位信号变得平稳。所提出的基于于自适应LMS的BP学习算法克服了尖峰放电信号的瞬态变化特性导致的误差驱动学习算法无法应用的问题。
简介:摘要目的探讨基于卷积神经网络(CNN)的人体行为识别在新一代院前急救中的应用。方法从蒙特利尔跌倒视频数据集获取60份视频,按5∶1比例分为模型训练数据和评价测试数据。①数据模型训练:利用奇异值分解对图片进行清晰化处理,通过目标检测与傅里叶变换识别图片中人体的目标边界,将人体曲线描绘出来;利用OpenCv计算机视觉和机器学习软件库人体姿态估计将人体的重要部位(如臀部、膝盖)标出,计算重要部位连线与水平方向的夹角及检测框架的长宽比例,识别人体是否具有异常行为。②评价测试:从模型训练数据集中随机提取6个视频,每个视频抽取10个1帧,将每帧看成一张图片,对每帧进行CNN行为识别,计算正常行为和异常行为的识别率。结果数据模型训练过程中,对每帧进行人为的标签化,训练CNN人体行为识别模型。评测结果显示,正常行为识别率为(90.33±3.03)%,异常行为识别率为(87.74±2.88)%。结论在路人发生危险行为时,通过CNN识别人体行为可判断其是否处于危急状态,并及时发出预警,对院前急救起到至关重要的作用。
简介:摘要目的运用独立成分分析法(independent component analysis,ICA)探究神经根型颈椎病(cervical spondylotic radiculopathy,CSR)慢性颈肩痛患者脑默认网络(default mode network,DMN)功能连接的变化。材料与方法采用3.0 T MR对29名受试者进行颅脑常规扫描、高分辨率3D-T1结构像及静息态功能MRI扫描,扫描结束后收集每例患者视觉模拟评分(visual analogue score,VAS)数据。采用ICA分离及识别默认网络,组间对比分析两组DMN功能连接的改变,将有差异的脑区功能连接强度与VAS评分进行pearson相关性分析。结果神经根型颈椎病慢性颈肩痛患者丘脑、海马、基底核、左侧颞中回及楔前叶的功能连接强度减低,右侧颞上回功能连接增强。海马的功能连接强度与VAS得分存在负相关(r=-0.546,P=0.043)。结论CSR慢性颈肩痛患者的脑DMN功能连接强度发生变化,可能与患者的认知痛觉加工、情绪处理和记忆功能变化相关。
简介:摘要目的探讨抑郁症患者达临床治愈后突显网络功能连接的变化。方法选取22名健康对照者(对照组)和17例临床治愈抑郁症患者(临床治愈组)进行静息态功能磁共振成像(resting-state functional magnetic resonance imaging,rs-fMRI)扫描,抑郁症患者在临床治愈基线期以及治愈6个月时分别进行扫描,对rs-fMRI数据进行常规预处理,利用独立成分分析(independent component analysis,ICA)提取突显网络,采用t检验比较基线期、治愈6个月临床治愈组与对照组的突显网络功能连接差异,并对结果进行AlphaSim校正。结果与对照组相比,基线期临床治愈组背外侧前额叶(t=2.84)功能连接值增高(P<0.01,AlphaSim校正);与基线期相比,治愈6个月的抑郁症患者内侧前额叶(t=4.08)功能连接值增高,而楔前叶(t=-3.06)和背外侧前额叶(t=-2.98)功能连接值减低(P<0.01,AlphaSim校正)。结论抑郁症患者达临床治愈后突显网络功能连接水平在6个月中并不稳定,基线期临床治愈抑郁症患者突显网络仍存在功能连接异常的脑区,而临床治愈6个月未见突显网络功能连接异常脑区。