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  • 简介:摘要DNA甲基是指通过DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,再将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶的过程,目前已有研究表明DNA甲基等表观遗传因素在糖尿病肾脏病(diabetic kidney disease,DKD)的发生发展中起着重要作用。DKD是糖尿病严重的微血管病变之一,其特征是肾小球和肾小管间质中细胞外基质蛋白的过度合成和沉积,最终导致肾小球硬化和间质纤维。而肾脏纤维是组织学水平上最终导致终末期肾衰竭的共同途径。DNA甲基通过调控肾脏纤维影响DKD的发展进程,本文旨在对DNA甲基促进DKD中肾脏纤维的研究进展进行综述。

  • 标签: 纤维化 表观遗传学 DNA甲基化 糖尿病肾脏病
  • 简介:摘要RA是慢性侵蚀性关节炎为特征的自身免疫病,病理特征为滑膜炎和血管翳。RA的发病机制目前尚不明确,遗传因素及环境风险因素与RA的发病相关。DNA甲基在RA的发生发展过程中发挥重要作用,有望成为RA治疗新的可行靶点。

  • 标签: DNA甲基化 关节炎,类风湿 发病机制
  • 简介:目的:寻找和鉴定对顺铂耐药胃癌细胞的异常甲基基因。方法:我们拟胃癌细胞和耐药细胞为研究对象,采用DNA甲基芯片,对比分析两种细胞DNA甲基表达谱差异,结合甲基特异性PCR(MS-PCR)技术验证获得的异常甲基基因。结果:利用DNA甲基谱芯片对胃癌细胞和耐药细胞两个细胞系的基因组DNA甲基谱进行分析,发现1095个甲基差异位点;并筛选出36个高甲基,14个低甲基修饰基因。然后通过MS-PCR方法对这50个基因的甲基修饰在细胞水平上又进行了验证分析,最终筛选出与甲基谱芯片结果一致的14种基因,包括11种高甲基和3种低甲基修饰基因。结论:胃癌癌细胞发生顺铂耐药时,细胞基因组存在广泛的DNA甲基修饰改变。

  • 标签: 胃癌 DNA甲基化 顺铂 耐药
  • 简介:摘要目前膀胱癌的诊断和复发监测主要通过有创性的膀胱镜检查实现,而尿液无创诊断技术如脱落细胞学、荧光原位杂交(FISH)和膀胱肿瘤抗原(BTA)等敏感性和/或特异性不高,容易出现漏诊和误诊。因此,开发高灵敏度的膀胱癌无创诊断技术可在降低患者痛苦的同时改善其诊疗现状。近日,国际著名杂志《Journal of Clinical Investigation》发表了我国学者的研究成果,黄健/林天歆团队开发了一项基于尿液DNA甲基的膀胱癌无创诊断技术,其敏感性明显优于目前临床常用的脱落细胞学和FISH检查,尤其在早期、微小、残留和复发膀胱癌诊断中展示出显著优势,明显提高了膀胱癌的检出率。该技术有望减少膀胱镜的使用,为膀胱癌精准诊疗提供新方案。本文对膀胱癌的无创诊断技术现状、尿液DNA甲基检测在膀胱癌诊断中的优势,以及尿液无创诊断的发展趋势进行阐述。

  • 标签: 膀胱肿瘤 膀胱癌 无创诊断 DNA甲基化
  • 简介:摘要糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是糖尿病的主要并发症之一,也是终末期肾功能衰竭的主要原因。代谢记忆,即之前存在的高血糖增加了发生DN的风险,造成了长期的代谢紊乱。已有研究显示,表观遗传学与代谢记忆存在一定的相关性。表观遗传学是指在不改变核苷酸序列的前提下,引起基因表达模式的可遗传性变化,包括DNA甲基、组蛋白的共价修饰和非编码RNAs。最近发现一些基因,AFF3、RGMA-MCTP2、SP3-CDCA7及其变异体与糖尿病肾病的相关性,已经达到全基因组性显著,更加说明表观遗传对糖尿病肾病发生发展的影响。本综述主要讨论糖尿病肾病患者的体液(包括唾液、尿液及外周血液)以及肾组织中DNA甲基改变的发现和进展,进一步了解表观遗传在人类DN中的机制作用,并为DN表观遗传学的新兴课题提供新观点。

  • 标签: 表观遗传学 DNA甲基化 糖尿病肾病
  • 简介:摘要慢性阻塞性肺疾病是全球慢性病发病及致死的主要原因,其发病受到遗传因素和危险因素暴露的影响,二者由表观遗传机制介导。DNA甲基是目前研究最为深入的一种表观遗传学修饰,甲基水平变化调控基因表达,从而参与慢性阻塞性肺疾病的发生发展。本文对近年来由吸烟、职业粉尘以及室内室外空气污染源暴露等危险因素引起DNA甲基变化而导致慢性阻塞性肺疾病发生的研究进行综述。

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  • 简介:摘要慢性阻塞性肺疾病(ChronicObstructivePulmonaryDisease,COPD)是现代社会常见病和多发病。随着生活环境的日益恶化,COPD受到广泛关注。研究发现COPD是一种慢性系统性疾病,其发展与遗传和环境因素及其相互作用有关,且越来越多的研究表明表观基因组是遗传和环境暴露之间的重要纽带。因此,本文就表观遗传学中的DNA甲基和环境暴露共同作用对于COPD的影响进行探讨。

  • 标签: COPD DNA甲基化 环境暴露 氧化应激 炎症反应
  • 简介:摘要目的研究不明原因自然流产患者绒毛组织中H19启动子区域甲基水平与正常早孕绒毛的差异,并分析其可能的发生机制。方法收集不明原因自然流产及正常早孕的绒毛组织各30例,对组织中H19基因启动区域甲基水平进行检测及对照分析,并对两组绒毛组织中的三种甲基转移酶的表达水平进行对照分析。结果H19上游DMR中甲基水平检测结果提示两组间绒毛组织中H19启动子区域甲基水平存在差异,自然流产组中甲基水平明显低于对照组,差异有显著性(P<0.01),自然流产组绒毛组织DNMT1mRNA及蛋白的表达量与正常早孕组无明显统计学差异(P>0.05),而自然流产组绒毛组织DNMT3a及DNMT3b的mRNA及蛋白的表达量明显低于正常早孕组,差异有显著性(P<0.01)。结论自然流产患者绒毛组织中H19DNA甲基水平的明显下降,下调DNA甲基转移酶中DNMT3a与DNMT3b的表达可能是甲基水平差异的重要机制之一。

  • 标签: DNA甲基化 H19基因 自然流产 印迹基因
  • 简介:摘要目的探讨大骨节病和骨性关节炎的软骨细胞是否存在过早衰老。方法收集大骨节病、骨性关节炎和对照组的膝关节软骨样本各5例,样本均来源于西安交通大学第二附属医院。提取膝关节软骨样本DNA,采用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片技术对其进行DNA甲基分析。同时,基于全基因组甲基数据,利用线上DNA甲基衰老时钟计算器(https://dnamage.genetics.ucla.edu/home)计算样本的DNA甲基年龄,并与实际年龄进行比较。结果在大骨节病组与对照组的比较中,发现1 212个差异甲基CpG位点,包括497个高甲基CpG位点和715个低甲基CpG位点,分别对应264个高甲基基因和368个低甲基基因;在骨性关节炎组与对照组的比较中,发现656个差异甲基CpG位点,包括343个高甲基CpG位点和313个低甲基CpG位点,分别对应177个高甲基基因和174个低甲基基因。在上述比较中,检测到367个重叠CpG位点(对应182个基因),这些位点在大骨节病组与对照组以及骨性关节炎组与对照组的比较中均存在差异甲基表达。DNA甲基衰老时钟结果表明,大骨节病、骨性关节炎以及对照组DNA甲基年龄与实际年龄的平均年龄加速度差异分别为2.549、0.017、- 5.364岁,大骨节病组和骨性关节炎组DNA甲基年龄均大于实际年龄。结论大骨节病和骨性关节炎的软骨细胞均存在过早衰老。

  • 标签: 地方性变形性骨关节炎 软骨细胞 衰老 DNA甲基化
  • 简介:摘要骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的异质性髓系克隆性疾病,具有高风险向急性髓细胞白血病(AML)转化的特点。MDS患者的自然病程及预后异质性较大,个体治疗策略对其尤为重要。自2004年甲基药物(HAM)获得美国食品药品监督管理局(FDA)批准上市,用于治疗MDS以来,迄今该药仍为治疗较高危MDS患者的一线药物。笔者拟就HMA单药治疗较高危MDS患者、以HMA为基础的联合治疗MDS方案、HMA用于治疗接受造血干细胞移植(HSCT)MDS患者的研究进展及临床治疗现状与应用前景进行阐述。

  • 标签: 骨髓增生异常综合征 药物疗法 去甲基化药物 联合治疗 造血干细胞移植
  • 简介:为了创造杨树甲基变异新种质,本研究以国外引进的优良欧洲黑杨种质资源N46(P.nigra'N46')无菌苗叶片为材料,通过在分化培养基中添加5-azaC(800μmol/L)的诱变方法,在再生植株群体中获得了一个圆叶突变株系M800-18。该株系叶片数量明显增多、叶片长宽比显著增大,叶绿素a、叶绿素b含量降低、光合能力下降,同时该株系保护酶活性显著增强,但其生长速度与对照基本相当。甲基敏感扩增多态性分析(MSAP)结果表明,变异株系叶片基因组DNA甲基水平均比对照显著升高。皮尔逊相关性分析结果表明,该株系DNA甲基水平与叶片数量呈显著正相关,全甲基、总甲基水平与光合参数的各项指标均呈显著负相关,说明圆叶突变株系表型的变化很可能是由于甲基的升高引起的。研究结果为研究杨树叶片形状变异的表观遗传基础研究及生产应用奠定了基础。

  • 标签: 欧洲黑杨N46 DNA甲基化 5-azaC 突变体 生理特性
  • 简介:摘要循环肿瘤DNA(ctDNA)是血液中由肿瘤细胞释放的DNA片段,含有癌症相关基因突变和表观遗传学变异。DNA甲基变异是发生于癌变早期,随肿瘤进展动态变化的一类表观遗传学改变。液体活检ctDNA甲基具有无创、靶分子稳定、成本效益良好、诊断性能高、应用范围广等优势,监测其水平有助于肿瘤的早期诊断、预后评估。其分析前流程和甲基检测方法显著影响检测结果,需加以规范以获得高质量检测结果。迄今为止,已发表大量文献报道ctDNA甲基在肿瘤诊断和预后中的应用。相信在不久的将来,能够实现ctDNA甲基检验流程标准,进而推广ctDNA甲基液体活检项目的大范围临床应用。

  • 标签: 循环肿瘤DNA 甲基化 肿瘤诊断预后
  • 简介:摘要目的探讨燃煤污染型地方性氟中毒(简称燃煤型氟中毒)患者外周血DNA甲基模式及甲基差异基因,为氟化物诱导机体损伤的发病机制研究提供依据。方法采用病例-对照研究方法,在贵州省六盘水水城县辖内常年敞灶燃用高氟煤的陡箐乡选择10例重度氟中毒患者为病例组,并在同地区以木柴为主要燃料的花嘎乡选择10例无氟中毒症状者为对照组。采集两组人群外周血,采用简并代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)技术,分析外周血全基因组DNA甲基模式(n = 4)、DNA差异甲基区域(differentially methylated region,DMR),结合DMR差异程度(log2Ratio值)和KEGG通路富集分析筛选甲基差异基因;采用实时荧光定量PCR,验证候选甲基差异基因的mRNA表达水平(n = 10)。结果甲基模式分析结果显示,病例组与对照组基因DNA的所有C碱基甲基水平分别为(61.53 ± 0.59)%、(62.48 ± 1.53)%;其中,CG位点甲基水平分别为(63.75 ± 0.65)%、(64.36 ± 1.01)%,CHG位点分别为(13.79 ± 0.72)%、(16.69 ± 4.06)%,CHH位点分别为(25.12 ± 1.72)%、(29.77 ± 3.97)%。与对照组比较,病例组患者分布在不同常染色体上的DMR共有1 000段;其中19号染色体最多,为104段。DMR相关基因978个,其中高甲基基因265个、低甲基基因713个;KEGG通路富集分析结果显示,甲基差异基因主要参与细胞新陈代谢、癌症发生、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)等信号通路;结合DMR差异程度,以高甲基的琥珀酸脱氢酶复合物黄素蛋白亚基A假基因3(SDHAP3,log2Ratio = 3.487)和低甲基的核因子κB抑制剂激酶调节亚基γ(IKBKG,log2Ratio =-4.436)为候选基因。病例组与对照组人群SDHAP3(0.54 ± 0.08、1.00 ± 0.00)、IKBKG mRNA表达水平(1.32 ± 0.39、1.00 ± 0.00)比较,差异均有统计学意义(F = 22.94、15.09,P < 0.01或< 0.05)。结论燃煤型氟中毒患者与对照人群基因组中存在大量的甲基差异基因,其中髙甲基的SDHAP3及低甲基的IKBKG可能参与了燃煤污染型氟化物诱导的机体损伤。

  • 标签: 氟化物 DNA甲基化 机体损伤
  • 简介:摘要:DNA甲基检测法在法医学中的应用前景广阔,主要涉及到亲权鉴定的工作,在特殊案例中DNA甲基检测法的应用具有一定价值,尤其可以解决同卵双生的鉴定问题,为法医学的个体甄别提供新思路,同时还能借助甲基状态与SNP“二等位基因”类似性的特点,实现法医学多态性标记目的,给法医学的发展带来更多新的机遇。为了充分发挥DNA甲基在法医学中的应用价值和优势,下文分析和研究DNA甲基在法医学中的检测方法,提出几点检测方面的建议,旨在为法医学中DNA甲基检测法的合理应用与长远发展提供帮助。

  • 标签: DNA甲基化 法医学 应用前景 检测方法 研究进展
  • 简介:结直肠癌是多种致癌因素作用下发生的恶性肿瘤,预后差,病死率较高。常用的结直肠癌筛查方法包括普通结肠镜检查、弯曲乙状结肠镜检查、愈创木脂化学法粪隐血试验、免疫化学粪隐血试验、粪便DNA检测、CT结肠成像以及血清癌胚抗原检测等,但这些检查均有缺陷。SEPT9DNA甲基水平升高与结直肠癌的发生相关,检测外周血SEPT9DNA甲基水平进行结直肠癌筛查,适合在易感人群中推广普及。本文就外周血SEPT9DNA甲基检测在结直肠癌筛查中的应用作一综述。

  • 标签: 结直肠肿瘤 筛查 SEPT9 DNA甲基化 诊断
  • 简介:摘要幼年型粒单核细胞白血病(JMML)是一类诊治较为困难的儿童造血系统恶性疾病,近年来研究发现基因启动子异常DNA甲基在JMML的发病机制中占据重要地位,并与临床不良预后显著相关。全基因组甲基水平分析证实了DNA甲基与疾病不同临床亚型的相关性,对临床结局具有预测作用。部分临床案例和体外研究表明,甲基药物对JMML的治疗有一定效果。本文对异常DNA甲基在JMML中的研究进展进行综述。

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  • 简介:摘要 目的 探讨非小细胞肺癌顺铂治疗与DNA甲基水平改变的相关性。方法 收集2019年1月-2020年1月经本院收治非小细胞肺癌50例为研究对象,均行顺铂化疗方案治疗,采集顺铂化疗前肺泡灌洗液标本,采用亚硫酸盐修饰和RT-PCR方法分析SHOX2和RASSF1A基因启动子的甲基水平,采集化疗前、后血液样本,通过ELISA方法测定血清中DNMT1、DNMT3a、DNMT3b的表达水平,且持续跟踪受试者治疗情况,评估患者SHOX2和RASSF1A基因甲基水平以及DNMTs浓度与肿瘤进展、顺铂耐药之间的相关性。结果 50例非小细胞肺癌患者经RT-PCR法后结果显示:SHOX2基因启动子甲基阳性37例,阳性率74.0%,RASSF1A基因启动子甲基阳性31例,阳性率为62.0%;化疗后DNMT1、DNMT3a、DNMT3b表达水平低于化疗前,差异有统计学意义(P

  • 标签: 非小细胞肺癌 顺铂 DNA甲基化
  • 简介:摘要:目的:分析粪便DNA甲基检验对结直肠癌患者早期筛查的价值。方法:从2021年1月-2023年1月期间入院接受结直肠癌筛查的高危人群120例作为研究对象,所有患者在肠镜前做一次粪便SDC2和TFPI2基因检测,同时以大便潜血、CEA、肠镜作为对照,盲法检测对比,分析比较各种方法对结直肠癌检测意义。结果:对于结直肠癌高危人群的筛查中,粪便SDC2和TFPI2基因甲基检测在大肠癌和大肠腺瘤的筛查中阳性率分别高于血清CEA检测和大便潜血检测(P0.05)。

  • 标签: 粪便DNA甲基化检测 结直肠癌 早期筛查