多囊卵巢综合征的circRNA-miRNA-mRNA调控网络生物信息学分析及其验证

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摘要 摘要目的通过构建多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者卵丘颗粒细胞的环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)调控网络,并进行临床标本验证,以探寻PCOS发病机制并提供诊疗靶点。方法使用R软件分析来自基因表达图谱(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据,得到差异表达的circRNA、miRNA、mRNA;使用CircInteractome、Starbase数据库,预测构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。回顾性研究收集2018年1月至2018年12月期间于郑州大学第二附属医院生殖医学部就诊的PCOS患者(记为PCOS组,n=40)和因男方或者输卵管因素治疗的患者(记为对照组,n=20)的卵丘颗粒细胞,提取RNA后进行实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)验证。结果筛选出278个差异表达mRNA、23个差异miRNA和2402个差异circRNA(P<0.05和 |log2FC|>0.8);构建256条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包含13个mRNA、2个miRNA和40个circRNA;临床验证后提示,妊娠相关血浆蛋白A(pregnancy-associated plasma protein A,PAPPA)、hsa-miR-127-3p、hsa_circ_0086809/hsa_circ_0063556及其调控网络与PCOS相关(P=0.004、P=0.002、P=0.014、P=0.003)。结论卵丘颗粒细胞中PAPPA、hsa-miR-127-3p、hsa_circ_0086809/hsa_circ_0063556的表达水平及其调控网络与PCOS发生相关。
出处 《中华生殖与避孕杂志》 2022年05期
出版日期 2022年12月13日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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