A Novel Interpretation of Structural Dot Plots of Genomes Derived from the Analysis of Two Strains ofNeisseria meningitidis

(整期优先)网络出版时间:2010-03-13
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Neisseriameningitidis是侵略meningococcal疾病的代理人,包括服的脑膜炎和败血病。因为不同的同种细胞的组(顺序类型)引起的疾病有他们的自己的流行病学的特征,在N的染色体之中理解差别是重要的。meningitidis同种细胞的组。到这个目的,染色体的一个结构的点阴谋的新奇解释被设计并且适用;在N的染色体之间的准确核苷酸火柴。meningitidisserogroupA紧张Z2491和serogroupB紧张MC58被识别,导致各种各样的结构的区域的说明。知道并且为每N的通常认为的毒力基因。meningitidis紧张然后被分类进这些区域。我们比Z2491做那些发现MC58的毒力基因更趋于到translocated区域(在新顺序上下文的chromosomal片断),显著地向在translocated区域和在同一直线上的区域之一之间的接口趋于。在在同一直线上的区域以内,毒力基因趋于在准确火柴发生在差距的16kb以内。用在每秒字符数地点聚类的基因的这些趋势的确认是足够地支持的建议这些趋势能被用来集中搜索为并且在这二个有机体毒力基因和致病力的机制理解。