学科分类
/ 1
15 个结果
  • 简介:为了学习简历,活跃代谢物由导出海绵的未耕作的共生者生产了,海绵Gelliodesgracilis的共生者的一个metagenomicDNA图书馆被构造。DNA的平均尺寸在图书馆插入是20kb。这个图书馆用纸圆盘assaying为抗菌素活动被屏蔽。二克隆对小球菌tetragenus显示了抗菌剂活动。这二克隆的代谢物通过HPLC被分析。结果证明他们的代谢物与主人E的那些相当不同。包含向量pHZ132的关口iDH5α和主人。这研究可以介绍一条新途径给探索简历海绵共生者的活跃代谢物。

  • 标签: 海绵 共生体 生物活性 代谢物 生物化学
  • 简介:Inthisstudy,theentiremitochondrialDNA(mtDNA)controlregion(CR)ofPholisfangiwasamplifiedviapolymerasechainreactionfollowedbydirectsequencing.ThelengthofthemtDNACRconsensussequenceofP.fangiwas853bpinlength.Inaccordancewiththerecognitionsitesaswerepreviouslyreportedinfishspecies,themtDNACRsequenceofP.fangicanbedividedinto3domains,i.e.,theextendedterminalassociatedsequence(ETAS),thecentralconservedsequenceblock(CSB),andtheCSBdomain.Inaddition,thefollowingstructureswereidentifiedinthemtDNACRsequenceofP.fangi:2ETASsintheETASdomain(TASandcTAS),6CSBsinthecentralCSBdomain(CSB-FtoCSB-A),and3CSBsintheCSBdomain(CSB-1toCSB-3).ThesedemonstratedthatthestructureofthemtDNACRofP.fangiwassubstantiallydifferentfromthoseofmostotherfishspecies.ThemtDNACRsequenceofP.fangicontainedoneconservedregionfrom656bpto815bp.Similartomostotherfishspecies,P.fangihasnotandemrepeatsequencesinitsmtDNACRsequence.PhylogeneticanalysisbasedonthecompletemtDNACRsequencesshowedthattherewerenogeneticdifferenceswithinP.fangipopulationsofthesamegeographicaloriginandbetweenP.fangipopulationsofdifferentgeographicalorigins.

  • 标签: 线粒体DNA控制区 结构 系统学 DNA序列 MTDNA 聚合酶链反应
  • 简介:Mercury(Hg)isoneofthecommonlyencounteredheavymetals,whichiswidespreadininshoresedimentsofChina.InordertoinvestigatethetoxicityofHgonmarineinvertebrates,westudiedtheeffectsofthedivalentmercuricion(Hg2+)(attwofinalconcentrationsof0.0025and0.0050mgL-1,preparedwithHgCl2)onmetallothionein(MT)content,DNAintegrity(DNAstrandbreaks)andcatalase(CAT)inthegillsandhepatopancreas,antioxidantenzymeactivitiesofsuperoxidedismutase(SOD),catalase(CAT)andglutathioneperoxidase(GPx),inthehemolymph,gillsandhepatopancreasoftheportunidcrabCharybdisjaponicaforanexperimentperiodupto15d.TheresultsindicatedthatMTwassignificantlyinducedafter3d,withapositivecorrelationwithHg2+doseandtimeinthehepatopancreasandanegativecorrelationwithHg2+doseandtimeinthegills.WhileCATinthehemolymphwasnotdetected,itincreasedinthehepatopancreasduringtheentireexperiment;SODandGPxinthethreetissueswerestimulatedafter12h,bothattainedpeakvalueandthenreducedduringtheexperimentalperiod.Meanwhile,DNAstrandbreakswereallinducedsignificantlyafter12h.TheseresultssuggestedthedetoxificationstrategiesagainstHg2+inthreetissuesofC.japonica.

  • 标签: DNA链断裂 过氧化氢酶 氯化汞 整性 螃蟹 日本蟳
  • 简介:Aciladivaricata(Hinds,1843)andA.mirabilis(AdamsandReeve,1850)arecommonbenthicbivalvesinChina.Anumberofresearchershaveproposedthatthelatterspeciesisajuniorsynonymoftheformerspecies.Becauseofmorphologicalsimilarities,itisdifficulttodistinguishthesetwospeciesbasedonvisualexaminationonly.Forbetterunderstandingoftheirtaxonomy,themitochondrialCOIgenefragmentsoffiveindividualsofA.divaricatafromtheEastChinaSeaandsixindividualsofA.mirabilisfromtheYellowSeaweresequencedinthisstudy.ThephylogeneticrelationshipsoftheobtainedCOIsequences,togetherwithnineteensequencesofthreespeciesofthegenusNucula,wereanalyzed.Thepairwiseintra-andinter-specificdistancesfortheCOIsequencesrangedfrom0.002to0.017andfrom0.128to0.134,respectively,andnooverlapwasfound.Phylogenetically,A.divaricataandA.mirabilisformdistinctcladesandclusterintoasistertoallotherNuculaspecies.TheresultsindicatedthatA.divaricataandA.mirabilisaretwodistinctspecies.Thedifferencesinthemorphologyanddistributionbetweenthetwospecieswerebrieflydiscussed.

  • 标签: 线粒体 物种 杆菌 防风 DNA 系统发育关系
  • 简介:用垂直凝胶电泳来研究采自中国的(条斑紫菜×坛紫菜)杂交种、坛紫菜、条斑紫菜、少精紫菜、半叶紫菜的同工多态性。然后分析最小可能位点数和观察同位基因数、遗传差异性和采用平均连接聚类法。选取23种带中的六个(MDH,ME,LDH,GDH,IDH和G-6-PDH)进行分析。最小可能等位基因位点数显示五种紫菜在ME等位基因位点都只有一个。LDH和GDH等位基因位点半叶紫菜和少精紫菜和另外的三种紫菜不同,而在分析MDH时半叶紫菜比较独特。在IDH位点分析时少精紫菜和坛紫菜和其他三种不同,而条斑紫菜和坛紫菜和其他三种不同在G-6-PDH位点不一致。总的来看,最小可能等位基因位点数分析半叶紫菜是最分离的。遗传多样性结果分析表明当遗传相似度为0.7550时,五种紫菜中的遗传变异研究受到限制。条斑紫菜和坛紫菜的杂交种非常接近少精紫菜。当遗传相似度达到0.8937时,出乎意料的是条斑紫菜和坛紫菜遗传同一。性很低。条斑紫菜4个株系的平均遗传相似度仅为0.7428,差异比较大。在所有紫菜中半叶紫菜是最分化的分支,它与最小可能等位基因位点数分析一致。

  • 标签: 紫菜 同工酶 等位基因 基因位点 遗传多样性
  • 简介:Inthispaper,wetooktheleadinstudyingonspecificityofthemicrosatelliteDNAlociandapplicabilityofmicrosatelliteDNAprimersinprotozoa.Inordertostudycharactersofmicrosatellitesinfree-livingprotozoa,eightmicrosatellitelociprimersdevelopedfromTrypanosomacruzi(MCLE01,SCLE10,MCLE08,SCLE11,MCLF10,MCLG10,MCL03,MCL05)wereemployedtoamplifymicrosatelliteinfourfree-livingprotozoa,includingBododesignis,EuglenagracilisFACHB848,ParameciumbruziseandTetrahymenathermophilaBF1.IntheamplificationsystemsofP.bruzise,fourloci(SCLE10,SCLE11,MCLF10,MCL03)wereamplifiedsuccessfully,andfouramplificationfragmentswereinpropersize.IngenomeofE.gracilisFACHB848,fiveofeightprimersbroughtfiveclearamplificationbands.InB.designis,three(No.4,5and7)ofeightlociproducedclearandsharpproductswithoutstutterbands,whereasnobandsappearedinT.thermophilaBF1.Further,eight300-500bpamplificationfragmentswereclonedandsequenced.Nevertheless,allsequencedproductsdidnotcontaincorrespondingmicrosatellitesequence,althoughBodoisinthesameorderandhasthenearestphylogeneticrelationwithTrypanosomaamongthesefourspecies.Thus,themicrosatelliteDNAprimerscannotbeappliedamongorderormorefartaxa,andthespecificityofmicrosatelliteDNAisveryhighinprotozoa.TheresultsofthisstudywillcontributetoourunderstandingofmicrosatelliteDNAinprotozoa.

  • 标签: 原生动物 DNA分析 锥虫 多行性 水生生物
  • 简介:Saccharina是最重要的无热水设备生活水兵褐之一海藻的类。在这研究,我们分析了S的transcriptome。装饰用的梨树,它属于1000植物(OneKP)工程,由使用定序技术的下一代的高产量的DNA。未加工的数据的大约5.16GB被产生,并且有454bp的平均长度的65536脚手架与肥皂denovo汇编方法被装配。总共,19040unigenes被强风识别;25734脚手架被聚类进37基因本体论功能的组;6760脚手架被分类进25个轮牙范畴,以及被分到306条KEGG小径的2665脚手架。unigenes的多数比另外的cyanobacteria,海洋的硅藻,和植物包括棕色的水藻和硅藻展出了更多的类似到水藻。Saccharina装饰用的梨树有突出的能力积累象Br那样的卤素,我从海水经由halogenation处理。我们在S获得了42不同钒依赖者haloperoxidases(vHPO)。装饰用的梨树transcriptome数据,包括钒依赖者iodoperoxidase(vIPO)的5个片断和钒依赖者bromoperoxidase(vBPO)的37个片断。识别fulllengthS的复杂分析。装饰用的梨树vBPO1和S。装饰用的梨树vBPO2在在海洋的海藻的vBPOs和vIPOs之间的棕色的水藻和强壮的关系的种类之中揭示了vBPO的重要性。这研究将提高我们生物特征的理解和S的经济价值。装饰用的梨树种类。

  • 标签: DNA测序技术 过氧化物酶 粳稻品种 基因本体论 高通量 转录
  • 简介:温度是水生生物尤其是贝类生存环境的关键因素之一。为了探究温度对岩扇贝无水保活和抗氧化系统的影响,本试验进行了温度对不同干露条件下岩扇贝存活率、半致死时间(LTd的影响以及温度胁迫对岩扇贝幼贝抗氧化活力的影响两项不同的试验。为了探明温度对岩扇贝存活率和半致死时间的影响,在实验室条件下,进行了的岩扇贝(壳长为(397±50)mm)在不同温度(5℃、15℃)、湿度(保湿组、不保湿组)和氧气(充氧组、不充氧组)环境下的生存分析、影响半致死时间的因素效应分析。结果发现低温、保湿、充氧均可以显著提高岩扇叽存活率、半致死时间(P〈0.05),其中温度变化对岩扇贝的半致死时间影响最显著,其次时氧气,最后是湿度。在三个因素的交互作用中,温度和湿度、温度和氧气交互作用显著(P〉0.05),湿度和氧气交互作用不显著(P〈0.05)。这为确定岩扇贝苗种运输时间提供了重要依据。为探究温度变化对岩扇贝幼贝抗氧化系统的响应,试验从低温开始逐渐升温(5℃、10℃、15℃、20℃、25℃),检测岩扇贝幼贝抗氧化活力(超氧化物歧化活力SOD、过氧化氢活力CAT、总抗氧化能力T-AOC)的变化。结果显示,岩扇贝幼贝SOD活力在5℃时显著低于其余组SOD活力(P〈0.05),在10℃至25℃间,SOD活力不存在显著性差异(P〉0.05);CAT活力在5℃至20℃间变化不显著(P〉0.05),在25℃时显著高于其余组CAT活力(P〈0.05);T-AOC水平在15℃时显著高于其余组(P〈0.05),温度从15℃升高或降低T-AOC活力都会显著下降(P〈0.05),降温下降幅度显著高于升温(P〈0.05)。这表明高温对岩扇贝幼贝组织液中CAT活力有着明显的诱导作用、对T-AOC活力有着明显的抑制作用;低温对岩扇贝幼贝组织液中SOD、T-AOC活力有着明显的抑制

  • 标签: 岩扇贝 幼贝 温度 无水保活 抗氧化酶活力
  • 简介:单细胞淡水绿藻-雨生红球藻能够在一定条件积累一种次生类胡萝卜素-虾青素,因而在生长后期藻体变为深红色。其中,IPP异构在雨生红球藻中的虾青素合成过程中发挥了重要作用。在本研究中,我们首次通过基因组上游步移克隆到了雨生红球藻中IPP异构基因的两个不同5’上游侧翼序列,大小分别是1.8kb和2.5kb。利用生物信息学方法分别对这两个不同5’上游侧翼序列进行了序列分析,结果发现,二者具有某些相同的顺式作用元件,如可能的脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box,GAG-motif,I-boxandATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、水杨酸反应元件(TCA-element)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)、缺氧特异反应中的增强子类似元件(GC-motif)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE),但是二者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中IPP异构基因转录调控方式的多样化。

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5’上游侧翼学列 雨生红球藻 IPP异构酶基因
  • 简介:单细胞淡水绿藻—雨生红球藻能够在一定条件积累一种次生类胡萝卜素—虾青素,因而在生长后期藻体变为深红色。其中,IPP异构在雨生红球藻中的虾青素合成过程中发挥了重要作用。在本研究中,我们首次通过基因组上游步移克隆到了雨生红球藻中IPP异构基因的两个不同5’上游侧翼序列,大小分别是1.8kb和2.5kb。利用生物信息学方法分别对这两个不同5′上游侧翼序列进行了序列分析,结果发现,二者具有某些相同的顺式作用元件,如可能的脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box,GAG-motif,I-boxandATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、水杨酸反应元件(TCA-element)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)、缺氧特异反应中的增强子类似元件(GC-motif)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE),但是二者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中IPP异构基因转录调控方式的多样化。更多还原

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5′上游侧翼学列 雨生红球藻 IPP异构酶基因
  • 简介:将金属盐法与光镜、电镜技术相结合,研究中华绒螯蟹精子形成过程中酸性磷酸分布的变化。研究表明,在精子形成的早期,酸性磷酸由细胞质中的内质网小泡上产生,随后出现在细胞核内、顶体囊膜上及顶体管内,并且反应产物逐渐由分布均匀的细密颗粒聚集成分布均匀的较大的颗粒:当精子成熟后酸性磷酸均匀分布在顶体管中,反应产物颗粒比较大,穿孔器部分发现有少量酸性磷酸分布。

  • 标签: 生物化学 精子发生 酸性磷酸酶 中华绒螯蟹
  • 简介:一个12周的饲养试验进行评估膳食水苏糖对生长性能的影响,消化活性和肠道结构的少年多宝鱼(大菱鲆)。五等氮(粗蛋白49.58%)和isolipidic(粗脂肪10.50%)日粮配方含有0(对照),0.625%(s-0.625),1.25%(s-1.25),2.5%(s-2.5)和5%(S-5)水苏糖,分别。随着水苏糖水平升高,生长性能和饲料利用率等多宝鱼,特定生长率,最终的平均体重,增重率和饲料效率,显著增加(P<0.05),然后稳定。鱼喂S-5采食量显著高(P<0.05)比其他组的鱼。活动关系的胰蛋白,肠酪蛋白,胃和肠道淀粉的水苏糖的显著影响(P<0.05)。胰蛋白和肠酪蛋白的活动的最高值是在s-1.25观察组,对照组以观察胃淀粉活性最高,肠淀粉活性最低。没有病变或损伤在所有处理鱼的远端小肠结构,而在远端小肠简单褶皱高度显著增加(P<0.05)时,1.25%或2.5%是在日粮中添加水苏糖。这些结果表明,中等水平的水苏糖(1.25%)改善生长性能,饲料利用率,消化活性和少年多宝鱼远端小肠结构。

  • 标签: 消化酶活性 肠道形态 生长性能 水苏糖 大菱鲆 少年
  • 简介:β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖苷与南美白对虾的食物消化吸收、蜕壳生长有着密切关系.海水里存在的有机污染物将影响生理功能,从而进一步影响虾的正常蜕壳,严重将导致对虾的死亡.甲醛是常用的有机溶剂,故本文应用动力学方法研究了南美白对虾β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖营在甲醛溶液中以pNP-NAG为底物时活力的变化规律.表明在甲醛浓度低于2.0mol·L-1,的失活过程是可逆的,测得甲醛对抑制的IC50为1.05mol·L^-1.用双倒数作图法测定甲醛对的抑制类型,结果显示甲醛是的竞争性抑制剂,甲醛只能与游离(E)结合,底物对的失活具有保护作用.用底物反应动力学方法观测在不同底物浓度下在0.0、0.5、1.0、1.5、2.0mol·L^-1的醋酸酐溶液中的失活过程,分别测定了的微观失活速度常数k+0及复活速度常数k-0并加以比较,结果表明甲醛对的影响是缓慢结合同时导致失活的过程,比较微观失活速度常数k+0及复活速度常数k-0,结果暗示在高浓度的甲醛溶液中,将完全失活.

  • 标签: 南美白对虾 β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖苷酶 失活 动力学 甲醛
  • 简介:β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖苷与南美白对虾的食物消化吸收、蜕壳生长有着密切关系。海水里存在的有机污染物将影响生理功能,从而进一步影响虾的正常蜕壳,严重将导致对虾的死亡。甲醛是常用的有机溶剂,故本文应用动力学方法研究了南美白对虾β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖苷在甲醛溶液中以pNP-NAG为底物时活力的变化规律。表明在甲醛浓度低于2.0mol?L-1,的失活过程是可逆的,测得甲醛对抑制的IC50为1.05mol?L-1。用双倒数作图法测定甲醛对的抑制类型,结果显示甲醛是的竞争性抑制剂,甲醛只能与游离(E)结合,底物对的失活具有保护作用。用底物反应动力学方法观测在不同底物浓度下在0.0、0.5、1.0、1.5、2.0mol?L-1的醋酸酐溶液中的失活过程,分别测定了的微观失活速度常数k+0及复活速度常数k-0并加以比较,结果表明甲醛对的影响是缓慢结合同时导致失活的过程,比较微观失活速度常数k+0及复活速度常数k-0,结果暗示在高浓度的甲醛溶液中,将完全失活。

  • 标签: 南美白对虾 β-N-乙酰-D-氨基葡萄糖苷酶 失活 动力学 甲醛
  • 简介:我们曾报道了短梗霉菌产生的高纤维素产量98。在这项研究中,羧甲基纤维素(CMCase)在培养的细胞。短梗霉98的纯化至均一,与的最大产量为4.51U(mg蛋白)-1。SDS-PAGE分析表明,纯化的的分子量为67.0kda。具有相当的敏感性为40℃纯化的的最适温度,比从其他真菌的cmcases低得多。该的最佳pH值为5.6,和活动的个人资料被稳定在一个范围内的酸度(pH5,0-6.0)。这种被激活Na+,Mg2+,Ca2+,K+,Fe2+和Cu2+,然而,它是由Fe3+,Ba2+,Zn2+,Mn2+和银离子抑制。公里和纯化的的Vmax值4.7mgml-10.57pmolL-1min-1(mg蛋白)1,分别。只有大小不同的低聚糖,羧甲基纤维素(CMC)释放与纯化的水解后。该基因编码的是A.霉98个克隆,其中包含一个开放阅读框(eu978473)意义。推导的蛋白质含有超家族的保守结构域(糖基水解家族5)。的N-末端氨基酸序列的纯化的是m-a-p-h-a-e-p-q-s-q-t-t-e-q-t-s-s-g-q-f,这与从克隆的基因推导一致。这表明,纯化的是由克隆纤维素基因在酵母编码。

  • 标签: 羧甲基纤维素酶 出芽短梗霉 基因克隆 海洋酵母 纯化 SDS-PAGE分析