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38 个结果
  • 简介:以便揭示在二CCDD染色体种,Oryzaalta和Oryzalatifolia之间的起源和进化关系,在situ杂交(鱼)的荧光被采用从O与C0t-1DNA分析二种的染色体。alta作为一根探针。Karyotype比较地也在O之间被分析。alta和O。latifolia基于他们杂交的类似的乐队模式发信号。在O之间有高相同和靠近的关系。alta和O。然而,在杂交之间的区别表明的latifolia也是清楚的。C0t-1DNA被证明是种类--并且染色体类型特定。C0t-1DNA鱼能是更有效的分析在不同种类之间的genomic关系,这被建议。根据在二allotetraploidy种之间的高度并且中等重复的DNA序列的比较分析,O。alta和O。latifolia,可能的起源和Oryza的allotetraploidy的进化机制被讨论。

  • 标签: 重复DNA序列 D基因组 水稻 染色体核型分析 杂交信号 原位杂交
  • 简介:一个简单协议用变白的稻秧为脱氧核糖核酸抽取被建立,米饭脱氧核糖核酸由此直接在单个eppendorftube在0.5mol/LNaOH答案被提取。比较PCR分析和电气泳动的结果证明用这个方法提取的脱氧核糖核酸象那个使用的标准CTAB方法同样好、有用。

  • 标签: 水稻 聚合酶 分子标记 PCR分析 基因序列
  • 简介:AnefficientandgoodDNAextractionprotocolshouldbesimple,affordableandyieldenoughDNAwithhighquality.Rice(OryzasativaL.)DNAextractionmethodsoftenuseseedlingsorleavesratherthanthegrainsandtendtobetime-consuming,involvemultiplesteps,andusehazardouschemicalsandexpensiveenzymes.RicegrainsofferseveralbenefitsoverseedlingsandleavesasasourceofDNAforgeneticanalysis.However,thesebenefitsareunderutilizedbecausethebulkofaricegrainismadeupofstarch.Itisparticularlyimportant,butdifficulttogetridofthestarchwhileextractingDNAfromricegrains.Thisco-precipitatedpolysaccharideisaknowninhibitorofDNApolymeraseactivityinpolymerasechainreaction(PCR).WedescribehereaverysimpleandhighlyaffordableChelex?-100basedDNAextractionmethodfromricegrains.Itdoesnotrequireanyhazardouschemicalsorenzymes.ThismethodreproduciblyextractsDNAwithgoodpurityindices(A260/A230andA260/A280values),butrequiresonlyafewsteps.

  • 标签: DNA EXTRACTION RICE GRAIN Chelex?100
  • 简介:基于模拟FZ14从Zizanialatifolia(Griseb)导出的抵抗基因的顺序,一双特定的PCR教材FZ14P1/FZ14P2被设计孤立候选人疾病抵抗基因。pooled-PCR途径用教材对被采用屏蔽转变能干的人工的染色体(TAC)图书馆从Z导出的genomic。latifolia。积极TAC克隆(ZR1)被顺序分析获得并且证实。结果显示ZR1由类似的保存主题组成了,建议它能是kinase3a和GLPL(Gly-Leu-Pro-Leu)抵抗打的NBS-LRR的部分P环(kinase1a),kinase2,基因。用Nipponbare成熟胚胎的调停Agrobacterium的转变,48独立转基因的T0植物的一个总数被获得。在他们之中,36植物对剧毒的细菌的老家紧张PXO71高度抵抗。结果显示ZR1包含至少一功能的细菌的老家抵抗基因。

  • 标签: 抗白叶枯病基因 基因组DNA 转基因水稻 茭白 可转化人工染色体 PCR引物
  • 简介:DNAmethylation是能被房间分割在有机体的进化转移到后代的epigenetic现象之一。基因表示伴随的epigenetic规定能在haploidy植物的显型直接被发现。在haploid,Shuhui527,Shuhui363和他们的混血儿的5-CpCpGpG地点的DNAcytosinemethylation被methylation分析敏感扩大多型性(MSAP)方法。有765个DNAmethylated地点,检测,methylation水平比父母在混血儿是更低的。同时,在混血儿和父母之间的不同乐队被分析,methylated地点的二种类型被检测,哪个从haploid,和其它继承了。与涉及房间的methylated地点有关的基因的生物功能组织,使产生代射变化并且反应因素。因此,DNAmethylated修正能激活并且沉默基因和戏在植物生长,开发和进化的一个重要角色。

  • 标签: DNA甲基化 单倍体植株 杂交水稻 ORYZA 双胚苗 基因组DNA
  • 简介:有低glutelin内容的瑞斯作为为肾失败影响的病人的功能的食物合适。在米饭的低glutelin内容基因Lgc1有在二高度类似的glutelin基因GluB4和GluB5之间的3.5-kb删除,它在染色体2的短手臂上定位。在低glutelin内容米饭改进选择效率繁殖,指定为InDel-Lgc1-1和InDel-Lgc1-2的二个分子的标记被开发检测低glutelin内容基因Lgc1。双PCR察觉显示二个标记的联合使用能容易把Lgc1的遗传型与不同米饭变化区分开来。作为一种简单、便宜的技术,因此,分子的标记能广泛地被用来与Lgc1基因识别不同变化并且在低glutelin内容米饭的帮助标记的选择适用。

  • 标签: 蛋白基因 水稻育种 分子标记 蛋白含量 ORYZA PCR检测
  • 简介:Rice(Oryzasativa)issensitivetosalinity,butthesalttoleranceleveldiffersamongcultivars,whichmightresultfromnaturalvariationsinthegenesthatareresponsibleforsalttolerance.High-affinitypotassiumtransporter(HKTs)hasbeenproventobeinvolvedinsalttoleranceinplants.Therefore,wescreenedfornaturalnucleotidepolymorphisminthecodingsequenceofOsHKT1,whichencodestheHKTproteinineightVietnamesericecultivarsdifferinginsalttolerancelevel.Intotal,sevennucleotidesubstitutionsincodingsequenceofOsHKT1werefound,includingtwonon-synonymousandfivesynonymoussubstitutions.Furtheranalysisrevealedthatthesetwonon-synonymousnucleotidesubstitutions(G50TandT1209A)causedchangesinaminoacids(Gly17ValandAsp403Glu)atsignalpeptideandtheloopofthesixthtransmembranedomain,respectively.Toassessthepotentialeffectofthesesubstitutionsontheproteinfunction,the3DstructureofHKTproteinvariantswasmodelledbyusingPHYRE2webserver.Theresultsshowedthatnodifferencewasobservedwhencomparedthosepredicted3DstructureofHKTproteinvariantswitheachother.Inaddition,thecodonbiasofsynonymoussubstitutionscannotclearlyshowcorrelationwithsalttolerancelevel.Itmightbeinterestingtofurtherinvestigatethefunctionalrolesofdetectednon-synonymoussubstitutionsasitmightcorrelatetosalttoleranceinrice.

  • 标签: 水稻科学 农业
  • 简介:ThecompleteopenreadingframeofOsPIN1awasamplifiedthroughreversetranscriptase-polymerasechainreaction(RT-PCR)basedonthesequencedepositedinGenBanktoexploretherelationshipbetweentheauxineffluxproteinOsPIN1aandthenegativephototropismofriceroots.SequencingresultsshowedthattheGCcontentofOsPIN1awas65.49%.ThefusionexpressionvectorpCAMBIA-1301-OsPIN1a::GFPcontainingtheOsPIN1ageneandacodinggreenfluorescentprotein(gfp)genewasconstructed.ThefusionvectorwastransferredintoonionepidermalcellsbyAgrobacteriumtumefacienstransformation.ThetransientexpressionofOsPIN1a-GFPwasmainlylocatedinthenucleusandcellmembrane.Moreover,thetransgenicplantswereobtainedbyAgrobacterium-mediatedgenetictransformation.MoleculardetectionperformedbyusingPCRandβ-glucuronidasestainingshowedthatthetargetconstructwasintegratedintothegenomeofrice.Thenegativephototropiccurvaturesofthetransgenicricerootswerehigherthanthoseofthewildtype.Similarly,theexpressionlevelsofOsPIN1ainthetransgenicplantswereconsiderablyhigherthanthoseinthewild-typeplants.TheseresultssuggestthatOsPIN1aiscrucialinthenegativephototropiccurvatureofriceroots.

  • 标签: RICE OsPIN1a green FLUORESCENT protein TRANSIENT
  • 简介:Membersoftheactivityofbc1complex(ABC1)familyareproteinkinasesthatarewidelyfoundinprokaryotesandeukaryotes.PreviousstudiesshowedthatseveralplantABC1genesparticipatedintheabioticstressresponse.Here,wepresentthesystematicidentificationofriceandArabidopsisABC1genesandtheexpressionanalysisofriceABC1genes.Atotalof15and17ABC1genesfromthericeandArabidopsisgenomes,respectively,wereidentifiedusingabioinformaticsapproach.Phylogeneticanalyseso...

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  • 简介:米饭镉(Cd)敏感变异的cadB-1用Agrobacteriumtumefaciens被获得调停的系统。在cadB-1和野类型(WT)的暴露以后米饭幼苗到为有增加外部Cd集中的cadB-1和WT的10d,在根积累到高水平的Cd,茎和叶子的Cd集中的一个范围,并且在cadB-1的幼苗生长的抑制比在WT更严肃。氢过氧化物累积在cadB-1的叶子和根是更高的。减少的谷胱甘肽(GSH)的比率/oxidized谷胱甘肽(GSSG),ascorbate(ASC)/dehydroascorbate(DHA)和减少的菸碱腺嘌dinucleotide磷酸盐(NADPH)/oxidized菸碱腺嘌dinucleotide磷酸盐(NADP+)在高Cd层次下面在叶子和根两个都比在WT在cadB-1是更低的。ascorbateperoxidase(APX)的活动,谷胱甘肽peroxidase(GR),dehydroascorbatereductase(DHAR)和monodehydroascorbatereductase(MDHAR)在Cd的高水平的处理下面在叶子和根两个都比在WT在cadB-1是也更低的。我们的结果建议在Cd应力下面,ASC-GSH周期更严重比在WT在cadB-1被禁止,显示变异的cadB-1不太能清除反应的氧种类并且对Cd敏感。

  • 标签: 脱氢抗坏血酸还原酶 还原型谷胱甘肽 镉(CD) 水稻幼苗 突变体 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
  • 简介:一个实验被进行用荧光灯的微分显示器(软式磁碟机)方法在干旱应激和正常条件下面在米饭叶子和根比较信使rna表达式差别。一积极碎片被H.A的联合孤立黄页(contained0.1%H.A。黄)分离和宏数组屏蔽方法。比作ArabidopsisthalianaNADPH氧化还原基因,它有96%身份。cDNA是1423bp,并且包含了与345氨基酸残余编码蛋白质的1048bp的一个完全的开的读物框架。而且,基因表示水平在正常条件下面比那在干旱应激下面是更高的。在干旱反应下面的NADPH氧化还原基因的可能的角色也被讨论。

  • 标签: 水稻 干旱压力 还原型辅酶II类氧化还原酶基因 克隆化 基因表达
  • 简介:到在米饭germplasm91-1A2的米饭胆量小蚊的抵抗被识别并且遗传上分析了。米饭人口的F1s从作为一个男父母与米饭材料Jinggui,TN1,W1263(Gm1),IET2911(Gm2),BG404-1(gm3),OB677(Gm4),ARC5984(Gm5)和Duokang1(Gm6)交叉的91-1A2被导出。到米饭胆量小蚊的所有父母线和F1,BC1F1和F2人口的抵抗被识别。结果证明91-1A2和所有F1s对中国米饭胆量小蚊遗传因子型IV抵抗。到在BC1F1和F2的易受影响的抵抗植物的分离比率被X2测试与1:3和9:7规则给予,建议到中国米饭胆量小蚊遗传因子型IV的91-1A2的抵抗被是新抵抗基因的二主导的基因控制,对已知的米饭胆量小蚊抵抗基因非突变而产生之遗传因子。

  • 标签: 水稻种质 遗传分析 稻瘿蚊 抗性鉴定 显性基因控制 F2群体
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