简介:摘要诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一,极易突变和重组,型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域,因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法,聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型,包括2个暂定基因组及16种暂定基因型,VP1可分为12个基因组及53种基因型,包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。
简介:摘要目的了解河北省散发腹泻病例诺如病毒的分子特征。方法收集2015年9月至2016年12月,河北省6市哨点医院散发腹泻病例粪便标本,用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测标本中的诺如病毒。阳性标本进行基因片段扩增,并测序进行序列比对,确定基因型。对测序所得序列与基因库中诺如病毒参考序列进行同源比对,并做进化树分析。结果共采集腹泻便样本1 240份,检出诺如病毒阳性样本58份,其中GI型5份,GII型53份。对诺如病毒阳性样品RNA进行测序,得到21条主要衣壳蛋白(VP1)区序列和17条RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRP)区序列。经过与GenBank中诺如病毒参考序列比对,得到VP1区5种基因型,GII.4型最多(10/21),其次为GII.17型(4/21),其他还有GII.2型(3/21)、GII.3型(3/21)和GII.6型(1/21)。RdRP区有2种基因型,分别为GII.P17型(4/17)和GII.Pe型(13/17)。结论河北省感染诺如病毒散发腹泻病例以GII.4型和GII.17型为主,其他型别也有检出,需要进一步加强监测,及时发现新型毒株。
简介:摘要目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作用时间等条件下热力及紫外线对MNV的消毒效果。结果MNV在4 ℃、25 ℃下可以稳定存在14 d,在37 ℃下可以维持5 d。在56 ℃下30 min、58 ℃下5 min、60 ℃下1 min作用MNV均可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm或30 cm处辐射7.5 min,以及在距离紫外光源1 m或2 m处辐射60 min,均可对MNV产生消毒效果。结论通过热力及紫外线均可对MNV进行有效消毒,为消毒和灭活HuNV提供了参考方法和依据。
简介:邵东市人民医院 湖南 邵 东 422800 [摘要 ]目的:有针对性的探讨和分析散发性诺如病毒性胃肠炎患者的临床特点和相对应的治疗方法。方法:随即选取我院在 2018年 10月到 2019年 10月期间内的症状为腹泻,呕吐等消化道疾病的病例 100例为研究对象,所有研究对象的发病时间在 3 d内,在每周自周一开始,连续性抽取 20例充分满足上述症状的相关病例,然后针对抽取的相关人员,展开相对应的流行病学调查分析和监测,着重把握患者的具体情况,并进行分析预测和处理,用 ELISA法针对患者的粪便标本行诺如病毒检测。结果:针对所有研究对象进行监测和检查,可以发现,感染诺如病毒的患者一共有 56例,占总比例的 56%,患者的一般资料,例如年龄,性别,文化程度等相关因素,和未感染该病毒的患者,无统计学差异, (P> 0.05),在实验室检查过程中,血常规中的中性粒细胞变化,便常规镜检红、白细胞,与未感染患者有十分显著的统计学差异, (P<0.05),在所有 56例患者中,对其进行相对应的对症治疗, 3 d之后恢复,有 53例患者恢复健康,针对某些可能伴有细菌感染性疾病患者进行抗生素治疗, 3~ 7 d之后也恢复健康。结论:通过临床的调查研究,能够充分看出,诺如病毒是一种比较典型的冬季散发性的急性胃肠炎的主要病原体,在临床实践中很容易和细菌合并出现感染,在对该疾病进行治疗的过程中,采取对症治疗方法并加之一定程度的抗生素治疗,这样能够使患者恢复健康。
简介:摘要目的了解浙江台州地区婴幼儿腹泻病例诺如病毒的感染情况,并分析其危险因素。方法选取2017年1—12月台州地区腹泻哨点监测医院0~6岁腹泻患儿670例,对患儿粪便样本进行诺如病毒核酸检测,与轮状病毒感染患儿进行症状对比,同时根据病毒阳性情况,选取396例健康体检儿童作为对照组,分析诺如病毒感染的危险因素。结果670例腹泻患儿中诺如病毒阳性率为19.70%(132例),其中GⅡ基因型110例,GⅠ基因型22例;不同性别和年龄腹泻患儿诺如病毒阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05)。2017年1—2月和10—12月阳性率呈现高峰;诺如病毒感染患儿腹泻≥5次/d、水样便、呕吐及发热的比例明显高于轮状病毒感染患儿,差异有统计学意义(χ2=43.147、12.563、49.847、28.589,P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,菜板生熟未分(OR=1.958,95%CI:1.243~3.086)和发病前1周接触胃肠炎患者(OR=2.438,95%CI:1.247~4.765)是诺如病毒感染的危险因素。结论婴幼儿腹泻病例诺如病毒感染呈明显的季节性分布,菜板生熟未分、发病前1周接触胃肠炎患者是诺如病毒感染的危险因素。
简介:摘要目的了解上海地区急性胃肠炎患儿感染诺如病毒(norovirus, NoV)的基因特征情况。方法收集2018年10月至2019年9月上海市儿童医院门急诊急性胃肠炎患儿的粪便标本709份,采用实时荧光RT-PCR方法对NoV进行初筛,使用普通RT-PCR方法,分别用VP1、RdRp区和跨RdRp-VP1区引物对部分NoV阳性标本进行分型鉴定。应用SPSS20.0统计学软件进行数据处理,并使用生物信息学软件对NoV基因序列进行同源性、系统进化及重组性分析。结果经实时荧光RT-PCR检测,709份粪便标本中NoV阳性的标本为265份,阳性率为37.4%(265/709)。基于NoV RdRp和VP1区的测序分析,NoV阳性标本中共检出7种不同的基因型,分别为GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012、GⅡ.P7-GⅡ.6、GⅡ.P8-GⅡ.8、GⅡ.P21-GⅡ.13和GⅡ.P17-GⅡ.17型,其中以GⅡ.P16-GⅡ.2型所占比例最高,为30.6%(34/111),其次为GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012型(27.0%,30/111)和GⅡ.P12-GⅡ.3型(24.3%,27/111)。本研究发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13,其重组位点位于ORF1/ORF2的交接区。NoV在每个月份皆有流行,但每个月份的主导基因型不尽相同。男女患儿的NoV阳性检出率差异无统计学意义(P=0.329),而不同年龄组患儿的NoV阳性检出率差异有统计学意义(P=0.011),以>11~12岁和>2~3岁年龄组所占比例最高。结论2018年10月至2019年9月,上海地区以GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012和GⅡ.P12-GⅡ.3 NoV重组株流行为主,并发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13散在流行。跨ORF1/ORF2的基因序列测定,有助于更好地了解NoV的基因分型和重组情况。
简介:摘要目的调查北京市宾馆住宿场所工作人员的诺如病毒隐性感染状况及宾馆住宿场所和旅游大巴车中诺如病毒污染情况,为诺如病毒防控提供科学参考依据。方法采用横断面调查方法,按照方便抽样的原则,抽取北京市16个区内的宾馆住宿场所以及旅游人员集中区域的旅游大巴车,采集环境标本,并采集相关工作人员肛拭子标本,使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测。采用描述性方法分析不同场所环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染情况。结果共采集北京市宾馆住宿场所工作人员肛拭子标本320件,环境涂抹标本640件,其中工作人员诺如病毒隐性感染率为0.94%,厨师隐性感染率为0.99%,环境污染阳性率为0.16%。旅游大巴车环境涂抹标本180件,未检出诺如病毒。结论在2019年诺如病毒非流行季期间北京市宾馆住宿场所中,工作人员诺如病毒感染率较低,环境中存在诺如病毒污染,为避免或减少旅游团体诺如疫情的发生,需进一步做好针对性的防控工作。
简介:摘要目的探讨一起由札如病毒引起的社区胃肠炎暴发的流行特征和临床发病情况,为开展疫情防控提供参考依据。方法采用回顾性研究方法对CT社区居民进行流行病学调查,以χ2检验比较罹患率的差异,采用RT-PCR方法对肛拭子、粪便和水样标本进行肠道病毒检测。结果该起疫情共发现422例病例,罹患率为11.95%。病例主要集中在21-24日,22日达到高峰,呈点源暴露特点,临床特征以呕吐和水样便为主。CT社区各村均有病例出现,以旧村罹患率最高(25.20%)。各年龄段均有病例发生,<25岁人群罹患率最高(16.41%),≥50岁次之(12.05%),25~49岁最低(8.42%)。病例肛拭子和粪便标本检测札如病毒阳性率为38.78%。采集24份水样的菌落总数、总大肠菌群和耐热大肠菌群合格率分别为95.83%、45.83%和50.00%,未检出札如病毒。结论本次疫情为一起由札如病毒感染引起的社区暴发事件,因集中式供水受污染而导致经水传播的可能性大。应完善感染性腹泻疾病监测体系,强化人群健康教育以及生活饮用水监测监督。
简介:摘要目的分析湖北省一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的流行因素,为制定防控措施提供依据。方法采用现场流行病学的方法进行调查,运用描述性流行病学方法、病例对照方法对调查数据进行分析。结果本次暴发共涉及病例181例,首例病例于4月10日16时发病,发病高峰集中在4月11日12时至24时(92例,占全部病例的51.00%),食用园区小卖部售卖的冰淇淋是本次暴发的危险因素(OR=5.03,95%CI:2.62~9.51)。结论该事件为1起由园区自来水管网铺设不规范、小卖部从业人员卫生安全意识薄弱导致的诺如病毒感染性腹泻暴发,应加强对公共场所水网的监管以及对公共场所服务人员的健康宣教工作。
简介:摘要目的调查北京市市售结球生菜诺如病毒(norovirus,NoV)和轮状病毒(rotavirus,RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月,在北京市某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法,分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩,用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因,PCR产物直接测序,用BioEdit7.0. 9.0软件进行序列比对,用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜,未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54),其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功,为GⅡ.3基因型,该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京市市售部分结球生菜存在人源NoV污染,生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。
简介:摘要目的了解2015—2016年上海地区成人门诊急性腹泻病例中诺如病毒(norovirus, NoV)GⅡ型的基因分型及分子流行病学特征。方法收集上海地区2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本,采用一步法定量逆转录PCR方法检测NoV GⅡ型,并扩增开放阅读框1(open reading frame,ORF1)的聚合酶和ORF2衣壳区域进行测序分型。结果2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本NoV GⅡ型阳性检出率为17.76%(162/912),其中2015年NoV GⅡ型阳性率为15.08%(65/431),2016年阳性率为20.17%(97/481),阳性标本中针对ORF1的RdRp区域和ORF2区域5′端均分型的标本为145份,共有10种型别,分别为GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012(60份)、GⅡ.P17_GⅡ.17(45份)、GⅡ.P16_GⅡ.13(10份)、GⅡ.P12_GⅡ.3(10份)、GⅡ.P7_GⅡ.6(9份)、GⅡ.P21_GⅡ.21(5份)、GⅡ.P16_GⅡ.4 Sydney 2012(2份)、GⅡ.Pe_GⅡ.17(2份)、GⅡ.P2_GⅡ.2(1份)、GⅡ.P7_GⅡ.14(1份)。结论上海地区2015年春季主要流行GⅡ.P17_GⅡ.17,2015/2016年冬春季主要流行GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012和GⅡ.P17_GⅡ.17,而2016年秋季主要以GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012流行为主。进行持续的NoV暴发监测对于确定基因型分布的变化趋势和新毒株的发现非常重要。
简介:摘要目的对湖州市2018年8起诺如病毒(norovirus, NoV)感染性腹泻聚集疫情基因特征进行分析。方法采用荧光定量RT-PCR方法对采集的73份病例标本进行NoV核酸检测,并从每起聚集性疫情中选取NoV核酸阳性标本进行多聚酶和衣壳蛋白区域扩增,扩增产物进行核酸序列测定和基因特征分析。结果8起疫情中共57份标本为GII型NoV核酸阳性,5份标本为GI型和GII型NoV核酸双阳性。NoV多聚酶和衣壳蛋白核酸序列比对结果显示,5起暴发是GII.P16/GII.2型,1起GII.P17/GII.17型,1起是GII.P12/GII.3型,1起是GI.P4/GI.5型和GII.P17/GII.17型混合感染。结论NoV是引起湖州市感染性腹泻聚集疫情的主要病原体,以GII型为主,有多种基因型别,并存在着重组株。
简介:[摘要 ]目的 采用非条件 Logistic回归分析法分析浏阳市诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素。方法 回顾性分析浏阳市 2019年 4月某中学发生的一起诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情,由专业人员制定调查表进行现场流行病学调查,将诺如病毒急性胃肠炎感染患者作为病例组,将未感染者作为对照组,对此次爆发的诺如病毒急性胃肠炎进行流行病学特征进行分析。整理并分析所有病例资料,分别对相关变量赋值并进行非条件 Logistic回归分析。结果 本次诺如病毒急性胃肠炎感染病例共 1098例,发病率 41.62%,其中学生 1081例,教职工 17例,二者发病率分别为 45.38%、 6.64%;流行病学分析显示,本次诺如病毒急性胃肠炎感染的 1098例患者中主要以住校学生群体为主,且高中年级占比居多,该类群体多在食堂就餐,且有饮用生水习惯或饮用生水史;多因素 Logistic回归分析显示,食堂就餐、住校、饮用生水等均是此次影响诺如病毒急性胃肠炎感染的独立危险因素。结论 浏阳市诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素主要是传染源、传播途径以及卫生习惯。
简介:摘要目的分析2018—2019年漳州市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征。方法选取2018年2月至2019年10月漳州市16起聚集性胃肠炎疫情中的114例疑似病例作为研究对象。收集研究对象粪便、带便肛拭子或呕吐物标本,采用荧光定量PCR方法对标本进行诺如病毒基因检测,GⅡ组阳性样本进一步用普通RT-PCR方法对部分聚合酶区(RdRp)-衣壳区(VP1)进行基因扩增,阳性标本进行测序并做系统进化分析。结果16起聚集性胃肠炎疫情中,11起诺如病毒检测阳性。114例疑似病例中,实验室确诊55例,阳性率为48.25%。其中,GⅡ组48例,GI组1例,GI组和GⅡ组同时阳性的6例;男性40例(72.73%,40/55),女性15例(27.27%,15/55);14岁以下儿童43例,占78.18%(43/55);幼儿园及中小学为主要暴发场所(9/11);季节高峰主要在2—3月及9—12月(10/11)。测序共获得来自8起聚集性疫情中的27份标本序列,系统发育树构建结果显示有4种GⅡ组基因型,包括15株GⅡ.2[P16]、2株GⅡ.4Sydney[P31]、4株GⅡ.17[P17]和6株GⅡ.3[P12]。结论诺如病毒是引起漳州市聚集性胃肠炎的常见病原体,其中GⅡ.2[P16]变异株为本地区优势流行株。
简介:摘要目的原核表达GII.6型诺如病毒(norovirus, NoV)P蛋白和制备多克隆抗体。方法扩增NoV GII.6型P区基因并克隆至pET28a载体,转化感受态E. coli BL21(DE3),IPTG诱导进行原核表达。使用Ni-NTA亲和柱层析进行纯化,重组蛋白进行寡糖结合分析,免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体血清,ELISA测定该抗体的效价,western blot (WB)检测抗体的特异性,并进行有效性评估。结果成功构建了原核表达载体GII.6P-pET28a并表达相对分子质量约40×103的GII.6型P蛋白;Ni柱亲和层析纯化后纯度达90%以上;寡糖结合显示GII.6型P蛋白与B、leb、H2型结合,与A、H1、lea型不结合;ELISA测得抗体的效价为1∶160 000;WB显示抗体具有较高特异性;交叉实验未显示出对GII.4的亲和力。结论成功表达了GII.6型P蛋白并获得高效价的抗体,为GII.6的检测和疫苗研发提供有效工具。
简介:摘要目的了解2018年德阳市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus, NoV)感染情况及其分子病原学特征,为NoV预防控制和疫苗研发提供参考。方法收集德阳市2018年3起AGE暴发疫情的疑似病例及健康人标本共63份。采用实时荧光RT-PCR检测NoV核酸,阳性标本用RT-PCR扩增聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRp)区和衣壳蛋白(capsid protein)VP1区并测序分析。结果NoV实时荧光RT-PCR结果显示3起AGE暴发疫情均由GII组NoV感染引起,检测阳性率为33.3%(21/63),其中病例标本检出率为95%(19/20),健康人标本检出率为4.7%(2/43)。测序分析表明,2起疫情由GII.17[P17]型NoV引起,与2014年以来流行的GII.17变异株高度同源;1起疫情由GII.2[P16]型NoV引起,与2016年以来流行的GII.2[P16]重组株高度同源。结论2018年德阳市至少存在2种以上不同型别的NoV同时流行。
简介:摘要目的探讨早孕期胎儿先天性半月瓣缺如的超声心动图、病理解剖及遗传学异常特征。方法对2014年12月至2018年12月在广西壮族自治区妇幼保健院诊断的11例孕11~13+6周先天性半月瓣缺如胎儿的声像图进行分析,结合引产后心脏标本病理解剖异常所见与早孕期超声心动图特征进行对照研究。结果11例先天性半月瓣缺如胎儿头臀长46~74(62.0±9.2) mm,颈项透明层厚度(nuchal translucency thickness,NT) 2.4~10.4(6.4±2.6) mm,10例NT >3.0 mm,11例彩色多普勒三血管气管切面均可显示主动脉和(或)肺动脉红蓝交替的"进出征"血流信号,可测得双期双向动脉血流频谱信号。11例胎儿中"窃血型"胎儿10例,分别为主动脉瓣缺如2例,肺动脉瓣缺如3例,双动脉瓣缺如5例;此10例均发生胎儿心力衰竭的继发性超声改变,染色体及基因分析有4例13-三体综合征,3例18-三体综合征,1例22q11.2缺失,1例12q24.32q24.33缺失,1例正常;8例解剖显示心脏均增大,2例主动脉瓣缺如(1例合并肺动脉闭锁、动脉导管缺失及胸腺缺如),3例肺动脉瓣缺如,3例双动脉瓣缺如,3例存在半月瓣遗迹,2例肺动脉瓣缺如及3例双动脉瓣缺如动脉导管均短而粗。"非窃血型"肺动脉瓣缺如1例(1/11),无胎儿心力衰竭的继发性超声改变,基因检测为22q11.2缺失,病理解剖存在半月瓣遗迹,并法洛四联症及动脉导管缺如。结论早孕期半月瓣缺如以"窃血型"为主,主动脉和(或)肺动脉的"进出征"及双期双向频谱是早孕期先天性半月瓣缺如的特征性声像图改变,13-三体综合征及18-三体综合征发生早孕期"窃血型"半月瓣缺如风险性明显增加。