简介：目的：对目前最常用的检测微小RNA（miRNA）的茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法进行比较。方法：分别用茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法检测人乳腺癌细胞MCF-7中U6和23种miRNA的表达,利用定量PCR分析软件和琼脂糖凝胶电泳方法,将2种方法在引物设计难度、特异性与灵敏度,以及检测通量方面进行比较。结果：茎环法的特异性和灵敏度比PAP法高,但引物设计难度大,检测通量低;PAP法引物设计难度较低,检测通量较高,但特异性和灵敏度较差。结论：茎环法实时定量PCR适于有针对性地检测小规模miRNA,而PAP法则适于大规模miRNA筛选实验。

简介：mirVanaqRT-PCRmiRNA检测试剂盒扩增特定的小RNA，可以精确定量小RNA表达水平。这个测定系统还可以通过传统的RT-PCR或实时RT-PCR使用SYBRGreen1描述小RNA表达特征。引物组也几乎涵盖人、大鼠、小鼠的微小RNA。另外，引物组特别含有小RNA-U6snRNA和5srRNA，它们可以控制输入的变异性和样本标准化。

简介：RNAi是指通过双链RNA介导特异性降解靶mRNA，导致转录后水平基因沉默的现象。其作用途径有RdRP依赖的RNAi的途径与非RdRP依赖的RNAi途径2种。利用RNAi的基因敲除技术在dsRNA序列选择、质粒或病毒为载体的dsRNA体内合成、发夹样siRNA的转录、dsRNA的导入方法等方面取得了很大进展，在研究人类或其他生物基因组中未知基因及蛋白质的功能等领域具有诱人的应用前景。

简介：RNaseMRPRNA是处理的RNasemitochondrialRNA(MRP)的RNA子单元涉及处理事件的多重细胞的RNA的酶建筑群。RNaseMRPRNA基因(RMRP)上的变化引起后退地继承的发展混乱，软骨头发发育不全(CHH)。遗传型(RMRP变化)的关系，RNaseMRPcomplex的RNA处理缺乏，和CHH和另外的骨胳的发育异常的显型还有待于被探索。

简介：

简介：Heterogeneousnuclearribonucleoproteins(hnRNPs)arespliceosomalmacromolecularassemblagesandthusactivelyparticipateinpre-mRNAmetabolism.Theyarecomposedofevolutionarilyconservedandtandemlyrepeatedmotifs,wherebothRNA-bindingandprotein-proteinrecognitionoccurtoachievecellularactivities.Byyetunknownmechanisms,theseribonucleoprotein(RNP)particlesaretargetedbyautoantibodiesandhenceplaysignificantroleinavarietyofhumansystemicautoimmunediseases.Thisfeaturemakesthemimportantprognosticmarkersintermsofmolecularepidemiologyandpathogenesisofautoimmunity.SinceRNPdomainisoneofthemostconservedandwidespreadscaffolds,evolutionalysesoftheseRNA-bindingdomainscanprovidefurthercluesondisease-specificepitopeformation.ThestudypresentedhereinrepresentsasequencecomparisonofRNA-recognitionregionsofrecentlyclonedandcharacterizedhumanhnRNPA3withthoseofotherrelevanthnRNPA/B-typeproteins.Theirimplicationsinhumanautoimmunityareparticularlyemphasized.

简介：在不到10年里自从它的开始，RNA干扰(RNAi)在生物医学的科学上有非凡的影响。RNAi被表明了到影响众多生物并且疾病小径。RNAi技术的开发和采纳是丰富的从基本loss-of-function工具，到药品的目标确认的染色体宽的屏蔽图书馆和治疗学的开发。然而，RNAiis的分子的机制理解远非完全。这简短评论的目的是在阐明加亮关键成就导致RNA的silencing建筑群并且到的生化学机制为这块地构画出主要挑战。

简介：在目前的疫苗研究中，对新疫苗免疫效果的要求越来越高。减毒或无毒的病毒疫苗载体能够激发高效持久的系统和黏膜免疫，并且具有较高的安全性，为研究新疫苗提供了一条途径。RNA病毒作为疫苗载体，在可操作性和免疫效果方面有着显著的优势，近年来已成为疫苗研究领域的热点。综述了几种RNA病毒载体目前的研究状况及其在疫苗载体方面的应用。

简介：Inordertostudythefunctionalstructureofthetranscriptionterminatorsandthemechanismoftemination,asurveyofthechromatinstructure,includingthelocationofDNaseIhypersensitivesitesandthenucleosomearrangement,ofyeastADH1andFLPterminatorswasmade.TheresultsshowthatthereisnorelationshipbetweenthefunctionoftheterminatorsandtheexistenceofDNaseIhypersensitivesites.However,itisfoundthatthereisalwaysanucleosmoeattheimmediateupstreamofthetranscriptionalterminationsites.Asacontrol,thechromatinstructuresofthepBR322DNAfragmentsontheyeastshuttervectorsarealsoinvestigatedatthesametime.TherandomnucleosomearrangementonthebacterialDNAinyesastagreeswiththepublishedreports.Anewhypothesis,aboutthemechanismoftranscriptionalterminationisputforwardandthereasonofdifferentnucleosomearrengementontheDNAswhichareoriginallyfromdifferentspeciesinyeastisdiscussed.

简介：很多小RNA病毒科病毒感染宿主细胞后可引发宿主细胞凋亡，这种现象被认为是宿主细胞对抗小RNA病毒侵染的防御机制。凋亡机制可由某些病毒蛋白对细胞产生信号干扰来实现多种凋亡通路。虽然这些凋亡通路的上游事件是不同的，但最后的效应却很一致。此外，一些病毒蛋白具有抑制细胞凋亡的功能，它们能够令感染病毒后的细胞不死亡，形成病毒与宿主细胞共存的持续性感染状态。

简介：目的：通过对TRIzol一步法进行改进，建立一种从富含胶原蛋白、多糖及色素的仿刺参体壁提取总RNA的有效方法。方法：样品在液氮中研磨并用TRIzol匀浆后再进行抽提；对TRIzol一步法提取的总RNA进行DNaseⅠ消化和酚氯仿抽提，用2.5mol/L的醋酸钾沉淀，并加入适量糖原（10mg/mL）与RNA共沉淀。结果：琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法以及RT-PCR检测结果表明，改进的方法能够有效去除基因组DNA、蛋白、多糖及色素的污染，RNA的产率提高。结论：制备的总RNA纯度高，完整性好，能够满足mRNA差异显示RT-PCR等分子生物学研究的要求，是一种提取仿刺参体壁及其他富含黏多糖、胶原蛋白和色素的动物组织总RNA的有效方法。

简介：比期望，非编码的RNA(ncRNA)基因才是更众多的。然而，与计算算法或生物实验识别ncRNAs仍然是一项困难的任务。最近的报告建议了ncRNAs可以也出现在表示顺序标签(EST的)数据库。不过，内部遗传因子的EST几乎没收到很少注意并且糟糕由于他们的低丰富被注解。这里，我们为从人的EST发现ncRNA基因开发了计算策略。我们首先收集了位于的EST内部遗传因子的区域并且别让详细注解。内部遗传因子的区域被划分成非重叠的50-nt窗口，从UCSC数据库获得的PhastCons分数被分到这些窗口。我们使有超过0.8的PhastCons分数并且有至少三支持EST充当种子的窗户保存。相应于种子的EST的每簇被装配进长contig。我们使用了二个标准从这些contigs为ncRNA抄本屏蔽：第一是最长预言的开的读物框架是不到300nt，第二是可能的Pol-II倡导者在contigs在上游或下游的2,000nt以内存在。作为结果，118新奇ncRNA基因从人的低丰富EST被识别。七个随机选择的候选人，六在由RT-PCR出现的人的2BS房间被抄录。我们的工作证明EST为检测新奇ncRNA基因是“隐藏的财富”。

简介：

简介：Humantumornecrosisfactorα(hTNFα),apleiotropiccytokinewithactivitiesrangingfromhostdefensemechanismsininfectionandinjurytoseveretoxicityinsepticshockorotherrelateddiseases,isapromisingtargetfordrugscreening.UsingtheSELEX(systematicevolutionofligandsbyexponentialenrichment)process,weisolatedoligonucleotideligands(aptamers)withhighaffinitiesforhTNFα.Aptamerswereselectedfromastartingpoolof40randomizedsequencescomposedofabout1015RNAmolecules.RepresentativeaptamersweretruncatedtotheminimallengthwithhighaffinityforhTNFαandwerefurthermodifiedbyreplacementof2'-OHwith2'-Fand2'-NH2atallribopurinepositions.ThesemodifiedRNAaptamerswereresistanttonuclease.ThespecificityoftheseaptamersforhTNFαwasconfirmed,andtheiractivitytoinhibitthecytotoxicityofhTNFαonmouseL929cellswasdetermined.Resultsdemonstratedthatfour2'-NH2-modifiedaptamersboundtohTNFαwithhighaffinityandblockedthebindingofhTNFαtoitsreceptor,thusprotectingtheL929cellsfromthecytotoxicityofhTNFα.OligonucleotideaptamersdescribedherearepotentialtherapeuticsanddiagnosticsforhTNFc-relateddiseases.

简介：以田间幼嫩叶片为试材,建立枣RNA改良CTAB提取法,改良之处包括利用巯基乙醇和PVP联合去除多酚、CTAB与异硫酸氰胍联合促进RNA释放及加入糖原提高产率等。改良CTAB法提取液组成：2%CTAB,4mol/L异硫酸氰胍,100mmol/LTris-HCl（pH8.0）,20mmol/LEDTA（pH8.0）,2%PVP,4%β-巯基乙醇,250μg/ml糖原。进而采用Trizol试剂法、改良CTAB法、改进SDS-酚法、热硼酸法和异硫氰酸胍法5种方法分别对枣组培苗、幼叶、幼嫩枝皮、根皮和枣果5种器官和组织进行了总RNA提取。结果表明,组培苗RNA提取以Trizol试剂法为最佳,田间幼叶和成熟果实宜采用改良CTAB法,幼嫩枝皮和根皮宜采用改良CTAB法或改进SDS-酚法;本研究建立的改良CTAB法可作为枣不同器官和组织RNA提取的通用方法;根据季节可从不同器官和组织中获得高质量RNA;枣组织RNA含量相差较大,以幼嫩叶片含量最高,其次为组培苗、枝皮、枣果和根皮。

简介：

简介：RNA干扰（RNAi）是生物体内源基因发生转录后特异性降解的一种生理现象，作为抵抗病毒的免疫机制，广泛存在于生物体内。RNAi在秀丽隐杆线虫中的发生机制已明确，但昆虫的系统性RNAi不同于线虫，在昆虫中尚未发现线虫跨膜蛋白SID．2的同源蛋白，且果蝇中不存在依赖于RNA的RNA聚合酶（RdRP），但存在具有相似活性的物质。昆虫发生RNAi的效率不仅与靶标基因自身及双链RNA的选择有关，而且与虫体的发育状态及摄入双链RNA的剂量相关。随着RNAi在昆虫中作用特点的阐明，RNAi的应用价值也逐渐体现。近年来，通过RNAi沉默靶标基因，不但促进了昆虫基因功能研究的发展，而且被广泛用于重要农业害虫抗药性基因的研究。最新研究表明，RNAi结合第2代测序技术，针对非模式昆虫，能迅速找到具有致死效应的靶标序列，加快了利用RNAi技术生产生物农药的步伐。

简介：运用RNA干扰（RNAi）技术可以通过以下策略进行肿瘤的靶向治疗：抑制癌基因、生长因子及其受体的过表达，从而抑制细胞生长；干扰细胞周期蛋白及其相关基因的表达，从而抑制细胞增殖；抵抗致癌病毒的入侵；抑制抗凋亡基因的表达；上调和恢复抑癌基因的功能；抑制肿瘤发生过程中的关键酶；抑制与肿瘤转移有关的血管生成；靶向端粒酶；靶向耐药基因。尽管目前RNAi已经较为广泛地应用于基因功能研究和肿瘤疾病的基因治疗研究中，但其在应用过程中还有许多亟待解决的问题。我们就RNAi及其在肿瘤疾病基因治疗中的应用策略和存在的问题做一综述。

简介：Honeybees(Apismellifera)havehaplodiploidsexdetermination:malesdevelopfromunfertilizedeggsandfemalesdevelopfromfertilizedones.Thedifferencesinlarvalfoodalsodeterminethedevelopmentoffemales.Herewecomparedthetotalsomaticgeneexpressionprofilesof2-dayand4-day-olddrone,queenandworkerlarvaebyRNASeq.Theresultsfromaco-expressionnetworkanalysisonallexpressedgenesshowedthat2-day-olddroneandworkerlarvaewerecloseringeneexpressionprofilesthan2-day-oldqueenlarvae.Thisindicatedthatforyounglarvae(2-day-old)environmentalfactorssuchaslarvaldiethaveagreatereffectongeneexpressionprofilesthanploidyorsexdetermination.Droneshadthemostdistinctgeneexpressionprofilesatthe4-daylarvalstage,suggestingthathaploidy,orsexdramaticallyaffectsthegeneexpressionofhoneybeelarvae.Dronelarvaeshowedfewerdifferencesingeneexpressionprofilesatthe2-dayand4-daytimepointsthantheworkerandqueenlarvalcomparisons(598against1190and1181),suggestingadifferentpatternofgeneexpressionregulationduringthelarvaldevelopmentofhaploidmalescomparedtodiploidfemales.Thisstudyindicatesthatearlyindevelopmentthequeencastehasthemostdistinctgeneexpressionprofile,perhapsreflectingtheveryrapidgrowthandmorphologicalspecializationofthiscastecomparedtoworkersanddrones.Laterindevelopmentthehaploidmaledroneshavethemostdistinctgeneexpressionprofile,perhapsreflectingtheinfluenceofploidyorsexdeterminationongeneexpression.

简介：AnewmethodforsimulatingthefoldingpathwayofRNAsecondarystructureusingthemodifiedantcolonyalgorithmisproposed.ForagivenRNAsequence,thesetofallpossiblestemsisobtainedandtheenergyofeachstemiscalculatedandstoredattheinitialstage.Furthermore,amorerealisticformulaisusedtocomputetheenergyofmulti-branchloopinthefollowingiteration.Thenafoldingpathwayissimulated,includingsuchprocessesasconstructionoftheheuristicinformation,theruleofinitializingthepheromone,themechanismofchoosingtheinitialandnextstemandthestrategyofupdatingthepheromonebetweentwodifferentstems.FinallybytestingRNAsequenceswithknownsecondarystructuresfromthepublicdatabases,weanalyzetheexperimentaldatatoselectappropriatevaluesforparameters.ThemeasureindexesshowthatourprocedureismoreconsistentwithphylogeneticallyprovenstructuresthansoftwareRNAstructuresometimesandmoreeffectivethanthestandardGeneticAlgorithm.