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  • 简介:摘要目的鉴定1例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)罕见等位基因C*08:84,并调查该基因的家系遗传情况,预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子三维空间结构影响。方法应用单核苷酸序列分析、序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应及单等位基因组特异性测序确定HLA-C分型并对该基因的先证者进行家系调查。应用Swiss-Model服务器,Phyre2和FATCAT在线软件对其三级结构进行模拟分析,对差异氨基酸结构和所处位置及可能的影响进行推测。结果家系分析表明HLA-C*08:84来自先证者母亲,与同源性最高的HLA-C*08:01相比较存在g.512G>C(p.Trp147Ser)变异。其编码三级结构模拟分析表明氨基酸变异位置为α2链,该位置参与构成抗原多肽结合凹槽F。C*08:84与C*08:01、C*08:02、C*08:03、C*08:22肽结合区182个氨基酸主链分子间抗原结合槽均方根偏差(RMSD)分别为1.70 nm、1.79 nm、0.71 nm、1.70 nm。结论确认并分析了罕见等位基因C*08:84,对其临床意义进行初步探讨和分析。

  • 标签: 人类白细胞抗原 罕见等位基因 HLA三维结构模拟分析
  • 简介:对人类201条转录假基因的2碱基片段、3碱基片段、4碱基片段、5碱基片段和6碱基片段进行了统计。发现所统计的碱基片段在相对频率小于2范围内的模式占总模式数的89%以上;长度较长的碱基片段(5碱基片段、6碱基片段)同三核苷酸碱基片段之间包含和被包含关系较明显;人类转录假基因序列里出现最多的碱基片段大多是由AG核组成的,稀有模式主要是以CG核组成的3碱基片段。这可能是因为转录假基因序列与其同源编码基因mRNA竞争去稳定蛋白所引起的:在人类转录假基因序列中每平均约26个碱基就有一个终止密码子模式(TAG、TAA和TGA),终止密码子的频繁出现可能是原功能基因编码区的一种容错机制。另外,进行了相对频率的统计分析,发现对于2碱基片段、3碱基片段、4碱基片段、5碱基片段和6碱基片段的研究是具有其统计意义的。

  • 标签: 转录假基因 碱基片段 相对频率
  • 简介:摘要目的确认人类白细胞抗原罕见等位基因HLA-DQB1*03:90N的序列,探讨检测方法,以提高HLA分型的准确性。方法采用PCR-序列特异性寡核苷酸探针(sequence-specific oligonudeotide probe,SSOP)对2018年中国造血干细胞捐献者资料库深圳分库登记的2265例造血干细胞捐献者进行HLA分型检测,针对1例HLA-DQB1罕见等位基因进一步选择聚合酶链反应-直接测序分型(sequence-based tying,SBT)技术和基于Ion Torrent S5平台的二代测序(next generation sequencing,NGS)分析技术进行确认。结果HLA-DQB1位点SSOP分型结果显示为罕见等位基因,经SBT复核发现序列在第2外显子疑似插入或缺失,最后通过NGS确认结果为DQB1*03:90N,DQB1*06:01。结论经SSOP法检测得到的罕见等位基因不能轻易排除,应借助多种方法复核确认,保证HLA基因分型结果的准确性。罕见等位基因或新等位基因序列存在碱基缺失,采用二代测序技术可能得到更准确的结果。

  • 标签: HLA-DQB1 碱基缺失 聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针 聚合酶链反应-直接测序分型 二代测序
  • 简介:作者根据x、y同源的Amelogenin第一内含子在x染色体有6bP缺失,设计一对引物扩增检测性别。并用PAGE电泳、银染显带检测扩增产物。x、y染色体分别扩增出106bP及112bP的特异性谱带。该方法在国内首次报道,灵敏度高,可对10pg的DNA.2mm2血痕提取DNA溶液的1/10作出性别鉴定;实用性强、对来自人体的各类检材、腐败、降解及陈旧检材有效,室温放置16年的血痕也可作出性别鉴定。

  • 标签: 性别鉴定 碱基缺失 蛋白基因 同源序列 第一内含子 染色体特异性
  • 简介:

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  • 简介:摘要目的观察三基序蛋白29(TRIM29)、三基序蛋白59(TRIM59)对非小细胞肺癌(NSCLC)迁移能力的影响。方法以RNA干扰(RNAi)技术由病毒介导法构建稳定表达TRIM29以及TRIM59短发卡RNA(shRNA)的NSCLC细胞株。以实时荧光定量(Real-time PCR)法检测小干扰RNA(siRNA)干扰后的TRIM29以及TRIM59基因表达情况,采用细胞迁移(Transwell)小室法检测siRNA干扰后NSCLC细胞株的迁移能力,通过蛋白质印迹法(Western blot)检测NSCLC细胞中的人类直系同源物(Twist1)以及E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达水平。采用t检验。相关性分析采用皮尔逊(Pearson)法进行评价。结果TRIM29处理组、TRIM59处理组及联合处理组穿过基质膜的迁移细胞数均低于空白组、对照组,且联合处理组穿过基质膜的迁移细胞数低于TRIM29处理组、TRIM59处理组,差异有统计学意义(P<0.05)。TRIM29处理组、联合处理组TRIM29 mRNA相对表达量低于空白组和对照组,而TRIM59处理组、联合处理TRIM59 mRNA相对表达量低于空白组和对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。TRIM29处理组、TRIM59处理组及联合处理组Twist1蛋白相对表达量均低于空白组、对照组,且联合处理组Twist1蛋白相对表达量低于TRIM29处理组、TRIM59处理组;TRIM29处理组、TRIM59处理组及联合处理组E-cadherin蛋白相对表达量均高于空白组、对照组,且联合处理组Twist1蛋白相对表达量高于TRIM29处理组、TRIM59处理组,差异均有统计学意义(P<0.05)。经皮尔逊(Pearson)相关性分析可得,TRIM29、TRIM59 mRNA相对表达量和Twist1蛋白相对表达量均呈正相关,而与E-cadherin蛋白相对表达量呈负相关,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论TRIM29、TRIM59对NSCLC迁移能力具有积极促进作用,其主要作用可能和调控Twist1、E-cadherin蛋白表达有关。

  • 标签: 肺癌 迁移
  • 简介:摘要目的观察微小RNA(miRNA,miR)-182通过靶向特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2(SATB2)基因对结直肠癌细胞增殖迁移的作用,探讨其对SATB2/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4(nox4)通路的调节机制。方法对数期生长人结肠癌细胞(HT-29)细胞,采用脂质体转染法将si-miR-182、Control-si转至HT-29细胞,分别设为Si-miR-182组、N-miR-182组,另取不做任何处理细胞为对照组。测定3组细胞中miR-182基因表达、增殖和迁移、SATB2、nox4、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)mRNA和蛋白表达。重复计量资料比较采用重复测量方差分析,两两样本比较采用LSD-t检验。结果Si-miR-182组miR-182基因相对表达量(0.35±0.05)低于对照组(1.24±0.26)和N-miR-182组(1.20±0.25),差异均有统计学意义(t=7.517、7.455,P<0.05);Si-miR-182组培养24、48、72 h MTT试验吸光度(A)值均低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(24 h:t=2.667、2.664;48 h:t=4.559、4.524;72 h:t=7.257、6.981;P<0.05);与培养24 h比较,3组培养48、72 h MTT试验A值均升高(48 h:t=5.507、5.092、3.741;72 h:t=11.330、10.637、9.229;P<0.05),且72 h MTT试验A值高于48 h,差异均有统计学意义(t=7.411、6.941、5.214,P<0.05)。Si-miR-182组细胞迁移率[(53.90±3.19)%]低于对照组[(81.66±5.92)%]和N-miR-182组[(80.35±5.40)%],差异均有统计学意义(t=9.231、9.430,P<0.05);Si-miR-182组细胞SATB2、E-cadherin mRNA和蛋白相对表达量高于对照组和N-miR-182组(SATB2:t=10.930、11.158;E-cadherin:t=9.288、9.369;P<0.05),nox4、Vimentin mRNA和蛋白相对表达量低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(nox4:t=8.955、7.590;Vimentin:t=6.543、6.644;P<0.05)。结论沉默miR-182基因可显著抑制结直肠癌细胞增殖及迁移能力,可能通过激活SATB2、E-cadherin的表达、抑制nox4、Vimentin的表达、参与SATB2/nox4通路共同调控。

  • 标签: 微小RNA-182 特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2 结直肠癌 增殖 迁移
  • 简介:DNA是生物界的主要遗传物质,它的空间结构最大特点之一是碱基互补配对,而且A只能与T配对或T与A配对;G只能与C配对或C与G配对。因此,组成DNA分子的碱基虽有四种,但其配对方式只有两种,故不能用数学中的排列组合法去任意配对,这也是由碱基本身分子结构及配对时的氢键数目,决定了DNA分子空间结构的横挡必须一样长(20)所致。

  • 标签: DNA 碱基互补配对 碱基比 互补链 排列组合 RNA
  • 简介:碱基类计算题是高中生物教学中的一个重点和难点,同时也是高考的一个热点。学生遇到这类问题往往“剪不断,理还乱”,或因审题错误而功败垂成。本人在教学中尝试借用几何证明的推导式梳理这类题目的解题思路,取得了较好的教学效果。

  • 标签: 高中 生物教学 碱基类计算题 题型 推导式教学 解题方法
  • 简介:[摘 要]根据进化论,现存物种拥有一个共同祖先,在漫长的时间中,各种环境因素及其他因素的条件下,得到了不同的进化结果。在这一过程中,生物细胞内的遗传物质在不断复制,分配给下一代。这其中就会因为各种各样的错误,导致子代序列与亲本的序列出现差异。这就是普遍存在的突变。已知现存物种都共用同一个密码子表,即基因序列中每三个碱基,所对应的氨基酸在所有生物体中是统一的。除此之外,密码子中存在多个密码子编码同一个氨基酸的现象,即密码子简并性。这也导致了突变结果会出现,序列改变但是编码的蛋白质没有改变的情况,这就是同义突变。突变普遍存在,但其具有低频性,两条序列经过一段时间的突变累积,我们可以推算得到他们的同义替换率(ks)和非同义替换率(ka),本研究采用核密度曲线将ks可视化,并探究ks推断的影响因素及矫正方法。

  • 标签: [] 碱基替换率 进化分析 可视化 ks矫正 突变
  • 简介:十二音体系的建立,对传统的旋律组织法作了彻底的变革,在音乐中奠定了序列主义的基础。但作曲家们并没有满足于“音高”的序列化,为了创造全新的音乐语言,他们的下一个目标是彻底改革传统的“节奏”组织法。

  • 标签: 序列主义 音乐语言 二音 序列化 三十二分音符 布列兹
  • 简介:摘要燃煤电厂锅炉在燃烧过程时会产生一定量的SO3,会对环境造成污染,并严重影响机组的正常、安全运行。本文介绍了一种碱基喷吹脱除三氧化硫的技术,采用碱金属盐,通过溶解送至烟道,与烟气充分混合后发生反应,脱除SO3,实现90%以上的脱除效率,有效解决SO3污染问题。

  • 标签: 燃煤电厂 选择性催化还原法(SCR)脱硝技术 SO3 SO3脱除
  • 简介:产生于20世纪上半叶的十二音序列,其基本原则已存在于晚期浪漫派及新民族乐派的作品中,甚至与13、14世纪的“等节奏”技术有着异曲同工之妙。在勋伯格建立起十二音体系之后,在不同作曲家的不同创作时期中,序列的发展从来没有停止过。它的极端表现形式是形成于50年代的整体序列,由于它对音乐的全面控制极大的束缚了作曲家的手脚,因而序列与各种不同风格的“调性”的结合,在作曲家和理论家们不断探索的过程中,越来越显示出强大的生命力。

  • 标签: 序列 十二音 特洛普 非十二音序列 结缘序列 关联序列
  • 简介:为了提高蓝牙跳频序列在军事通信抗干扰系统中的应用性能。文中给出了一种通过蓝牙跳频序列生成算法的改进得到的新型跳频序列。这种新序列与原来的蓝牙序列相比,其周期更长,数量更多,汉明相关性能和均匀性更好,线性跨距也更大。

  • 标签: 蓝牙 跳频 序列 军事通信 抗干扰
  • 简介:虽然有不少优秀的序列作品仍保留传统的旋律写作原则,但对一个初学者来说,最好是先掌握“非传统”旋律的写作方法。一、“非传统”性质的旋律在传统音乐中,推动音乐向前发展的动力主要来自调式功能,体现音与音之间、和弦与和弦之间、调性与调性之间的

  • 标签: 序列音乐 旋律线 无调性音乐 写作原则 写作方法 勋伯格
  • 简介:作为一种新型分子标记,表达序列标签一简单重复序列(EST—SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接的关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记的开发策略、方法及其应用进展,总结了其中存在的一些问题,目的是为今后该领域的研究提供一定的参考。

  • 标签: 表达序列标签 简单重复序列 标记开发 策略
  • 简介:摘要三基序蛋白44(TRIM44)是TRIM家族的成员,其编码的蛋白具有E3泛素连接酶活性,是调控肿瘤细胞DNA损伤反应的关键元件。研究结果表明,TRIM44在多种恶性肿瘤中高表达,并与肿瘤发生发展及患者不良预后密切相关。本文拟就TRIM44在恶性肿瘤中的研究进展作一综述,重点关注TRIM44在肿瘤的恶性进程中发挥的作用及其调控机制,为肿瘤的诊治提供新的思路。

  • 标签: 恶性肿瘤 预后 信号通路
  • 简介:月望节日序列,是指由正月十五日、七月十五日、八月十五日、十月十五日四个满月之日构成的节目序列。这是中国古代节日内部结构体系中占有重要位置的节日序列。本文立足岁时文化整体性研究的学术立场,通过与重数节日序列的比较,探讨了月望节日序列存在的结构性意义。本文在岁时研究领域第一次对于月望节日序列的排列规则做了初步探讨,提出“均衡”与“重阴”为其排列的基本原则,并进一步对月望节日系列形成的历史过程以及八月十五中秋节的特殊意义做了相应讨论。

  • 标签: 月望 节日 序列 结构 形成史
  • 简介:<正>当代作曲大师梅西安预言:“序列主义的原理将在21世纪的音乐中被充分发挥。”英国剑桥大学作曲教授葛尔说:“了解现代音乐,必须从十二音体系入手。”著各理论家彼得·汉森指出:“这一体系不仅不是一种使人受限制的方法,相反,它给作曲家提供了巨大数量的各种可能性。”我院作曲系郑英烈教授深受以上三位名家的名言所启迪,立志为发展具有

  • 标签: 受限制 教授 序列音乐 写作基础 数量 现代音乐