简介:摘要目的构建预测电离辐射诱导DNA双链断裂(DSB)水平的随机森林分类模型,初步研究DSB在基因组中的分布规律。方法将GRCh38参考基因组分为50 kb的片段,根据MCF-7细胞的测序数据把片段分为电离辐射诱导的DSB低水平和高水平区域,以8种表观遗传学特征作为输入,随机将数据集的2/3列为训练集,1/3列为测试集,构建含100棵决策树的随机森林分类模型。分析分类模型中表观遗传学的特征重要性,展示这些标记在不同DSB水平区域的富集差异。结果随机森林分类模型在测试集上预测的准确率为99.4%,精准率为98.9%,召回率为99.9%,受试者操作特征曲线下面积为0.994。8个特征中H3K36me3和DNase标记的重要性最高,富集分析表明DSB高水平区域的这两类标记明显高于DSB低水平区域。结论以表观遗传学数据作为特征输入,随机森林分类模型可在50 kb基因组区域上准确预测电离辐射诱导的DSB水平,分析表明这些DSB可能主要分布在基因组中转录活跃的部位。
简介:摘要目的研究DNA双链断裂(DNA double-strand breaks,DSB)修复能力的影响因素及其与分化型甲状腺癌(DTC)发生风险的关系。方法回顾性分析河南省肿瘤医院2020年1月至3月收治的140例甲状腺疾病患者,其中男性26例,女性114例,年龄18~78岁。依据病理结果将患者分为DTC组(90例)与对照组即甲状腺良性结节(benign thyroid nodules,BTN)组(50例),应用流式细胞仪测定所有患者外周血T淋巴细胞的DSB修复能力,通过Wilcoxon秩和检验对2组数据进行比较,评估DSB修复能力与DTC发生风险的关系。并根据BTN组DSB修复能力中位数将DSB修复能力分为高和低2组,采用Logistic 回归法对可能影响DSB修复能力的因素进行分析。采用SPSS 22.0软件对数据进行统计学分析。结果DTC组的DSB修复能力中位数为27.87%,BTN组中位数为36.75%,DTC组的DSB修复能力低于BTN组,差异有统计学意义(Z=-3.999,P<0.05);通过Logistic 回归分析发现DTC患者比BTN患者的DSB修复能力低(OR=2.245,95%CI:1.067~4.725,P=0.033),有辐射暴露史的人群DSB修复能力降低(OR=2.698,95%CI:1.271~5.725,P=0.010)。结论DSB修复能力较低的人患DTC的风险可能增加,辐射暴露可能是DSB修复能力降低的危险因素。
简介:摘要目的探讨DNA双链断裂修复基因XRCC5、LIG4的多态性与脑胶质瘤的相关性。方法以126例脑胶质瘤患者以及120例健康志愿者作为研究对象,检测XRCC5基因rs828704、rs9288516位点以及LIG4基因rs3093737、rs3093739、rs10131位点的多态性,分析其与脑胶质瘤易感性的关系。结果XRCC5基因rs828704、rs9288516位点及LIG4基因rs3093737、rs3093739、rs10131位点在两组的分布均满足Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。病例组XRCC5基因rs9288516位点的A等位基因、LIG4基因rs10131位点的T等位基因频率高于对照组(P<0.05)。XRCC5基因rs9288516位点、LIG4基因rs10131位点在显性模型及加性模型下与胶质瘤易感性具有相关性(P<0.05); LIG4基因rs3093739位点在显性模型下与胶质瘤的易感性相关(P<0.05)。结论XRCC5基因rs9288516位点、LIG4基因rs10131位点与胶质瘤的易感性存在相关性。
简介:摘要:在建筑企业中,保证资金链正常运行尤为重要。本文分析了造成建筑企业资金链断裂的因素,并制定了相关的解决方法,为保证建筑企业的顺利发展奠定了基础。
简介:摘要目的探究miR-375-3p调控结直肠癌细胞放射敏感性的作用和机制。方法在结直肠癌细胞HCT116及HT29中过表达miR-375-3p,利用CCK-8法检测细胞增殖能力,利用克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,利用Annexin V-FITC/PI双染法流式细胞术检测细胞凋亡,利用流式细胞术检测细胞周期分布。过表达miR-375-3p后,检测γ-H2AX foci形成点数量、同源重组(HR)及非同源性末端连接(NHEJ)修复效率,分析miR-375-3p表达对DNA双链断裂(DSBs)以及其修复效率的影响;利用生物信息学预测miR-375-3p在HR修复通路中的下游靶基因,利用双荧光素酶报告基因法进一步验证miR-375-3p表达对靶基因重组蛋白A (RAD51)表达调控作用。最后,利用荧光定量PCR技术检测经60Co γ射线2、6 Gy照射后HCT116细胞miR-375-3p的表达量;抑制miR-375-3p表达,经0、1、2、4、6 Gy不同剂量照射后,分析miR-375-3p表达变化对结直肠癌细胞HCT116放射敏感性的影响。结果过表达miR-375-3p显著抑制了结直肠癌细胞HCT116及HT29的增殖及克隆形成能力,诱发其细胞凋亡、G1期周期阻滞和DSBs损伤,下调了Rad51表达,显著降低了HR修复效率[miR-375-3p(3.55 ± 0.30)%,miR-nc(1.97 ± 0.15)%;t=10.055,P<0.05];双荧光素酶报告基因实验显示miR-375-3p能够靶向Rad51 3′UTR区域结合(t=5.013,P<0.05);电离辐射能诱导miR-375-3p表达,抑制其表达显著降低了结直肠癌细胞放射敏感性(t=6.460、5.619、10.150,P<0.05)。结论miR-375-3p能够靶向抑制Rad51表达,下调DSBs的HR修复效率,增强结直肠癌细胞的放射敏感性。
简介:AventadorLP700-4还是延续了Lamborghini的一贯设计风格,显得粗犷而霸气,浑身充满了如蛮牛般的力量。而从整体感觉上,我们也能从其身上看到Murcielago、Renventon以及SestoElementoConcept的影子。