简介：目的：对药物基因组学在肿瘤中应用的研究文献进行计量学分析,了解该领域目前的研究状态。方法：检索美国科学引文索引网络版数据库,运用文献计量学分析方法,对1982年1月1日—2017年4月19日所收集文献的年份、国家和（或）地区、研究机构、期刊、作者、研究领域及被引用频次等进行统计分析。结果：最终纳入文献3495篇,1982—2013年发表文献数量呈上升趋势,2013年为文献发表高峰年,之后逐渐下降。共涉及91个国家和（或）地区,美国文献发表量显著超过其他的国家和（或）地区。共涉及3987家研究机构,芝加哥大学居首。文献发表在876种期刊上,文献发表量排序居前10位的期刊共发表文献987篇（占28.240%）,排序居第1位的期刊为《药物遗传学和基因组学》;排序居前10位的期刊中影响因子最高的是《临床肿瘤学杂志》;排序居前10位的期刊共涉及16个期刊引证报告类别。共涉及作者16807位,其中140位作者发表的文献量在10篇以上;文献发表量排序居前10位的作者中,7位来自于美国,排序居第1位的作者为美国H.LeeMoffitt癌症中心的McleodHL。共涉及了87个研究领域,排序居前4位的分别为医药学、肿瘤学、基因遗传学和生物技术与应用微生物学。3495篇文献被引次数共94500次,平均被引次数为27.04次,排序居前3位的文献中标注的通信作者分别来自英国、德国和法国,排序居第4—10位的均来自美国;排序居第1位的文献为《系统识别肿瘤细胞系药物敏感性的基因组标记》。结论：药物基因组学在肿瘤中应用研究取得了较大进展,但近几年的发展减慢,研究者最关注的问题为基因表达与抗肿瘤药敏感性的关系。目前,美国研究实力最强,我国也有较强的科研实力,但与美国尚存在一定差距。

简介：摘要目的探讨主观认知减退（SCD）人群静息态皮质网络的拓扑特征及与认知水平的相关性。方法收集2017年6月至2019年11月在南京各社区招募36例自诉有记忆下降的中老年人与32名健康对照（NC），分析认知量表、T1加权像（T1WI）和静息态功能磁共振（rs-fMRI）数据。SCD组男5例、女31例，年龄（64±5）岁；NC组男8例、女24例，年龄（65±5）岁。对rs-fMRI数据进行预处理，并根据先验模板将大脑皮质分为333个脑区（节点）和10个模块，建立皮质-皮质的全连接矩阵，在矩阵基础上计算每个节点的模块内连接度（WMD）和参与系数（PC）。比较两组间各节点的WMD值和PC值，并与认知量表评分作相关性分析。结果SCD组右侧额顶网络（FPN）的背外侧前额叶（DLPFC）（P<0.05，FDR校正）与额中央回（P<0.005，未校正）WMD增加；左侧视觉网络（VN）的枕上回WMD降低（P<0.05，FDR校正）；左侧背侧注意网络（DAN）的缘上回PC降低（P<0.005，未校正）。SCD组中，DLPFC的WMD值与听觉词汇学习测验（AVLT）短时记忆（r=0.364，P=0.029）、再认记忆（r=0.364，P=0.029）及波士顿命名评分（BNT）（r=0.356，P=0.033）成显著正相关；缘上回的PC值与BNT评分（r=0.413，P=0.012）成显著正相关。结论SCD人群存在皮质网络失衡与重构，表现为VN的模块内连接性及DAN的模块间连接性降低，并通过增强FPN的模块内连接性而代偿认知水平的早期减退。

简介：摘要目的基于基因组学的数据，通过机器学习，构建胃癌相关甲基化预测模型。方法下载TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库中胃癌基因突变数据、基因表达数据和甲基化芯片数据，进行特征选择，构建支持向量机（径向基核函数）、随机森林和误差反向传播（error back propagation，BP）神经网络模型，并在新的数据集中进行模型的验证。结果在3个模型中BP神经网络的检验效能最高（F1 值=0.89，Kappa=0.66，受试者工作特征曲线下面积=0.93）。结论BP神经网络能够充分利用分子检测的基因组数据进行机器学习，可以用于胃癌相关甲基化预测。

简介：摘要目的探讨乳腺X线影像组学方法预测乳腺癌腋窝淋巴结转移的价值。方法回顾性分析2013年6月至2017年7月河南省人民医院病理证实为乳腺癌女性患者的临床及X线资料。共入组214例患者，年龄30~85（53±11）岁，并按照3∶1的比例随机分成训练集（n=153）和验证集（n=61）。根据腋窝淋巴结是否转移，分为腋窝淋巴结阳性组99例，阴性组115例。对获得的双乳内外斜位（MLO）和头尾位（CC）X线图像进行病灶分割和特征提取。应用LASSO回归模型分别从CC、MLO和CC联合MLO图像的高维特征中依次筛选出3、9和7个腋窝淋巴结转移相关的组学特征。根据影像组学特征和临床特征构建预测模型。使用10折交叉验证模型的预测能力。结果腋窝淋巴结阳性组病灶大小大于腋窝淋巴结阴性组，差异有统计学意义（t=2.611，P<0.05）。在验证集中，单独CC、MLO、CC联合MLO图像、临床特征及临床特征联合CC和MLO图像的组学特征预测腋窝淋巴结转移效能的受试者操作特征曲线下面积（AUC）值分别为0.680、0.723、0.740、0.558和0.714，其中，CC联合MLO图像的预测效能最大，AUC值均高于单独CC、MLO图像、CC联合MLO图像预测效能。结论乳腺X线组学特征可术前定量预测乳腺癌腋窝淋巴结转移，但仍需扩大样本量进一步验证。

简介：摘要目的探讨基线期MRI多序列影像组学在预测直肠黏液腺癌（RMAC）新辅助放化疗（NCR）疗效的应用价值。方法回顾性分析2012年8月至2018年10月中山大学附属第六医院在NCR前行MRI检查的RMAC患者的临床和影像资料。共纳入79例患者，男52例，女27例，年龄20~78岁，中位年龄52岁。根据病理消退分级标准，将所有患者分为NCR有效组（n=31）和NCR无效组（n=48）。分别提取基线期MRI的T2WI、扩散加权成像（DWI）和增强T1WI图像的701个影像组学特征，并通过可重复性分析和特征降维筛选出特征子集构建影像组学预测模型。比较NCR有效组和无效组基线期MRI影像特征，将P<0.05的特征与影像组学结合构建模型。以病理为金标准，采用受试者操作特征（ROC）曲线评价预测模型的诊断效能，并计算曲线下面积（AUC）、95%可信区间、灵敏度和特异度，并采用DeLong法比较不同预测模型的诊断效能。结果NCR有效组和无效组常规影像表现比较，淋巴结分期和有无黏液结节差异有统计学意义（χ²=6.040、5.870，P<0.05）。基于T2WI、DWI、增强T1WI影像组学ROC曲线的AUC分别为0.816、0.821和0.819，均高于常规特征（淋巴结分期、黏液结节状态）的AUC（0.607），且差异均有统计学意义（Z=-2.391、-2.580、-2.717，P<0.05）。T2WI、DWI及增强T1WI影像组学特征联合常规特征预测模型中，DWI联合常规特征的AUC最大，为0.843，且3种联合模型之间差异均无统计学意义（P均>0.05）。结论基线期T2WI、DWI、增强T1WI影像组学构建模型可以预测RMAC行NCR后疗效，优于常规特征预测效能；且联合常规特征后可进一步提升预测效能。

简介：摘要目的应用影像组学技术结合心电门控4DCT强化扫描图像，量化分析左心室肌CT影像组学特征在心动周期中的变化情况，为基于心电门控4DCT进行心脏功能动态评估提供可行方法。方法将14例患者的4DCT强化扫描图像以心动周期5%为间隔，重建0%～95% 20个时相的图像。分别在单个时相勾画左心室肌(LVM)，并在左心室心腔造影剂充盈完好区域勾画直径为13 mm的球体[心腔感兴趣区(ROI)]。利用3DSlicer软件对所有勾画的92个特征进行提取，分析CT值在心腔ROI和LVM上的分布情况，基于心腔ROI进行初步筛选(单因素方差分析)得到稳定特征，再利用稳定特征对LVM进一步筛选(单因素方差分析)得到有差异特征，然后采用Wilcoxon秩和检验量化分析特征在心跳周期中随心跳的变化情况。结果心跳周期中心腔ROI的平均CT值变化率小于LVM，变化率分别为9.23%、17.88%。有36个稳定特征在心腔ROI上差异均无统计学意义(P>0.05)；在36个稳定特征中，对LVM分析得到20个差异有统计学意义的特征(F＝1.641～6.206，P<0.05)，且平均变化率达到98.63%，其中Firstorder矩阵：中值(-103.96%)、均值(123.67%)；GLDM矩阵：灰度非均匀性(99.81%)等变化率达到了99%以上，且不同心动周期中的最大值、最小值之间的差异均具有统计学意义(Z＝-3.921～-3.173，P<0.05)。结论通过结合影像组学技术和心电门控4DCT强化扫描图像可以放大心动周期中CT图像的微观变化，可为左心室肌功能的变化评估提供一个新方法，Firstorder矩阵的均值等特征更具应用潜力。

简介：摘要目的探究基于病变内部及病变周围MRI影像组学模型预测临床显著性前列腺癌的价值。材料与方法140例(训练集112例，测试集28例)进行过前列腺磁共振扫描的患者纳入研究。手动勾画T2加权成像(T2 weighted imaging，T2WI)、ADC图像病变内部区域(intralesional volume，ILV)及病变周围区域(perilesional volume)并分别提取影像组学特征，构建最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator，LASSO)回归预测模型。运用ROC曲线分析、临床决策曲线分析对模型进行评估。结果训练集的AUC、准确率分别为：0.93 (95%置信区间：0.88～0.98，特异度：0.87，敏感度：0.89)、0.84 (95%置信区间：0.76～0.90)。测试集的AUC、准确率分别为0.92 (95%置信区间：0.81～1.00，特异度：0.95，敏感度：0.68)、0.89 (95%置信区间：0.72～0.98)。临床决策曲线分析中诊断阈值位于0.01～0.83或0.87～0.98时，运用预测模型患者具有良好的净受益。结论基于病变内部及病变周围MRI影像组学特征对于临床显著性前列腺癌的预测具有应用价值。

简介：摘要目的结合机器学习与影像组学特征构建预测间变性胶质细胞瘤和胶质母细胞瘤的模型并进行验证。方法回顾性收集首都医科大学附属北京天坛医院神经外科自2005年8月至2012年8月收治的241例经病理证实的间变性胶质细胞瘤或胶质母细胞瘤患者的影像学资料。按随机数字表法分为训练组(n=140)和验证组(n=101)。使用MRIcron软件在训练组患者术前T1增强影像上勾勒肿瘤边界，运用Matlab软件提取肿瘤区域的影像组学特征，应用最低绝对收缩和选择算子(LASSO)回归模型筛选最佳影像组学特征，基于所选特征通过支持向量机(SVM)分类器建立胶质瘤鉴别模型，使用受试者工作特征(ROC)曲线评价模型对间变性胶质细胞瘤或胶质母细胞瘤的预测效果。结果241例胶质瘤患者中，经病理证实为间变性胶质细胞瘤101例、胶质母细胞瘤140例。训练组和验证组中，胶质母细胞瘤、间变性胶质细胞瘤患者的年龄差异均有统计学意义(P<0.05)；胶质母细胞瘤和间变性胶质细胞瘤患者的性别分布，肿瘤位置，肿瘤坏死、水肿所占比例差异均无统计学意义(P>0.05)。Matlab软件共提取431个影像组学特征，LASSO回归模型筛选出11个最佳影像组学特征。ROC曲线分析显示SVM分类器建立的模型预测训练组患者胶质瘤类型的曲线下面积(AUC)为0.942，预测验证组患者胶质瘤类型的AUC为0.875。结论结合机器学习与影像组学特征构建的模型可有效鉴别间变性胶质细胞瘤和胶质母细胞瘤。

简介：摘要目的探讨老年与中青年食管鳞癌（esophageal squamous cell carcinoma， ESCC）患者食管组织的菌群特征及差异，以助于研究老年ESCC患者潜在的生物标志物。方法采用回顾性研究，选取2018年7月至2019年7月在湖北省十堰市太和医院确诊的72例ESCC患者，其中老年组49例（≥60岁，男性40例，女性9例），中青年组23例（<60岁，男性21例，女性2例），以同期消化内镜中心20名胃镜检查无异常的健康体检者作为对照组（年龄范围35~78岁，中位年龄57岁，男性16名，女性4名）。收集ESCC患者病变食管组织和健康对照组中段食管组织、提取基因组DNA，对细菌16SrRNA基因序列V4高变区扩增，采用Illumina HiSeq测序技术，对比分析老年和中青年ESCC患者菌群特点。采用QIIME和Rstudio软件分析序列数据，统计学方法采用非参数Kruskal-Wallis检验或Wilcoxon秩和检验。结果两组患者菌群Shannon指数［5.17（4.53，5.95）比4.79（3.74，5.97）］、Simpson指数［0.94（0.91，0.96）比0.92（0.83，0.96）］和Chao1 ［343.55（259.76，570.59）比329.16（268.88，648.00）］指数相似，差异无统计学意义（Z=-0.791、-1.057、-0.380，均P>0.05）；Beta多样性老年组与中青年组亦无明显差异（PC1=19.14%、PC2=6.95%，PPC1=0.67、PPC2=0.42）。在门水平，中青年组丰度前五的菌门依次为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）和梭杆菌门（Fusobacteria），老年组患者丰度最高的五个门分别是厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）、梭杆菌门（Fusobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）；两组差异显著的是梭杆菌门（Fusobacteria）（Q=0.596，P<0.05）。在属水平，中青年组丰度前五的菌属依次为：普雷沃菌属（Prevotella）、拟杆菌属（Bacteroides）、链球菌属（Streptococcus）、月形单胞菌属（Selenomonas）和韦荣球菌属（Veillonella）；而老年组丰度前五的分别是普雷沃菌属（Prevotella）、拟杆菌属（Bacteroides）、链球菌属（Streptococcus）、月形单胞菌属（Selenomonas）和嗜血杆菌属（Haemophilus），两组有显著差异的为梭杆菌属（Fusobacterium）（Q=0.938，P<0.05）。基于未观测状态重建的群落系统发育研究（PICRUSt）功能预测，老年组患者氨酰tRNA生物合成（Aminoacyl.tRNA.biosynthesis）、核苷酸切除修复（Nucleotide.excision.repair）、核糖核酸聚合酶（RNA.polymerase）、核糖体（Ribosome）、克拉维酸生物合成（Clavulanic.acid.biosynthesis）、光合作用（Photosynthesis）和光合作用蛋白（Photosynthesis.proteins）丰度较中青年组降低（均Q=0.734，P<0.05）。结论老年ESCC患者食管菌群与中青年患者的Alpha多样性和Beta多样性无明显差异，但老年患者梭菌属菌群丰度增高。

简介：摘要支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia，BPD)是早产儿常见疾病，致残率和病死率高。BPD生物标志物的研究有助于疾病的早期防控及改善预后，现多集中在基因、炎性因子及细胞因子。代谢组学通过研究代谢产物的改变，反映BPD在基因表达及环境因素的综合作用下的病理生理改变，包括氧化应激、肺泡表面活性物质及微生物定植等，可早期识别BPD的发生。该文就近年来应用代谢组学筛选BPD新的生物标志物的研究进行综述。

简介：在中医学中,“肺与大肠相表里”是重要的脏腑相关理论,自古便有效的指导着中医关于肺肠相关疾病的治疗,受到了学术界的广泛关注。随着现代分子生物学的发展,宏基因组学作为21世纪生命科学的产物,其是以生态环境中的所有细菌与真菌的基因组DNA作为研究对象,通过克隆与异源表达的方式筛选出有用的基因及其产物,并进一步研究这些细菌与真菌的基因组DNA之间的功能与彼此之间的相互作用与联系。因此能够摆脱传统只依靠培养微生物基因的方式来进行研究的束缚,显著扩大微生物基因的可探测范围,近些年来广泛应用于医学研究领域当中。本文通过对肺与大肠相表里的机制及临床研究的情况进行初步的归纳、分析并对宏基因组学技术及其在肺、肠疾病中的研究应用进行介绍,旨在提出借助宏基因组学的技术与方法来研究中医“肺与大肠相表里”理论的初步设想。

简介：前列腺癌发病率在美国和欧洲稳居男性恶性肿瘤的第一、第二位,肿瘤相关死亡率的第二位。在我国前列腺癌的发病率呈现明显的上升趋势。根据中国疾病控制中心的统计数据,1988～1992年、1993～1997年和1998～2002年这3个时间段中国部分城市和地区前列腺癌发病率分别为1.96/10万、3.09/10万、4.36/10万,不同地区也有着明显的差别,上海、北京等大城市明显高于其他地区。

简介：摘要目的探讨医疗质量安全管理与医患关系学组在防范医疗纠纷中的实践效果。方法选取2011年1月至2013年1月我院未建立医疗质量安全管理与医患关系学组前为对照组，选取2013年2月至2015年2月我院建立医疗质量安全管理与医患关系学组后为观察组，观察医疗质量安全管理与医患关系学组建立前后防范医疗纠纷中的效果评分。结果观察组的医疗机构质量、安全管理质量、沟通能力、鉴定能力评分明显优于对照组的医疗机构质量、安全管理质量、沟通能力、鉴定能力评分（P＜0.05）。结论建立医疗质量安全管理与医患关系学组在防范医疗纠纷中具有显著的效果，能够为医疗机构人员提供新知识，掌握新技能，降低医疗纠纷的发生率。

简介：摘要目的探讨基于MR的影像组学列线图预测喉癌颈淋巴结转移的临床价值。方法采用回顾性队列研究，收集2016年1月至2019年12月117例在烟台毓璜顶医院接受开放式手术并颈淋巴清扫的喉癌患者治疗前的临床资料及MR资料，完全随机法以约3∶1比例分为训练集89例和测试集28例。放射组学云平台（汇医慧影）上手动分割增强T1和T2WI的原发肿瘤感兴趣容积，提取影像组学特征。在训练集中，使用方差分析（analysis of variance，ANOVA）与套索算法（least absolute shrinkage and selection operator，LASSO）对影像组学特征进行降维，根据各自的加权系数建立影像组学标签。单因素ANOVA和多因素Logistic回归分析，确定颈淋巴转移的高危因素。联合高危因素和影像组学标签建立列线图。采用受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线、校准曲线评估列线图的效能，决策曲线分析（decision curve analysis，DCA）评估列线图的临床应用价值。测试集数据用于验证模型。结果经降维后剩余21个影像组学特征。纳入MR淋巴结状态及影像组学标签建立列线图模型。ROC曲线和校准曲线均显示出良好的预测效能；在训练集中，列线图模型的曲线下面积（area under curve，AUC）、特异性、敏感性分别为0.930、0.930、0.875；在测试集中，AUC、特异性、敏感性分别为0.883、0.889、0.800。DCA显示列线图预测颈部淋巴结转移有一定的临床获益。结论基于MR的影像组学列线图对喉癌患者术前颈淋巴结转移具有良好的预测效能，具有潜在的临床应用价值。

简介：目的：从代谢组学角度探讨香莲外洗液对白念珠菌生物膜的抗真菌效力及其作用机制。方法：建立白念珠菌生物膜体外模型，采用XTT减低法测定香莲外洗液、氟康唑对不同成熟程度（4h、24h、48h）白念珠菌生物膜的最低粘附抑菌浓度（SMIC50、SMIC80），并采用UPLC-Q-TOF-MS分别进行代谢组学检测。结果：香莲外洗液对4h、24h、48h的白念珠菌生物膜的SMIC50分别为7.81、125和500mg／mL，SMIC80分别为31.25、250和＞1000mg／mL；氟康唑对4h、24h、48h的白念珠菌生物膜的SMIC50分别为32、64和＞1024μg／mL，SMIC80分别为64、128和＞1024μg／mL；香莲外洗液、氟康唑干预不同成熟程度的生物膜代谢模式不同，存在Tyrosyl-Arginine（酪氨酰－精氨酸）、Pentosidine（戊糖）等多种可能差异代谢物。结论：香莲外洗液对不同成熟程度的白念珠菌体外生物膜具有不同程度的抑制作用，白念珠菌悬浮菌与生物膜在代谢过程中，主要涉及了糖代谢、氨基酸代谢途径的改变。

简介：

简介：20世纪90年代开始实施的人类基因组计划（HumanGenomicProject），完成了大量的基因序列的测定，在基因结构和遗传学以及疾病与基因的关联上取得了很大的进展。随着基因计划的完成，生命科学已进入后基因时代，研究的重点已从揭示生命所有遗传信息转移到从整体水平上对生物功能的研究。而以生命功能的主要执行者和体现者——蛋白质为研究对象的蛋白质组学（proteomics）就显得越来越重要了。其中肿瘤蛋白质组学是从细胞整体水平上认识在肿瘤的发生、发展过程中蛋白表达谱的变化。

简介：建立符合中药方剂自身特点的整体药效评价体系是中药现代化研究的重要科学任务之一，近年来，随着代谢组学科学技术的发展为中药方剂整体药效评价与多靶点作用机制研究提供了崭新的和强有力的技术手段。本论文围绕代谢组学研究技术在中医证动物模型评价、“方证对应”研究、中药整体药效作用评价及作用机制研究等方面的研究现状进行了扼要评析，提出和讨论了代谢组学研究结果的定量表征，多组分多靶点中药与单成分、单靶点化学药物药效作用的代谢组学比较研究，药物代谢动力学与代谢组学整合研究在中药药效物质基础及整体药效作用评价与作用机制研究中重要作用意义。

简介：摘要：蟹足肿是人特有的常见皮肤疾病，又名瘢痕疙瘩，痛痒强烈，侵袭率高，术后极易复发，严重影响工作和生活。为更好指导我省民间药丁毒豆在临床治疗蟹足肿的应用，本研究基于1H NMR代谢组学对丁毒豆抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖机制进行研究。首先应用MTT法检测丁毒豆对成纤维细胞存活率，进而应用1H NMR技术分析正常和丁毒豆作用的瘢痕疙瘩成纤维细胞差异代谢物，通过MetaboAnlyst平台筛选出主要代谢途径，最终在细胞水平上探讨丁毒豆治疗蟹足肿的整体作用机制。该研究不仅探索了民间药丁毒豆治疗蟹足肿机制研究新方法，而且为其在临床的合理应用提供科学依据。

简介：摘要：本文深入探讨了质谱技术的蛋白质组学在肿瘤标志物发现中的应用，强调其在肿瘤诊断和治疗研究中的关键作用。通过高通量和高精度分析，质谱技术提供了一种强大的方法来识别和定量肿瘤相关蛋白质，为早期诊断和治疗策略的制定提供了重要信息。尽管在处理复杂样本和低丰度蛋白质检测方面存在挑战，未来的发展应集中于提高技术灵敏度和数据分析准确性。质谱技术的进步预示着其在未来肿瘤学研究中扮演更加核心的角色，为肿瘤患者提供更精准、高效的诊疗方案。