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  • 简介:近日.国外安全机构截获首例能摧毁手机操作系统的木马病毒。该病毒是由芬兰一家信息安全公司发现的,并命名为“FONTAL.A”,它能够通过手机文件共享或因特网聊天传输,向手机操作系统植入恶意文件,使手机下次启动时因操作系统崩溃而失败。此外它还能破坏手机操作系统的程序管理器,阻止用户下载安装新的应用程序,也阻止用户将自己删除。该病毒是继首例概念性手机病毒“卡比尔”后首例被截获的能够攻击手机操作系统的恶性病毒,正是由于其巨大的破坏性.该病毒被称作是“手机病毒王”。

  • 标签: 手机病毒 计算机病毒 木马病毒 反病毒软件 工具软件 智能手机
  • 简介:摘要目的探讨长链非编码RNA同源异形盒转录反义RNA(lncRNA HOTAIR)通过靶向微小RNA-520g-3p(miR-520g-3p)对胰腺癌细胞增殖、迁移能力的影响。方法实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测胰腺癌细胞中miR-520g-3p、HOTAIR表达水平;转染HOTAIR小干扰RNA至SW1990胰腺癌细胞中,并分为NC组、siHOTAIR-1组、siHOTAIR-2组。细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞增殖能力,划痕愈合实验检测细胞迁移能力;双荧光素酶报告基因实验验证miR-520g-3p与HOTAIR靶向调控关系,两组之间的定量资料比较采用t检验。结果qRT-PCR结果表明SW1990中HOTAIR mRNA水平明显高于人正常胰腺导管上皮细胞(HPDE,3.08±0.33比1.57±0.17,t=29.830, P<0.01);miR-520g-3p在SW1990中的表达水平明显低于人正常胰腺导管上皮细胞(HPDE,0.93±0.11比2.63±0.24,t=22.410, P<0.01);HOTAIR小干扰RNA转染至SW1990中,72 h后NC组细胞吸光度(A)值明显高于siHOTAIR-1组、siHOTAIR-2组(3.52±0.99比1.92±0.23、2.36±0.58,t=6.340、5.150,P<0.01);降低HOTAIR表达48 h后,NC组细胞划痕愈合面积百分比为显著高于siHOTAIR-1组、siHOTAIR-2组[(85.37±9.82)%比(50.56±5.82)%、(35.28±6.86)%,t=7.760, 14.750,P<0.01],差异均有统计学意义。双荧光素酶报告基因表明miR-520g-3p可明显降低野生型HOTAIR载体荧光素酶活性。下调miR-520g-3p表达水平后,SW1990细胞增殖及迁移能力高于对照组(t=13.190、12.480,P<0.01),差异有统计学意义。结论HOTAIR可通过靶向负调控miR-520g-3p影响胰腺癌细胞增殖、迁移能力。

  • 标签: 长链非编码RNA 微小RNA 胰腺癌 增殖 迁移
  • 简介:摘要目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOXA末端转录本反义RNA(HOTTIP)对胰腺癌诊断的临床价值。方法收集2017年6月至2018年12月间徐州市中心医院18例行手术切除并经病理证实的胰腺癌组织及癌旁正常胰腺组织(距癌组织>1 cm);收集78例临床确诊的胰腺癌患者血浆,选取78例健康体检者作为健康对照组,同时收集原发性肝癌、结直肠癌及胃癌各50例作为疾病对照组。实时荧光定量PCR法检测胰腺癌组组织及血浆、健康对照组和疾病对照组血浆HOTTIP的表达水平,化学发光法检测胰腺癌患者血浆CA19-9水平。分析胰腺癌患者血浆HOTTIP与癌组织HOTTIP及血浆CA19-9相关性,分析血浆HOTTIP水平与肿瘤临床病理特征之间的关系。绘制高表达HOTTIP组和低表达HOTTIP组患者的生存曲线,log-rank检验比较两组间的生存率差异。绘制受试者工作特征曲线(ROC),计算曲线下面积(AUC),评估血浆HOTTIP水平对胰腺癌的诊断效能。结果胰腺癌患者癌组织HOTTIP表达量显著高于癌旁正常胰腺组织(2.24±0.25比0.62±0.11,P<0.001);胰腺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌患者及健康对照者血浆HOTTIP水平分别为1.33±0.32、0.57±0.17、0.51±0.10、0.41±0.09、0.54±0.05,胰腺癌组显著高于肝癌、结直肠癌、胃癌患者及健康对照者,差异均有统计学意义(P值均<0.05),但肝癌、结直肠癌、胃癌患者血浆HOTTIP水平与健康对照者的差异均无统计学意义。胰腺癌患者血浆HOTTIP表达与CA19-9及癌组织中HOTTIP表达均呈正相关(P值均<0.001),且血浆HOTTIP表达水平与TNM分期有关(P=0.029),而与患者性别、年龄及淋巴结转移、肿瘤大小无关。HOTTIP高表达患者生存率明显低于HOTTIP低表达患者(15.9个月比30.6个月,P<0.05)。血浆HOTTIP水平诊断胰腺癌的AUC值为0.81(95% CI 0.74~0.87),诊断临界值为1.14,灵敏度为62%,特异度为94%,准确性为74%。血浆HOTTIP联合CA19-9诊断胰腺癌的灵敏度提高到81%,特异度提高到97%,准确性提高到84%。结论胰腺癌患者血浆HOTTIP水平对胰腺癌的诊断具有一定的临床价值。

  • 标签: 胰腺肿瘤 诊断 敏感性与特异性 长链非编码RNA HOXA末端转录本反义RNA
  • 简介:摘要目的探讨环状RNA(circRNA) AAMDC调控非小细胞肺癌细胞A549凋亡的分子机制。方法在非小细胞肺癌细胞A549中过表达circRNA AAMDC后,膜联蛋白染色分析A549细胞的凋亡水平。通过CSCD在线分析circRNA AAMDC的潜在靶标miRNA。过表达circRNA AAMDC后,实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测潜在靶标miRNA的水平。敲低潜在靶标miRNA,膜联蛋白染色分析A549细胞的凋亡水平。通过miRDB分析靶标miRNA的潜在靶标mRNA。过表达靶标miRNA后,实时荧光定量PCR检测潜在靶标mRNA的水平。敲低和过表达靶标mRNA,膜联蛋白染色检测A549细胞的凋亡水平。组间差异通过Student’s t检验分析两组单向方差分析。结果在非小细胞肺癌细胞A549中,过表达circRNA AAMDC后A549细胞的凋亡水平下降(0.31±0.01,0.08±0.02,t=17.820,P<0.05),在A549细胞中miR-1197(1.53±0.51比0.35±0.11,t=3.917,P<0.05)和miR-205-3p的表达下降(1.23±0.24比0.20±0.02,t=7.408,P<0.05)。分别敲低miR-1197和miR-205-3p后,发现敲低miR-1197的A549细胞凋亡水平下降(0.31±0.04比0.12±0.04,t=5.818,P<0.05),而敲低miR-205-3p的A549细胞凋亡水平无明显变化(0.31±0.04比0.33±0.05,t=0.541,P>0.05)。荧光素酶报告系统发现circRNA AAMDC靶向miR-1197(102.00±6.02比16.02±5.49,t=18.280,P<0.05)。过表达miR-1197后,发现TIAF1的mRNA水平下降(2.53±0.57比0.45±0.09,t=6.243,P<0.05)。通过荧光素酶报告系统发现miR-1197靶向TIAF1的3’端非编码区(3’UTR)(101.01±6.02比25.02±5.49,t=16.370,P<0.05)。在非小细胞肺癌细胞A549中,过表达TIAF1后A549细胞的凋亡水平下降(0.31±0.04比0.05±0.01,t=10.920,P<0.05)。敲低TIAF1后A549细胞的凋亡水平上升(0.31±0.01比0.68±0.22,t=2.910,P<0.05)。通过回补实验,发现circRNA AAMDC-miR-1197-TIAF1调控A549的细胞凋亡。结论circRNA AAMDC靶向miR-1197后导致miR-1197的表达水平降低,而miR-1197靶向TIAF1 mRNA导致TIAF1的蛋白水平降低。因此,circRNA AAMDC促使TIAF1水平升高,降低了非小细胞肺癌A549的凋亡水平。

  • 标签: 环状RNA AAMDC 微小RNA-1197 TIAF1 非小细胞肺癌 凋亡
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  • 简介:摘要目的通过RNA测序(RNA-sequencing, RNA-seq)获取表达数据,并通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选与呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)毛细支气管炎患儿疾病严重程度相关的核心基因,为预测RSV感染病情提供参考。方法将2019年10月1日—2020年2月29日在温州医科大学附属第二医院住院的22例RSV毛细支气管炎患儿作为病例组,根据病情分为轻度组、中度组及重度组,以22例健康儿童作为对照组,收集全血白细胞总RNA进行RNA-seq,比较不同严重程度患儿与对照组的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),寻找与疾病严重程度相关的基因共表达模块,筛选能评估疾病严重程度的生物学指标。结果22例患儿中位年龄3个月,男19例,女3例,对照组中位年龄4个月,男14例,女8例,两组年龄及性别差异无统计学意义。轻度组8例,中度组和重度组各7例。通过显著性分析发现轻度组有416个DEGs,中度组有586个,重度组有846个。根据WGCNA分析发现10个共表达模块,其中棕色模块与疾病严重程度存在明显相关性(r=0.62,P<0.001)。进一步对棕色模块中的DEGs进行蛋白质互作(protein-protein interaction, PPI)网络构建并根据基因节点的连接度筛选出前30个核心基因,其中关联度较大的为基因RBX1和PSMA7。RBX1、PSMA7基因在重度组中表达上调,在轻、中度组中的表达与对照组比较差异无统计学意义。结论RBX1和PSMA7基因可能是RSV毛细支气管炎疾病严重度的生物学预测指标。

  • 标签: RNA测序 加权基因共表达网络分析 呼吸道合胞病毒 毛细支气管炎 疾病严重程度
  • 简介:在感染人类SARS病毒株中尚未发现具有抗体依赖的病毒入侵增强作用的抗体。该抗体作用因能影响疫苗抗病毒能力甚至会加重疾病,而一直备受疫苗研制者们的重视。迄今为止,抗体依赖性增强作用并未在感染人SARS-CoV病毒株系中发现,这也许能减轻人们对疫苗这种抗体依赖的增强作用产生的忧虑,但在该类疫苗投入使用前必须做好相关的动物模型试验。

  • 标签: 病毒入侵 病毒抗体 SARS-COV 加速 增强作用 疫苗研制
  • 简介:Anincreasingnumberofstructuralhomologysearchtools,mostlybasedonprofilestochasticcontext-freegrammars(SCFGs)havebeenrecentlydevelopedforthenon-codingRNAgeneidentification.SCFGscanincludestatisticalbiasesthatoftenoccurinRNAsequences,necessarytoprofilespecificRNAstructuresforstructuralhomologysearch.Inthispaper,asuccinctstochasticgrammarmodelisintroducedforRNAthathascompetitivesearcheffectiveness.Moreimportantly,theprofilingmodelcanbeeasilyextendedtoincludepseudoknots,structuresthatarebeyondthecapabilityofprofileSCFGs.Inaddition,themodelallowsheuristicstobeexploited,resultinginasignificantspeed-upfortheCYKalgorithm-basedsearch.

  • 标签: RNA 核糖核酸 SCFGs 结构
  • 简介:SmallRNA(sRNA)-mediatedpost-transcriptionalregulationdiffersfromprotein-mediatedregulation.Throughbasepairing,sRNAcanregulatethetargetmRNAinacatalyticorstoichiometricmanner.Sometheoreticalmodelswerebuiltforcomparisonoftheprotein-mediatedandsRNA-mediatedmodesinthesteady-statebehaviorsandnoiseproperties.ManyexperimentsdemonstratedthatasinglesRNAcanregulateseveralmRNAs,whichcausescrosstalkbetweenthetargets.Here,wefocusonsomemodelsinwhichtwotargetmRNAsaresilencedbythesamesRNAtodiscusstheircrosstalkfeatures.Additionally,thesequence-functionrelationshipofsRNAanditsroleinthekineticprocessofbase-pairinghavebeenhighlightedinmodelbuilding.

  • 标签: 调控理论 RNA介导 细菌 小RNA 碱基配对 转录后调控
  • 简介:摘要环状RNA为由外显子或内含子反向剪接形式闭合环状非编码RNA。临床越多研究证实,环状RNA本身高度保守,普遍存在各种真种真核细胞基因组之中,并且稳定表达在细胞质内。环状RNA为微小RNA海绵吸附miRNA或者RNA相关蛋白结合而形成的复合物,对基因转录进行调节。肿瘤组织环状RNA发现可有效的提示可能在肿瘤发生、发展以及侵袭方面发挥调控作用,则十分有希望成为肿瘤诊断、治疗潜在的靶标。本文主要对环状RNA种类、主要特点、在肿瘤中的生物学作用进行总结,望能够为临床环状RNA和肿瘤之间的诊断提供依据。

  • 标签: 环状RNA 研究 肿瘤 进展
  • 简介:摘要环状RNA(circRNA)是由前体mRNA反向剪接形成的具有封闭结构的环状分子,可充当微小RNA(miRNA)"海绵",与蛋白质、RNA结合形成复合物,发挥调控宿主基因表达、蛋白翻译的功能,在生理学和病理生理学中具有重要意义。多种眼科疾病中均存在特异性circRNA的异常表达,其通过"海绵"作用调控靶基因表达可引起多种眼部细胞功能异常,导致新生血管形成、血管渗漏、炎症反应、视网膜神经退行性变、晶状体混浊、肿瘤生长等病理改变,在眼病的发生和发展中可能起重要作用。本文就近年来circRNA在眼科疾病中的表达特点及其在眼病病理过程中介导的基因调控网络进行综述,探讨circRNA作为眼科疾病生物标志物及新型治疗靶点的意义。

  • 标签: 环状RNA 眼科疾病 新生血管形成 视网膜神经退行性变 眼肿瘤
  • 简介:摘要线粒体疾病受线粒体DNA和核基因组的双重调控,对线粒体DNA的变异解读一直充满挑战,本文将美国贝勒医学院临床医学遗传诊断室于2020年发表的线粒体信使RNA(mRNA)变异分类标准进行解读,以期为我国临床医生提供线粒体mRNA变异解读的最新依据。

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  • 简介:目的为探索提高库血丙型肝炎病毒(HCV)的检出率.方法采用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测4530份抗-HCV阴性的库血HCV-RNA.结果4530份库血中HCV-RNA阳性55份,阳性率1.21%,其中个体献血者血液2110份,HCV-RNA阳性40份,阳性率1.90%;无偿献血者血液2420份,HCV-RNA阳性15份,阳性率0.62%.结论RT-PCR可用于检测库血HCV-RNA,以减少因输血造成HCV感染.

  • 标签: HCV-RNA 库血 阳性率 血液 RT-PCR 检测分析
  • 简介:随着大量生物领域科研人员进入植物RNA研究领域,开展RNA研究,使得以RNA为终产物的基因组研究取得突破性进展,新的RNA基因不断增加,RNA的新功能不断被发现。但由于RNA的不稳定性,使得RNA操作远比DNA操作困难,且尚有大量未知的RNA及其功能等待人们去探索、研究.而这些研究又都基于高质量RNA的提取。因此,根据笔者自身实验经验,及在查阅大量相关文献的基础上。针对植物总RNA提取的一些关键影响因素、消除对策、RNA检测方法及RNA保存方法上进行了系统的阐述,旨在为高质量植物组织总RNA的制备提供理论参考,为RNA分子生物学实验后续研究提供理论支撑。

  • 标签: 高质量 影响因素 植物组织 总RNA
  • 简介:检测胰腺组织mRNA的表达已经成为研究胰腺疾病的重要手段,但由于胰腺组织富含RNase,抽提胰腺总RNA是分子生物学实验的难点之一。为此,本实验旨在探讨提取胰腺总RNA的理想方法。

  • 标签: 胰腺组织 总RNA 提取 分子生物学实验 大鼠 RNASE
  • 简介:利用雄性不育系做母本生产杂交一代种子,为改善作物的生产提供了十分有利的条件.细胞质雄性不育(CMS)和由光周期(PGMS)/温度诱导(TGMS)的不育性极大地促进了作物杂交育种的发展.越来越多的研究表明非编码ncRNA分子与植物雄性不育有关,如水稻的PGMS和TGMS与ncRNA密切相关.在CMS中,线粒体ORF影响小孢子发育而导致CMS发生的机制仍然不明确.高通量测序使得在全基因组范围内发现和验证这些调控分子及其靶基因,并阐述它们与CMS的相关性成为可能.植物线粒体DNA中的ncRNA以及其可能诱导的CMS的机理是当前研究的热点,但目前尚没有证据表明ncRNA与CMS有关,还需要转基因等遗传方法来进行验证.在本文中,我们总结了最近关于ncRNA与植物CMS关系的相关研究,希望能够提高对控制植物CMS的ncRNA介导的调控途径的理解.深入了解植物CMS可为促进CMS在农作物育种的利用提供技术支撑.

  • 标签: 非编码RNA 雄性不育 线粒体 花粉 基因表达
  • 简介:动脉粥样硬化是各种损伤刺激作用于动脉管壁引起的,涉及多细胞、多因素、多环节的全身性疾病,其发病机制至今未完全阐明。微小RNA(miRNA)是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA(约22个碱基),在转录后水平负性调控基因表达。

  • 标签: 动脉粥样硬化 微RNAS 基因表达调控 血栓形成
  • 简介:摘要目的基于生物信息学方法挖掘胆道闭锁(BA)差异表达基因(DEGs)并初步构建微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络,探索其在BA中的分子调控机制。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载数据集GSE46960,利用GEO2R在线工具分析BA和正常肝组织之间的DEGs,利用注释、可视化和富集发现数据库(DAVID6.8)对DEGs进行富集和功能注释。基于蛋白质互作数据库(STRING11.0)和Cytoscape_v3.7.1软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络,分析其关键基因。通过人类miRNA疾病数据库(HMDD_V3.2)查询与BA相关且经过验证的miRNA,并利用miRNA目标预测数据库(miRDB)预测其靶基因。将预测的靶基因和GSE46960中的差异表达基因求得交集,获得miRNA、mRNA相互作用关系。利用Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络图。结果从GSE46960数据集中共获得565个DEGs,其中352个为上调基因,213个为下调基因。其中上调的DEGs显著富集于细胞外基质受体相互作用、黏着斑激酶、阿米巴病通路、磷酸酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路中,下调的DEGs显著富集于新陈代谢、抗生素的生物合成、视黄醇代谢通路中。根据PPI网络,筛选出10个关键基因。在DEGs基础上成功构建了BA miRNA-mRNA分子调控网络。结论通过生物信息学筛选出的DEGs及构建的miRNA-mRNA调控网络有助于全面了解BA发生的分子机制,为探索联合miRNA及DEGs作为临床诊断及治疗的分子靶点提供了新方向。

  • 标签: 胆道闭锁 生物信息学 差异表达基因 微小RNA 调控网络
  • 简介:摘要目的探讨环状RNA-7(circularRNA, ciRS)-7在食管鳞癌细胞放疗抵抗中的作用及生物学机制。方法采用慢病毒转染食管鳞癌细胞系KYSE410和KYSE510构建ciRS-7敲降细胞系(分为正常对照组和sh#1组、sh#2组)。不同剂量射线(2 Gy组、4 Gy组、8 Gy组)照射上述细胞,收集各组细胞染色,流式细胞术检测活细胞比例。双荧光素酶报告系统检测ciRS-7与微小RNA(microRNA,miR)-7的调控关系;KYSE410细胞分正常组、ciRS-7敲降组,RT-qPCR检测miR-7表达。shRNA转染KYSE410细胞,分为干扰组(正常对照组、敲降ciRS-7组);过表达组(ciRS-7和miR-7同时过表达组、阴性对照组、miR-7过表达组),蛋白质印迹法检测各组中B细胞淋巴瘤/白血病-2蛋白(bcl-2)的表达。两组间比较采用独立样本的t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果KYSE410细胞sh#1组(0.36±0.03)、sh#2组(0.37±0.12)ciRS-7表达量低于正常对照组(1.00±0.01, t=24.460、8.910, P<0.05); KYSE510细胞sh#1组(0.40±0.08)、sh#2组(0.34±0.08)ciRS-7表达量低于正常对照组(1.00±0.08, t=8.514、9.550, P<0.05),差异均有统计学意义。4 Gy射线照射后,KYSE410细胞sh#1组[(37.00±3.07)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(63.50±6.36)%, t=7.400、5.301, P<0.05]; KYSE510细胞sh#1组[(39.00±8.48)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(73.50±6.36)%, t=4.600、7.509, P<0.05]。8 Gy射线照射后,KYSE410细胞sh#1组[(22.50±3.53)%]、sh#2组[(39.50±0.70)%]活细胞比例低于正常对照组[(50.50±2.12)%, t=9.604、11.800, P<0.05]; KYSE510细胞sh#1组[(33.00±2.82)%]、sh#2组[(31.00±2.82)%]活细胞比例低于正常对照组[(60.50±2.12)%, t=11.000、11.800, P<0.05],差异均有统计学意义。KYSE410细胞过表达ciRS-7组(1.00±0.23)的miR-7表达低于正常对照组(0.54±0.08, t=3.191, P<0.05),双荧光素酶报告系统证实ciRS-7吸附结合miR-7。同时过表达miR-7及ciRS-7组的bcl-2表达高于过表达miR-7组(0.59±0.11, t=6.013, P<0.05)、敲降ciRS-7组(0.83±0.08, t=3.717, P<0.05),差异均有统计学意义。结论ciRS-7通过靶向miR-7促进食管鳞癌细胞的放疗抵抗。

  • 标签: 食管鳞癌 凋亡 环状RNA 放疗抵抗