简介：MicroRNAs(miRNAs)areendogenouslyexpressednon-codingRNAsof20-24nucleotides,whichpost-transcriptionallyregulategeneexpressioninplantsandanimals.RecentlyithasbeenrecognizedthatmiRNAscompriseoneoftheabundantgenefamiliesinmulticellularspecies,andtheirregulatoryfunctionsinvariousbiologicalprocessesarewidelyspread.Therehasbeenasurgeintheresearchactivitiesinthisfieldinthepastfewyears.Fromtheverybeginning,computationalmethodshavebeenutilizedasindispensabletools,andmanydiscoverieshavebeenobtainedthroughcombinationofexperimentalandcomputationalapproaches.Inthisreview,bothbiologicalandcomputationalaspectsofmiRNAwillbediscussed.AbriefhistoryofthediscoveryofmiRNAanddiscussionofmicroarrayapplicationsinmiRNAresearcharealsoincluded.

简介：MicroRNAs(miRNAs)是一个家庭(2123nt)突然，规章的非编码的RNA处理了从长(70110nt)miRNA先锋(pre-miRNAs)。识别真、假的先锋在miRNAs的计算鉴定起一个重要作用。一些数字特征从先锋序列和他们的第二等的结构被提取了适合一些分类方法；然而，他们可以失去在序列和结构隐藏的一些有用地歧视的信息。在这研究，pre-miRNA序列和他们的第二等的结构直接被用来基于在二个序列之间的加权的Levenshtein距离构造一个指数的核。这个字符串内核然后为检测真、假的pre-miRNAs与支持向量机器(SVM)被相结合。在331上基于训练真、假的人的pre-miRNAs的样品，在SVM的2个关键参数被5褶层选择有不同5褶层分区的十字确认和格子搜索，和5条认识被执行。在16独立人士之中，测试从3人，8动物，2工厂，1个病毒，和2人工地假的人设定pre-miRNAs，我们的方法统计上在11个集合上超过以前的基于SVM的技术包括3人，7动物，和1假人的pre-miRNAs。特别地，有通常在以前的工作被排除的多重环的premiRNAs正确地与92.66%的精确性在这研究被识别。

简介：尽管有它对疟疾的功效，在Artemisiaannua的artemisinin的相对低的收益(0.01%-0.8%)是到这药的商品化的严肃的限制。由外长、内长的因素的artemisinin和它的规定的biosynthetic小径的更好的理解是必要的改进artemisinin产量。增加的证据证明了microRNAs(miRNAs)在各种各样的生物过程起多重作用。在这研究，我们对表示顺序标签(EST)从Arabidopsis和米饭使用了以前已知的miRNAsA的数据库。annua将在A寻找潜在的miRNAs和他们的目标。annua。六潜在的miRNAs的一个总数被预言，它属于miR414和miR1310家庭。而且，八潜在的目标基因在这种被识别。在他们之中，七基因编码在artemisinin生合成起重要作用的蛋白质，包括HMG-CoAreductase(HMGR)，amorpha-4,11-dienesynthase(广告)，farnesyl焦磷酸盐synthase(FPS)和细胞色素P450。另外，为通常认为的AINTEGUMENTA编码的基因，涉及信号transduction和开发，也作为目标之一被预言。这在silico学习是第一显示miRNAs指向编码涉及artemisinin生合成的酶的基因，它可以帮助在A理解artemisinin生合成的调停miRNA的规定。annua。