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  • 简介:随着现代分子生物学技术发展,反转录聚合酶链式反应技术在甘薯病毒检测上应用越来越广泛。采用该技术可检测出甘薯组织中含量极低病毒RNA,具有灵敏度高、特异性强等优点。在本研究中根据NCBIGenBank中收录SPCSV病毒外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列保守区域设计了3对特异性引物,使用天根生化科技(北京)有限公司生产QuantOneStepRT-PCRkit试剂盒,针对影响扩增产物影响因素退火温度进行优化,建立了甘薯退绿矮化病毒RT-PCR检测方法。该方法使RT-PCR在一管内完成,大大降低了外源物质污染及RNA降解几率,可作为甘薯SPCSV病毒快速检测方法。

  • 标签: 甘薯 退绿矮化病毒 RT-PCR检测技术
  • 简介:生物芯片技术自上个世纪90年代诞生以来,在生物科研方面该技术起到了越来越重要作用并且得到了国内外广泛重视。本研究先对生物芯片各个主要分类进行详细介绍,说明相关原理,结合国内外近年来最新科研报道进行总结,根据该技术在测序,基因表达,抗病机理等研究中巨大作用,对生物芯片技术在植物分子生物研究中不同领域、不同层面、实验技术方法以及研究策略上进行阐述。

  • 标签: 生物芯片 实验技术方法 植物分子生物研究
  • 简介:简单重复序列(SSR)广泛存在于基因组中,亲缘关系分析、DNA指纹图谱构建和遗传多样性研究领域中非常重要遗传标记之一。红豆树群体已处于濒危状态,且属无参基因组,其近缘种开发SSR引物亦很少,满足红豆树遗传多样性研究及制定合理保护策略,本研究基于SLAF-seq(specific-locusamplifiedfragmentsequencing)技术对天然群体中典型红豆树进行简化测序,利用MISA软件对测序获得所有SLAF片段进行SSR位点搜索,并对SSR位点特征进行统计分析,最后利用PrimerPremier5.0软件进行引物批量设计。与日本晴水稻测序数据相比,红豆树参考基因组双端比对效率90.14%,酶切效率92.37%,说明SLAF建库正常;测序Q3092.32%,GC含量37.17%,说明达到测序要求。本研究共获得6426462reads和592221个SLAF标签,其中16653个多态性SLAF标签,含有17868个SSR位点,平均每6.98kb就分布有1个SSR位点。不同核苷酸重复类型基元类型数量及SSR位点数量间差异较大,除单核苷酸外,二、三核苷酸重复类型数量较多,分别占总SSR位点17.15%和15.02%,其中AT/TA和GAA/TTC基元重复数量最多,分别为1090个(43.1%)和349个(15.2%)。通过批量引物设计共得到2817对引物,二、三核苷酸类型较多,两者所占比例高达94.8%。结果表明:SLAF-seq技术可以很好应用于红豆树(无参基因组)SSR位点开发,基于简化基因组测序数据发掘SSR位点能够为SSR分子标记开发提供信息,并有助于后续群体遗传多样性和交配系统分析等。

  • 标签: 红豆树 SLAF-seq SSR 分布 位点分析
  • 简介:本研究对219份茄子种植资源进行耐涝性鉴定,获得了219份材料耐涝表型数据。用196个SSR标记对219份茄子种质资源基因组进行扫描,分析219份茄子材料群体结构及亲缘关系,并采用TASSEL软件一般线性模型(GLM)方法对标记性状进行关联分析。最终得到了219份茄子材料群体结构、亲缘关系以及茄子耐涝性紧密关联27个分子标记,茄子耐涝分子标记辅助育种提供一定参考。

  • 标签: 茄子 耐涝性状 SSR分子标记 关联分析
  • 简介:据报道,酵母中HOPS复合体参与囊泡融合及运输。本研究分别酿酒酵母HOPS复合体各亚基氨基酸序列,通过BLASTp在稻瘟病菌数据库中搜索得到了6个酿酒酵母HOPS复合体各亚基同源蛋白,我们通过生物信息学方法对稻瘟病菌6个HOPS复合体亚基同源蛋白理化特性、蛋白质结构域和进化关系进行了分析。基于稻瘟病菌98-06菌丝阶段和孢子侵染水稻CO39不同阶段转录组测序数据,分别选取稻瘟病菌内吞和外泌途径相关基因,制作了表达模式图。此外,MoYpt7蛋白在其假定下游效应因子ΔMoVps41突变体中定位研究表明MoVps41可能影响了液泡融合。

  • 标签: 稻瘟病菌 内吞 外泌 MoYpt7 MoVps41
  • 简介:辣椒资源遗传多样性丰富,育种潜力大,本研究从分子水平研究不同种间辣椒种质资源遗传多样性差异,辣椒种质资源收集、研究及合理利用提供参考。并首次利用基于辣椒全基因组编码区序列设计152对SSR辣椒基因组引物,用不同地理来源且性状差异显著11个种(亚种)24份辣椒种质资源对152对SSR引物进行筛选,从而获得条带清晰、稳定性好41对SSR多态性引物,并利用NTSYS-pc2.10e和POPGENE32软件分析24份辣椒种质资源遗传多样性数据。结果表明:41对SSR引物扩增出211个多态性条带,平均每对引物扩增出5.15个位点,说明SSR引物在辣椒遗传分析中有较高实用性。有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、香农指数(Shannon-Weaver)(I)、多态信息含量(PIC)均值结果分别为4.0861、0.4198、0.7247、1.4232、0.6654,表明辣椒遗传信息非常丰富。UPGMA方法聚类分析及主成分分析将24份辣椒聚7类,结果基本辣椒种类来源相符。

  • 标签: 辣椒 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析
  • 简介:DNA条形码技术基于物种种内特异性和种间多样性利用一个或几个标准DNA片段(DNAbarcode)构建生物鉴别数据库。本研究根据GenBank中豆科牧草matK和rbcL基因核苷酸序列,设计4对通用引物对豆科五个主要牧草属(苜蓿属Medicago,车轴草属Trifolium,红豆属Onobrychis,小冠花属Coronilla,野豌豆属Vicia)六种牧草进行扩增。扩增产物进行测序和分析,筛选出六种牧草四个标记位点5’端和3’端保守序列,并对各标记位点保守区内核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)单倍型分析,数据表明:matK1、matK2、matK3均有5个单倍型,五个牧草属有其特有单倍型;rbcL基因有6个单倍型,车轴草属白三叶和红三叶有其特有单倍型。根据matK(matK1,matK2,matK3)和rbcL基因筛选四个标记位点六种牧草建立了相对应特异DNA识别码。说明matK和rbcL组合后可作为豆科六种牧草潜在条形码。

  • 标签: 单倍型组合 MATK基因 RBCL基因 DNA条形码
  • 简介:NBS类抗病基因植物中最大一类抗病基因。亚麻荠一种新型能源及特用油料作物,抗病、虫、杂草及逆境能力极强。然而,有关其抗性分子机理鲜有报道。本研究采用NB-ARC标准结构域HMM模型,对亚麻荠本地蛋白质数据库进行检索分析,在全基因组水平上鉴定NBS类抗病基因。结果表明亚麻荠基因组共有472个NBS类抗病基因,分布于17条染色体上,56%基因成簇分布。所有串联重复基因也都以基因簇形式出现,这表明串联重复有利于基因簇形成。系统发生树分析显示TIR-NBS-LRR(TNL)和CC-NBS-LRR(CNL)两类亚家族抗病基因可能在进化过程中遵循不同进化路径,导致其在应对病原菌侵染时发挥不同功能。本研究发现将为鉴定新植物抗病基因和解析亚麻荠高抗病机制提供科学参考。

  • 标签: 亚麻荠 抗病基因 NBS家族 基因簇 生物信息学
  • 简介:通过ISSR分子标记研究桃儿七遗传多样性,建立并优化桃儿七ISSR-PCR反应体系。使用正交设计辅以单因素试验,对桃儿七ISSR-PCR反应体系中5种主要因素(模板DNA,Mg-(2+),TaqDNA酶,dNTPs及ISSR引物)进行筛选优化,选取甘肃碌曲县西仓神山山顶桃儿七居群样本验证该反应体系。正交试验各因素显著性引物〉TaqDNA酶〉DNA浓度〉dNTPs〉Mg-(2+),桃儿七ISSR-PCR反应最佳体系为(25μL):2.5mmol/LMg-(2+),0.2mol/LdNTP,0.4μmol/L引物,0.5UTaqDNA酶,40ngDNA,2.5μL10×Buffer。该体系具有高稳定性,多态性丰富特点,野生桃儿七遗传多样性及保护策略研究提供了技术支持。

  • 标签: 桃儿七 ISSR-PCR 正交试验 单因素试验
  • 简介:为了从蛋白质分子生物学方面研究白菜型冬油菜不同抗寒品种低温逆境及恢复条件下相关蛋白响应机制,揭示大田生产中冬油菜抵御突发骤变低温伤害抗寒机理,超强抗寒冬油菜品种陇油7号和弱抗寒品种天油2号材料,在培养箱培养至幼苗五叶期时,模拟北方寒旱区冬油菜返青期倒春寒环境,运用双向电泳结合质谱技术,分析其幼苗在低温(4℃)-恢复(20℃)-低温(4℃)-恢复(20℃)过程中存在蛋白及其差异表达量。研究表明低温胁迫恢复过程中,有2个蛋白点发生了显著差异丰度变化,它们分别是半胱氨酸型氧化还蛋白过氧化物酶(定义1号蛋白)和一种未知蛋白(2号蛋白)。且不同抗寒性品种存在2种不同蛋白差异表达机制,1号蛋白在抗寒性较弱天油2号低温胁迫恢复过程中表现出上调-下调-上调变化趋势,抗寒性较强陇油7号中此蛋白在第一次低温胁迫后消失,而出现了另外一种未知蛋白(蛋白2),且在低温胁迫恢复过程中也表现出上调-下调-上调变化趋势,并且表达量高于天油2号中蛋白1,因此,这种未知蛋白2可能陇油7号抗寒性强于天油2号原因之一。

  • 标签: 白菜型冬油菜 低温胁迫 双向电泳 蛋白质
  • 简介:在植物体胚发生过程中愈伤组织里存在着复杂生化反应,不同愈伤组织有着不同生理生化特性。用MS培养基对楸树幼嫩种子进行培养,诱导产生出三种类型胚性愈伤组织和一种非胚性愈伤组织,以此作为实验材料。对可溶性蛋白、可溶性糖和游离脯氨酸含量进行测定分析,研究楸树胚状体形成过程中三种类型胚性愈伤组织之间以及胚性愈伤组织和非胚性愈伤组织之间生理生化差异。结果表明,可溶性蛋白和游离脯氨酸在楸树胚性愈伤组织中含量都远远高于其非胚性愈伤组织;而楸树胚性愈伤组织可溶性糖含量均显著低于其非胚性愈伤组织。并且可溶性蛋白、可溶性糖和游离脯氨酸含量在楸树不同类型胚性愈伤组织之间存在差异。

  • 标签: 楸树 胚性愈伤组织 非胚性愈伤组织 生理生化差异
  • 简介:根据刺五加鲨烯合酶基因2(squalenesynthase,SS2)和鲨烯环氧酶基因1(squaleneepoxidase,SE1)DNA序列,通过Southern杂交和qRT-PCR法确定SS2和SE1拷贝数。actin内参照基因,利用qRT-PCR法和分光光度法确定不同SS2和SE1拷贝数下基因表达量和皂苷含量。结果表明,刺五加SS2存在1和2拷贝,SE1存在1、2和3拷贝类型及其相互组合6种拷贝数组合基因型。刺五加SS2和SE1表达量皂苷含量均随拷贝数增加而显著提高(p〈0.05),两者间存在极显著正相关关系(P〈0.01)。SS2和SE1每增加1个拷贝可使皂苷含量分别提高0.57和0.42倍。研究结果进一步揭示刺五加皂苷含量差异形成分子机理奠定了基础。

  • 标签: 刺五加 鲨烯合酶 鲨烯环氧酶 拷贝数 皂苷
  • 简介:不论野生还是离体条件下,珠芽均是植物进行繁殖再生重要器官,已从多方面进行了研究,但缺乏全面系统介绍。本综述从植物珠芽定义、起源发生部位、发育过程、显微结构、生理生态及实际生产中作用等方面介绍了珠芽研究进展,认为植物珠芽可着生于叶腋、花序或叶片表面,由薄壁细胞分裂分化而来;珠芽发育一般经历了启动、膨大和成熟三个阶段,内源激素含量和变化有关;珠芽在数量、萌发率和生活力等方面有明显优势,良种繁育和种群繁衍高效方式;并探讨了珠芽形成分子机制,对未来珠芽研发进行了展望。

  • 标签: 珠芽 发育过程 形成机制 研究应用
  • 简介:49份申请品种保护提供品种和47份收集草莓已知品种材料,通过从208对草莓SSR引物中筛选出20对多态性好核心引物,采用变性聚丙烯酰氨凝胶电泳检测和毛细光电泳检测相结合方式对96份草莓品种进行标记分析,检测每个标记不同等位变异大小,并为每个等位变异选取了相应参照品种。结果显示:20对引物共检测出206个等位位点,每对引物检测到等位位点6~15个平均10.3个;共检测到600个带型,每对引物检测到带型数11~58个,平均30个,平均多态性信息含量(polymorphisminformationcontent,PI

  • 标签: 品种指纹 图谱构建 指纹图谱
  • 简介:由植物病毒侵染而引起作物减产农业生产中一个持久性问题,为了最大限度地减少病毒造成损害,确保农业可持续发展,探寻快速而精准检测方法对控制这些植物病毒至关重要。随着贸易全球化发展,加剧了病毒及其宿主和载体转移,这使得植物病毒检测技术变得更加重要。近年来,植物病毒检测技术发展很快,多种多样。本研究主要综述了一些植物病毒检测方法原理和特点,以及在植物病毒检测和诊断中应用,包括生物学方法、血清学方法、电镜观察方法以及分子生物学方法中核酸分子杂交技术、双链RNA电泳技术、聚合酶链式反应技术(PCR,RT-PCR,实时荧光定量PCR,多重PCR,巢式PCR)、核酸序列扩增技术、环介导等温扩增技术等。

  • 标签: 植物病毒 检测技术 核酸 方法
  • 简介:本研究采用福林-酚法测定7种油茶饼提取物中总多酚含量,并用高效液相色谱法(HPLC)对其多酚类物质成分进行鉴定和定量分析,同时应用DPPH自由基清除法、ABTS自由基清除法、羟基自由基(OH·)清除法和FRAP法测定油茶饼提取物抗氧化能力。结果表明,7种油茶饼中海南(炒)(6.10mg/g)总多酚含量显著高于江西(蒸)(2.66mg/g),且在所有样品中共鉴定出6个多酚组分,分别为没食子酸、儿茶素、表儿茶素、槲皮素、3,4-二羟基苯乙酸和山茶甙,其中海南(炒)油茶饼山茶甙含量18.444mg/g,广西(蒸)中山茶甙含量18倍,广西(炒)15倍;此外,海南(炒)中槲皮素含量江西(蒸)中槲皮素含量50倍,差异十分显著。7种油茶饼提取物均具有明显抗氧化活性,且在一定范围内呈量效关系。因此,油茶饼有望作为一种潜在天然抗氧化剂应用于食品、保健品、医药品及化妆品中,具有较高开发利用价值。

  • 标签: 油茶饼 福林-酚法 高效液相色谱法 总多酚 抗氧化活性
  • 简介:研究不同类型马铃薯淀粉积累及相关酶活性变化动态,探讨各种酶活性淀粉含量关系。"陇薯3号"、"宁薯15号"、"农家1号"(高淀粉马铃薯品种)和"陇薯6号"、"青薯168号"、"宁薯14号"(低淀粉马铃薯品种)试验材料,取不同发育时期块茎,分别测定淀粉含量、ADP焦磷酸化酶(AGPase)可溶性淀粉合成酶(SSS)和淀粉分支酶(DBE)活性。6个马铃薯品种AGPase、SSS、DBE酶活性均呈现单峰曲线变化趋势;6个马铃薯品种淀粉含量变化曲线表现为"升高-降低",薯块重量120-200g时,马铃薯淀粉总量达到最大值。马铃薯块茎淀粉含量各种酶综合作用结果。

  • 标签: 马铃薯 淀粉合成 淀粉合成关键酶
  • 简介:了解菜心光能利用效率规律性,可为具优良光合性状菜心品种选育提供参考。据此,本研究选用在二份耐热性强和二份耐热性弱菜心品种作为研究对象,探讨了这些品种叶绿素荧光参数日变化规律。结果表明:随着光强和温度上升和下降日变化,四份菜心材料初始荧光(Fo)、相对可变荧光(VJ)和单位反应中心热耗散能量(DIo/RC)出现先升后降趋势,而最大荧光(Fm)、光能转化效率(Fv/Fm)、光化学性能指数(PIABS)则出现先降后升情况;除Fo最大峰值在四份材料中均在13:00时外,耐热性强材料其余参数最大或最小峰值出现在光照强度最大13:00时且变化幅度较小,而在耐热性弱材料中这些值变化幅度大且出现在日最高温度14:00。另外,随着光强和温度降低,各荧光参数又逐渐向初始水平恢复,但耐热性强菜心品种恢复速率高于耐热性弱菜心品种。这一结果表明叶绿素荧光参数可考虑作为评价菜心材料耐热性强弱一个参考指标。

  • 标签: 菜心 叶绿素荧光参数 日变化
  • 简介:转基因菊花在生产应用中具有良好前景,而未知环境安全性严重制约其发展。对转Vgb基因菊花开展连续两年中间试验,在栽培管理条件一致、安全防护措施严格前提下,转基因菊花T0代,T1代外源标记基因PMI和目的Vgb经PCR技术检测均稳定存在,周边杂草及非转基因菊花尚无基因漂移现象发生,越冬越夏能力相对对照不显著。本实验说明试验地内转基因菊花外源基因在两年内仍稳定存在于基因组中,而且尚未发生基因漂移可能,其微弱生长竞争力转变为杂草可能性极低。

  • 标签: 转基因菊花 中间试验 稳定性 安全性
  • 简介:番茄试材,研究了热处理对番茄硬度、Vc含量、可滴定酸含量、可溶性固形物含量和贮藏期影响。结果表明:55℃处理番茄硬度最大,其次38℃和52℃。说明热处理会减少番茄果实水分,增加果皮韧性;热处理32℃和52℃对贮藏期番茄可溶性固形物保存效果较好;高温短时间热处理对贮藏期番茄Vc保存效果较好;55℃热处理可滴定酸含量较高。52℃番茄热处理对延长番茄贮藏时间效果明显。

  • 标签: 热处理 番茄 品质 耐贮性