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  • 简介:AbstractBackground:Oncomelania hupensis is only intermediate snail host of Schistosoma japonicum, and distribution of O. hupensis is an important indicator for the surveillance of schistosomiasis. This study explored the feasibility of a random forest algorithm weighted by spatial distance for risk prediction of schistosomiasis distribution in the Yangtze River Basin in China, with the aim to produce an improved precision reference for the national schistosomiasis control programme by reducing the number of snail survey sites without losing predictive accuracy.Methods:The snail presence and absence records were collected from Anhui, Hunan, Hubei, Jiangxi and Jiangsu provinces in 2018. A machine learning of random forest algorithm based on a set of environmental and climatic variables was developed to predict the breeding sites of the O. hupensis intermediated snail host of S. japonicum. Different spatial sizes of a hexagonal grid system were compared to estimate the need for required snail sampling sites. The predictive accuracy related to geographic distances between snail sampling sites was estimated by calculating Kappa and the area under the curve (AUC).Results:The highest accuracy (AUC = 0.889 and Kappa = 0.618) was achieved at the 5 km distance weight. The five factors with the strongest correlation to O. hupensis infestation probability were: (1) distance to lake (48.9%), (2) distance to river (36.6%), (3) isothermality (29.5%), (4) mean daily difference in temperature (28.1%), and (5) altitude (26.0%). The risk map showed that areas characterized by snail infestation were mainly located along the Yangtze River, with the highest probability in the dividing, slow-flowing river arms in the middle and lower reaches of the Yangtze River in Anhui, followed by areas near the shores of China’s two main lakes, the Dongting Lake in Hunan and Hubei and the Poyang Lake in Jiangxi.Conclusions:Applying the machine learning of random forest algorithm made it feasible to precisely predict snail infestation probability, an approach that could improve the sensitivity of the Chinese schistosome surveillance system. Redesign of the snail surveillance system by spatial bias correction of O. hupensis infestation in the Yangtze River Basin to reduce the number of sites required to investigate from 2369 to 1747.

  • 标签: Schistosomiasis Oncomelania hupensis Snail infestation Yangtze River Random forest Spatial sampling Machine learning China
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  • 简介:Oncomelania(Oncomelaniahupensis),adioecian,ovoviviparous,andamphibioussnail,isthesoleintermediatehostofSchistosomajaponicum,themostwide-spreadsnailfeverintheworld.Chemicaleliminatingthehostprovedunacceptablefortherewasseverecontaminationtowaterandsoil.TheriverbeachesandthedeltaareasoffiveprovincesinthemiddleandlowerreachesofYangtzeRiverinChinaprovidethemostfavorablehabitatsforOncomelania.Ourstudieshaverevealedthattheoccurrenceof...

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  • 简介:目的探讨Snail和E—cadherin表达与肝细胞癌转移的关系及干扰Snail对肝癌细胞转移的影响。方法采用免疫组化和RT—PCR分别检测36例肝癌组织中Snail,E—cadherin蛋白和mRNA的表达。检测HCC9024细胞中Snail对E—cadherinmRNA和蛋白表达的逆转作用及对HCC9024体外侵袭、运动的抑制作用。结果转移组肝癌组织中Snail蛋白和mRNA表达明显高于非转移组(P〈0.05),而E-cadherin在转移组肝细胞癌中无表达。SnailmRNA在未转染组、瞬时转染组、稳定转染组中的表达为0.985±0.016,0.554±0.011,0.206±0.017,P〈0.05。E—cadherinmRNA在未转染组、瞬时转染组、稳定转染组中的表达为0.120±0.001,0.360±0.002,0.727±0.006,P〈0.05。Snail和E—cadherin蛋白表达结果与mRNA表达结果一致。HCC9024细胞体外运动和侵袭能力实验表明,未转染组、阴性对照组及转染Snail组跨膜细胞数及穿透基底膜细胞数差异有统计学意义(P〈0.05)。结论肝癌细胞中SnailmRNA可影响E-cadherinmRNA的表达,并在肿瘤细胞获得侵袭和转移能力的过程中起重要作用,阻断SnailmRNA的表达可能会为肝癌的基因治疗提供新的靶点。

  • 标签: SNAIL E-CADHERIN 干扰Snail 肝癌转移
  • 简介:土豆茄属tuberosumL的年轻叶子。栽培变种Kardal包含抵抗因素到绿桃树蚜虫Myzuspersicae(Sulzer)(半翅类:Aphididae)并且正常探查行为被阻碍。然而,M。persicae能在cv的成熟、衰老的叶子幸存并且复制。没有问题的Kardal植物。我们比较了安定M。在年轻、旧的叶子的persicae并且分析了以基因表示在植物上安定的蚜虫的影响。安定,由在年轻或旧的叶子留下来的蚜虫数字测量了证明在21h以后,显著地,更少蚜虫在年轻叶子被发现。在更早的时间点,年轻、旧的叶子之间没有差别,建议年轻的叶抵抗因素没在表面水平,但是在织物深处被定位。基因表示在96hpostinfestation在植物被测量,它在在相互作用的一个迟了的阶段,在兼容相互作用,这足够长让主人植物接受发生。在cv的旧叶子。Kardal(兼容相互作用),M。persicae群袭得到了差别的一个更高的数字比在年轻叶子调整了基因。很多基因比镇压导致了的对包括的蚜虫群袭的植物反应,和导致对镇压的基因的比例比在旧叶子在幼仔是更大的。改变表示的几基因似乎涉及从来源把叶的新陈代谢的状态改变到水池。

  • 标签: 马铃薯 桃蚜 成熟 基因表达 枝叶 宿主植物
  • 简介:目的:构建人snail基因真核表达载体并鉴定。方法:使用RT-PCR法获取人snail基因全长cDNA,经BamHI、EcoRI双酶切、连接,插入pcDNA3.1(+)真核表达载体,转化TOP10感受态细胞,用含氨苄青霉素的LB培养基筛选阳性克隆,提取质粒双酶切电泳及测序鉴定,瞬时转染siha细胞Western-blot从蛋白水平鉴定重组质粒在真核细胞内的表达。结果:pcDNA3.1-snail重组质粒经酶切电泳符合预期片段,测序鉴定插入片段与NCBIGenBank文库中人snail序列一致,重组质粒瞬时转染后snail蛋白表达量明显增高。结论:成功构建pcDNA3.1-snail重组质粒载体,为进一步探讨snail基因生物学功能奠定了基础。

  • 标签: SNAIL 重组质粒 载体构建
  • 简介:[摘要]:Snail为锌指蛋白超家族的第一个成员,在转录调控、细胞信号和发育过程中发挥积极作用。有研究表明,Snail 可促使上皮-间充质转化及E-cadherin的降解,在许多肿瘤组织中呈中高表达,被认为是促进肿瘤侵袭转移的因素。对 Snail的深入研究不仅能更进一步阐明 Snail的作用机制,并且为进一步研究以 Snail 为靶点的肿瘤治疗策略提供理论依据。

  • 标签: []Snail 上皮-间充质转化 肿瘤
  • 简介:摘要目的探讨缓激肽(BK)促进非小细胞肺癌(NSCLC)放疗耐受的作用机制。方法实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测细胞株中信使RNA(mRNA)的表达;瞬时转染技术在细胞株中转染小干扰RNA(siRNA);蛋白质印迹法(Western blot)检测细胞中Snail的表达;噻唑蓝(MTT)实验检测放疗后细胞存活情况;彗星实验检测放疗后细胞DNA修复能力变化。组间比较采用t检验。结果BK在耐放射人肺癌细胞株中的表达显著高于亲代细胞(A549R26比A549:58.582±3.986比1.000±0.249,t=14.418,P<0.01;H157R24比H157:23.979±0.791比1.000±0.101,t=28.817,P<0.01)。在放疗4 h后亲代细胞中BK即明显升高(A549:6.530±0.603比1.000±0.214,t=8.642,P<0.01;H157:1.384±0.031比1.000±0.125,t=2.982,P<0.05)。用BK处理肺癌亲代细胞株后,神经内分泌标志物NSE(A549:1.551±0.071比1.000±0.027,t=7.254,P<0.01;H157:1.343±0.064比1.000±0.037,t=4.640,P<0.01)、表达上升,而用BK的拮抗剂处理肺癌耐放射细胞株后,NSE(A549R26:0.703±0.036比1.000±0.045,t=5.154,P<0.01;H157R24:0.780±0.017比1.000±0.046,t=4.486,P<0.05)表达下降。亲代细胞在过表达BK后,细胞放射后的存活率增加,DNA修复能力增强;而耐放射细胞在抑制BK表达后,这些耐放射特性减弱。Snail在耐放射细胞中表达高于亲代细胞(A549R26比A549:5.223±0.216比1.000±0.061,t=18.815,P<0.01;H157R24比H157:3.698±0.360比1.000±0.057,t=7.402,P<0.01)。BK处理亲代细胞后,Snail的蛋白表达升高;用BK拮抗剂处理耐放射细胞后,Snail蛋白表达下降。抑制肺癌耐放射细胞的Snail表达后,细胞的耐放射特性减弱。结论BK通过激活Snail通路促进NSCLC的放疗耐受。

  • 标签: 非小细胞肺癌 放疗耐受 缓激肽
  • 简介:斑马薄片(ZC)症候群是到土豆工业的土豆和主要威胁的新兴的疾病。土豆psyllid,Bactericercacockerelli(Sulc)被相信是ZC病原体的向量,它现在是思维是CandidatusLiberibacter,一个细菌。为了推进,理解在土豆psyllid群袭和ZC疾病表示之间的关系,在不同生长阶段(在萌芽以后的4,6和10个星期)的健康土豆植物独立暴露于独立在四solanaceous主人植物上被饲养的土豆psyllids(土豆,西红柿,茄子或钟辣椒)为超过1年。在叶子和健康、大批出没于psyllid的植物的澡盆ers的ZC症状,叶率和全部的非结构的糖类累积被监视并且记录。典型ZC症状在叶子和不管他们在上被扶养的主人植物暴露于土豆psyllids的所有植物的澡盆ers被观察。这被重要减小也在网里伴随光合的率。没有到土豆psyllids(uninfested控制)的暴露的将关入笼中的土豆植物没在叶子并且在收获澡盆ers显示出任何ZC症状。叶子损坏和ZC表示在4个星期与在以后的生长阶段大批出没于的植物相比在萌芽以后暴露于土豆psyllids的土豆植物是很严重的。从大批出没于psyllid的植物有的土豆的Tubers在健康植物比那些减少糖(葡萄糖)和淀粉的底层显著地高级,显示那土豆psyllid群袭在叶子或澡盆ers防碍糖类新陈代谢,导致ZC表示。

  • 标签: 马铃薯 发病率 木虱 时间 疾病 芯片
  • 简介:目的:构建pEGFP—N1-Snail真核表达质粒,并进行鉴定,转染SCC25肿瘤上皮细胞,检测其表达。方法:利用RT—PCR方法从SCC9肿瘤上皮细胞中提取Snail基因片段,与pMD18-T载体连接,构建pMD18-T—Snail重组质粒,挑选阳性克隆,PCR鉴定后送测序。重组质粒双酶切后与pEGFP—N1真核表达载体连接,构建pEGFP—N1-Snail真核表达质粒,进行测序、酶切鉴定,表明质粒构建成功。分别抽提pEGFP—N1及pEGFP—N1-Snail质粒,用脂质体2000转染SCC25肿瘤上皮细胞,RT.PCR检测Snail在该细胞中表达。结果:本实验成功构建了pEGFP—N1—Snail真核表达质粒,并在SCC25肿瘤上皮细胞中表达。结论:本实验结果为进一步研究Snail作为转录抑制因子诱导上皮间质转化提供实验基础。

  • 标签: 口腔黏膜鳞癌 pEGFP—N1 SNAIL 基因
  • 简介:目的研究胎盘Snail的表达与胎盘滋养细胞侵袭性及前置胎盘和胎盘植入发病的关系。方法选取60例孕产妇,分为胎盘植入组10例、前置胎盘组20例及对照组30例。采用免疫组织化学、WesternBlot和RT-PCR检测各组胎盘母体面Snail的表达情况。结果胎盘植入组和前置胎盘组Snail蛋白的表达水平高于对照组,胎盘植入组SnailmRNA相对水平高于对照组,差异均有统计学意义(P〈0.05)。结论胎盘植入和前置胎盘患者胎盘母体面Snail表达升高可能与胎盘滋养细胞侵袭性增强及胎盘植入发病相关。

  • 标签: 胎盘植入 前置胎盘 SNAIL 上皮间质转化 滋养细胞
  • 简介:在草食动物攻击以后的摘要,许多植物射出导致草食动物的植物volatiles(HIPV)。HIPV能吸引食肉动物或排斥草食动物,从而调停tritrophicplantherbivorecarnivore相互作用。HIPV充当在有机体之间的化学信息;因此,他们的可变性和稳定性是重要的。在现在的学习,在不稳定的排出物的变化,从茶植物山茶sinensis(O。Ktze)由茶象鼻虫Myllocerinusaurolineatus(Voss)损坏了(翘目:Curculionidae)与象鼻虫密度,光周期和群袭持续时间,被调查。高密度的象鼻虫导致的volatiles比低密度的象鼻虫导致的那些更充满作文和数量,是否在中午,夜里或在象鼻虫移动以后。导致的不稳定的排出物在在群袭以后的第二和第三天是类似的,并且专业的排出物导致了显示的混合物日报周期。沉香醇,(E,E)--farnesene,和本甲基nitrile主要在中午被射出,而1,3,8-p-menthatriene和(E)--ocimene最大地在夜里被射出。给不同排放动力学,重要差别在导致中午、导致夜里的volatiles之间被发现。在摘要,不同象鼻虫密度损坏的茶植物在一特别时间射出一个相对稳定的信号。这稳定性能在主要导致的不稳定的混合物,他们的相对比率和导致的volatiles的排放动力学的二密度下面被归因于类似。

  • 标签: 植物挥发物 感染时间 象鼻虫 高密度 稳定性 花草茶
  • 简介:摘要目的探讨Snail参与调控卵巢癌细胞上皮间质过程及卵巢癌侵袭能力的影响。方法选取齐齐哈尔医学院临床病理诊断中心2010-2014年期间病理诊断为卵巢癌的病例,外科手术切除的癌组织和癌旁组织64例,用RT-PCR法检测卵巢癌组织和癌旁组织中Snail和E-cadherin基因的表达。用Transwell实验来观察Snail对卵巢细胞侵袭能力的影响。结果Snail基因在III期和IV期卵巢癌中的表达水平,明显高于I期和II期(P<0.05)。而E-cadherin的表达水平随着临床分期的进展而下降(P<0.05)。Snail的表达与E-cadherin的表达呈负相关。Transwell实验显示Snail能够明显促进卵巢癌细胞的侵袭。结论Snail可能通过靶向控制E-cadherin表达,促进卵巢癌细胞的上皮间质转化进程,促进卵巢癌细胞的侵袭。

  • 标签: Snail 上皮间质转化 卵巢癌
  • 简介:摘要目的探讨Snail对Hela细胞侵袭的作用。方法采用Hilymax法进行细胞转染,RT-qPCR法检测mRNA表达,Westernblot检测蛋白表达,Transwell小室检测细胞侵袭。结果与对照组相比,干扰组SnailmRNA表达下降约72.3%(P<0.01);Snail蛋白水平下降约54.2%(P<0.05)。在24h,48h,72h,干扰组较对照组细胞侵袭能力下降,其抑制率约为17.6%(P<0.05),31.5%(P<0.01),36.1%(P<0.05)。结论Snail下调可显著抑制Hela细胞的侵袭能力。

  • 标签: Snail 宫颈癌 侵袭
  • 简介:目的探讨化生性乳腺癌组织中Snail和上皮性钙黏附素(E-cad)的表达水平及其与临床病理特征的关系。方法采用免疫组化SP法检测58例化生性乳腺癌组织中Snail和E-cad的表达,并收集相应病例的临床病理资料,分析Snail、E-cad表达与化生性乳腺癌临床病理特征的关系及两蛋白的相关性,同时根据随访资料分析两者表达与复发转移的关系。结果在化生性乳腺癌中,Snail和E-cad的阳性表达率分别为77.6%(45/58)和48.3%(28/58)。Snail的表达与临床分期、淋巴结转移和ER表达有关(P〈0.05),而E-cad表达与组织学分级、淋巴结转移有关(P〈0.05),两者与年龄、HER-2表达、病理类型、肿瘤大小及月经状态均无关(P〉0.05)。Snail与E-cad的表达呈负相关(r=-0.308,P=0.019),且均与化生性乳腺癌复发转移有关(P〈0.05)。结论Snail和E-cad联合检测可判断化生性乳腺癌的恶性程度和侵袭能力,且与复发转移有关,两者有望作为化生性乳腺癌治疗的分子靶点。

  • 标签: 化生性乳腺癌 SNAIL 上皮性钙黏附素(E-cad) 复发 转移
  • 简介:摘要目的探讨鼠双微体基因2(MDM2)和锌指转录因子Snail在甲状腺癌组织的表达及其临床意义。方法收集2016年3月至2021年2月吉林省肿瘤医院病理确诊的125例甲状腺肿瘤患者的组织标本,其中94例甲状腺癌组织、31例甲状腺瘤组织,同时选择24例正常甲状腺组织为对照组。采用免疫组织化学法检测各组织中MDM2和Snail表达水平,进行χ2检验统计学分析MDM2和Snail的表达与甲状腺癌临床病理学参数之间的关系。结果甲状腺瘤组织、正常甲状腺组织和甲状腺癌组织中MDM2表达率分别为35.48%(11/31)、8.33%(2/24)和82.98%(78/94),两两之间比较差异有统计学意义(χ2=25.645、48.793、5.525,P<0.05);MDM2表达水平与甲状腺癌TNM分期、组织学分级、颈淋巴结转移、包膜浸润明显相关(χ2=7.592、8.516、5.829、5.048,P<0.05),差异有统计学意义。甲状腺瘤组织、正常甲状腺组织和甲状腺癌组织中Snail表达率分别为38.71%(12/31)、12.50%(3/24)和67.02%(63/94),两两之间比较差异有统计学意义(χ2=7.786、23.057、4.685,P<0.05);Snail表达水平与甲状腺癌颈淋巴结转移、TNM分期和包膜浸润明显相关(χ2=5.966、5.457、4.250,P<0.05),差异有统计学意义。结论MDM2和Snail在甲状腺癌组织过表达,MDM2和Snail的表达与甲状腺癌的发生、发展及预后密切相关。

  • 标签: 鼠双微体基因2 甲状腺癌 Snail 免疫组织化学法
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