简介:目的探讨全血中miR-155与乳腺癌临床病理特征之间的关系。方法收集2010年12月至2011年4月淮安市第一人民医院甲状腺乳腺外科符合入选条件的65例女性(乳腺癌47例,非乳腺癌18例)的血液标本,提取全血中总RNA,通过荧光实时定量PCR的方法,检测全血中miR-155表达水平,分析其与乳腺癌临床病理特征问的关系。结果乳腺癌患者全血中的miR.155的表达水平与非乳腺癌患者相比上调,差异有统计学意义(P〈0.05);与淋巴结转移阴性的乳腺癌患者相比,淋巴结转移阳性的乳腺癌患者全血中miR-155的表达水平上调,差异有统计学意义(P〈0.05);与Ⅰ、Ⅱ期乳腺癌患者相比,Ⅲ期乳腺癌患者全血中miR-155的表达水平上调,差异有统计学意义(P〈0.05);与T1乳腺癌相比,他和T3乳腺癌患者中miR-155表达上调,差异有统计学意义(P〈0.05);与ER、PR阴性的乳腺癌相比,ER、PR阳性的患者全血中miR-155表达水平下调,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论全血中miR-155的表达水平与乳腺癌的临床病理特征相关,全血中的miRNA有望成为新一代的乳腺癌的肿瘤标志物。
简介:摘要目的高通量测序分析日本血吸虫童虫的微小RNA(microRNA,miRNA),鉴定已知miRNA的表达水平,预测分析miRNA靶基因及其生物学功能。方法体外制备日本血吸虫童虫,提取童虫的总RNA构建文库进行Illumina高通量测序。采用DEGseq R语言包,结合perl脚本进行miRNA表达量的差异分析;分别利用miRanda、Blast软件和KEGG数据库对差异miRNA进行靶基因及其生物学功能预测。结果构建文库中,日本血吸虫童虫表达的miRNAs与最新miRBase数据库比对结果显示,共有38 483条匹配序列,鉴定到已知miRNA 60个;其中,sja-miR-125b表达量最高,其次为sja-miR-61、sja-miR-71a、sja-miR-36-3p和sja-miR-10-5p,上述5种miRNA表达量占总miRNA的91%(3 263/3 585)。共预测到靶基因7 176个,基因功能集中在核苷酸转移酶活性、细胞氮复合代谢、分子功能、生物学过程、生物合成、等离子体膜及蛋白质成熟;功能富集分析显示,高表达的miRNA主要参与致病过程、生物进展及多条代谢途径通路。结论日本血吸虫童虫显著表达的miRNA参与了血吸虫分化、生长发育和致病过程中的代谢途径调节,为研究血吸虫发育调控机制及新药物开发奠定了基础。
简介:摘要卵巢癌是导致女性死亡的最常见的妇科恶性肿瘤之一,其早期诊断和预防十分复杂。因此,用于疾病预测和预后的生物标志物对于早期诊断和个体化治疗均是迫切需要的。miRNA是一种短链、高度保守的非编码RNA分子,主要通过在转录后水平上降解或抑制靶基因从而调控细胞生长、增殖、分化、代谢和凋亡。有研究结果已证实miRNA可作为潜在的临床诊断和治疗癌症的生物标记物;同时,与肿瘤相关的miRNA通过调控多种癌基因和抑癌基因的表达,在卵巢癌的发生、侵袭和转移过程中发挥着重要作用。探讨了miRNA作为卵巢癌早期预防或检测、预后的诊断和治疗靶点的生物标志物的作用,对miRNA在卵巢癌患者中未来的临床应用提出了展望。
简介:摘要MicroRNAs(miRNA)是一类约20~22碱基大小的小分子非编码RNA。是一类新发现的在转录后水平负性调控基因表达的基因调控因子。miRNA在多种肿瘤中都存在表达异常。miRNA表达异常可能在胰腺癌的发生中起到了重要作用。本课题假设miRNA的基因序列在胰腺癌中存在变异,因此检测了8种miRNA在胰腺癌组织及肿瘤细胞株中前体的基因序列。总共发现了4种新的基因序列的变异。miRNA定量分析显示,miR-21在20例胰腺癌病例标本及6种肿瘤细胞株中均有显著的高表达。新发现的一个位于pre-miR-21基因下游29个碱基处的A-G突变导致了其附近二级结构的改变,并引起miR-21的相对低表达。这些结果显示miRNA可能在胰腺癌的发生中起到了重要的作用,但是其基因序列的变异引起表达异常的分子机制仍待进一步的研究。
简介:摘要目前研究显示,miRNA普遍存在于各种生物中,在起源上具有物种的差异与系统的差异,哺乳动物中其可能参与调控30%的基因表达,因而其形成的过程在植物与动物中存在着一些差别,推测这些或许是独立进化造成的。传统认为不存在在植物和动物间都保守的miRNA,可是据有关研究的人员实验发现,起源于长末端重复的转录子区域的某些基因,在植物与动物中都有存在,这就提示着植物和动物也许使用类似的蛋白质编码基因,即来自于相同基因片段(遗传信息系统),而部分miRNA存在不同强度的致癌物理活性,比如高表达的miRNA通过抑制一些抑癌基因,从而起到癌症基因的作用;另一些则表现为抑癌特性,比如低表达miRNA失去对抑癌基因的抑制作用,从而起到抑癌基因的功效。miRNA的出现为人们钻研调节细胞及生物体种种生命活动的分子功能机制开启了新的视野,也为肿瘤发生、发展及诊疗的研究开辟了一个崭新的途径。目前发现,miR-128在普通脑神经体系中呈现出高表达水平,而且能够影响到其正常的发育以及一般的生理功能。miR-128在胶质母细胞瘤患者的外周血中显著增多1,在正常脑组织中的异常表达与神经胶质瘤、阿尔茨海默病等密切相关。miRNA-128还通过干预不同的靶miRNAs参与肺癌、胃癌、宫颈癌、前列腺癌、结肠癌等一些肿瘤的发生与进展过程。miR-128对于恶性肿瘤的指示性作用逐渐被发现,因此,阐明miRNA-128参与肿瘤发生发展的分子作用机制,对进一步研究肿瘤基因治疗具有重要意义。
简介:摘要目的探讨常规内参基因U6和Cel-miR-39用于结核性脑膜炎患者脑脊液微小核糖核酸(miRNA)定量检测的可行性,并初步用于脑脊液miRNA定量检测分析。方法本研究选取首都医科大学附属北京胸科医院常规脑脊液检测后保存的标本,根据最终诊断依据纳入结核性脑膜炎患者36例、病毒性脑膜炎患者34例。提取其脑脊液标本miRNA,采用TaqMan探针法检测miRNA的表达水平。采用GeNorm、NormFinder和Bestkeeper软件分析内参基因miRNA的稳定性,采用2-ΔCt方法计算靶标miRNA的相对表达量。标本重复检测的一致性分析采用Pearson检验。靶标基因在两组间的表达差异比较采用t检验。结果70份脑脊液标本中,U6检测的循环阈值(Ct)为(30.40±3.30)个循环,表达丰度较低,Cel-miR-39检测的Ct值为(21.49±0.70)个循环,表达丰度适中。内参和靶标基因miRNA在重复样本检测中一致性均较好(r>0.931, P<0.001)。根据3种软件分析结果,Cel-miR-39在70份脑脊液标本中表达稳定性更高,更适合作为脑脊液miRNA检测的内参基因。以Cel-miR-39为内参,靶标基因miR-126-3p(1.13±0.41比3.34±0.82, t=2.452, P=0.016)、miR-130a-3p(0.56±0.10比2.59±0.70, t=2.960, P=0.004)和miR-151a-3p(0.64±0.25比2.11±0.33, t=3.536, P=0.001)在结核性脑膜炎组脑脊液中的相对表达量均显著低于病毒性脑膜炎组。结论Cel-miR-39可作为结核性脑膜炎患者脑脊液中miRNA定量检测的标准内参,脑脊液中miR-126-3p、miR-130a-3p和miR-151a-3p的相对表达量在结核性脑膜炎患者和病毒性脑膜炎患者之间存在差异。
简介:理解扩大多拷贝microRNA(miRNA)在植物的家庭,我们局部性从到他们的染色体的Arabidopsis和米饭的报导miRNA基因,分别地并且从Arabidopsis观察了117miRNA基因中的那37%个,从米饭的173miRNA基因中的35%个是在染色体的部分复制。为了描绘表示多样化是否多发生在植物之中,拷贝miRNA家庭成员,我们设计了在Arabidopsis和米饭从10个家庭指向48位预言的miRNA先锋的PCR教材。从RT-PCR数据的结果建议在一样的miRNA家庭以内的成员的抄录先锋在不同表示层次是在场的。另外,尽管miR160和miR162序列在Arabidopsis和米饭被保存,我们发现这些基因的表示模式在二种之间不同。这些数据建议那表达式多样化发生了在多拷贝miRNA家庭,在植物增加我们miRNAs的表达式规定的理解。