简介：摘要雷东多病毒是新发现的一种环状单链DNA病毒，分为Vientovirus和Brisavirus两个种，在人呼吸道中普遍存在，可引起呼吸道系统疾病。本文对雷东多病毒的基因组特征、致病性、流行病学、实验室检测等方面进行综述。

简介：摘要目的建立一种检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，作为实时荧光PCR法检测新型冠状病毒的补充，并探讨该方法在临床样本检测中的初步应用价值。方法根据新型冠状病毒基因保守序列，利用在线软件设计N、S基因引物，构建巢式PCR反应体系，N基因巢式PCR及产物测序用于定性检测，S基因PCR产物测序用于型别初步鉴定。检测梯度稀释新型冠状病毒阳性样本评价检测灵敏度，检测流感病毒和人冠状病毒OC43、229E、HKU1、NL63等样本评价其特异性。分别检测Ct值>33与Ct值<33的各15份新型冠状病毒阳性样本，对扩增产物进行测序及比对分析，对检测方法进行验证。结果所建立的巢式PCR法可扩增出355 bp N基因片段及449 bp S基因片段的特异性条带，冠状病毒229E、OC43、HKU1、NL63、H3N2亚型流感病毒、甲型H1N1流感病毒、乙型流感病毒阳性样本无扩增条带。N基因片段最低检测限可达Ct值37.21。30份新冠核酸阳性样本中，巢式PCR检测的N基因阳性符合一致率达100%(30/30)；S基因阳性符合一致率达60%(18/30)。28份样本N基因片段测序成功，BLAST与新型冠状病毒相似性100%。12份样本S基因片段可获得位点突变特征结果。结论建立了可特异检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，并可通过对PCR扩增产物测序分析其位点突变特征，可作为实时荧光PCR法的补充。

简介：摘要目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别及药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及测序进行emm基因分型，采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用χ2检验和Fisher′s确切概率法进行组间比较。结果共收集GAS菌株557株，检测到11种emm基因型(emm1、emm3、emm4、emm6、emm11、emm12、emm22、emm75、emm89、emm128、emm212)。其中emm1型42.73%(238/557株)，emm12型48.65%(271/557株)，其他emm型8.62%(48/557株)。emm1、emm12、其他emm型2018年分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株)；2019年分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株)；2021年分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018年和2019年≤6岁儿童组中感染emm12型的构成比均高于>6岁儿童组(62.50%比46.88%，46.36%比30.36%)，差异均有统计学意义(χ2＝7.182、6.973，均P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测，结果对青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%，对红霉素、四环素、克林霉素的耐药率分别为：2018年88.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株)；2019年94.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株)；2021年3种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018年青霉素MIC50、MIC90均为0.03 mg/L；2019年分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L；2021年均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药，且均为联合耐药，红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株)，红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株)，红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。结论北京市2018年、2019年、2021年儿童GAS的emm基因型别多样，优势基因型为emm12与emm1，以emm12为主导流行型别。GAS菌株对红霉素、克林霉素、四环素维持较高耐药率，对青霉素等抗生素保持敏感，但青霉素MIC50和MIC90呈递增趋势。

简介：摘要目的掌握2021年北京市流感流行特征及乙型Victoria系（简称BV）流感病毒血凝素（hemagglutinin，HA）基因、抗原性变异情况，为北京市流感防控提供科学依据。方法对北京市2021年1—11月流感病原学监测结果进行统计分析，并随机抽取15株BV流感病毒，通过HA基因扩增测序，分析其基因变异和进化特征。结果研究期间共收集流感样病例样本16 097份，其中核酸检测阳性208份，经型别鉴定BV流感病毒205份（98.56%）、乙型Yamagata（简称BY）系流感病毒3份（1.44%）。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比，核苷酸相似度为98.39%~98.75%，氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支，与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株（6.6%）为疫苗株的低反应株。结论2021年北京市监测到的流感病毒中BV流感病毒占绝对优势，其HA基因位点多处发生变异，提示对该亚型变异的持续监测至关重要，为制定流感防控策略提供科学依据。

简介：摘要目的分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系（BV）疫情的病毒血凝素（HA）的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本，提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点，采用Mega 6.0软件中的NJ模式构建HA基因的遗传进化树并分析。结果通过二代测序获得了2株BV的HA基因全长序列。与本年度的疫苗株HA基因相比较，疫情株有9个氨基酸位点发生变异，其中6个变异位点位于3个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支，与2021—2022年度北半球推荐的流感疫苗株（B/Washington/02/2019）不在同一分支。结论本起BV疫情毒株的HA基因在抗原表位发生多处变异，必需加强BV流感的监测与变异规律分析，为BV防控策略的制定提供有力的数据支撑。