简介：摘要目的对延庆区新冠肺炎聚集性疫情进行流行病学调查和基因测序，分析病例的感染来源、传播链条、防控措施，为新冠疫情防控提供参考。方法对病例开展流行病学调查，应用大数据技术对病例的活动轨迹进行核查，对风险点位进行调查管控，判定和管理密切接触者，并对人员和环境开展核酸检测，对溯源重点人群采集血清标本进行抗体检测，对报告的病例进行全基因组测序、比对，分析感染来源和传播链。结果2022年7月4日至7月10日，延庆区聚集性疫情共涉及16例新冠病毒确诊病例（普通型1例、轻型15例），其中延庆区8例，顺义区5例，通州区、昌平区、丰台区各1例，毒株分型均为新冠病毒Omicron亚型变异毒株BA.5，潜伏期中位数为3 d。指示病例为1例从美国入境人员，6月15日至6月30日在上海隔离点隔离，7月1日隔离期满后返京，7月4日诊断为确诊病例，在工作单位传播给同工作、同餐人员引起的聚集性疫情。结论OmicronBA.5亚分支正成为全球主要流行毒株，要加强入境人员管理，做好口岸城市疫情防控工作。加强疫苗接种、核酸检测等常态化防控措施落实，早期发现疫情后，采取科学精准的防控措施。

简介：摘要目的建立一种检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，作为实时荧光PCR法检测新型冠状病毒的补充，并探讨该方法在临床样本检测中的初步应用价值。方法根据新型冠状病毒基因保守序列，利用在线软件设计N、S基因引物，构建巢式PCR反应体系，N基因巢式PCR及产物测序用于定性检测，S基因PCR产物测序用于型别初步鉴定。检测梯度稀释新型冠状病毒阳性样本评价检测灵敏度，检测流感病毒和人冠状病毒OC43、229E、HKU1、NL63等样本评价其特异性。分别检测Ct值>33与Ct值<33的各15份新型冠状病毒阳性样本，对扩增产物进行测序及比对分析，对检测方法进行验证。结果所建立的巢式PCR法可扩增出355 bp N基因片段及449 bp S基因片段的特异性条带，冠状病毒229E、OC43、HKU1、NL63、H3N2亚型流感病毒、甲型H1N1流感病毒、乙型流感病毒阳性样本无扩增条带。N基因片段最低检测限可达Ct值37.21。30份新冠核酸阳性样本中，巢式PCR检测的N基因阳性符合一致率达100%(30/30)；S基因阳性符合一致率达60%(18/30)。28份样本N基因片段测序成功，BLAST与新型冠状病毒相似性100%。12份样本S基因片段可获得位点突变特征结果。结论建立了可特异检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，并可通过对PCR扩增产物测序分析其位点突变特征，可作为实时荧光PCR法的补充。

简介：摘要目的分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系（BV）疫情的病毒血凝素（HA）的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本，提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点，采用Mega 6.0软件中的NJ模式构建HA基因的遗传进化树并分析。结果通过二代测序获得了2株BV的HA基因全长序列。与本年度的疫苗株HA基因相比较，疫情株有9个氨基酸位点发生变异，其中6个变异位点位于3个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支，与2021—2022年度北半球推荐的流感疫苗株（B/Washington/02/2019）不在同一分支。结论本起BV疫情毒株的HA基因在抗原表位发生多处变异，必需加强BV流感的监测与变异规律分析，为BV防控策略的制定提供有力的数据支撑。

简介：摘要目的评估三种商业化试剂盒对新型冠状病毒奥密克戎变异株核酸检测的效果。方法收集2021年12月北京市监测发现的经测序分析确定为新型冠状病毒奥密克戎变异株的咽拭子标本8份，同时收集北京市2021年11月监测发现的新型冠状病毒德尔塔变异株咽拭子标本5份，用三种针对新型冠状病毒奥密克戎变异株的商业化荧光定量RT-PCR试剂盒进行检测，对检测效果进行比较分析。取其中两份Ct值较低的样本10倍系列稀释5个梯度，用于比较检测试剂的灵敏性。结果三种试剂盒均能特异性地检出8份奥密克戎变异株和5份非奥密克戎株（德尔塔变异株）。试剂A和B的灵敏性高于试剂盒C一个稀释度。结论三种试剂盒均能特异性地检测奥密克戎变异株。试剂盒A核酸用量最少，虽然只检测一个变异位点（Q498R），但该位点是奥密克戎变异株特有的，从而使实验操作和结果判定都更简便。

简介：摘要目的分析新型冠状病毒在不同食品和加工材料表面存活规律，为制定预防病毒通过食品和加工材料传播的防控措施和风险评估提供参考。方法将病毒培养物接种至常见进口食品和加工材料表面，使用荧光定量PCR方法测定在不同温度和时间条件下样本表面病毒核酸载量；使用半数组织培养感染剂量实验测定病毒滴度，观察病毒存活时间。使用线性回归模型计算病毒半衰期。结果食品和加工材料表面病毒核酸载量随时间下降，且温度越高病毒核酸载量下降越快。不同种类食品和加工材料表面病毒存活时间不同，室温条件下，猪肉和车厘子表面病毒存活24 h；其次为带鱼和鲜橙表面。加工材料表面病毒存活时间均较短，小于24 h。4 ℃条件下，病毒在猪肉表面至少存活1周，其次为车厘子和带鱼。-20 ℃条件下，病毒在猪肉和塑料包装表面的活性下降缓慢，8周后病毒滴度仍然较高，而在带鱼和纸板表面的活性下降明显。结论不同食品和加工材料表面的病毒核酸存续时间和存活规律不同，且温度越低病毒存活时间越长，应根据食品、加工材料类型，以及生产环境条件制定针对性预防和消毒措施。

简介：摘要目的了解北京市2021—2022流行季北京市流感流行特征，为科学防控流感提供依据。方法使用北京市2021—2022年二级以上医疗机构流感样病例和流感病原学监测数据，分析流感流行趋势和病原学特征。结果2021—2022流感流行季累计报告流感样病例530 829例，流感样病例百分比为1.25%，流感活跃期持续15周。流感样病例中以0~15岁年龄组为主（60.71%），60岁以上人群占比5.90%。共检测流感样病例咽拭子标本18 505件，阳性率14.91%，其中乙型Victoria系流感病毒为优势毒株（99.56%）。乙型Victoria系流感病毒中，44例标本为1A.3a2分支，与WHO本年度推荐的疫苗株B/Washington/02/2019为1A.3分支存在一定的进化距离。结论加强对流感等呼吸道传染病的监测预警，适时接种流感疫苗，及时调整疾病防控策略至关重要。

简介：摘要目的系统探讨东京2020年奥运会和残奥会（简称"东京奥运会"）和北京2022年冬奥会和冬残奥会（简称"北京冬奥会"）在各自疫情形势下的防控效果，为未来传染病大流行背景下大型集会筹办工作提供启示。方法系统检索东京奥运会和北京冬奥会相关文献及数据，利用公开数据对二者病例构成、发现方式、发病趋势及外溢情况进行比较分析。结果东京奥运会共报告新冠肺炎阳性人员869例，其中奥运会546例（62.8%），残奥会323例（37.2%）；海关筛查发现55例（6.3%），常规筛查发现814例（93.7%）；运动员41例（4.7%），其他利益相关方828例（95.3%）；入境人员249例（28.7%），本土居民620例（71.3%）；未对城市层面造成大量外溢传播。北京冬奥会共报告新冠肺炎阳性人员535例，其中冬奥会509例（95.1%），冬残奥会26例（4.9%）；海关筛查323例（60.4%），常规筛查212例（39.6%）；运动员及随队官员209例（39.1%），其他利益相关方326例（60.9%）。无外溢病例报告。结论东京奥运会与北京冬奥会举办期间所面临的国内外疫情形势截然不同，其新冠阳性人员构成及传播情况虽有较大差异，但结合各自背景来看，均取得了较好的防控效果。

简介：摘要北京2022年冬奥会和冬残奥会举办之际，正值奥密克戎变异株导致的全球第四波新冠肺炎流行高峰。通过疫苗应接尽接、全程闭环管理、每日核酸检测、佩戴N95口罩及保持社交距离等各项疫情防控政策及措施调整，北京冬奥会疫情防控工作成效卓著，确保赛事如期顺利举办和所有境内外参与者健康安全，其防控经验对社会面疫情防控具有重要的借鉴意义。

简介：摘要猴痘是由猴痘病毒引起的人畜共患病，猴痘病毒属于痘病毒科正痘病毒属，是继天花灭绝后能够感染人类的最重要的正痘病毒。自1970年刚果民主共和国发现第一例人感染猴痘病毒病例以来，猴痘主要流行于中非与西非地区。2022年5月6日至7月15日，猴痘在多个国家出现了暴发，已经在全球62个国家和地区发现猴痘病例，并且出现了人际传播，引起了全球的高度关注。人类发现猴痘病毒已经60多年，但是对猴痘病毒的认识和研究还相对有限。因此本文就此次疫情的流行情况、暴发的可能原因以及未来的重点研究方向进行分析，提出应对策略，为猴痘的防控提供科学参考。

简介：摘要目的对发生在中国的首例疑似猕猴α疱疹病毒1型感染者进行实验室确诊。方法采集疑似感染者的脑脊液进行高通量测序，并采集疑似感染者的脑脊液、痘疱液、鼻咽拭子、结痂涂抹、唾液等标本以及密切接触者的痘疱液、口咽拭子、血清等标本后，利用4套实时定量PCR方法检测猕猴α疱疹病毒1型、水痘-带状疱疹病毒、猴痘病毒和正痘病毒。结果疑似感染者的脑脊液高通量测序结果检出285个猕猴α疱疹病毒样序列读数；猕猴α疱疹病毒1型特异性实时定量PCR检测患者脑脊液、结痂涂抹和唾液标本为阳性，疑似感染者的其余样本及密切接触者的样本均为阴性。水痘带状疱疹、猴痘和正痘病毒荧光定量PCR检测所有样本均为阴性。结论患者脑脊液、结痂涂抹和唾液标本猕猴α疱疹病毒1型核酸检测为阳性，结合病人的临床特征、动物接触史及高通量测序结果，确诊该患者为猕猴α疱疹病毒1型感染。

简介：摘要猕猴α疱疹病毒1型，又称为B病毒，属于疱疹病毒科，a疱疹病毒亚科，单纯疱疹病毒属，是一种在猕猴中广泛流行的疱疹病毒。猕猴是该病毒的天然宿主，人感染后病死率约为80%。2021年4月，我国发现首例人感染猕猴α疱疹病毒1型感染病例，通过开展流行病学调查，对密切接触者采取管理措施，开展实验室检测工作，有效地处置了该起疫情。本文结合我国首例人感染猕猴α疱疹病毒1型病例的流行病学调查、疫情处置措施以及实验室检测进行讨论和研究，形成专家共识，旨在为猕猴α疱疹病毒1型的风险评估和疫情应对提供科学的依据。

简介：摘要目的评估三种商用试剂盒对新型冠状病毒英国B.1.1.7变异株的检测效果。方法收集2021年1月北京市某区新冠肺炎聚集性疫情期间的10份鉴定为B.1.1.7变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本，同时收集2020年6—12月北京市监测发现的10份鉴定为非变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本做为对照。用三种可检测该变异株的商业化试剂盒分别进行检测，分析比较检测结果。结果三种试剂盒中，以B试剂盒的检测效果最差，C试剂盒的综合效果最好，其检测灵敏度可达1 000 copy/mL。结论部分检测试剂盒在灵敏度、稳定性等方面还有待进一步提高。为保证检测结果的质量，需要及时评估检测试剂对变异株的有效性，以使新冠病毒的检测更迅速，检测结果更可靠。

简介：摘要目的分析2021年1月北京市某区一起新冠肺炎聚集性疫情中新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组特征及变异情况，为疫情防控和风险评估提供参考。方法收集此次疫情相关呼吸道样本和外环境样本26份，使用高通量测序对病毒全基因组进行测定分析，对基因组数据拼接整理后进行一致性分析、变异位点分析及系统发生分析。结果共测定获得SARS-CoV-2病毒全基因组序列26条。26条病毒基因组之间高度一致，与参考株基因组（NC_045512）相比，核苷酸序列一致性中位数为99.896%，氨基酸序列一致性中位数为99.733%。26例病毒属于GR分支，共存在33个核苷酸突变位点，分布在ORF1ab、S、ORF8和N基因上，对应27个氨基酸突变位点，包括S蛋白69-70位缺失、N501Y、D614G等。病毒具有近期英国变异株（VOC 202012/01）的关键特征，属于英国变异株的类似株。结论此次聚集性疫情为同一传播链，疫情病毒为境外输入的英国变异株的类似株。