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  • 简介:摘要目的探究人体中与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv1705c蛋白相互作用的蛋白。方法原核表达Rv1705c蛋白基因,收集包涵体,裂解后透析纯化Rv1705c并测定其浓度,ELISA法检测细菌Rv1705c刺激巨噬细胞后细胞因子IFN-γ的分泌量,使用纯化并带有生物素标记的Rv1705c孵育人蛋白组芯片HuProt™,筛选与Rv1705c相互作用的人类蛋白,使用GenePix Pro 6.0软件对蛋白芯片的信号图像进行数据提取,使用GO、KEGG等多个数据库进行生物信息学分析,GST pulldown验证Rv1705c与PSMA3、RSAD2的相互作用。结果纯化结果显示,Rv1705c在包涵体中表达,Rv1705c刺激巨噬细胞后IFN-γ分泌量显著上升。芯片结果显示共筛选出了29个与Rv1705c相互作用的潜在阳性蛋白,其中PSMA3、NLN、THOP1、UPF3A、RSAD2、OMG、PNKD、STEAP3、MED8共9个蛋白的信噪比(signal-to-noise ratio,SNR)>1.6。进一步的生物信息学分析发现候选蛋白PSMA3、RSAD2、C1QBP参与固有免疫应答激活信号转导,并且PSMA3、RSAD2与干扰素存在交互作用,GST pulldown验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c确有相互作用。结论发现并验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c存在相互作用,为Mtb感染机制的研究提供参考。

  • 标签: 人蛋白质组芯片 Rv1705c 生物信息学 结核病
  • 简介:摘要原发性肝癌是我国第4位常见恶性肿瘤及第2位肿瘤致死病因,研发新型生物标志物应用于肝癌患者的早诊早治对于提高生存率十分重要。目前临床上常见的肿瘤标志物大多是糖蛋白,组学技术对于探索糖蛋白在肝癌中的临床诊断价值具有重要作用。本文基于肿瘤临床诊断中的糖蛋白标志物,分析了其诊断方法、问题与挑战;介绍针对糖蛋白研究的相关技术,包括高通量组学和单一糖蛋白检测方法,以及基于这些技术发现肝癌潜在的糖蛋白标志物;并且展望糖蛋白在肝癌临床诊断中的潜力与应用价值。

  • 标签: 肝肿瘤 糖蛋白类 诊断 肿瘤标记
  • 简介:摘要蛋白组学研究的对象是生命活动的直接执行者——蛋白蛋白在人体的发育生长和疾病发生发展过程中起着至关重要的作用,是目前临床应用最广泛的标志物类型,也是最直接的药物作用靶标。近年来,以色谱和质谱技术为核心的蛋白组学技术的进步,推动了蛋白组学研究在深度和广度上的快速发展,其在肝细胞癌临床队列样本研究中的应用,开启了“蛋白组学驱动的精准医学”新时代。现对近年来蛋白组学研究凸现的新技术、新方向和在肝癌研究中的新发现做一综述,为临床医生了解蛋白组学,并利用蛋白组学助力疾病的诊断和个性化治疗药物研发提供新的思路和参考。

  • 标签: 蛋白质组学 精准医学 肝细胞癌
  • 简介:

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  • 简介:摘要目的通过蛋白重组技术低成本、快速制备高浓度人视黄醇结合蛋白4(hRBP4)参考物质,解决临床hRBP4高值参考物质难以获取的需求。方法在美国国立生物技术信息中心NCB查找hRBP4的互补DNA序列,经大肠埃希菌密码子优化后人工合成,然后将DNA片段克隆至原核表达质粒pET-28a(+)中,以构建重组hRBP4表达载体。将重组质粒转化至E. coli BL21感受肽中,优化诱导表达条件(如温度、转速和异丙基硫代半乳糖苷IPTG浓度等)、诱导质粒表达并对重组蛋白进行His融合标签纯化,获取纯化后的hRBP4重组蛋白。结果DNAMAN软件对比显示编码hRBP4蛋白的碱基序列完全正确,成功构建重组hRBP4原核表达质粒;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳结果显示亲和纯化产物中可清晰可见约相对分子质量26 000电泳条带;临床尿液和血清hRBP4常规检测系统均可检测到纯化的hRBP4蛋白,且稀释倍数与检测浓度间呈现良好线性关系。结论成功构建重组hRBP4高水平表达系统,重组hRBP4蛋白纯度大、浓度高、生产周期短,有望在室间质量评价质控品和有证参考物质研制中发挥重要作用。

  • 标签: 视黄醇结合蛋白质类 重组蛋白 参考物质 质控品 室间质量评价
  • 简介:摘要环状RNA由于5'帽状结构的缺失一直被认为是非编码RNA,不具有编码蛋白或多肽的功能。随着高通量转录组测序、核糖体测序等技术的进展,研究发现环状RNA的序列中存在短开放阅读框和内部核糖体进入位点,具有编码多肽或蛋白的能力,并在胶质瘤、肝细胞癌、胃癌、乳腺癌、结肠癌等恶性肿瘤增殖中发挥重要作用。现通过综述环状RNA编码功能,分析其编码产物-多肽或蛋白在人类恶性肿瘤增殖机制中的作用。

  • 标签: 环状RNA 蛋白质组学 肽类 肿瘤
  • 简介:摘要糖蛋白上的聚糖是细胞黏附和细胞间通讯的主要参与者,糖基化通过调节血小板膜糖蛋白影响血小板数量和功能。在糖基转移酶(GT)的作用下,巨核细胞表面蛋白的糖基化参与调控巨核细胞成熟、分化和血小板生成。血小板去唾液酸化后,被相关受体识别而快速清除,并触发级联信号介导血小板生成素(TPO)产生,从而完成对血小板数量的快速调控。血小板膜糖蛋白多个糖基化关键位点的改变影响其与配体的结合能力,这也提示糖基化对血小板功能发挥具有重要作用。病理状态下,蛋白糖基化异常,可导致血小板数量异常和功能紊乱,从而引起相关疾病。笔者拟就蛋白糖基化对血小板数量和功能的调控机制进行阐述,旨在进一步了解蛋白糖基化在血小板增多、减少和功能异常中的作用。

  • 标签: 糖基化 糖基转移酶 糖蛋白类 血小板生成 N-乙酰神经氨酸 止血
  • 简介:摘要目的探讨长基因间非蛋白编码核糖核酸174(LINC00174)调控骨质疏松分子机制。方法选择烟台山医院47例骨质疏松症患者和47例正常健康人为研究对象。人骨髓间充质干细胞(hBMSCs)购自美国ScienCell公司。过表达LINC00174质粒(pcDNA-LINC00174)、过表达阴性对照(pcDNA-NC)、LINC00174小干扰RNA(si-LINC00174)、小干扰RNA阴性对照(si-NC)转染至hBMSCs。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测基因信使核糖核酸(mRNA)表达;噻唑蓝(MTT)检测细胞增殖活性;流式细胞仪检测细胞凋亡率;蛋白印迹法检测蛋白表达;酶联免疫吸附法检测丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)及过氧化氢酶(CAT)水平。两组间比较行t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验。结果骨质疏松症患者血清中LINC00174表达水平显著高于健康对照(2.38±0.21比1.00±0.11),差异有统计学意义(t=39.908,P<0.05)。pcDNA-LINC00174组hBMSCs细胞LINC00174表达(3.01±0.25比1.00±0.08)、凋亡率[(23.25±1.42)%比(12.46±1.07)%]和活化的天冬氨酸蛋白水解酶3(cleaved Caspase-3)表达(0.75±0.05比0.39±0.03)显著高于pcDNA-NC组,增殖活性(0.53±0.04比0.91±0.06)、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、(0.42±0.05比0.86±0.06)、碱性磷酸酶(ALP)(0.37±0.03比0.65±0.05)、Runt相关转录因子2(RUNX2)(0.41±0.04比0.83±0.06)和骨钙蛋白(OCN)(0.27±0.03比0.72±0.05)蛋白表达显著低于pcDNA-NC组,差异有统计学意义(t=15.671、20.877、9.564、12.431、17.498、21.652、18.932、21.774,P<0.05)。si-LINC00174组hBMSCs细胞LINC00174表达(0.38±0.04比1.01±0.09)、凋亡率[(8.46±0.78)%比(13.73±1.43)%]和cleaved Caspase-3(0.26±0.02比0.45±0.04)表达显著低于si-NC组,增殖活性(1.21±0.08比0.78±0.05)、Cyclin D1(0.78±0.06比0.54±0.04)、ALP(0.75±0.06比0.49±0.04)、RUNX2(0.89±0.06比0.53±0.05)和OCN(0.92±0.06比0.68±0.05)蛋白表达显著高于si-NC组,差异有统计学意义(t=13.032、16.541、10.125、19.356、15.238、18.981、9.237、11.343,P<0.05)。pcDNA-LINC00174组hBMSCs细胞Nrf2(0.39±0.03比0.88±0.06)和Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Keap1)(0.24±0.02比0.59±0.05)蛋白表达显著低于pcDNA-NC组,差异有统计学意义(t=17.238、14.045,P<0.05)。si-LINC00174组hBMSCs细胞核因子红系2相关因子2(Nrf2)(0.94±0.05比0.72±0.04)和Keap1(0.86±0.05比0.47±0.04)蛋白表达显著高于si-NC组,差异有统计学意义(t=13.032、16.541,P<0.05)。结论LINC00174可调控骨质疏松,其机制可能与通过Nrf2/Keap1信号通路调控hBMSCs增殖、成骨细胞分化、凋亡及氧化应激有关。

  • 标签: 骨质疏松 机制
  • 简介:摘要头颈鳞状细胞癌的全球发病率在最近十年明显上升。头颈肿瘤的病理类型超过90%为鳞状细胞癌,临床上大部分患者确诊时已是晚期,早期识别诊断头颈肿瘤能够极大程度改善患者的预后。随着蛋白组学技术的不断发展,从传统的蛋白组学到靶向定量蛋白组学,再到空间蛋白组学的出现,特异性的生物标志物有望被发现用于头颈肿瘤的早期诊断、指导治疗以及判断预后。

  • 标签: 头颈部肿瘤 蛋白质组学
  • 简介:摘要卵巢上皮性癌(卵巢癌)起病隐匿且进展迅速,是死亡率最高的妇科恶性肿瘤,认识卵巢癌发生、发展过程中的关键事件并从中寻找潜在的诊疗靶标,是改善患者预后的有效策略。蛋白糖基化是在分泌蛋白和膜结合蛋白上普遍存在的翻译后修饰过程,恶性肿瘤常呈现蛋白的异常糖基化。卵巢癌可表现为O-糖基化、N-糖基化、唾液酸化、岩藻糖基化等异常改变。这些异常糖基化不仅参与肿瘤的恶性转化以及进展过程,而且可作为诊断标志物和治疗靶点用于临床。本文对蛋白的异常糖基化及其与卵巢癌发生发展的关系进行综述,并揭示其潜在的诊疗价值。

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  • 作者: 张安然 马科锋 佘晓俊 刘洪涛 崔博 王瑞
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华劳动卫生职业病杂志》 2022年第04期
  • 机构:山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东省职业卫生与职业病防治研究院,济南 250062 军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所,天津 300050,军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所,天津 300050,山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东省职业卫生与职业病防治研究院,济南 250062
  • 简介:摘要目的研究二甲双胍干预对噪声性听力损失(NIHL)的保护作用及其差异蛋白组学表达谱。方法于2021年1月,将39只Wistar雄性大鼠随机分为对照组、噪声暴露组、二甲双胍+噪声暴露组,每组13只。噪声暴露组和二甲双胍+噪声暴露组大鼠连续暴露在声压级120 dB(A)、中心频率8 kHz的倍频程噪声下4 h;二甲双胍+噪声暴露组大鼠从噪声暴露前3 d开始给予200 mg/kg/d二甲双胍干预,共7 d。采用听性脑干反应(ABR)测试各组大鼠右耳噪声暴露前、噪声暴露后1、4、7 d的听力阈值变化情况,采用串联质谱标签(TMT)定量蛋白组学鉴定并分析各组大鼠内耳差异表达蛋白,并用冰冻切片进行免疫荧光染色验证。结果在噪声暴露后1、4、7 d,噪声暴露组和二甲双胍+噪声暴露组大鼠右耳短声ABR阈值明显高于对照组,二甲双胍+噪声暴露组大鼠右耳短声ABR阈值明显低于噪声暴露组(P<0.05)。与噪声暴露组比较,二甲双胍+噪声暴露组大鼠差异表达上调蛋白1 035个,差异表达下调蛋白1 145个;GO富集分析显示,显著差异表达蛋白主要涉及结合、分子功能调节、信号转导等功能;KEGG通路富集分析发现,差异表达蛋白显著富集的通路包括磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、焦点黏附、糖尿病性心肌病、分裂体、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等。免疫荧光实验显示,与噪声暴露组比较,二甲双胍+噪声暴露组胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)荧光强度增加,真核细胞翻译起始因子4E结合蛋白1(eIF4EBP1)荧光强度减弱。结论噪声暴露可导致大鼠听力阈值升高,二甲双胍可通过多条通路和生物学过程改善噪声引起的听力阈值异常。

  • 标签: 听力丧失 二甲双胍 耳蜗 蛋白质组学
  • 简介:摘要糖尿病视网膜病变(DR)是糖尿病患者常见的神经血管性并发症,严重威胁工作年龄人群的视力健康,给我国带来了沉重的社会和经济负担。DR患者就诊时多已发展至增生性糖尿病视网膜病变阶段,需接受玻璃体腔注射药物或手术治疗,但视力恢复不佳,因此以糖尿病患者或早期DR患者为研究对象,探索DR发病新的生物标志物,对早期DR进行及时诊断与治疗具有重要意义。高通量蛋白组学研究可以检查诸如房水、玻璃体液、泪液和血清等标本量较少的生物流体,找到涉及视网膜炎症过程的差异蛋白,为DR的早期诊断和治疗提供参考。本文就近年来蛋白组学技术筛选鉴定DR炎性生物标志物的情况及存在的问题进行综述。

  • 标签: 糖尿病视网膜病变 蛋白质组学 炎性生物标志物
  • 作者: 章立华 卓慧钦 侯静静 章惠萍 周阳 蔡建春
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《国际中医中药杂志》 2022年第10期
  • 机构:厦门大学附属中山医院胃肠外科,厦门 361004 厦门大学医学院胃肠肿瘤研究所,厦门 361004 厦门市胃肠肿瘤重点实验室,厦门 361004,厦门大学附属中山医院胃肠外科,厦门 361004 厦门市胃肠肿瘤重点实验室,厦门 361004,广州中医药大学第三临床医学院,广州 510006,厦
  • 简介:摘要目的通过网络药理学和蛋白组学方法探讨加减血癥汤治疗浸润型胃癌的潜在作用机制。方法利用TCMSP检索加减血癥汤有效成分及其作用靶点,采用高效液相色谱法串联质谱联用(HPLC-MS/MS)法测定浸润型胃癌的靶点,加减血癥汤预测的靶基因与浸润型胃癌的靶点蛋白数据进行维恩分析,获取作用靶基因,通过STRING获得蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),采用Cytoscape软件构建方剂-药物-化合物-基因网络,通过DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果筛选出加减血癥汤中69个有效成分,215个药物靶点;660个在浸润型胃癌过表达蛋白,10个药物靶点和基因靶点的共有靶点。PPI网络包括10个蛋白节点,其中3个核心节点为CASP3、BCL2L1和STAT1。KEGG富集到11条通路,包含PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、癌症中蛋白聚糖、细胞凋亡、Jak-STAT信号通路等。结论加减血癥汤可能通过PI3K-Akt信号通路、p53信号通路和Jak-STAT信号通路介导凋亡发挥抑制作用。本研究为加减血癥汤治疗浸润型胃癌作用机制的进一步研究提供理论依据。

  • 标签: 蛋白质组学 浸润型胃癌 加减血癥汤 有效成分 网络药理学 药理作用分子作用机制(中药)
  • 简介:摘要急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)的临床病死率高,早期预警并积极干预对于改善ARDS预后非常重要。文章就近年来ARDS相关预警生物标志物及蛋白组学研究现状进行综述,分析与ARDS发生、发展和预后相关的各种预警生物标志物,讨论蛋白组学在ARDS预警生物标志物中的应用,为后续开展标志物高通量的筛选、验证提供参考。

  • 标签: 急性呼吸窘迫综合征 蛋白质组学 生物标志物
  • 简介:摘要目的探讨壳多糖酶3样蛋白1(chitinase-3-like protein 1,CHI3L1)对软骨细胞生物学功能的影响在关节突关节退行性病变中的作用。方法收集人关节突关节软骨组织标本,检测CHI3L1基因的mRNA相对表达量,分析关节突关节退变等级与患者性别、年龄、CHI3L1基因mRNA相对表达量的相关性。体外培养人软骨细胞,检测CHI3L1组与对照组软骨细胞增殖、周期、凋亡和相关炎症因子表达的差异,以信号传导通路蛋白芯片分析CHI3L1调节软骨细胞退变的作用机制。结果关节突关节退变等级与CHI3L1基因mRNA相对表达量呈正相关(r=0.76,P<0.001),与性别不相关(r=-0.12,P=0.500),与年龄呈正相关(r=0.47,P=0.005)。退变组CHI3L1基因mRNA表达量升高,且随退变等级加重表达量升高(F=18.90,P<0.001)。与对照组比较,CHI3L1组软骨细胞在培养48 h(OD490/fold=7.132)、72 h(OD490/fold=4.803)、96 h(OD490/fold=2.431)和120 h(OD490/fold=0.009)的增殖倍数显著降低。CHI3L1组软骨细胞处于G1期、S期和G2/M期的比例分别为85.03%±3.05%、12.78%±2.29%和0.90%±0.76%,对照组分别为73.93%±2.73%、22.81%±1.93%和0.99%±0.87%;两组软骨细胞G1期比例(t=4.70,P<0.001)和S期比例(t=5.80,P<0.001)的差异均有统计学意义;两组软骨细胞凋亡百分比分别为8.64%±0.76%和5.68%±1.13%,差异有统计学意义(t=4.47,P<0.001);CHI3L1组软骨细胞IL-6的表达量为(49.60±0.01) pg/ml,大于对照组的(47.88±0.01) pg/ml(t=132.72,P<0.001),TNF-α的表达量为(95.93±0.02) pg/ml,大于对照组的(90.69±0.02) pg/ml(t=376.10,P<0.001)。蛋白芯片检测到表达量显著差异的蛋白共53个,蛋白磷酸化水平显著差异的蛋白43个。通过生物信息学分析筛选出差异蛋白可能参与的信号通路共16个。MAPK信号通路中,CHI3L1组软骨细胞MAPK1和RAF1蛋白的表达量(分别为1.094±0.00、0.988±0.00)较对照组(分别为0.814±0.00、0.786±0.00)升高(t=103.16,P<0.001;t=54.32,P<0.001)。结论CHI3L1的表达与关节突关节退行性病变相关:CHI3L1可抑制关节软骨细胞增殖,抑制软骨细胞周期由G1期进入S期,促进软骨细胞凋亡,促进软骨细胞表达IL-6和TNF-α;可通过调节MAPK信号通路调节软骨细胞的生物学功能,是关节突关节退行性病变临床诊疗的潜在生物标志物。

  • 标签: 椎关节突关节 骨关节炎 软骨细胞 壳多糖酶3样蛋白质1
  • 简介:摘要目的定量分析SD大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变(NAION)模型中视神经组织蛋白表达变化,并对差异蛋白进行生物信息学分析。方法选取10只8周龄体质量200~250 g的SPF级雄性SD大鼠,采用孟加拉玫瑰红联合激光光动力方法建立NAION模型,最终选取4只造模成功的大鼠作为NAION模型组,同时取4只体质量和周龄相匹配的健康、无眼疾SD大鼠作为正常对照组。于造模后7 d,分离各组大鼠球后视神经,采用酶切法进行样本制备,采用同位素标记相对和绝对定量标记结合液相色谱-串联质谱技术对组织蛋白进行质谱鉴定和定量检测,选取组间表达倍数大于1.5倍且差异有统计学意义(P<0.05)的蛋白为差异蛋白,并对差异蛋白进行生物信息学分析。结果造模后3 d,NAION模型组大鼠视盘隆起,荧光素眼底血管造影图像显示视盘区有荧光素钠渗漏,模型建立成功。共鉴定出1 291个可定量蛋白,其中差异蛋白80个。与正常对照组比较,NAION模型组中表达上调的蛋白5个,表达下调的蛋白75个。V型胶原α1链(Col5A1)和cAMP依赖性蛋白激酶催化亚基β(Prkacb)、G蛋白相关支架蛋白(Dlg1)等蛋白表达升高;神经微丝蛋白(Nefm)、微管相关蛋白1b(Map1b)、Ras相关蛋白(Rala)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N2(Pkn2)、血小板活化因子乙酰水解酶IB亚基(Pafah1b1)等蛋白表达降低。差异蛋白主要参与细胞骨架的调节、细胞对缺氧的反应、轴突生成及延伸、突触调节、神经元凋亡调控、轴浆运输等生物学进程。京都基因与基因组通路富集分析结果显示,差异蛋白主要参与代谢通路、突触囊泡循环、血小板活化等信号通路。结论神经生长、能量代谢、轴浆运输及凋亡等信号通路相关蛋白的表达共同参与NAION中神经细胞的凋亡。

  • 标签: 视神经病变,缺血性 视神经 蛋白质组学
  • 简介:摘要目的探讨短期高蛋白低碳水化合物饮食干预在肥胖合并高血压患者中的应用。方法回顾性选取2015年5月至2019年12月在深圳市人民医院体检并进行体重管理的200例肥胖合并高血压患者,按照随机数字表法分为对照组和试验组(各100例),对照组采用常规饮食指导,试验组采用高蛋白低碳水化合物饮食指导。干预指导8周后,观察两组体重、体质指数、收缩压、舒张压、空腹血糖、总胆固醇、三酰甘油及降压药费用变化。采用t检验和Wilcoxon秩和检验进行两组干预前后对比,以P<0.05为差异有统计学意义。结果干预后试验组体重、体质指数、收缩压、舒张压、空腹血糖、总胆固醇、三酰甘油及降压药费用均低于干预前[70.0(66.0,72.0)比79.0(74.0,85.0)kg、26.1(25.4,27.7)比28.5(26.8,29.5)kg/m2、160.0(154.0,166.0)比168.0(162.0,178.0)mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)、97.0(90.5,98.0)比101.0(98.0,108.0)mmHg、4.95(4.70,5.20)比5.25(4.80,5.52)mmol/L、5.40(5.00,5.80)比5.80(5.27,6.40)mmol/L、1.10(0.90,1.20)比1.25(0.90,1.50)mmol/L、(646.4±21.3)比(669.6±21.6)元](均P<0.05);对照组体重低于干预前[78.0(73.3,83.0)比79.5(74.5,85.0)kg](P<0.05),体质指数、收缩压、舒张压、空腹血糖、总胆固醇、三酰甘油及降压药费用差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论短期高蛋白低碳水化合物饮食干预可有效减轻肥胖合并高血压患者的体重,并显著降低其血压、空腹血糖、总胆固醇、三酰甘油及降压药费用。

  • 标签: 肥胖 高血压 饮食干预
  • 简介:摘要目的探讨长基因间非蛋白编码核糖核酸01638(LINC01638)调控胶质瘤细胞增殖和凋亡机制。方法U251胶质瘤细胞购自中国科学院细胞库。选择2017年1月至2019年1月兰州大学第一医院诊治的颅脑胶质瘤患者及颅脑血肿清除术患者为研究对象。将U251细胞根据转染基因分为si-NC组、si-LINC01638组、pcDNA组、pcDNA-LINC01638组、miR-NC组、miR-647 mimics组、si-LINC01638+anti-miR-NC组和si-LINC01638+anti-miR-647组。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测LINC01638和微小核糖核酸647(miR-647)表达;细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测48 h细胞吸光度;流式细胞术检测细胞凋亡;蛋白印迹法检测细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(p21)、B细胞淋巴瘤-2(bcl-2)及bcl-2相关X(bax)表达;双荧光素酶报告实验检测LINC01638和miR-647的靶向关系。两组间比较采用t检验;多组间比较采用单因素方差分析(两组间比较用SNK-q检验)。结果胶质瘤组织中LINC01638表达显著高于正常脑组织(2.96±0.27比0.95±0.08),miR-647表达显著低于正常脑组织(0.54±0.05比1.02±0.06),差异有统计学意义(t=31.921、27.485,P<0.05)。si-LINC01638组U251细胞LINC01638表达(0.49±0.03比0.97±0.07)、48 h细胞吸光度值(0.41±0.03比0.72±0.04)、Cyclin D1表达(0.24±0.02比0.69±0.04)显著低于si-NC组,p21表达(0.58±0.03比0.19±0.02)、细胞凋亡率[(22.63±3.18)%比(6.95±0.86)%]及bax表达(0.91±0.06比0.26±0.03)显著高于si-NC组,差异有统计学意义(t=14.238、18.432、20.399、16.981、19.322、24.876,P<0.05)。miR-647与WT-LINC01638共转染后U251细胞荧光素酶活性显著降低,转染pcDNA-LINC01638后miR-647低表达,转染si-LINC01638后miR-647高表达(P<0.05)。miR-647 mimics组U251细胞miR-647表达(2.71±0.08比1.01±0.03)、细胞凋亡率[(20.60±2.14)%比(6.12±0.39)%]、p21(0.51±0.06比0.18±0.02)和bax(0.83±0.07比0.23±0.04)表达显著高于miR-NC组,48 h细胞吸光度值(0.45±0.07比0.63±0.09)、Cyclin D1(0.28±0.05比0.69±0.07)和bcl-2(0.29±0.03比0.81±0.08)表达显著低于miR-NC组,差异有统计学意义(t=20.254、16.133、15.541、12.689、17.431、21.356,P<0.05)。si-LINC01638+anti-miR-647组U251细胞miR-647表达(0.62±0.05比1.01±0.06)、细胞凋亡率[(11.37±2.33)%比(22.43±3.41)%]、p21(0.28±0.06比0.59±0.08)和bax(0.39±0.05比0.87±0.09)表达显著低于si-LINC01638+anti-miR-NC组,48 h细胞吸光度值(0.58±0.06比0.32±0.03)、Cyclin D1(0.58±0.06比0.21±0.03)和bcl-2(0.63±0.07比0.25±0.04)表达显著高于si-LINC01638+anti-miR-NC组,差异有统计学意义(t=13.133、12.087、19.287、11.303、16.765、18.433,P<0.05)。结论抑制LINC01638表达可抑制U251细胞增殖并促进凋亡,其机制可能与LINC01638上调miR-647有关。

  • 标签: 微小RNA 胶质瘤 增殖 凋亡
  • 简介:摘要目的对良性气道狭窄(BAS)患者肉芽组织成纤维细胞进行蛋白组学分析,以进一步揭示BAS的发病机制。方法取5例BAS患者的肉芽组织(BAS组)和3例肺癌患者的正常支气管组织(对照组)进行成纤维细胞原代培养,用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术分析成纤维细胞的蛋白组表达情况,筛选差异表达蛋白,并使用基因本体(GO)数据库、京都基因和基因组(KEGG)数据库和重复出现邻近基因检索工具(STRING)数据库对差异表达蛋白的功能、代谢通路和蛋白相互关系进行富集分析。结果共筛选出93个差异表达蛋白。其中有36个差异表达蛋白在BAS肉芽组织成纤维细胞中显著下调,57个差异表达蛋白显著上调。差异表达蛋白主要定位于细胞膜和细胞外区域,参与离子结合功能、代谢活性功能,主要参与的通路有糖酵解-糖异生代谢、细胞外基质-受体结合、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-AKT信号传导、复杂环境中的微生物代谢和次级代谢物合成。结论BAS狭窄部位肉芽组织成纤维细胞的细胞外基质-受体结合异常、PI3K-AKT信号通路异常和代谢异常可能与BAS的发生发展有关。

  • 标签: 蛋白质组 细胞外基质 信号通路 代谢 良性气道狭窄
  • 简介:摘要目的探讨益肾健脾助运方对糖尿病肾病维持性血液透析并发蛋白能量消耗(protein energy expenditure, PEW)患者营养状态及微炎症状态的影响。方法选取安阳市人民医院血液透析室2018年9月至2020年9月期间收治的95例糖尿病肾病维持性血液透析并发PEW患者作为研究对象,依据治疗方案不同将其分为观察组和对照组。对照组患者接受优质蛋白饮食+降糖+调节钙磷代谢等基础治疗和血液透析治疗,观察组患者在对照组治疗的基础上加用益肾健脾助运方治疗。比较两组患者体表测量学指标[肱三头肌皮褶厚度(triceps skinfold thickness, TSF)、中臂围(mid-arm circumference, MAC)、中臂肌围(mid-arm muscle circumference, MAMC)及体质量]、炎症感染指标[白细胞介素-6(interleukin-6, IL-6)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平]及营养状态指标[血清白蛋白(albumin, ALB)、前白蛋白(prealbumin, PA)、血红蛋白(hemoglobin, Hb)]。结果治疗后,两组患者TSF、MAC、MAMC差异无统计学意义(P>0.05),观察组患者PA、血清ALB、Hb及体质量均明显高于对照组(P< 0.05),IL-6及TNF-α均低于对照组(P<0.05)。结论益肾健脾助运方联合西医治疗能显著改善糖尿病肾病维持性血液透析并发PEW患者营养状态及微炎症状态,改善PEW,效果优于单独西医治疗,值得推荐。

  • 标签: 益肾健脾助运方 糖尿病肾病 蛋白质能量消耗 微炎症状态