简介:摘要目的了解GII.8和GII.9型诺如病毒P蛋白的糖结合特征。方法利用大肠杆菌系统获得GII.8和GII.9诺如病毒P颗粒蛋白,通过寡糖和唾液结合实验,研究P颗粒蛋白与组织血型抗原等糖的相互作用,再采用序列比对和结构比较,分析GII.8和GII.9糖结合位点的序列和结构特征。结果GII.8 P蛋白与所检测的寡糖无明显结合,与部分人A/B/O型别唾液样本有结合。GII.9 P蛋白结合H双糖,与人A/B/O型别唾液有很好结合。序列和结构分析均显示GII.8 P蛋白具有与GIII.9相似的潜在糖受体结合位点,其位点与流行株GII.4等型别的糖受体区区相近。结论非流行株GII.8和GII.9 P蛋白与不同组织血型抗原的结合能力不同,提示可能会造成流行的差异,需要对非流行株开展持续的分子监测。
简介:摘要目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus, NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)筛查NoV;阳性标本进行NoV VP1基因及RdRp基因扩增及序列测定,所测得的序列应用在线分型工具Norovirus Genotyping Tool 2.0进行基因分型。结果本研究共收集2 577例急性腹泻儿童粪便标本,NoV核酸检测阳性的484例(18.78%,484/2 577);NoV感染全年均可发生,具有明显的季节分布,流行高峰在秋冬季节。NoV的检出无性别差异(χ2=1.77, P=0.183)。其中有399例得到了VP1区分型,结果显示有11个基因型,主要为GII基因群(98.25%, 392/399),GII.4 Sydney型为主(52.13%, 208/399),其次为GII.3型(19.8%, 79/399)、GII.2型(18.5%, 74/399)。267例完成了RdRp区分型,结果显示有10个基因型,以GII.P31型为主(57.3%, 153/267),其次为GII.P12型(15.36%, 41/267)及GII.P16型(14.98%, 40/267)。双基因分型结果显示存在16种组合方式,主要为GII.4 Sydney[P31](53.18%, 142/267),GII.3[P12]检出率呈下降趋势,而GII.4 Sydney[P16]检出率逐渐增高。结论NoV是北京市2014—2019年儿童急性腹泻的重要病原,流行的基因型别多样。
简介:摘要法洛四联症合并一侧肺动脉缺如是一种罕见的先天性畸形,目前缺乏统一的治疗方案,存在诸多争议,外科医师在临床决策过程中感到困惑。本文综合文献报道,讨论这一疾病的临床分型及治疗方案的选择,以期为心血管外科医师的临床决策提供参考。
简介:摘要目的对GI.1型札如病毒进行全基因组扩增测序尝试并开展初步分析。方法利用本研究设计的GI组札如病毒全基因组5’末端通用引物及杯状病毒3’末端引物,对本实验室保存的两株GI.1型札如病毒标本进行全基因组扩增,然后进行文库构建、上机测序及序列组装。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA 7.0软件构建进化树进行进化分析。结果两个标本测序质量优异,测序方法具有可行性;在全基因组(WGS)、NSP基因、VP1基因及VP2基因进化树中,均归类为GI.1型;位点变异分布于各个基因片段,但VP1基因的N端保守性较好,熵值较低;大部分基因的核苷酸突变尤其是NS3、NS5及VP1基因的核苷酸突变以同义突变为主,未形成相应氨基酸的突变。结论成功地开展了对GI.1型札如病毒全基因组扩增测序及相关进化分析,为札如病毒的检测提供了新的思路。
简介:摘要目的探讨腹泻患者中诺如病毒RT-PCR检验结果及曲线分析。方法对巴州地区哨点医院巴州第一人民医院上送的腹泻病粪便标本中的诺如病毒,进行RT-PCR检验。结果从2015年上送的241份腹泻患者粪便中,检测出33份诺如病毒GⅡ型阳性标本,检出率达13.69%;检测出2份诺如病毒GⅠ型阳性标本,检出率为0.83%。结论新疆巴州地区腹泻患者中诺如病毒多为GⅡ型,阳性标本RT-PCR曲线应与阳性对照保持相似的“S”型曲线,在FAM通道和HEX通道峰值要大于2000。
简介:摘要目的分析血清尿酸水平同高血压与高血压前期间的关系。方法选取2015年4月~2017年11月来我院进行健康体检的400例体检者作为本次研究的观察对象,通过对患者的吸烟、饮酒等情况进行调查,并对体检者的血压、血糖、尿酸等指标进行测量,根据患者具体情况将其分成高血压组、前期组与健康组,进而采取单因素与多因素的分析方法来具体分析血尿酸和血压水平同高血压、高血压前期间的相关性。结果通过分析对比发现,血清尿酸水平同患高血压与高血压前期的危险性成正比关系,且同血清尿酸水平最低4分位者相比较,对多因素进行调整后,最高4分位者出现高血压与高血压前期的危险比则分别是3.392(95%CI2.191~5.251)、1.973(95%CI1.418~2.747)。结论血清尿酸水平的逐步增加可作为高血压其前期人群发展到高血压的一个独立性危险因素看待,必须引起足够关注并加以控制。
简介:摘要目的了解上海地区急性胃肠炎患儿感染诺如病毒(norovirus, NoV)的基因特征情况。方法收集2018年10月至2019年9月上海市儿童医院门急诊急性胃肠炎患儿的粪便标本709份,采用实时荧光RT-PCR方法对NoV进行初筛,使用普通RT-PCR方法,分别用VP1、RdRp区和跨RdRp-VP1区引物对部分NoV阳性标本进行分型鉴定。应用SPSS20.0统计学软件进行数据处理,并使用生物信息学软件对NoV基因序列进行同源性、系统进化及重组性分析。结果经实时荧光RT-PCR检测,709份粪便标本中NoV阳性的标本为265份,阳性率为37.4%(265/709)。基于NoV RdRp和VP1区的测序分析,NoV阳性标本中共检出7种不同的基因型,分别为GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012、GⅡ.P7-GⅡ.6、GⅡ.P8-GⅡ.8、GⅡ.P21-GⅡ.13和GⅡ.P17-GⅡ.17型,其中以GⅡ.P16-GⅡ.2型所占比例最高,为30.6%(34/111),其次为GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012型(27.0%,30/111)和GⅡ.P12-GⅡ.3型(24.3%,27/111)。本研究发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13,其重组位点位于ORF1/ORF2的交接区。NoV在每个月份皆有流行,但每个月份的主导基因型不尽相同。男女患儿的NoV阳性检出率差异无统计学意义(P=0.329),而不同年龄组患儿的NoV阳性检出率差异有统计学意义(P=0.011),以>11~12岁和>2~3岁年龄组所占比例最高。结论2018年10月至2019年9月,上海地区以GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.Pe-GⅡ.4_Sydney 2012和GⅡ.P12-GⅡ.3 NoV重组株流行为主,并发现2株新的NoV重组株GⅡ.P21-GⅡ.13散在流行。跨ORF1/ORF2的基因序列测定,有助于更好地了解NoV的基因分型和重组情况。
简介:摘要目的调查北京市宾馆住宿场所工作人员的诺如病毒隐性感染状况及宾馆住宿场所和旅游大巴车中诺如病毒污染情况,为诺如病毒防控提供科学参考依据。方法采用横断面调查方法,按照方便抽样的原则,抽取北京市16个区内的宾馆住宿场所以及旅游人员集中区域的旅游大巴车,采集环境标本,并采集相关工作人员肛拭子标本,使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测。采用描述性方法分析不同场所环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染情况。结果共采集北京市宾馆住宿场所工作人员肛拭子标本320件,环境涂抹标本640件,其中工作人员诺如病毒隐性感染率为0.94%,厨师隐性感染率为0.99%,环境污染阳性率为0.16%。旅游大巴车环境涂抹标本180件,未检出诺如病毒。结论在2019年诺如病毒非流行季期间北京市宾馆住宿场所中,工作人员诺如病毒感染率较低,环境中存在诺如病毒污染,为避免或减少旅游团体诺如疫情的发生,需进一步做好针对性的防控工作。
简介:摘要目的探讨一起由札如病毒引起的社区胃肠炎暴发的流行特征和临床发病情况,为开展疫情防控提供参考依据。方法采用回顾性研究方法对CT社区居民进行流行病学调查,以χ2检验比较罹患率的差异,采用RT-PCR方法对肛拭子、粪便和水样标本进行肠道病毒检测。结果该起疫情共发现422例病例,罹患率为11.95%。病例主要集中在21-24日,22日达到高峰,呈点源暴露特点,临床特征以呕吐和水样便为主。CT社区各村均有病例出现,以旧村罹患率最高(25.20%)。各年龄段均有病例发生,<25岁人群罹患率最高(16.41%),≥50岁次之(12.05%),25~49岁最低(8.42%)。病例肛拭子和粪便标本检测札如病毒阳性率为38.78%。采集24份水样的菌落总数、总大肠菌群和耐热大肠菌群合格率分别为95.83%、45.83%和50.00%,未检出札如病毒。结论本次疫情为一起由札如病毒感染引起的社区暴发事件,因集中式供水受污染而导致经水传播的可能性大。应完善感染性腹泻疾病监测体系,强化人群健康教育以及生活饮用水监测监督。
简介:摘要目的调查某学校9月一起感染性腹泻暴发疫情,分析和探讨其流行因素,评价控制措施效果,为今后感染性腹泻疫情的防控提供参考。方法对全校学生和教职员工进行快速症状筛查后,再对初筛病例逐一进行个案调查。对学校的基本情况、食堂卫生状况、饮用水供应、学生宿舍环境卫生进行调查,并开展病例对照研究。采集病例的粪便或肛拭子标本、管网末梢水、地面及物表涂抹样等样品。粪便和肛拭子样品进行诺如病毒、轮状病毒和腺病毒荧光PCR检测,生活饮用水进行卫生学指标和诺如病毒荧光PCR检测,涂抹样进行诺如病毒荧光PCR检测。结果79例病例,罹患率为11.60%,临床表现为腹泻(100%)、腹痛(81.01%)、头痛(29.11%)、食欲不振(13.92%)、发热(7.59%)、呕吐(7.59%);21例现患病例中的13例的粪便或肛拭子标本诺如病毒GII阳性;发病高峰在9月19日至9月24日,聚集在男生宿舍楼(78.48%),该校各学生宿舍楼内班级住宿学生罹患率无统计学差异;男生宿舍楼罹患率高于女生宿舍楼罹患率(Pearson?2=44.10,P<0.001);男生宿舍楼采光差、地面潮湿,学生在宿舍呕吐及通槽式公共卫生间可产生气溶胶。结论此次疫情为一起GII型诺如病毒腹泻暴发,结合疫情流行病学特征、饮食调查、卫生学和宿舍楼环境调查,认为此次疫情9月1日至9月18日主要传播途径可能为接触传播,9月19日-9月24日可能发生了男生宿舍楼内的气溶胶传播。
简介:摘要目的分析湖北省一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的流行因素,为制定防控措施提供依据。方法采用现场流行病学的方法进行调查,运用描述性流行病学方法、病例对照方法对调查数据进行分析。结果本次暴发共涉及病例181例,首例病例于4月10日16时发病,发病高峰集中在4月11日12时至24时(92例,占全部病例的51.00%),食用园区小卖部售卖的冰淇淋是本次暴发的危险因素(OR=5.03,95%CI:2.62~9.51)。结论该事件为1起由园区自来水管网铺设不规范、小卖部从业人员卫生安全意识薄弱导致的诺如病毒感染性腹泻暴发,应加强对公共场所水网的监管以及对公共场所服务人员的健康宣教工作。
简介:目的了解安徽省某高校一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体基因分型和分子特征。方法采用实时荧光定量PCR法(Real-timePCR)对6份粪便/肛拭子标本检测诺如病毒核酸,检出的阳性标本经传统RT-PCR扩增衣壳蛋白区(ORF2)部分序列、基因测序和型别鉴定,利用ClustalX2.0和Mega6.0软件对测定序列进行核苷酸同源性比对和构建基因进化和亲缘性关系树。结果检出4份标本诺如病毒核酸阳性,阳性率为66.67%(4/6);基因序列比对和进化亲缘性关系显示:诺如病毒基因型为GII.4型;2毒株序列之间核苷酸同源性为100%;与2014~2015年上海株、香港株核酸同源性最高,均为100%;与2012澳大利亚Sydney株(JX459908)同源性为99.6%;与上海和香港两地区毒株亲缘性关系最近,聚为独立一簇,同属GII.4/Sydney2012分支。结论引发该起急性胃肠炎暴发的病原体为GII.4型诺如病毒,且属于GII.4Sydney2012变异株。