简介:Wepresentanintegratedstand-alonesoftwarepackagenamedKaKs_Calculator2.0asanupdatedversion.Itincorporates17methodsforthecalculationofnonsynonymousandsynonymoussubstitutionrates;amongthem,weaddedourmodifiedversionsofseveralwidelyusedmethodsasthegammaseriesincludingγ-NG,γ-LWL,γ-MLWL,γ-LPB,γ-MLPB,γ-YNandγ-MYN,whichhavebeendemonstratedtoperformbetterundercertainconditionsthantheiroriginalformsandarenotimplementedinthepreviousversion.Thepackageisreadilyusedfortheidentificationofpositivelyselectedsitesbasedonaslidingwindowacrossthesequencesofinterestsin5'to3'directionofprotein-codingsequences,andhaveimprovedtheoverallperformanceonsequenceanalysisforevolutionstudies.Atoolbox,includingC++andJavasourcecodeandexecutablefilesonbothWindowsandLinuxplatformstogetherwithauserinstruction,isdownloadablefromthewebsiteforacademicpurposeathttps://sourceforge.net/projects/kakscalculator2/.
简介:TodevelopaNaI(Tl)detectorforinsituradioactivitymonitoringinthemarineenvironmentandenhancetheconfidenceoftheprobabilityofthegamma-spectrumanalysis,MonteCarlosimulationsusingtheMonteCarloN-Particle(MNCP)codewereperformedtoprovidetheresponsespectraofsomeinterestedradionuclidesandthebackgroundspectraoriginatingfromthenaturalradionuclidesinseawaterrecordedbyaNaI(Tl)detector.Anewlydeveloped75mm×75mmNaI(Tl)detectorwascalibratedusingfourreferenceradioactivesources137Cs,60Co,40Kand54Mninthelaboratorybeforethefieldmeasurementsinseawater.Asimulationmodelwasestablishedforthedetectorimmersedinseawater.ThesimulatedspectrawereallbroadenedwithGaussianpulsestoreflectthestatisticalfluctuationsandelectricalnoiseintherealmeasurement.Thesimulatedspectrashowthatthesingle-energyphotonsintothedetectoraremostlyscatteringlow-energyphotonsandthehighbackgroundinthelowenergyregionmainlyoriginatesfromtheComptoneffectofthehighenergyγ-raysofnaturalradionuclidesinseawater.Thesimulatedbackgroundspectrumwascomparedwiththeexperimentalonerecordedinfieldmeasurementandtheyseemtobeingoodagreement.Thesimulationmethodandspectracanbeusedfortheaccurateanalysisofthefiledmeasurementresultsoflowconcentrationradioactivityinseawater.
简介:BACKGROUND:Anaminoacidimbalancehasbeenconsideredtoberesponsibleforepilepsypathogenesis.Gamma-aminobutyricacid-Breceptor(GABA_BR)inhibitsvoltage-sensitivecalciumionchannelsandGABAorglutamicacid(Glu)neurotransmitterrelease,whichpromotesorinhibitsonsetanddevelopmentofepilepsy.OBJECTIVE:ToexploretheeffectofbaclofenonGBR1aandGBR2mRNAexpressioninthehippocampusofepilepticratsfollowingkainicacid(KA)induction,andtostudytheadaptabilityofGABA_BRsubunits.DESIGN,TIMEANDSETTING:Arandomized,controlled,animalexperimentbasedonmolecularbiologywasperformedattheLaboratoryResearchCenterofSecondHospitalAffiliatedtoSoochowUniversityfromNovember2005toMarch2006.MATERIALS:KAwasprovidedbySigma,USA.InsituhybridizationdetectionkitofGBR1aandGBR2wasprovidedbyWuhanBosterBiologicalTechnology,China.GABA_BRagonist(baclofen)wasprovidedbySigma,USA.METHODS:Forty-fourepilepticratswererandomlyallocatedtoepileptic(n=28)anddrugintervention(n=16)groups.Theepilepticgroupwasfurtherdividedintopost-epilepticsubgroupsatdifferenttimepoints:6,12hours,1,3,7,15,and30days(n=4).Thedruginterventiongroupwasfurtherdividedintointerventioncontrolssubgroupsatvarioustimepoints:6hours,1day,and3days(n=4).Fouradditionalratswereconsideredthenormalcontrolgroupandnotmodeled,butwereinjectedwithsalineinthehippocampalCA3region.MAINOUTCOMEMEASURES:GBR1aandGBRmRNAexpressionwasdetectedintherighthippocampalCA1,CA3,anddentategyrus(DG)areasofthecontrol,epileptic,andinterferencegroupsatvarioustimeintervalsaccordingtoinsituhybridizationresults.RESULTS:(1)Duringtheearlystageofepilepsy(6and12hours),GBR1aandGBR2mRNAexpressionwasdecreased,andexpressionwaslessthanthecontrolgroupatonedayafterKAinduction(P<0.05).mRNAexpressionwasincreasedintheDG,butwasgreaterthanthecontrolgroupatday3(P<0.05).ExpressioninthehippocampalCA1andCA3regi
简介:Itisstandardpractice,wheneveraresearcherfindsanewgene,tosearchdatabasesforgenesthathaveasimilarsequence.Itisnotstandardpractice,wheneveraresearcherfindsanewgene,tosearchforgenesthathavesimilarexpression(coexpression).Failuretoperformco-expressionsearcheshasleadtoincorrectconclusionsaboutthelikelyfunctionofnewgenes,andhasleadtowastedlaboratoryattemptstoconfirmfunctionsincorrectlypredicted.WepresentheretheexampleofGliaMaturationFactorgamma(GMF-gamma).Despiteitsname,ithasnotbeenshowntoparticipateingliamaturation.ItisageneofunknownfunctionthatissimilarinsequencetoGMF-beta.ThesequencehomologyandchromosomallocationledtoanunsuccessfulsearchforGMF-gammamutationsinglioma.WeexaminedGMF-gammaexpressionin1432humancDNAlibraries.Highestexpressionoccursinphagocytic,antigen-presentingandotherhematopoieticcells.WefoundGMF-gammamRNAinalmosteverytissueexamined,withexpressioninnervoustissuenohigherthaninanyothertissue.OurevidenceindicatesthatGMF-gammaparticipatesinphagocytosisinantigenpresentingcells.Searchesforgeneswithsimilarsequencesshouldbesupplementedwithsearchesforgeneswithsimilarexpressiontoavoidincorrectpredictions.
简介:摘要 目的:探讨 不同季节和献血次数对献血者丙氨酸氨基转移酶( ALT)的影响 。 方法: 2019 年 3 月 ~2020 年 3 月在本血站自愿无偿献血者 20746 例为研究对象, 采用 速率法检测所有献血者血液的 ALT指标值;采用 酶联免疫吸附试验( ELISA)法检测献血者血液的 抗 -TP、 HBs Ag、 抗 -HIV、 抗 -HCV指标值 。记录献血者的献血日期与献血次数,并进行统计分析。 结果:春季献血者血液 ALT 不合格率最低为 2.73% ,夏季与冬季 ALT 不合格率居中分别为 8.55% 、 9.62% ,秋季 ALT 不合格率最高为 15.68% , 各个季节献血者血液 ALT 不合格率有明显差异,有统计学意义。两两比较时,夏季与冬季 ALT 不合格率有差异但不明显,不具有统计学意义,除此外,任意两个季节相较均有显著差异,有统计学意义。 献血者 ALT 不合格率呈现出次数越多 ALT 不合格率越高的趋势,首次、二次、多次的 ALT 不合格率分别为 8.79% 、 10.17% 、 11.83% ,不同献血次数的献血者血液 ALT 不合格率有明显差异,有统计学意义。 结论:不同季节和不同的 献血次数都 对献血者ALT有不同程度影响,采购血机构应广泛宣传献血有关知识 。
简介:摘要目的对我市招工人员体检静脉抽血做HBsAg和ALT检查。方法共3458例血清标本,HBsAg采用ELISA法,ALT采用赖氏法。结果3458例检出HBsAg阳性926例,阳性率26.78%(926/3458);ALT≥41赖氏单位101例,阳性率2.92%(101/3458)。结论HBsAg阳性率为26.78%(926/3458)。高于血清学调查10%以上,可能为福清地处于沿海人口众多、流动性大感染率高的原因。在体检中发现HBsAg阳性者,应尽早进行“两对半”模式检测及时发现本病处于哪一阶段如“大三阳”、“小三阳”、或急、慢性肝炎HBsAg携带者,采用适当的有效防治措施十分必要,这也已经成为愈来愈受普遍关注的社会问题;大部分单项ALT升高并非病毒性肝炎所致,而是与相当一部分体检人员精神过度兴奋、紧张或过度疲劳、或体检前喝酒、剧烈运动后静脉抽血化验有关。因此,在要进行体验抽血前避免紧张、疲劳、戒酒等至关重要。
简介:摘要目的了解青年人群中ALT升高情况,为这类患者的临床治疗提供建议。方法选取在我院体检的青年人(18~35周岁),其中ALT轻度升高(40~80U/L)者4604人,其中有复测结果者980人,分析相关检查,了解患者是否进行了药物干预,分析复查结果。结果青年体检人群中ALT升高占11.2%,其中轻度升高占88.1%;在980名患者中446名进行了相关检查,乙肝55名,单纯脂肪肝251名;980患者中403名进行了药物治疗,其中乙肝患者的治疗率达81.8%;980名患者413名恢复正常,治疗组403名患者中228名恢复正常。结论青年人群中ALT轻度升高很常见,即便经过药物治疗,很多人扔不能恢复正常,对于此类患者可能需要综合治疗及长期随访。
简介:【摘要】目的:本文主要为了研究乙肝患者的谷丙转氨酶( ALT)、乙肝血清标志物、乙肝病毒脱氧核糖核酸( HBV-DNA) 的检验结果。方法:研究对象为2021年10月29日-2022年10月29日我院检验科收入的乙型肝炎患者266例,对这些患者进行血清乙肝表面抗原( HBsAg) 、乙肝表面抗体(HBsAb)、乙肝e抗原(HBeAg)、乙肝e抗体( HBeAb) 以及乙肝核心抗体(HBcAb) 等标志物检测,并能够分析各个检测结果,具体分组为: HBsAg、HBeAg以及HBcAb三项阳性为Ⅰ组,共63例; HBsAg 与HBeAg 双项阳性为Ⅱ组,共66例;HBsAg、HBeAb以及HBcAb三项阳性为Ⅲ组,共70例;HBsAg与HBcAb双项阳性为Ⅳ组共67例,比较不同血清学模式患者的HBV-DNA 与ALT指标水平差异。结果:Ⅱ组、Ⅲ组、Ⅳ组的HBV DNA、ALT的检出指标均明显低于Ⅰ组,P<0.05;阳性检出方面,Ⅱ组、Ⅲ组的HBV DNA阳性检出率明显低于Ⅰ组,P<0.05,而Ⅳ组的HBV DNA阳性检出率和Ⅰ组无明显差异,P>0.05;Ⅱ组、Ⅲ组、Ⅳ组的ALT的阳性检出率均明显低于Ⅰ组,P<0.05。结论:通过对乙肝患者进行乙肝血清标志物、ALT、HBV-DNA等多项联合检测,能够明确分析出患者病毒复制和感染情况,能够为医生诊断疾病提供科学依据,临床效果值得肯定。
简介:摘要:目的 为科学合理的制定嘉峪关血站单采血小板ALT筛查模式,杜绝单采血小板采集后因ALT不合格的报废,稳定和逐步壮大单采血小板献血队伍提供依据。方法 统计分析本站2019—2023年单采血小板ALT不合格情况,对ALT不合格献血者进行追踪,统一召回重新采样进行全项检测,根据结果评估献血者健康状况。结果 2019-2023年本站共采集单采血小板3210人份,不合格65人份,其中ALT不合格57人份。召回57人检测8人ALT仍不合格,其余项目均合格。结论 在严格做好不同生化仪器的性能比对和校准的前提下,单采血小板ALT只进行速率法初筛,而不再进行复检的筛查模式既能杜绝单采血小板采集后因ALT不合格的报废而造成的血液浪费,又能节约检测成本,保证血液安全。