简介:摘要目的检测结肠癌中微小RNA(miRNA,miR)-1228的表达,分析其与转移相关指标的关系。方法选择2013年9月至2014年7月确诊为结肠癌59例患者作为研究对象,留取肿瘤组织(研究组)和正常结肠黏膜组织(对照组)。PCR法检测二组中miR-1228的表达。免疫组织化学法检测结肠癌中上皮型黏附素(E-cadherin)和基质金属蛋白酶(MMP)-2的表达。蛋白质印迹法(Western blot)法检测结肠癌中神经型黏附素(N-cadherin)和MMP-9的表达。应用t检验、配对t检验、方差分析、Spearman相关分析和K-M生存分析。结果结肠癌和正常组织粘膜组织中miR-1228的表达差异有统计学意义(1.85±0.41比1.12±0.28,t=6.990,P<0.05),miR-1228在肿瘤浸润深度(1.73±0.38比1.96±0.34)、癌结节(1.78±0.45比1.99±0.41)、脉管累犯(1.82±0.39比2.04±0.30)、淋巴结转移(1.80±0.40比1.99±0.41)和不同TNM分期(1.59±0.30比1.98±0.33)的表达差异有统计学意义(t=5.790、5.490、5.510、5.320、7.010,P<0.05),生存分析显示miR-1228与生存时间明显相关(χ2=5.900,P<0.05)。相关分析显示miR-1228与MMP-2(r=0.540,P<0.05)、miR-1228与MMP-9(r=0.540,P<0.05)、miR-1228与N-cadherin(r=0.590,P<0.05)呈正相关,miR-1228与E-cadherin呈负相关(r=-0.560,P<0.05)。结论miR-1228高表达状态与肿瘤形成有关,与病变的临床病理特征有关,miR-1228可能通过调控细胞黏附作用和细胞外基质的降解参与到肿瘤进展过程中。
简介:以卷丹、麝香百合品种富田和离体鲜切花的花蕾为材料,比较Trizol法、异硫氰酸胍法、CTAB改进法和SDS改进法提取总RNA的效果,结果表明,SDS改进法能有效去除多糖,提取的RNA中28SrRNA亮度约为18SrRNA的两倍,OD260/OD280值介于1.7-2.2之间,卷丹RNA得率为132.52μg/g,富田RNA得率为186.88μg/g。进一步用SDS改进法分别提取富田外轮花瓣、内轮花瓣、雄蕊、雌蕊、叶和茎的RNA,同样可以获得完整的纯度高的RNA,其中28SrRNA亮度约为18SrRNA的两倍,OD260/0D280值介于1.7~2.2之间,说明此方法适用于百合各个组织RNA的提取。经RT—PCR获得了花发育基因的特异性条带,说明用SDS改进法从百合中提取的RNA质量好、产率高、完整性强,完全适合于百合进一步的分子生物学研究。
简介:摘要根据核苷酸大小,非编码RNA统分为短非编码RNA、中等非编码RNA和长非编码RNA。其中,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和微小RNA(microRNA,miRNA)通过参与调控Six2、Hnf-1β、Bim、mTOR等信号通路来维持肾脏正常发育,其调控异常又将导致先天性肾脏和尿路畸形(congenital anomalies of the kidney and urinary tract,CAKUT)的发生。此外,环境也将影响非编码RNA在肾脏发育期间的表达活性。该文综述非编码RNA在肾脏发育以及在CAKUT发生发展过程中的具体作用及其调控机制。
简介:目的:对目前最常用的检测微小RNA(miRNA)的茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法进行比较。方法:分别用茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法检测人乳腺癌细胞MCF-7中U6和23种miRNA的表达,利用定量PCR分析软件和琼脂糖凝胶电泳方法,将2种方法在引物设计难度、特异性与灵敏度,以及检测通量方面进行比较。结果:茎环法的特异性和灵敏度比PAP法高,但引物设计难度大,检测通量低;PAP法引物设计难度较低,检测通量较高,但特异性和灵敏度较差。结论:茎环法实时定量PCR适于有针对性地检测小规模miRNA,而PAP法则适于大规模miRNA筛选实验。
简介:【摘要】目的: 探讨使用国产和进口试剂对 HCV RNA定量检测的效果。 方法 : 纳入时间为 2018 年 7 月至 2019 年 7 月,选取来我院就诊的慢性丙肝患者 65 例,对所有患者均行使用国产和进口试剂定量检测 HCV RNA水平,现对其 2 种检测方法的结果作分析。 结果: 使用进口试剂定量检测结果相比检测下限而言高出的例数为 58 例,占比为 96.67% ;使用国产试剂定量检测结果相比于检测下限而言高处的例数为 60 例,占比为 92.31% ;经比较组间差异性不显著( p > 0.05 )。 结 论 : 临床在 HCV RNA水平定量检测中使用国产和进口试剂检测结果的一致性和相关性均较高。
简介:摘要RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)是转录后调节的关键参与者。RNA结合蛋白的RNA结合域(RBD)具有功能多样和结构灵活的特点,使得RBP能够控制大量基因的转录水平。RBP调控方式包括与RNA结合,调节RNA的剪接、修饰、转运、定位、降解和翻译等。RNA结合蛋白表达水平的改变,往往会引起一系列连锁反应,甚至诱发肿瘤的产生。近年来,RBP与癌症的相关研究众多,我们回顾了结直肠癌中几种抑癌和促癌的RNA结合蛋白的作用机理,期望未来发现更多的RNA结合蛋白并构建更加庞大的调节网络,为临床结直肠癌患者的治疗提供新的方向。
简介:Inordertostudythefunctionalstructureofthetranscriptionterminatorsandthemechanismoftermination,asurveyofthechromatinstructure,includingthelocationofDNaseIhypersensitivesitesandthenucleosomearrangement,ofyeastADH1andFLPterminatorswasmade.TheresultsshowthatthereisnorelationshipbetweenthefunctionoftheterminatorsandtheexistenceofDNaseIhypersensitivesites.However,itisfoundthatthereisalwaysanucleosomeattheimmediateupstreamofthetranscrip-tionalterminationsites.Asacontrol,thechromatinstructuresofthepBR322DNAfragmentsontheyeastshuttervectorsarealsoinvestigatedatthesametime.TherandomnucleosomearrangementonthebacterialDNAinyeastagreeswiththepublishedreports.Anewhypothesis,aboutthemechanismoftranscriptionalterminationisputforwardandthereasonofdifferentnucleosomearrangementontheDNAswhichareori-ginallyfromdifferentspeciesinyeastisdiscussed.
简介:针对沙棘组织中多糖、多酚、粗蛋白等次生代谢产物含量高的特点,采用RNAplantPlus总RNA提取试剂改良法,成功地提取了沙棘叶片总RNA。所提取的沙棘叶片总RNA凝胶电泳显示28s和18s条带清晰完整,A260/A280和A260/A230比值分别为1.79和2.07,且平均得率为298.1μg/g(鲜叶)。试验结果表明,RNAplantPlus总RNA提取试剂改良法具有方便快捷、提取RNA纯度高、有效排除多种次生代谢产物影响的特点,用该方法提取的沙棘叶片总RNA可以用于后续的分子生物学研究中。
简介:本文对两种具有抗HIV-1活性的药物与RNA的相互作用进行了探讨.紫外Tm测定及CD光谱结果表明,两种药物均可与polyA@polyU相互作用,影响其构象的改变.流式细胞仪分析提示药物可不同程度地影响cos-7亚二倍体细胞含量,其中ribavirin的作用更显著.
简介:摘要RNA干扰技术已经迅速的被发展成为一种治疗手段,用于特异的下调基因从而减轻病痛。这一技术特别适用于由于病毒感染的疾病。现在大量的研究已经表明无论在体内还是在体外,RNA干扰都可以抑制病毒。这里有一个基本原则每一个的病原物RNA干扰治疗都必须量身定做,其中包括1.发挥干扰的RNA的导入方法途径,2.给药途径,3.目的基因,4.RNA干扰作用的持续时间。尽管对于每种病毒都可以制定有效的策略但是他们都面临着同样的挑战。重要的是,治疗策略必须考虑到在病毒基因组可能出现的极快速进行,以及利用计算和生物信息学方法来辅助治疗策略以防止病毒逃逸。此外,所有的RNA干扰治疗策略都需将发挥干扰作用的核酸序列导入到靶细胞中,这将受益于基因设计和导入方法的发展。这里我们总结了在抗病毒RNA干扰方面取得的重要进展,讨论如何将这些发现有效的应用到诊断治疗中。
简介:无