简介:摘要目的利用网络药理学技术研究经典药对当归-白芍治疗心血管疾病的作用及机制。方法检索TCMSP和相关文献筛选得到当归-白芍药对中潜在活性化合物,并结合SWISS、STITCH数据库挖掘化合物对应的靶点;通过治疗靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和DrugBank数据库挖掘心血管疾病靶点;构建蛋白互作网络,分析主要靶点;利用生物学信息注释数据库(DAVID 6.8)进行KEGG信号通路注释分析,并应用Cytoscape构建成分-主要靶点-关键通路网络。结果构建的成分-靶点-通路网络中包括17个药对成分,54个主要靶点及10条关键通路。涉及的通路包括炎症相关通路(TNF信号通路)、心血管系统相关通路(PI3K-AKT信号通路、FoxO信号通路、VEGF信号通路、Rap1信号通路等)、催乳素信号通路和雌激素信号通路。结论应用网络药理学验证了当归-白芍药对多成分、多靶点、整体调节的作用特点,推测其主要通过调节血管生成、炎症反应和细胞凋亡等途径发挥治疗心血管疾病的作用。
简介:摘要: 目的 探索黄芍颗粒治疗糖尿病周围神经病变(Diabetic peripheral neuropathy, DPN)的作用机制 方法 运用TCMSP、Genecards和OMIM数据库收集活性成分及靶点。通过String数据平台构建PPI网络,再利用Metascape数据库进行GO与KEGG富集分析,来获得核心靶点与通路。结果 筛选得到黄芍颗粒的90个活性成分与294个靶点,DPN相关靶点1404个,取交集后得到靶点128个。构建PPI网络后利用Cytoscape分析,得到PPI核心靶点17个。富集结果发现,这些靶点涉及多个生物过程以及160条通路。经过Cytoscape分析得到MAPK1、AKT1、RELA、MAPK8、TNF共5个核心靶点,和以AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications为首的17条核心通路,它们在黄芍颗粒治疗DPN的过程中可能发挥重要作用。结论 黄芍颗粒可通过MAPK1、AKT1 等靶点,调控AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications等信号通路来治疗DPN。
简介:摘要:目的 基于网络药理学方法探讨芹菜叶中的主要药效物质基础,阐释其主要活性成分的作用机制。方法 选取芹菜叶中的特征性成分,通过TCMSP、Uniprot 等数据库预测化合物作用靶点,OMIM、DisGeNet、GeneCards等数据库收集相关疾病靶点,对获得靶点进行GO和KEGG通路富集分析,利用 Cytoscape 软件构建“活性成分-作用靶点-通路”网络。利用分子对接技术进行活性成分与关键靶点。结果 芹菜叶中主要活性成分为柚皮素、绿原酸、圣草酚、槲皮素、芹菜叶素、木犀草素、芦丁、山奈酚、漆黄素和水蓼素;关键靶点为IL6、AKT1、TNF、BCL-2、INS、EGFR、STAT3和IL1B;分子对接结果显示绿原酸、槲皮素、芦丁、水蓼素和8个关键靶点结合能均低于-5。结论 芹菜叶中的绿原酸、槲皮素、芦丁、水蓼素四种主要活性成分通过PI3K-Akt、脂质和动脉粥样硬化、FoxO等信号通路调控血管内皮细胞增生、血管收缩、氧化应激等生物过程发挥调血脂、降压、抗炎作用。
简介:目的观察普罗帕酮对生理状态下兔心肌心室间复极异质性的影响。从动作电位时程(actionpotentialduration,APD)的角度探讨临床应用普罗帕酮治疗心律失常作用的电药理学机制。方法采用膜片钳技术,观察在不同刺激频率[即基础循环周长(basiccyclelength,BCL)=2000、1000、500及250ms]下,不同浓度普罗帕酮(对照组,1μmol/L普罗帕酮组,6μmol/L普罗帕酮组,10μmol/L普罗帕酮组)对正常心肌左右心室内膜APD的影响。结果普罗帕酮由低浓度(1μmol/L)至超治疗浓度(10μmol/L)呈非浓度依赖性地减少室间离散;左右心室内膜APD和室间离散在不同浓度的普罗帕酮干预下仍呈慢频率依赖性特点(P<0.05),且这种特点对普罗帕酮呈非浓度依赖性。结论生理状态的心肌左右心室间存在复极离散。普罗帕酮可减少这种复极异质性,这可能是其对无缺血心肌室性心律失常治疗作用的电药理学机制之一。
简介:摘要目的利用网络药理学探讨麻杏二三汤治疗COPD的作用靶点、信号通路,揭示麻杏二三汤治疗COPD多靶点、多通路的干预作用机制。方法借助TCMSP筛选麻杏二三汤的有效成分及相应靶点,利用GeneCards数据库筛选COPD疾病相关靶点。运用STRING数据库进行蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析。通过Cytoscape构建化合物靶点网络、PPI网络,利用Draw Venn Diagram网站绘制韦恩图筛选交集靶点,运用R软件对麻杏二三汤作用靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路分析。结果共得出麻杏二三汤101个活性成分,对应250个靶点,包括与COPD相关靶点214个。通过GO及KEGG富集分析,筛选出与麻杏二三汤主要成分相关的信号通路有48条。结论基于网络药理学分析得出麻杏二三汤有效化学成分,发现麻杏二三汤可能通过炎症反应、调节免疫等多靶点、多途径作用于COPD。
简介:摘要目的通过网络药理学对筋痛灵膏外用治疗肩关节周围炎的主要活性成分及其潜在的作用机制进行研究。方法筋痛灵膏的主要活性成分和靶标于中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取,肩关节周围炎的靶标通过五大疾病数据库查找获得。药物-疾病交互靶点在Venny平台上获取,并建立蛋白质相互作用网络来筛选出核心靶点。交集靶点在Metascape平台上进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组大百科全书数据库(KEGG)的富集分析。最后对药物主要成分和核心靶点进行分子对接。结果共筛选出53个活性成分,121个重要靶点;其中,核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、谷甾醇、黄芩素,关键靶点为JUN、ESR1、TP53。GO功能富集分析得出筋痛灵膏作用的生物途径包括对异生素刺激的反应、细菌来源分子的反应、伤口愈合以及氧气水平的反应等。KEGG通路富集分析表明筋痛灵膏治疗肩关节周围炎主要富集在白细胞介素17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。结论筋痛灵膏通过核心成分调控JUN、ESR1、TP53关键靶点,作用于多种生物途径来参与调节免疫反应、减少炎性反应,以达到治疗肩关节周围炎的作用。
简介:摘要目的采用实验及网络药理学方法研究额力根-7抗肝纤维化的作用机制。方法将50只大鼠按随机数字表法分为空白组、模型组及额力根-7低、中、高剂量组,每组10只。除空白组外,其余各组大鼠灌胃50%四氯化碳-花生油溶液制备肝纤维化模型。额力根-7低、中、高剂量组分别灌胃135、270、405 mg/kg额力根-7散剂0.5%羧甲基纤维素钠溶液(CMC-Na),1次/d,连续10周。采用赖氏法检测大鼠血清GPT、GOT含量,可见光比色法检测ALP含量,采用HE染色及Masson染色观察肝组织结构。提取肝星状细胞(HSCs)RNA及蛋白,采用q-PCR技术及Western blot法检测α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、Ⅰ型胶原(collagen Ⅰ)mRNA、蛋白表达水平,流式细胞术检测HSC凋亡情况。通过TCMID、TCMSP数据库及文献检索获得药物有效成分及靶点,通过OMIM和PubMed:Geen数据库获得肝纤维化靶点,运用Cytoscape 3.7.2构建“药物-有效成分-靶点-疾病”网络,运用STRING构建蛋白质相互作用网络(PPI)筛选中心靶标,运用R语言在线检索Bioconductor 平台对靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果与模型组比较,额力根-7高、中、低剂量组GPT、GOT、ALP水平降低(P<0.01)。与对照组比较,含药血清低、中、高剂量组α-SMA[(0.24±0.12)、(0.25±0.12)、(0.41±0.15)比(1.00±0.00)]、collagenⅠ[(0.64±0.24)、(0.33±0.13)、(0.28±0.11)比(1.00±0.00)]mRNA水平降低(P<0.05或P<0.01),含药血清低、中、高剂量组α-SMA[(0.03±0.01)、(0.01±0.00)、(0.01±0.00)比(0.04±0.00)]、collagenⅠ[(0.08±0.01)、(0.10±0.01)、(0.13±0.01)比(0.18±0.01)]蛋白水平降低(P<0.01)。PPI结果显示,共筛选出额力根-7中35个有效成分,196个药物靶点,3 740个疾病靶点,药物疾病共同靶点170个。GO富集分析获得159个条目,其中主要的分子功能包括DNA结合转录激活活性、RNA聚合酶Ⅱ特异性、细胞因子受体结合等;KEGG富集分析获得43条信号通路,其中排在前3位的通路为PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、细胞凋亡。结论额力根-7可通过多成分、多靶点、多通路发挥抗肝纤维化作用。
简介:摘要目的通过网络药理学和分子对接方法探讨半夏厚朴汤治疗紧张型头痛的有效成分及作用机制。方法通过TCMSP筛选得到半夏厚朴汤有效成分与靶点,运用GeneCards、PharmGKB、TTD、Drugbank和OMIM获取紧张型头痛作用靶点,利用Perl软件得到“半夏厚朴汤-紧张型头痛”交集靶点,上传至STRING数据库绘制蛋白相互作用网络并进行拓扑分析,借助Cytoscape 3.8.0软件构建“半夏厚朴汤-药物成分-靶点-紧张型头痛”可视化网络,利用R 4.1.0语言及相关程序对交集靶点进行GO及KEGG通路富集分析。采用AutoDockTools-1.5.6软件进行分子对接分析。结果半夏厚朴汤与紧张型头痛的交集靶点有33个,拓扑属性分析提示MAPK1、TP53、ESR1、PTGS2、MYC、CYP1A2、CYP3A4、GSTP1等可能是半夏厚朴汤防治紧张型头痛的重要潜在靶点。GO富集分析得到516个细胞生物学过程,62个细胞组分,149个分子功能;KEGG通路富集分析得到G蛋白偶联受体途径、胆碱能突触通路、5-羟色胺能突触通路和TNF信号通路等94条等相关信号通路。结论半夏厚朴汤防治紧张型头痛具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,主要通过ESR1、TP53、PGTS2等多靶点,作用于5-HT突触通路、TNF信号通路、胆碱能突触通路、G蛋白偶联受体途径等多种通路发挥作用。